Co p yright @ 2 016 , Jurnal Rise t Akuakultu r, p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 207 # Ko r e sp o n d e nsi: Balai Pe n elit ian d an Pe n ge m b an g an Bu d id aya
air Tawar. Jl. Se m p u r No . 1 , Bo g o r 1 6 1 54 , Ind o n e sia. Te l.: + (0 2 5 1 ) 8 3 1 3 2 0 0
E-m ail: i r i ni r i ana@ gmai l .com
Tersedia online di: ht t p://ej ournal-balit bang.kkp.go.id/index.php/j ra
KARAKTERISASI FENOTIPE DAN GENOTIPE TIGA POPULASI IKAN TENGADAK,
Barbonymus schwanenfeldiiIrin Iriana Kusmini#, Rudhy Gustiano, Deni Radona, Vitas At madi Prakoso,
Fera Perm ata Putri, dan Tri Heru Prihadi
Balai Penelitian dan Pen gemb angan Bud idaya air Tawar
ABSTRAK
Ikan ten gadak, Barbonymus schwanenfeldii m erup akan salah sat u je nis ikan lo kal yan g po ten sial unt uk dikembangkan . Kemungkinan keberhasilan pengembangan ikan in i sangat tinggi karena ikan tengadak sekerabat dengan ikan tawes. Studi keragaman genetik dilakukan dalam upaya pemanfaatan sumber daya genetik untuk kegiatan budidaya secara berkelanjutan. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis keragaman dan kekerabatan antara populasi ikan tengadak asal Jawa, Sumatera, dan Kalimantan. Analisis feno tipe dilakukan berdasarkan p engukuran t russ-mo rfomet rik, sedangkan an alisis geno tipe dilaku kan se cara molekuler m enggunakan meto de PCR-RAPD den gan primer OPA-08, OPA-09, dan OPC-02. Hasil analisis fu ngsi kano nikal t r uss-m orfo metrik m enun jukkan sebaran pengukuran ketiga p opulasi berada pada kuadran yang be rbeda de ngan persentase indeks keseragaman tert inggi pada populasi Sumatera d an Jawa (100%). An alisis gen o t ipe m e nu n ju kkan ikan t e n gad ak po p u lasi Kalim ant an me m iliki n ilai polimorfisme (50,00) dan heterozigositas tertinggi (0,206); secara kekerabatan ikan tengadak Kalimantan memiliki jarak yang jauh dengan ikan tengadak Jawa dan Sumatera.
KATA KUNCI: tengadak; Barbonymus schwanenfeldii; RAPD; truss morfometrik
ABSTRACT: Phenotype and genetic characterization of three population of tinfoil barb. By: Irin Iriana Kusmini, Rudhy Gustiano, Deni Radona, Vitas Atmadi Prakoso, Fera Permata Putri, and Tri Heru Prihadi
Tinfoil barb Barbonymus schwanenfeldii is one of pot ent ial local fish species for aquacult ure development . The successful probabilit y of aquacult ure development of t infoil barb is very high due t o close genet ic relat ionship wit h silver barb. St udy relat ed t o genet ic diversit y was conduct ed in order t o explore genet ic resources for sust ainable aquaculture. The aim of t his st udy was t o analyze t he genetic diversity and relat ionship bet ween t infoil barb populations from Java, Sumat ra, and Kalimant an. Phenot ype analysis was conduct ed by t russ morphomet ric, whereas genot ype analysis conduct ed by PCR-RAPD using OPA-08, OPA-09, and OPC-02 primers. The result s of canonical correlat ion analysis from t russ-morphomet ric measurement s showed t hat t he dist ribut ion of t hree populat ions were locat ed in different quadrant s wit h t he highest similarit y index percent age on Sumat ra and Java populat ion (100%). Genot ypic analysis showed t hat t infoil barb populat ion from Kalimant an revealed the highest value of polymorphism (50.00) and het erozygosit y (0.206), Kalimant an populat ion have dist ant ly genet ic relat ionship t o t infoil barb from Java and Sumatra.
