MANUAL
VIRTUAL STATISTICS LABORATORY
I Made Tirta et al
PUPTN 2016
IDENTITAS
Ketua :
Prof. Drs. I Made Tirta, MSc. Ph.D (NIDN: 0020125907)
Anggota : 1. Ir Martinus H. Pandutama, M.Sc., Ph.D
(NIDN: 0026035402)
2. Drs. Budi Lestari, PGDiSc. M.Si (NIDN: 0025106308)
3. Diah Anggraini, S.Si, M.Si (NIDN:0016028201)
Latar Belakang
Penelitian dalam bidang biosains masih sangat membutuhkan metode dan program statistika sebagai alat bantu dalam analisis data.
Saat ini penggunaan piranti lunak statistika di Universitas Jember dan di Indonesia pada
umumnya, masih didominasi oleh beberapa piranti lunak berbayar seperti SPSS, Minitab, SAS,
dikarenakan kemudahan cara penggunaannya (berbasis GUI/menu).
MANUAL VSL
Latar Belakang
Namun sebagian besar piranti lunak tersebut tidak memiliki ijin resmi dikarenakan harga yang berijin resmi masih relatif mahal.
Di sisi lain tersedia piranti lunak statistika berbasis open source R yang gratis, tidak membutuhkan ijin resmi, berkembang pesat dan fleksibel untuk disesuaikan dengan kebutuhan.
Namun piranti lunak ini tidak banyak diminati karena penggunaannya yang tidak mudah (berbasis skrip).
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI
Wallace et al. (2012) Methodologists (usually statisticians) tend to implement advanced methods in statistical programming languages..., and perhaps most commonly now, in R.
Non-technical researchers, meanwhile, are often deterred by programming and rely on available graphical user interface (GUI) driven tools. Such specialized software is generally easy to use, but usually lags withrespect to the statistical methods available.
MANUAL VSL
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI
Wallace et al. (2012) ... The result is that practitioners continue to use inappropriate or suboptimal methods due to their being restricted to what is made available via GUIs. The problem is compounded by the fact that statistical programmers generally do not implement custom GUIs for new methods they develop.
GAP ANTARA STATISTISI & PRAKTISI
Pure Theoritical Statistician
• Penghasil Teori
• Pengisi Journal of Probability and Statistics
Good Stat + Good Programer
• Mentransform teori ke Program Komputer
• Pengisi JSS, R Journal
Sosialisasi Metode Baru Metode mudah dipahami
Mudah diakses/
dieksekusi R
Peneliti Lapangan
• Aplikasi Statistika
• Kasus Real, Lapangan
Belum Implementable
Limited Access UNFRIENDLY
More Accessable MORE FRIENDLY
Bridging
FILLING THE GAP MANUAL VSL
POPULARITAS R (Muenchen, 2015)
Handbook Statistika Online
E-Text Book, StatSoft
(http://www.statsoft.com/textbook) yang mencakup teori statistika secara umum (dan mengacu pada paket StatSoft), tetapi tidak menggunakan notasi matematika yang baik, dan tidak dilengkapi dengan ilustrasi real.
MANUAL VSL
IDE BESAR VIRTUAL STATS LAB
WEB YANG MEMUAT
E-modul/E-Tutorial (Dengan contoh riil dan dinamik) &
dilengkapi Glosarium
E-Praktikum (Simulasi)
Analisis Data Online.
Tujuan bukan sekedar “inform to others”, tapi transfer knowledge and experience to others khususnya dalam mengaplikasikan metode dengan lebih mudah
STARTING POINT
Fokus di bidang Biostatistika (khususnya yang mendukung penelitian kuantitatif di bidang lingkungan, seperti Regresi, Biodiversitas, Multivariat)
Pada penelitian ini, lebih fokus lagi pada bidang Model Statistika (Regresi)
MANUAL VSL
KEUNGGULAN
Desain: lebih cepat, tidak perlu kompilasi seperti Latex, secara umum lebih sederhana dari GUI PC
Pengguna: tidak perlu registrasi, tidak diperlukan penguasaan skrip R, hanya perlu penguasaan konsep, teori statistika. Cocok untuk pembelajar atau pengguna yang tidak cukup/perlu
keterampilan pemrograman
Dapat sekaligus belajar teori dan praktek analisis dengan data yang fleksibel (luaran dinamis)
Ikut menaikkan rate webometrik
PROTOTIFE VIRTUAL LAB
PonStat (Pondok Statistik) Virtual Stats Lab
E-Module/ e- Tutorial
Metode Stats Model Stats/
REGRESI Multivariat*
Glosarium
Analisis Data Online (SOLARS++)
Dasar &
Menengah (SOLAR-S)
MODEL STATS
MULTIVARIAT*
Latex Board
MANUAL VSL
CAKUPAN BIDANG
REGRESI/
MODELING
ROBUS LINIER
NORMAL GLM
ORDINAL GAMMA
(Kontinu Positif)
POISSON (Cacahan)
LOGIT/PROBIT (Biner)
ADITIF
GLM+NS GAM
GAMLSS
REPEATED
GEE
GEE NOMINAL
KARAKTERISTIK E-TUTORIAL
Bisa Memilih/input Data
Memuat uraian materi yang dilengkapi dengan contoh.
