perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
DETEKSI GEN TIMP-2 PADA KARSINOMA SEL SKUAMOSA LIDAH DARI SPESIMEN BLOK PARAFIN
SKRIPSI
Untuk Memenuhi Persyaratan
Memperoleh Gelar Sarjana Kedokteran
MUHAMMAD RAMA ANSHORIE
G0010117
FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET
commit to user ii
PENGESAHAN SKRIPSI
Skripsi dengan judul: Deteksi Gen TIMP-2 Pada Karsinoma Sel Skuamosa
Lidah dari Spesimen Blok Parafin
Muhammad Rama Anshorie, NIM: G.0010117, Tahun: 2013
Telah diuji dan sudah disahkan di hadapan Dewan Penguji Skripsi Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret Surakarta
Pada Hari...., Tanggal ... 2013
Pembimbing Utama
Nama : Dr. Pradipto Subiyantoro,drg.,SpBM
NIP :19570629 198403 1 003 (...)
Pembimbing Pendamping
Nama : Vita Nirmala A.,drg.,SpPros.,SpKG
NIP : 19660827 199403 2 003 (...)
Penguji Utama
Nama : Dr. Risya Cilmiaty AR,drg.,M.Si.,SpKG
NIP : 19580710 198610 2 001 (...)
Penguji Pendamping
Nama : Widia Susanti,drg.,M.Kes
NIP : 19690216 200401 2 002 (...)
Surakarta, ………..
Ketua Tim Skripsi Dekan FK UNS
Ari Natalia Probandari, dr., MPH, PhD
NIP 197512212005012001
Prof. Dr. Zainal Arifin Adnan, dr., SpPD-KR-FINASIM
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user iii
PERNYATAAN
Dengan ini menyatakan bahwa dalam skripsi ini tidak terdapat karya yang pernah
diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu perguruan tinggi dan
sepanjang pengetahuan penulis juga tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah
ditulis atau diterbitkan oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam
naskah dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Surakarta, 7 Oktober 2013
Muhammad Rama Anshorie
commit to user
ABSTRAK
Muhammad Rama Anshorie, G0010117, 2013, Deteksi Gen Timp-2 pada
Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin. Skripsi, Fakultas Kedokteran, Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
Latar belakang: Kanker lidah merupakan kanker yang banyak dijumpai di
seluruh dunia. Pengobatan dan prognosis dari kanker ini sangat bagus tetapi tingkat metastasisnya cukup tinggi. Banyak kasus di jumpai telah mengalami metastasis. Penelitian ini bertujuan untuk melihat apakah adanya gen TIMP-2 yang berfungsi sebagai inhibitor factor metastasis sel kanker pada sampel Blok Parafin
Metode : Produk DNA yang digunakan adalah hasil isolasi DNA dari 14 sampel
Blok Parafin. Kemudian produk diamplifikasi mengunakan PCR dengan primer sebagai cetakan. Analisis sampel dengan elektroforesis untuk mengetahui Gen TIMP-2 pada ke-14 sampel tersebut.
Hasil : Visualisasi gen TIMP-2 pada agarose menunjukkan hasil yang negatif
pada saat elektroforesis pada masing-masing sampel.
Kesimpulan : Gen TIMP-2 tidak tervisualisasi pada gel agarose, menunjukkan
bahwa tidak terdeteksinya gen TIMP-2 pada sampel.
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
ABSTRACT
Muhammad Rama Anshorie, G0010117, 2013, TIMP-2 Gen Detection on
Squamous Cell Carcinoma of Parafin Block Specimen. Mini Thesis, Faculty of Medicine, Sebelas Maret University, Surakarta.
Background : Tongue cancer is the most cancer type often found across the
globe. The treatment and the progonosis of this cancer have a very good chance to be succeed but otherwise the spread of the cancer cell (metastasis) has a very high extent on them. There are numerous cases to be found in metastasis process. This research aims to observe whether there is a TIMP-2 cell that function as factor inhibitor of cancer cell metastasis on Parafin Block sample.
Method : this research employed a DNA product which is resulted from DNA
isolation from 14 Parafin Block samples. First, the product is amplified using PCR and primer act as a mold of PCR. Furthermore, the result of PCR product will undergo a electrophoresis process to find out TIMP-2 on each 13 samples
Result : TIMP-2 gen visualization on agarose shows negative result on
electrophoresis process on each sample
Summary : This research indicated that TIMP-2 gen was not found on agarose
gel. Which means that all samples taken for this research did not detect any TIMP-2 gens
commit to user
vi PRAKATA
Alhamdulillahirobbil’aalamiin, segala puji penulis panjatkan kepada Allah SWT. yang senantiasa memberikan rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul “Deteksi Gen TIMP-2 pada Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dari Spesimen Blok Parafin.”. Penelitian dan penulisan skripsi ini dapat terlaksana dengan baik berkat bantuan, bimbingan, dan petunjuk dari berbagai pihak. Untuk itu, penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada:
1. Prof. Dr. Zainal Arifin A, dr., Sp.PD (KR), FINASIM selaku Dekan
Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
2. Ari Natalia Probandari, dr.,MPH,PhD selaku Ketua Tim Skripsi FK UNS.
3. Dr. Pradipto Subiyantoro, drg.,SpBM selaku Pembimbing Utama atas
bimbingan dalam penyusunan skripsi ini.