KEYW ORDS: Barbonymus schwanenfeldii; RAPD; truss morphometric
PENDAHULUAN
Ik a n t e n g a d a k , Bar b onym u s schw a n en f el d i i m e r u p a k a n ika n lo ka l d a r i Pro vin s i Kalim an t an , Su m a t e r a , d a n Ja w a ya n g k e b e r a d aa n n ya m u la i berkurang akibat tingginya t ingkat penangkapan yang t idak memperhat ikan t ingkat kelest ariannya di alam. Je n is ik a n lo k a l m e n ja d i s a n g a t p e n t in g u n t u k
t ermasuk jenis herbivo ra yang memakan t anaman air dan t anaman darat yang t erendam. Ukuran maksimum panjang t o t al yang dapat dicapai unt uk jenis jant an adalah 35,0 cm; sedangkan betina adalah 20,0 cm. Ikan t e n gad ak t e r se b ar d i su n gai b e sar Asia Te n ggara sepert i Sungai Meko ng, Chao Phraya di darat an Asia dan su ngai-sun gai besar di Sem enan jung Malaysia, Pulau Sumat era, dan Kalimant an (Ko t t elat & Whit t en, 1996).
Pro ses do mest ikasi merupakan sebuah upaya agar ikan dapat hidup, berkembang biak dan t umbuh pada lingkungan budidaya. Do mest ikasi sangat diharapkan dapat menjaga kelest arian sumber daya genet iknya, se rt a d ap at m e n in gk at k an p r o d u kt ivit a s m e lalu i pengelo laan secara berkelanjut an. Keragaman genetik yang meliput i variasi alel dan het ero zigo sit as pent ing u n t u k ke le st arian jan gka p an jan g su at u p o p u lasi m au p u n s p e s ie s t e r ka it d e n g a n k e m a m p u a n n ya beradaptasi terhadap perubahan lingkungan (Dunham, 2 0 0 4 ). An a lis is k e r a g a m a n g e n e t ik d e n g a n menggunakan met ode RAPD dan truss morfometrik telah dilakukan pada beberapa jenis ikan asli Indo nesia di ant aranya ikan Tor soro (Asih et al., 2008), ikan t awes Barbonymus gonionot us (Kusmini et al., 2009), dan ikan gabus, Channa st riat a (Gust iano et al., 2013).
Upaya pengembangan ikan lo kal ini diharapkan agar t idak hilang dari perairan di beberapa wilayah di In-do nesia. Secara feno t ipe dan geno t ipe ikan t engadak mempunyai kekerabatan yang lebih dekat dengan ikan tawes albino dibandingkan dengan ikan t awes asal Jawa Barat (Kusmini et al., 2009). Tujuan penelit an ini adalah untuk menganalisis keragaman dan kekerabatan antara Jambi dari Kawasan Ko nser vasi Perairan Ar wana Kutur, Desa Mo ent i, Saro langun; dan Kalimant an Barat dari Ba la i Be n ih Ik a n Se n t r a l An jo n g a n Po n t ia n a k (Gam bar 1). Ju mlah sam pe l yang d igun akan u nt uk
analisis PCR-RAPD adalah 10 eko r unt uk t iap po pulasi, sedangkan unt uk analisis t russ-mo rfo met rik masing-masing sebanyak 30 eko r dari set iap po pulasi.
Karakterisasi Fenotipe dengan Analisis
Truss-M or fom et rik
Ik a n t e n g a d a k p a d a s e t ia p p o p u la s i d ip ilih b e r d a s a r k a n k e le n g k a p a n a n g g o t a b a d a n n ya , selanjutnya dilakukan pemilihan tit ik-t itik truss di badan ikan b erdasarkan Brzeski & Do yle (19 88 ). Met o d e pengukuran dilakukan dengan menghubungkan jarak t it ik-t it ik sp e sifik yan g b e rsifat past i p ad a b ad an . Pe n g u k u r a n m o r fo m e t r ik d ila k u k a n p a d a ik a n t engadak dengan ukuran panjang 15,2 ± 1,1 cm dan bo bo t badan 124,2 ± 28,5 g hasil ko leksi po pulasi Jawa, Su m at e ra, d an Kalim an t an . Se t iap p o p u lasi diambil sebanyak 30 eko r kemudian ikan dilet akkan d i at as ke rt a s yan g t e lah d ilap isi p last ik b e n in g. Masin g-masing t it ik dit andai dengan menggu nakan jarum sesuai dengan po la t russ-morfo met rik, meliput i: pengukuran jarak t it ik-t it ik t anda yang dibuat pada
Karakt erisasi Genotipe dengan Analisis RAPD
Pro fil ge n o t ip e ik a n d ia n alisis m e n g g u n a ka n eko r per po pulasi) dilakukan menggunakaan met o de phenol-chloroform (Nugro ho et al., 1997).
