B1J009090 14.

LAMPIRAN

Lampiran 1. Profil RAPD Jabon Putih menggunakan primer OPA 4

L 1 2 3 4 5 6 7 8 9 L

500 bp 1000 bp

600 bp 700 bp

800 bp 900 bp

Lampiran 2. Profil RAPD Jabon Putih dan Jabon Merah menggunakan primer OPA 14

1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

L L

500 bp 500 bp

1000 bp 1000 bp

Jabon Putih Jabon Merah

600 bp

Lampiran 3. Profil RAPD Jabon Merah menggunakan primer OPA 16

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 L

500 bp 1000 bp L

Lampiran 4. Profil RAPD Jabon Putih dan Jabon Merah menggunakan primer OPQ 14

1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 L

500 bp 1000 bp

Jabon Putih Jabon Merah

Lampiran 5. Profil RAPD Jabon Putih dan Jabon Merah menggunakan primer OPQ 15

1 2 3 4 5 6 7 8 9 _{1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20}

L _L

500 bp 500 bp

1000 bp

1000 bp

Jabon Putih Jabon Merah

Lampiran 6. Profil RAPD Jabon Putih dan Jabon Merah menggunakan primer OPQ 16

1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

L L

500 bp 1000 bp

500 bp 1000 bp

Jabon Putih Jabon Merah

Lokus N na ne h

Rata-rata 9 1,62 1,35 0,21

Standar deviasi

0,50 0,36 0,19

Lampiran 8. Keragaman genetik dalam populasi Jabon Merah

Lokus N na ne h

A12/230 20 1 1,00 0,00

A12/250 20 1 1,00 0,00

A12/350 20 1 1,00 0,00

A12/390 20 1 1,00 0,00

A12/420 20 1 1,00 0,00

A12/450 20 1 1,00 0,00

A12/500 20 1 1,00 0,00

A12/690 20 1 1,00 0,00

A12/710 20 1 1,00 0,00

A12/850 20 1 1,00 0,00

A12/900 20 1 1,00 0,00

A14/350 20 1 1,00 0,00

A14/390 20 1 1,00 0,00

A14/400 20 1 1,00 0,00

A14/420 20 2 1,54 0,35

A14/500 20 1 1,00 0,00

A16/350 20 2 1,45 0,31

A16/390 20 2 1,79 0,44

A16/450 20 2 1,87 0,46

A16/490 20 2 1,76 0,43

A16/510 20 2 1,11 0,10

A16/620 20 2 1,53 0,35

A16/700 20 2 1,76 0,43

A16/800 20 1 1,00 0,00

A16/990 20 1 1,00 0,00

Q14/360 20 2 1,93 0,48

Q14/400 20 2 1,11 0,10

Lokus N na ne h

Q14/490 20 2 1,76 0,43

Q14/600 20 1 1,00 0,00

Q14/700 20 1 1,00 0,00

Q14/800 20 2 1,53 0,35

Q14/890 20 2 1,53 0,35

Q14/990 20 2 2,00 0,50

Q15/500 20 1 1,00 0,00

Q15/580 20 1 1,00 0,00

Q15/640 20 2 1,23 0,19

Q15/720 20 2 1,98 0,49

Q16/200 20 1 1,00 0,00

Q16/300 20 1 1,00 0,00

Q16/350 20 1 1,00 0,00

Q16/420 20 2 1,76 0,43

Q16/500 20 2 1,53 0,35

Q16/630 20 1 1,00 0,00

Q16/760 20 1 1,00 0,00

Rata-rata 20 1,42 1,24 0,15

Standar deviasi 0,50 0,34 0,19

Keterangan: N: jumlah sampel na: nilai pengamatan alel

ne: nilai efektifitas alel menurut Kimura dan Crow (1964) h : heterosigositas berdasarkan Nei (1972).

