IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI
Mycobacterium tuberculosis
DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP
RIFAMPISIN
SKRIPSI
Untuk memenuhi sebagian persyaratan Mencapai Derajat Sarjana S-1
Diajukan oleh: Vinie Triana
1008010100
Kepada Fakultas Farmasi
Universitas Muhammadiyah Purwokerto Purwokerto
RIWAYAT HIDUP
Nama : VINIE TRIANA
Tempat Tanggal Lahir : Jatibarang, 12 september 1992
Nama Ayah : Darmansyah
Nama Ibu : Sunani
Riwayat Pendidikan
SD NEGERI 1 PILANGSARI Tahun 1998-2004
SMP NEGERI 1 JATIBARANG Tahun 2004-2007
SMK FARMASI INDRAMAYU Tahun 2007-2010
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO Tahun 2010-2014
Riwayat Kegiatan Ilmiah yang pernah diikuti :
1. Seminar Nasional “Pharmacist For Solving Hypertension With Herbal Medicine” Program Profesi Apoteker Angkatan XIII Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 22 Januari 2011. 2. Seminar Nasional Kefarmasian “Self Management in Asthma Patients”
Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21 Maret 2013.
Riwayat Kegiatan Pengembangan Diri yang Dilakukan :
1. Anggota BEM Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2011-2012.
2. Anggota ISMAFARSI Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2011-2012.
3. Anggota PIKMA YOUTH CENTER Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa jabatan 2010-2012 dan 2012-2014.
4. Panitia Seminar Nasional “ Belajar bersama tentang seksualitas untuk Tanggal 10 Mei 2012.
5. Panitia Talk Show “Pergaulan Bebas sebagai investasi menuju
HIV/AIDS” pada tanggal 2 Desember 2012.
6. Panitia Training Of Trainer “Soft Skills Education, Information And
MOTTO
“
Sesungguhnya
sesudah kesulitan
ituada
kemudahan
”
( terjemahan Q.S. Al-Insyirah : 6 )
Tak ada
sesuatupun
yang dapat membuatmu menyerah!
Kecuali dirimu
yang mengizinkannya!
( buku “selalu ada harapan” )
Detik Sekarang
bukanlah waktunya untuk menyesali apa
yang telah terjadi,tetapi waktunya
mencari solusi
untuk kedepannya yang
lebih baik
PERSEMBAHAN
Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT yang telah memberi kenikmatan yang sungguh luar biasa. Penulis persembahkan karya ini untuk: 1. Bapak Darmansyah dan Ibu Sunani, terima kasih atas segala doa dan
dukungan yang telah diberikan serta kasih sayang yang tulus kepadaku. 2. Kakakku tersayang (Sugiono, Yuli Darmansyah, Novi Anggraeni) dan
Adikku tersayang (Lintang Risgiyani), serta kedua keponakanku yang cantik (Ayunda Rahani dan Syahla Aulia F) yang selalu membuatku tersenyum dan penuh semangat, terimakasih atas doa dan dukungannya.
3. Keluarga besarku yang tidak dapat disebutkan satu per satu, terima kasih atas doa dan dukungannya.
4. Untuk Supporterku (Om Raya) yang selalu membuatku tersenyum dan bersemangat kembali disaat ingin menyerah, terimakasih atas doa dan dukungannya yang yakin bahwa Vinie pasti mampu menyelesaikan tugas akhir ini.
5. Teman terdekatku (Mba Agustina Olivia Nezar, Mba Siti komerawati, Mba Rulfita Oka, Ari Ardiansyah, Adi Wibowo, Helmi Al’afghani, Mba Kheriyah, Ika Arifah D, Diah Nurlaily) terima kasih atas persahabatannya selama ini, yang tak lupa memberikan semangat dan doanya.
6. Teman- teman di Fajar kozt yang selalu membuatku tersenyum.
KATA PENGANTAR
Syukur alhamdulillah penulis panjatkan kepada Allah SWT, yang telah melimpahkan rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi yang berjudul “
IDENTIFIKASI
DAN
RESISTENSI
Mycobacterium
tuberculosis
DARI
SPUTUM
PASIEN
TUBERKULOSIS TERHADAP RIFAMPISIN.