Amplifikasi DNA dengan Teknik PCR
Amplifikasi DNA dilakukan menggunakan met o de PCR dengan primer yang diuji adalah OPA-8, OPA-9, OPA-11, OPA-18, OPC-2, d an OPC-5 (Rado na et al., 2016).
Co p yright @ 2 016 , Jurnal Rise t Akuakultu r, p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 209 Gambar 2. Tit ik pengukuran t russ-mo rfo met rik
Figure 2. M easurement point s of t russ morphomet ric
Tabel 1. Deskripsi 21 karakt er unt uk t russ-mo rfo met rik pada ikan t engadak Table 1. Descript ion of 21 charact ers for t russ morphomet ric of t infoil barb
Bi dang tr uss Tr uss ar ea
Kode
Code
Deskri psi j arak
Descr iption of distance
A-1 Uju n g mu lut - u ju n g o p erku lu m bawah (End of mout h - t he lower end of operculum)
A-2 Uju n g mu lu t - b atas akh ir tulan g kep ala (End of mouth - lat ter part of skull)
A-3 Uju n g mu lut - sir ip ven tr al (End of mout h - vent ral fin)
A-4 Uju n g o p erku lu m bawah - b atas akh ir tu lan g kep ala The lower end of operculum - latt er part of skull
A-5 Uju n g o p erku lu m bawah - sir ip ventr al (The lower end of operculum - vent ral fin)
A-6 Batas akh ir tu lan g kep ala - sirip ven tral (Lat ter part of skull - ventral f in)
B-1 Batas akh ir tu lan g kep ala - awal sir ip d o rsal (Lat ter part of skull - beginning of dorsal f in)
B-3 Batas akh ir tulan g kep ala - awal sir ip an al (Latt er part of skull - beginning of anal fin)
B-4 Sir ip ven tr al - awal sir ip d o r sal (Vent ral fin - beginning of dorsal fin)
B-5 Sir ip ven tr al - awal sir ip an al (Ven tral fin - beginning of anal fin)
B-6 Awal sirip d or sal - awal sir ip an al (Beginning of dorsal f in - beginning of anal f in)
C-1 Awal sir ip d o r sal - akh ir sir ip d o rsal (Beginning of dorsal f in - end of dorsal fin)
C-3 Awal sir ip d o r sal - akh ir sir ip an al (Beginning of dorsal f in - end of anal fin)
C-4 Awal sir ip an al - akh ir sirip d o rsal (Beginning of anal f in - end of dorsal fin)
C-5 Awal sir ip an al - akh ir sir ip an al (Beginning of anal f in - end of anal fin)
C-6 Akh ir sir ip d o r sal - akh ir sir ip an al (End of dorsal fin - end of anal f in)
D-1 Akh ir sir ip do r sal - awal sir ip ekor atas (End of dorsal fin - beginning of upper part of caudal fin)
D-3 Akhir sirip d o rsal - awal sir ip eko r bawah (End of dorsal fin - beginning of lower part of caudal fin)
D-4 Akh ir sirip an al - awal sirip eko r atas (End of anal f in - beginning of upper part of caudal fin)
D-5 Akhir sirip anal - awal sir ip ekor b awah (End of anal f in - beginning of lower part of caudal fin)
D-6 Awal sir ip ekor atas - akhir sirip eko r b awah
Beginning of upper part of caudal f in - beginning of lower part of caudal fin Pan gkal
eko r Caudal
peduncle Kep ala
Head
Ten g ah b ad an M iddle
body
Bad an b elakan g
Rear
Analisis Ragam Genet ik
Keragaman genet ik dianalisis menggunakan pro -gram TFPGA (Tools for Populat ion Genet ic Analysis) me ngacu p ada Wright (197 8) dalam Miller (19 97 ). Hu b u n ga n k e k e r a b at a n in t e r p o p u la s i d ia n a lis is berdasarkan jarak genet ik dengan bant uan pro gram UPGMA (Unweight Pair Met hods Arit hmetic) dan disajikan dalam bent uk dendro gram. Analisis sebaran karakt er morfomet rik intra dan int erpopulasi dilakukan dengan ano va menggunakan SPSS versi 18 dan disajikan dalam diagram diskriminan kano nikal, sert a analisis indeks keseragaman (sharing component).