paparan teorinya menggunakan notasi dan simbol-simbol matematika secara real dan benar
contoh yang dibahas merupakan contoh yang dinamik dan interaktif
paparan analisis akan menyesuaikan dengan data yang dipilih
Estimasi, Uji inferensi (p-Val), Ukuran kecocokan (AIC/BIC)
Dapat berfungsi sebagai file/dokumen penolong (help doc)
MANUAL VSL
KARAKTERISTIK ANALISIS DATA (SOLARS++)
Mudah Input Data
Eksplorasi Data (Numerik dan Grafik)
Pemeriksaan Asumsi (Numerik dan Grafik)
Ada Hasil Estimasi
Ada Uji Signifikansi
Ada Pemeriksaan Goodness of Fit
Ada Seleksi Variabel
Ada Visualisasi Grafik
CONTOH TAMPILAN
MANUAL VSL
TAMPILAN WEB INDUK (VSL)
http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/
DAFTAR TOPIK (SEMENTARA)
MANUAL VSL
http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/indextc.html
KUNJUNGAN
AWAL AGUST
2016
Regresi (Model Statistika) dengan Respon univariat/ saling bebas/ independen
Ada banyak variabel bebas, tetapi hanya 1 variabel terikat/ respon
LM/RLM, GLM, GLM+NS, GAM*, GAMLSS*
MSI
MANUAL VSL
http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/ /RProg/MSI/
MENU UTAMA
INPUT DATA
MANUAL VSL
INPUT DATA
Bisa memilih data yang sudah ada pada datanbase (online)
Bisa mengimpor data sendiri (dalam format csv)
Setiap kali melakukan penggantian data, laman web harus di-refresh !
EKSPLORASI DATA (UMUM)
MANUAL VSL
EKSPLORASI DATA UMUM
Dapat melihat/menghitung/ menampilkan Numerik:
Ringkasan Data
Matriks korelasi (variabel numerik) Grafik:
Matriks Diagram Korelasi
Matriks Diagram Pencar
EKSPLORASI SMOOTHER
MANUAL VSL
EKSPLORASI SMOOTHER
Eksplorasi Smoother (grafik) untuk nonlinear dengan 2 variabel
LM/RLM
GLM
GLM+NS
GAM
GAMLSS
FORMULA MODEL
MANUAL VSL
FORMULA MODEL
Dibuat tersendiri untuk menghemat penggunaan
simbol dalam program, sehingga 1 formula berlaku untuk beberapa jenis regresi (jika mau
membandingkan).
Untuk menentukan, variabel bebas dan variabel terikat
Untuk menentukan distribusi dan link
LUARAN/OUTPOT
Untuk jens regresi LM, GLM, GLM+NS, RLM, Muntinom Meliputi
Estimasi parameter (+Smoother)
Nilai p-value
Ukuran GOF (Goodness of Fit)
Beberapa tersedia Regresi bertatar (stepwise)
Grafik Diagram Pencar/ Diagnostik
Luaran khusus yang diperlukan
MANUAL VSL
LUARAN LM
LUARAN (PLOT LM)
MANUAL VSL
LUARAN (Plot, NonParametrik)
Cara Menyimpan Hasil Grafik
MANUAL VSL
Cara Menyimpan Hasil Teks
TUTORIAL TERKAIT (HELP DOC)
Hasil Pendukung (E-Tutorial) terkait
Tutorial GLM(http://statslab- rshiny.fmipa.unej.ac.id/RDoc/GLM/)
Tutorial Logistik Multinom untuk respon nominal saling bebas (http://statslab-rshiny.fmipa.unej.ac.id/JORS/logmut)
MANUAL VSL
PERBANDINGAN DENGAN
RCommander (Windows)
Model Statistika dengan respon dependen/
multi respon (respon yang diukur berulang, atau gabungan beberapa variabel)
MSD
MANUAL VSL
GEE 1
GEE 1
Pilihan respon (Y) dan prediktor (X) untuk mean
Pilihan identitas yang menunjukkan respon 1 kesatuan yang berulang (id)
Jenis korelasi antar respon yang beriuang (CovStr)
Uniform (exchangeable)
AR1
Independen (=GLM)
Jenis Distribusi dan Link
MANUAL VSL
GEE 2
GEE 2
GEE1
+ Pilihan prediktor (X) untuk dispersi (konstan=GEE1)
+ Link korelasi (identitas=GEE1)
MANUAL VSL
GUI versi windows yang populer adalah Rcommander (Rcmdr)
Referensi awal:
Presentasi dan Analisis Data dengan R
GUI-WINDOWS
RCmdr
MANUAL VSL
RCmdr
Kontribusi sebagai penerjemah ke Bhs Indonesia
Kontak RCmdr developer
MANUAL VSL
GUI-WEB VS GUI WINDOWS
No Modeling Web Virtual GUI-Rcmdr
1 LM √ √
2 GLM √ √
3 GAM * √√√√ ××××
4 GAMLSS * √√√√ ××××
5 RLM √√√√ ××××
6 GLM+NS √√√√ ××××
7 GEE √√√√ ××××
8 Logistik Multinomial √ √
9 Tutorial/ Teori √√√√ ××××
10 User perlu Download & Instal ×××× √√√√
11 Bergantung jaringan internet √√√√ ××××
MANUAL VSL