Penulis menyadari bahwa penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna karena keterbatasan, kemampuan dan pengetahuan, namun berkat bimbingan, saran, dorongan dan bantuan dari berbagai pihak, akhirnya penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Oleh karena itu, pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih yang setulus- tulusnya kepada:
1. Darmansyah dan Sunani, sebagai kedua orang tua yang selalu memberikan dukungan dan motivasinya hingga selesainya skripsi ini.
2. Drs. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H. Rektor Universitas Muhammadiyah Purwokerto.
3. Dr. Nunuk Aries Nurulita.,M.Si,Apt. Sebagai Dekan Fakultas Farmasi dan Dosen pembimbing I, yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan serta motivasi dalam penulisan skripsi ini.
4. Githa Fungie Galistiani.,M.Sc.,Apt. Sebagai pembimbing II yang dengan sabar membimbing dan mengarahkan serta memotivasi penulis dalam menyelesaikan skripsi ini.
5. Dosen penguji skripsi Program Studi Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto.
7. Seluruh laboran dan karyawan TU Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah memberikan arahan dan bimbingannya.
8. Semua pihak yang telah membantu terselesaikannya skripsi ini.
Peneliti
menyadaribahwaskripsiinimasihjauhdarisempurnakarenafaktorketerbatasan yang adadalamdiripenulisolehsebabitupenulismohon saran dankritik yangmembangundansemogaskripsiinidapatbermanfaatbagisemuapihak.Terim akasih.
Purwokerto, 10 September 2014
DAFTAR ISI
BAB I PENDAHULUAN A.Latar Belakang ... 1
B.Rumusan Masalah ... 2
BAB II TINJAUAN PUSTAKA
BAB III METODEPENELITIAN A. Jenis dan Rancangan Penelitian ... 15
B. Definisi Variabel Operasional ... 15
C. Waktu dan tempat penelitian ... 16
D. Alat dan Bahan ... 16
E. Populasi dan Sampel ... 16
F. Cara Penelitian ... 18
G. Analisis Data ... 20
BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN A.Pengambilan sampel ... 21
B.Identifikasi dan Resistensi dengan GeneXpert MTB/RIF ... 22
C.Hasil deteksi M.tuberculosis dan Resistensinya ... 28
D.Keterbatasan penelitian ... 31
B. Saran ... 32 DAFTAR PUSTAKA ... xviii
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1.Faktor Risiko Kejadian TB dan riwayat alamiah
pasien TB yang tidak diobati ... 6 Gambar 2.Tahapan perkembangan TB resistensi OAT ... 10 Gambar 3. Gen rpoB menentukan regio resistensi rifampisin; Mutasi
gen rpoB terjadi pada probe B, probe D,dan probe E ... 24 Gambar 4a. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B,
Probe D,dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah MTB sangat rendah, rendah, sedang, dan tinggi, Tidak terjadi resistensi ... 25 Gambar 4b. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B, Probe D,
dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah MTB
DAFTAR TABEL
Halaman Tabel 1. Sistem klasifikasi Tuberkulosis dalam U.S.Departement of
Health and human services ... 7
Tabel 2. Hasil MTB dan jumlah nilai Ct ... 20
Tabel 3. Karakteristik subjek penelitian ... 21
Tabel 4. Hasil identifikasi M. tuberculosis pasien Tuberkulosis ... 28
Tabel 5.Informasi gen ropBmenentukan regio resistensi rifampisin. ... 29
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman Lampiran 1. Alur Penelitian. ... xxiii Lampiran 2. Data pasien Tuberkulosis paru RSUD Cilacap ... xxiv Lampiran 3. Data Hasil Pemeriksaan Identifikasi dan Resistensi ... xxv Lampiran4. Hasil Amplifikasi real-time PCR Genexpert MTB/RIF