HASIL DAN BAHASAN
Truss-m orfometrik Ikan Tengadak
Pengukuran t russ-morfo metrik dilakukan t erhadap 21 karakt er pada ikan t engadak asal Jawa, Sumat era, d a n k a lim a n t a n . Nila i r a t a -r a t a k a r a k t e r t r u ss -mo rfo me t rik ikan t e ngadak disajikan pada Tabel 2. Keragaman mo rfo met rik dinyat akan dalam ko efisien keragaman karakt er (CV) dan nilai CV disajikan dalam Tabel 3.
Nilai CV suat u karakt er mengindikasikan t ingkat variabilit as karakt er yang bersangkut an pad a suat u po pulasi. Tingkat variabilit as suat u karakt er feno t ipe
mencerminkan variabilitas genot ipe po pulasi (Falconer & Mackay, 1996; Gjedrem, 2005). Pada Tabel 2 terdapat 2 1 karakt e r t e ru ku r yang m e m iliki karakt e r yan g berbeda (kecuali A5= ujung o perculum bawah – sirip ve n t ral). Ko e fisie n ke ra gam an t r uss-m o r fo m e t r ik po pulasi ikan t engadak berkisar ant ara 2,24%-12,76%. Nilai CV in i t ergo lo n g ren dah. Re nd ahn ya nilai CV bukanlah hal yang luar biasa unt uk jenis-jenis ikan air t aw a r d a lam d o m e s t ik a si s e p e r t i yan g t e r a m a t i sebelumnya pada ikan nilem (Mulyasari, 2009), yait u berkisar ant ara 3,38%-10,35%. Rendahnya nilai CV ini relat if sempit sehingga peluang t erjadi pert ukaran gen dengan po pulasi lain juga relat if kecil (Iskandariah et al., 2015).
Ha s il a n a lis is fu n g s i k a n o n ik a l (Ga m b a r 3 ) m e m p e rlih at ka n b a h w a ka ra kt e r m o r fo lo gi ika n t engadak dari Jawa, Sumat era, dan Kalimant an t idak saling bersinggungan, t erdist ribusi pada kuadran yang berbeda. Ikan t engadak Jawa berada pada kuadran-2 dan 3, ikan t engadak Sumat era berada pada kuadran-1 se dangkan ikan t en gad ak Kalimant an be rad a pada kuadran 4. Uji signifikan dilakukan untuk menget ahui karakt er yang dapat digunakan sebagai penciri dari suat u jenis ikan. Hal ini mengindikasikan bahwa ikan t engadak dari ket iga po pulasi (Jawa, Sumat era, dan
Sumatera (Sumatra) Jawa (Java) Kalimantan
Co p yright @ 2 016 , Jurnal Rise t Akuakultu r, p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 211 Tabel 3. Ko e fisien variasi (CV) 2 1 karakt er m o rfo met rik dari ikan t engadak, Barbonymus
schwanenfeldii asal Jawa, Kalimant an, dan Sumat era
Table 3. Coefficient of variat ion (CV) of 21 morphomet ric charact ers of t infoil barb, Barbonymus schwanenfeldii from Java, Kalimant an, and Sumat ra
Ke terang an (Descri pt ion): * = Berbed a n yata (P< 0,05) (Si gnificant ly differ ent (P< 0.05 ))
Gambar 3. Penyebaran karakt er mo rfo met rik ikan t engadak, Barbonymus schwanenfeldii asal Jawa, Kalimantan, dan Sumat era
Figure 3. M orphomet ric charact ers dist ribut ion of t infoil barb,
Barbonymus schwanenfeldii from Java, Kalimant an, and Sumat ra
Sum at era (Sumatr a) Jawa (Java) Kal im ant an
1 A-1 6 .6 2 9 .8 0 5 .8 1 ,0 0 0*
2 A-2 8 .1 7 6 .6 2 6 .5 4 ,0 0 1*
3 A-3 3 .1 2 5 .3 0 3 .4 0 ,0 0 0*
