Juni 1994, hlm. 1-4 ISSN 0854-8587
I, No. I
ULAS BALIK
DNA
Mitokondria
dalam Studi Keragaman
dan Biologi populasi pada
DEDY DURYADIBiologi FMIPA IPB, Pajajaran, 16144
18 Mei 18 Juni 1994
Pengkajian keragaman genetik telah dilakukan s t u d i protein dan Namun demikian masalah yang umum bahwa keragaman genetik y a n g d a p a t diungkapkan tidak maksimum. Rendahnya protein disebahkan beberapa yaitu: (i) A d a o y a pada sekuen D N A yang mengkode asam- asam a m i n o yang bermuatan tidak akan
mempengaruhi protein yang diha-
(ii) Substitusi amino yang bermuatan sama tidak akan ban yak mempengaruhi mobi protein; Substitusi pada basa ketiga dari suatu tidak membawa perubahan amino yang diha-
(Kode Wobble); (iv) Adanya sekuen-sekuen DNA yang tidak protein (seperti pada sekuen intron atau daerah sisi lainnya (spacer) tidak akan mempengaruhi proteinnya. ini merupakan
daerah untuk DNA.
Untuk
kan perhatiannya pada pengkajian melalui studi DNA. Hasil yang didapat kan pengkajian DNA
yang dalam intra dan
menyangkut struktur, dan
p a d a tingkat D N A (Avis er 1 9 7 9 ;
Botstein 1980; 1985; Nakamura
1987; Burke 1991; 1992).
(1993) menandaskan sumbangan yang
dari penanda DNA
(RFLP),
dan Amplified Polymorphic DNA (RAPD)) di dalam studi keragaman hayati maupun herbagai aspek
yang genom herbagai organism.
Material DNA yang digunakan kebanyakan adalah DNA inti atau DNA total. DNA untuk
me eukariot tidak hanya dari DNA inti juga didapat
dari seperti mitokondria
dan
Beherapa peneliti seperti Avis dan (
Brown (1985)
yang dari DNA mitokondria dalam studi keragaman genetik dan hiologi populasi. Hal ini
jukkan dari huhungan
yang dengan hasa-
pznyusun genomnya. dan lain-lain. Di dalam ini akan
dan DNA mitokondria
huhungannya dengan genetik
dan masalah studi populasi.
dalam dan kali ini
diungkapkan mengenai mitokondria
tumbuhan dapat lebih dalam dengan
pada yang disitasi.
ORCANISASI MOLEKULER CENOM
Mitokondria adalah yang di
dalam aerobik pada eukariot.
kondria DNA tersendiri dengan ukuran yang susunannya berbeda dengan D N A inti.
satu sampai mitokondria. DNA mitokondria DNA ganda yang berhentuk
Ukuran dan sekuen DNA dari genom dria telah diungkapkan, misalnya pada mencit (Bihh
manusia (Anderson dan sapi
(Anderson
Genorn. Ukuran ganom mitokondria berkisar dari 14,000- 39,000 hasa I ).
Terlihat bahwa ukuran genom mitokondria minimum untuk berfungsinya mitokondria
adalah 14,000 Ukuran genom mitokondria relatif kecil dibandingkan dengan ukuran genom intinya. Karena ukuran genomnya yang relatif
ini genom ini dapat
ruh sebagai suatu unit tersendiri. G e n o m mitokondria tumbuhan jauh lebih besar dan bahkan sampai
kali ukuran genom mitokondria 117-2.400 (Newton, 1988; Narayanan 1993).
dari DNA mitokondria kan sitoplasma dari intinya dengan
sehingga hanya didapatkan rnitokondria. Untuk kontaminasi dari DNA inti dilakukan pznamhahan
mitokondria dilisis. Mitokondria
hut dilisis (misalnya
dan proteinnya dengan dan
kemudian dengan