Lampiran 9. Ukuran DNA

Ladder

Lampiran 10. Spesifikasi Alat dan bahan

a. Spesifikasi Alat

No. Nama Alat

Spesifikasi

Mini Bead beater-8

Menghaluskan bahan

Lab Genmol BBPBPTH

2. Spatula Oxone Mencampur bahan Lab Genmol

BBPBPTH 3. Gelas ukur Pyrex Mengukur volume

Larutan

Lab Genmol BBPBPTH 4. Labu

Erlenmeyer

Pyrex Wadah larutan Lab Genmol

BBPBPTH 5. Timbangan

Analitik

Mettle Toledo Menimbang bahan Dikalibrasi tgl 27 maret ’08 o/ E. T armidji

Lab Genmol BBPBPTH

6. Refrigerator Hoshizaki HRF 180 k

Menyimpan larutan Spesification : cabinate air temperature refrigerator 50_C

or less, freezer -200_{C at 30}0_C ambient temperature. Date received : 1992

Melarutkan agarosa Made in England

Date received : 23.02.95 Provider : JICA

Lab Genmol BBPBPTH

8. Rak tabung Eppendorf Menyimpan tabung Lab Genmol

BBPBPTH

9. Amplop Kiky Tempat sampel Lab Genmol

BBPBPTH 10. Sarung

tangan

SAFE EX Melindungi tangan Lab Genmol

BBPBPTH

11. Kertas tisu Nice Membersihkan Lab Genmol

BBPBPTH

12. Masker Sensi mask Mencegah Lab Genmol

No. Nama Alat

13. Silica gel Merck Menjaga sampel daun tetap kering

Lab Genmol BBPBPTH 14. Pippete u/

ekstraksi

Gilson (pipet man) 5000 µl

Mengambil larutan Lab Genmol

BBPBPTH 15. Pipette Eppendorf

200-1000 µl

Mengambil larutan Lab Genmol

BBPBPTH 16. Pipette Eppendorf 50-250

µl

Mengambil larutan Date recevied : 26.06.95 Provider : dep of forestry

17. Pipette Eppendorf 2-20 µl

Mengambil larutan dengan volume kecil

Date recevied : 26.06.95 Provider : dep of forestry

18. Pipette Eppendorf 0,5-10 µl system) 0,5-10 µl (8 well)

Eppendorf Tempat larutan Lab Genmol

BBPBPTH 21. 96-well plate Pure MβP PCR Lab Genmol

BBPBPTH 22. Vortex Vortex Genie-2

G-560

Menghomogenkan Bahan

Made in USA Lab Genmol BBPBPTH

23. Evaporator Hybaid Menginkubasi Lab Genmol

BBPBPTH 24. Aspirator Eyela A-3S Menyedot larutan Lab Genmol

BBPBPTH 25. Nano Vue GE Healthcare Mengukur

transmitan

Amplifikasi DNA 96 well Parta :

Elektroforesis Lab Genmol

BBPBPTH 28. Micro mixer TAITEC E-36 Menghomogenkan Lab Genmol

No. Nama Alat

PCR mix BBPBPTH

29. Fotodyne Image Analyzer

BIO-RAD Gel DocTM_EQ

Visualisasi DNA Lab Genmol

BBPBPTH

30. Monitor Samsung Sync master 171 N

Melihat hasil

31. Keyboard

Apple Pro

keyboard

Mengetik Lab Genmol

BBPBPTH

32. Printer

Mitsubishi

Mencetak hasil Lab Genmol

BBPBPTH

33. CPU

Apple Power

mac G4

Menyimpan data Lab Genmol

BBPBPTH 34. Sentrifuge Eppendorf 5417 R Sentrifugasi Germany Lab Genmol

BBPBPTH 35. Centrifuge

(high speed micro centrifuge)

Tomy

Mex-150

Sentrifugasi microtube

Made in Japan Lab Genmol BBPBPTH

Sony Dokumentasi Milik sendiri

38. PC Aspire one Analisis data Lab Genmol

BBPBPTH 39. Flashdisk Kingstone Menyimpan data Milik sendiri

40. Gunting SHIN-EI Memotong sampel Lab Genmol

BBPBPTH 41. Small rotator Taitec rotator

RT-50

Menghomogenkan Lab Genmol

BBPBPTH

b. Spesifikasi Bahan

No. Nama Bahan Spesifikasi

(Merk/Type/Katalog) Fungsi

Tempat

1. Daun jabon - Sebagai sampel Koleksi

persemaian

Sigma Sebagai buffer

4. 5M NaCl Sigma Meningkatkan

No. Nama Bahan Spesifikasi

(Merk/Type/Katalog) Fungsi

Tempat

kelarutan polisakarida

5. EDTA Sigma Mencegah aktivasi

reaksi logam

6. β-Mercaptoetanol - Mencegah kerja

enzim polifenol oksidase

7. CTAB Sigma (10%) Melisis membran sel

8. Chloroform Sigma Memisahkan

kontaminan

9. NaOAc - Mengendapkan

DNA

10. Isopropanol - Presipitasi DNA

11. Ethanol Merck (70% & 100%) Memurnikan DNA

12. NaI - Menghilangkan

kontaminan

13. Silica Sigma Mengikat DNA

14. New Wash - Mencuci pellet DNA

15. Kapa Taq Extra Buffer

5x Sebagai buffer

16. MgCl2 - Meningkatkan

konsentrasi ion Mg

17. dNTPs Promega dNTP aktif

18. Kapa Taq Extra HotStart

Applied Biosystem Taq DNA polymerase 19. TBE Sigma (1X & 20X) Sebagai buffer 20. Agarose Invitrogen (1,2 %) Sebagai media

21. EtBr - Mengikat DNA

untuk menangkap sinar UV

22. Gel Loading Dye Gl3& Gl6 Sebagai

pewarna/penanda laju DNA dan pemberat saat elektroforesis 23. DNA ladder Vivantis (100 bp) Sebagai marker 24. Primer RAPD Proligo 10 pb Sebagai primer

BIODATA PENULIS

Sukenda, lahir di Indramayu, 14 Agustus 1990 anak keempat

dari ayah Sarta dan Ibu Salimah. Riwayat pendidikan dari SD

N 1 Pabean Ilir, lulus pada tahun 2003. SMP N 2 Indramayu

Kabupaten Indramayu, lulus pada tahun 2006. SMA N 2

Indramayu, lulus pada tahun 2009, kemudian melanjutkan

studidi Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman Purwokerto tahun

angkatan 2009. Pengalaman organisasi antara lain tergabung dalam kepengurusan

Unit Kegiatan Mahasiswa Islam (UKMI) Fakultas Biologi selama dua tahun.

Pengalaman dalam bidang akademik yaitu tergabung dalam Asisten Mahasiswa

mata kuliah Biologi Gulma tahun 2013. Prestasi yang pernah diraih yaitu Juara 1

Volley ball tahun 2010-2013

Turnamen “Biologi Champion League”, Juara 2

Futsal tahun 2013 Turnamen “Biologi Champion League”.

Pengalaman kegiatan

pengembangan diri yang pernah diikuti antara lain peserta kegiatan Orientasi

Pengenalan Kampus (OSPEK) tahun 2009. Peserta kuliah umum tentang “

Taxonomy in Changing World” oleh Bayu Adjie, Ph.D tahun 2010.

Purwokerto,

Desember 2014

Penulis