4 A-4 5 .1 3 7 .6 8 5 .1 0 ,0 0 0*
5 A-5 5 .5 1 7 .3 6 4 .9 0 ,2 6 5
6 A-6 3 .7 4 5 .7 0 3 .7 9 ,0 0 0*
7 B-1 3 .9 7 6 .5 5 4 .8 2 ,0 0 0*
8 B-3 2 .2 4 3 .0 6 3 .3 6 ,0 0 0*
9 B-4 4 .3 9 5 .7 5 4 .6 4 ,0 0 0*
1 0 B-5 6 .8 2 5 .8 6 6 .9 2 ,0 0 0*
1 1 B-6 2 .6 1 3 .0 5 3 .6 5 ,0 0 0*
1 2 C-1 9 .9 8 10 .51 7 .0 3 ,0 0 0*
1 3 C-3 5 .3 3 3 .6 8 3 .4 8 ,0 0 0*
1 4 C-4 5 .0 0 5 .2 4 3 .6 7 ,0 0 0*
1 5 C-5 1 0 .6 7 10 .96 6 .1 9 ,0 0 0*
1 6 C-6 4 .4 5 3 .3 6 4 .1 6 ,0 0 0*
1 7 D-1 4 .1 2 5 .2 1 6 .2 5 ,0 0 0*
1 8 D-3 5 .2 9 4 .1 8 4 .2 9 ,0 0 0*
1 9 D-4 5 .0 9 8 .4 3 5 .7 2 ,0 0 0*
2 0 D-5 1 1 .0 9 12 .76 9 .9 2 ,0 0 0*
2 1 D-6 4 .0 8 11 .22 6 .1 8 ,0 0 0*
No. Si gni fi kansi
Significance
Koefi si en keragam an
Coefficient of variation (%) Karakt er m orfom et rik
M orphometric characters
Jawa (Java) Sumatera (Sumat ra)
Kalimantan
4 3
1 2
6
3
0
-3
-6
Menurut So ewardi (2007), sebagian besar variasi feno t ipe ant ar po pulasi cenderung disebabkan o leh fakt o r lin gku n gan dan san gat se dikit d ip e ngaruh i fakt o r genet ik. Selain it u, aspek bio lo gi dan fisio lo gi ik a n , e fe k m a t e r n a l, p o la m a k a n , k o m p e n s a s i pert umbuhan dan pemeliharaan bersama (communal st ocking) juga dapat memengaruhi t ingkat keragaman feno t ipe po pulasi.
Nilai persent ase sharing component int ra-po pulasi ikan t engadak dit ampilkan pada Tabel 4. Nilai sharing in t r a -p o p u la si t e r t in g g i d ip e r o le h d a ri p o p u las i Su m a t e r a d a n Ja w a s e b e s a r 1 0 0 %, s e d a n g k a n Kalimant an dengan nilai 96,7%. Menurut Set ijaningsih et al. (2007), t inggi rendahnya nilai indeks kesamaan d ip en garu h i o le h sum b e r gen e t ik pe m b e n t u kn ya, sehingga kuat dugaan bahwa perbedaan ikan t engadak inter-populasi murni berasal dari sumber genet ik yang b e r b e d a . Hu b u n g a n k e k e r a b a t a n m e m b e r ik a n gambaran t erhadap kemungkinan adanya perkawinan silang. Terkait dengan usaha do mest ikasi, salah sat u aspek yang perlu diperhat ikan dan berperan pent ing dalam pro gram do mest ikasi adalah penyediaan induk yang berkualit as.
Keragaman Genotipe Ikan Tengadak
Amplifikasi DNA yang menggunakan t iga primer (OPA-08, OPA-09, dan OPC-02) pada ikan tengadak asal Sumat era, Jawa, dan Kalimant an memperlihatkan DNA t e r am p lifika si p a d a s e t iap lo ku s d an b e r var ia si. Keragaman pro fil RAPD (Tabel 5) menunjukkan jumlah fra gm e n DNA p ro d u k PCR p a d a ke t ig a p o p u las i berkisar 8-18 dengan kisaran ukuran 180-3.000 bp. Jumlah dan ukuran fragmen t erbanyak dipero leh pada po pulasi ikan t engadak asal Sumat era.
Persent ase po limo rfisme dan het erozigo sit as pada k e t ig a p o p u la s i ik a n t e n g a d a k (Ta b e l 6 ) memperlihatkan bahwa po pulasi Kalimantan memiliki persent ase po limo rfisme dan het ero zigo sit as leb ih t inggi dibandingkan dua po pulasi lainnya.
