1. Pulau San Cristobal adalah pulau pertama yang dikunjungi Darwin saat tiba di Kepulauan Galapagos pada tanggal 16 September 1835. Di pulau ini ia mendapat kesempatan untuk mendapatkan spesies pertama yang nantinya akan menjadi dasar dan fondasi Teori Evolusi: San Cristobal Mockingbird.
2. Floreana adalah pulau kedua yang dieksplorasi oleh ekspedisi Beagle. Di sini Darwin memiliki waktu tiga hari untuk mengumpulkan spesies. Ia mendapatkan burung kedua: Floreana Mockingbird. Dia menyadari perbedaan antara spesimen sebelumnya yang ditemukan di San Cristobal, dan mulai memperhatikan spesies di pulau ini.
Disini Darwin juga bertemu dengan seorang Wakil Gubernur Inggris yang memberinya informasi penting tentang perbedaan dan variasi bentuk cangkang kura-kura di setiap pulau.
3. Isabela adalah pulau ketiga di Kepulauan Galapagos yang dikunjungi Darwin pada tanggal 29 September 1835. Darwin menggambarkan pulau itu sebagai pulau yang paling sunyi namun aktif secara vulkanik. Saat berlayar, ia mengamati aliran lava dan asap yang keluar dari kawah.
Beagle memutuskan untuk berlabuh di sebuah tempat bernama Tagus Cove. Darwin mendarat pada tanggal 1 Oktober 1835 dan menjelajahi medan vulkanik di sana.la lalu menemukan iguana yang berhabitat di laut dan darat. Iguana digambarkannya sebagai makhluk purba.
4. Santiago adalah pulau terakhir yang dikunjungi Darwin pada tanggal 8 Oktober 1835. Ini juga pulau tempat Darwin tinggal paling lama di Kepulauan Galapagos. Pada kunjungannya, dia menghabiskan waktu 2 minggu Di sini dia pertama kali melihat perbedaan antara kura-kura dari tiga pulau sebelumnya. Darwin juga memperhatikan bahwa sebagian besar spesies yang ada di Kepulauan Galapagos itu serupa tetapi berbeda darisatu pulau ke pulau lainnya.
Penemuan tersebut memberikannya cukup bukti untuk berteori "Bahwa spesies dapat berubah, terkait dengan makanan dan lingkungan mereka". Dia sekaligus mengumpulkan burung kutilang yang membantunya memahami fakta tersebut. Darwin meninggalkan Kepulauan Galapagos pada tanggal 20 Oktober 1835
