STUDI AKTIVITAS -L-ARABINOFURANOSIDASE DARI
REKOMBINAN Saccharomyces cerevisiae YANG BERASAL DARI STOK GLISEROL DALAM MEDIA YANG MENGANDUNG LAKTOSA
SKRIPSI
Oleh : ITA ZUHRIYAH NIM. 1208105025
JURUSAN KIMIA
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS UDAYANA
vi
KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT yang telah
melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya, sehingga akhirnya penulis dapat
menyelesaikan skripsi dengan judul “Studi Aktivitas -L-arabinofuranosidase
dari Rekombinan Saccharomyces cerevisiae yang Berasal dari Stok Gliserol dalam Media yang Mengandung Laktosa” dengan baik dan lancar. Skripsi ini sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar di Jurusan Kimia, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Udayana.
Penulisan dan penyusunan skripsi ini mendapatkan bantuan dan bimbingan
dari berbagai pihak. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih yang
sebesar-besarnya kepada :
1. Bapak Dr. I Nengah Wirajana, M.Si., selaku pembimbing I yang telah
memberikan bimbingan dan dukungan dalam penyusunan skripsi ini dan juga
bantuan biaya penelitian.
2. Ibu Dr. Dra. Ni Made Suaniti, M.Si., selaku pembimbing II yang telah
memberikan bimbingan dan dukungan moral dalam penelitian dan
penyusunan skripsi ini.
3. Seluruh staf dosen dan pegawai di Jurusan Kimia FMIPA Universitas
Udayana yang telah memberikan bantuan kepada penulis untuk
menyelesaiakan skripsi ini.
4. Bapak Abdul Muchid dan Ibu Khusniyatin selaku orang tua serta semua
kakak penulis yang telah memberi doa, semangat, dukungan, dan bantuan
vii
5. Seluruh teman-teman angkatan 2012 dan teman-teman kost, terimakasih atas
segala bantuan dan dukungan yang telah diberikan pada penulis.
Akhir kata, semoga Allah SWT membalas setiap kebaikan dengan
kebaikan yang jauh lebih besar kepada semua pihak yang telah membantu penulis
dalam menyelesaikan skripsi ini. Penulis menyadari penyusunan skripsi ini masih
jauh dari sempurna, namun penulis berharap semoga skripsi ini dapat memberikan
manfaat bagi semua pembaca dan pihak yang membutuhkan.
Bukit Jimbaran, 17 Juni 2016
viii
DAFTAR SINGKATAN DAN ISTILAH ... xiv
BAB I PENDAHULUAN ... 1
2.4 Pertumbuhan Mikroorganisme ... 13
ix
3.4.1 Prosedur Penelitian Secara Umum ... 23
3.4.2 Pembuatan Media ... 23
3.4.3 Peremajaan ragi S. cerevisiae ... 24
3.4.4 Pembuatan Kurva Pertumbuhan ragi S. cerevisiae .... 24
3.4.5 Penentuan Aktivitas Enzim ... 24
3.5 Analisis Data ... 26
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ... 27
4.1 Kemampuan Rekombinan S.cerevisiae Tumbuh dalam Media YPL ... 27
4.2 Aktivitas α-L-arabinofuranosidase dari rekombinan S.cerevisiae BJ1824/pYHM1-Af dalam Media YPL ... 34
BAB V SIMPULAN DAN SARAN ... 42
5.1 Simpulan ... 42
x
DAFTAR PUSTAKA ... 43
xi
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 3.1 Variasi volume larutan blanko, standar, kontrol, sampel ... 26
Tabel 4.1 Hasil uji aktivitas AbfA pada media YPG ... 36
xii
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 2.1 Model Struktur dari Enzim AbfA yang Menghidrolisis
Polisakarida ... 9
Gambar 2.2 Siklus Hidup S. cerevisiae... 13
Gambar 2.3 Kurva Pertumbuhan Mikroorganisme ... 14
Gambar 2.4 Struktur -Laktosa dan β-Laktosa ... 20
Gambar 2.5 Reaksi Hidrolisis dari Laktosa ... 20
Gambar 4.1 Koloni tunggal rekombinan S. cerevisiae BJ1824/pYHM1-Af, Gambar A Tumbuh di Media YPD ; Gambar B Tumbuh di Media YNBD ... 29
Gambar 4.2 Rekombinan S. cerevisiae BJ1824/pYHM1-Af yang ditumbuhkan pada Media Padat YPL ... 30
Gambar 4.3 Reaksi Hidrolisis dari Laktosa ... 31
Gambar 4.4 Rekombinan S. cerevisiae BJ1824/pYHM1-Af yang ditumbuhkan pada Media Cair YPD, YPDL, dan YPL ... 32
Gambar 4.5 Kurva Pertumbuhan Media YPL dan YPDL... 33
Gambar 4.6 Reaksi Reduksi DNS ... 37
Gambar 4.7 Peta Plasmid pYHM1-Af yang ada di Rekombinan S.cerevisae BJ1824/pYHM1-Af ... 38
Gambar 4.8 Model Regulasi Transkripsi Promotor GAL1 dalam pYHM1-Af ... 39
xiii
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Prosedur Penelitian Secara Umum ... 47
Lampiran 2. Peremajaan Ragi S. cerevisiae ... 48
Lampiran 3. Skema Pembuatan Kurva Pertumbuhan S. cerevisiae ... 49
Lampiran 4. Skema Penentuan Aktivitas Enzim ... 50
Lampiran 5. Pembuatan Media Pertumbuhan Ragi ... 51
Lampiran 6. Pembuatan Larutan... 54
Lampiran 7. Perhitungan Kurva Standar Glukosa ... 56
Lampiran 8. Perhitungan Aktivitas Enzim ... 61
Lampiran 9. Perhitungan Standar Deviasi Aktivitas Enzim Rata-rata ... 66
xiv
DAFTAR SINGKATAN DAN ISTILAH
AbfA = Enzim α-L-Arabinofuranosidase
abfA = gen α-L-Arabinofuranosidase
DNS = Dinitrosalisilat
GRAS = Generally Recognized As Safe
OD = optical density
rpm = rotation per minute (putaran per menit)
YNBD = yeast nitrogen base without amino acid dan dextrosa
YPD = yeast extract, pepton, dan dextrosa
YPG = yeast extract, pepton, dan galaktosa