4. Vita Nirmala A., drg.,SpPros.,SpKG selaku Pembimbing Pendamping atas
bimbingan dalam penyusunan skripsi ini.
5. Dr. Risya Cilmiaty AR, drg,M.Si.,SpKG selaku Penguji Utama yang telah
memberikan bimbingan, kritik dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini.
6. Widia Susanti, drg.,M.Kes selaku Anggota Penguji yang telah memberikan
bimbingan, kririk dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini. 7. Seluruh Dosen dan Staf Laboratorium Biomedik FK UNS.
8. Bagian Skripsi FK UNS yang turut memberi kelancaran pembuatan skripsi ini. 9. Ayahanda Halma Anhar, Ibunda Beni Ratna Murwani, adik Salsabil Ayu Anhari yang selalu mendoakan tanpa tiada henti dan memberikan semangat dari jauh bagi penulis
10.Nurul Wahda Aulia yang dengan setia selalu memberikan semangat dan dukungan kepada penulis
11.Teman-teman seperjuangan Giluters (Ega, Fai, Nabiel), sahabat-sahabat tercinta faiz, wahyu, mifta, agil, shofri, abbas, iqbal, dan keluarga besar Achiles yang senantiasa bersama penulis dalam menyelesaikan skripsi ini. 12.Teman-teman dan pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu-persatu yang
turut mendukung skripsi ini.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih banyak kekurangan dan jauh dari kata sempurna. Penulis mengharapkan saran dan kritik yang membangun demi kebaikan skripsi ini. Akhir kata penulis berharap semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi dunia kedokteran umumnya dan pembaca khususnya.
Surakarta, 7 Oktober 2013
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
BAB II LANDASAN TEORI A. Tinjauan Pustaka ... 5
1. Rongga Mulut... 5
2. Karsinogenesis ... 7
3. Karsinoma Sel Skuamosa Lidah ... 10
4. Gen Matrix Metalloproteinases dan Tissue Inhibitor Metalloproteinases ... 12
5. Hubungan Metastasis Karsinoma Sel Skuamosa Lidah dengan Gen Tissue Inhibitor Metalloproteinases ... 15
B. Kerangka Pemikiran ... 18
commit to user
viii
H. Teknik Analisis Data ... 27
BAB IV HASIL PENELITIAN
A. Hasil Penelitian ... 28
B. Analisis Hasil Visualisasi Gen TIMP-2 ... 33
BAB V PEMBAHASAN ... 36
BAB VI PENUTUP
A. SIMPULAN ... 41
B. SARAN ... 41
DAFTAR PUSTAKA ... 42
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user ix
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 2.1 Informasi tentang Lokasi dan Ekspresi Gen TIMP pada Manusia 15
Tabel 3.1 Primer Sequence Gen Timp-2... 24
commit to user
x
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 2.1 Gambar Anatomi Lidah ... 6
Gambar 2.2 Perbandingan antara Sel Normal dan Sel Kanker ... 8
Gambar 2.3 (a) Histologi Normal Lidah; (b) KSSL yang Sudah Bermetastasis ... 12
Gambar 2.4 Proses Metastasis Neoplasma ... 16
Gambar 2.5 Skema Kerangka Pemikiran ... 19
Gambar 3.1 Skema Rancangan Penelitian ... 20
Gambar 4.1 Skematik Hasil Elektroforesis ... 30
Gambar 4.2 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Laboratorium Biomedik FK UNS ... 31
Gambar 4.3 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Sampel nomer 1-12 di Laboratorium PK RSUD Dr. Moewardi ... 32
Gamabar 4.4 Hasil Elektroforesis Gen TIMP-2 Sampel no 13 dan 14 Bersama dengan Gen P-16, P14ARF, dan Ecaderin 12 di Laboratorium PK RSUD Dr. Moewardi ... 32
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user xi
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Surat Izin Penelitian dari Fakultas Kedokteran UNS
Lampiran 2. Surat Izin Peminjaman Status Pasien di SMF Rekam Medik dari
SMF Gigi dan Mulut RSUD Dr. Moewardi
Lampiran 3. Dokumentasi Kegiatan.
Lampiran 4. Data Pasien