Persent ase po limo rfisme dit ent ukan o leh jumlah fr a g m e n DNA ya n g t e r a m p lifik a s i. Pe r b e d a a n po limo rfisme pit a DNA yang dihasilkan t ergant ung pada sit us penempelan primer dan dapat digunakan u n t u k m e m b e rik an ga m b a r an m e n ge n a i t in g ka t keragaman genet ik suat u po pulasi (Gu st iano et al., 2 0 1 3 ). He t e r o z ig o s it a s m e n u n ju k k a n p o t e n s i
Tabel 4. Nilai persent ase sharing component ikan t engadak po pulasi Sumat era, Jawa, dan Kalimantan
Table 4. The percent age value of sharing component of t infoil barb from Sumat ra, Java, and Kalimant an
Popul asi (Populations) Sum at era (Sumatr a) Jawa (Java) Kal im ant an Jum l ah (Total)
Su mater a (Sumat ra) 1 00 0 0 10 0
Jawa (Java) 0 1 0 0 0 10 0
Kalimantan (Kalimantan) 3 .3 0 9 6 .7 10 0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M
A B C
Co p yright @ 2 016 , Jurnal Rise t Akuakultu r, p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 213 kemampuan adapt asi t erhadap lingkungannya, karena
semakin t inggi het ero zigo sit as maka semakin banyak ge n yan g t erlib at dalam m en yu m b angkan t ingkat kebugaran suat u po pulasi (Tave, 1993).
Uji p e r b a n d in g a n b e r p a s a n g a n Fs t (Ta b e l 7 ) m en u nju kkan p erb ed aan keragam an ge n et ik yan g
n yat a an t ar a k e t iga p o p u las i ikan t e n ga d ak d a ri Sumatera, Jawa, dan Kalimant an (P> 0,05). Untuk jarak genet ik masing-masing po p ulasi (Tabel 8), po pulasi Jawa dan Sumat era memiliki nilai t erdekat , sedangkan nilai terjauh adalah antara populasi Jawa dan Kalimantan (Gambar 7).
Gambar 5. Hasil amplifikasi DNA ikan t engadak Kalimant an (A), Sumat era (B), dan Jawa Barat (C) dengan PCR-RAPD menggunakan primer OPA-08 (Ket erangan: no mo r (1-15) = sampel ikan, M = marker DNA)
Figure 5. DNA amplificat ion result of t infoil barb from Kalimant an, Sumat ra, and West Java by PCR-RAPD using OPA-08 primer (Descript ion: number (1-15) = samples, M = DNA marker)
Gambar 6. Hasil amplifikasi DNA ikan t engadak Kalimant an (A), Sumat era (B), dan Jawa Barat (C) dengan PCR-RAPD menggunakan primer OPC-02 (Ket erangan: no mo r (1-15)= sample ikan, M= marker DNA)
Figure 6. DNA amplificat ion result of t infoil barb from Kalimant an, Sumat ra, and West Java by PCR-RAPD using OPC-02 primer (Descript ion: number (1-15)= samples, M = DNA marker)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M
A
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M
B C
A B C
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 M
Populasi
Populations
Jum l ah fragm en
Number of fr agments
Kisaran ukuran fragm en
Fr agment size range (bp)
Su mater a (Sumat ra) 8 -1 8 2 5 0 -1 ,8 0 0
Jawa (Java) 1 1-1 6 1 8 0 -3 ,0 0 0
Kaliman tan 1 1-1 5 2 0 0 -2 ,0 0 0
Tabel 5. Jumlah dan ukuran fragmen DNA pro duk PCR-RAPD menggunakan primer OPA-08, OPA-09, dan OPC-02 dengan t emplat dari ikan t engadak asal Sumat era, Jawa, dan Kalimant an
Tabel 6. Pe rse n t ase p o lim o rfism e d an h e t e ro zigo sit as ikan t e n gad ak asal Sumat era, Jawa, dan Kalimant an
Table 6. Percent age of polymorphism and heterozygosit y of t infoil barb from Sumat ra, Java, and Kalimant an
Tabel 7. Uji perbandingan berpasangan Fst pada ikan t engadak asal Sumatera, Jawa, dan Kalimant an
Table 7. Fst pair w ise compar ison of t infoil bar b fr om Sumat r a, Java, and Kalimant an
Popul asi
Populations
Pol im orfi sm e
Polymor phism (%)
Het erozigosi t as
Heterozygosity
Su matera (Sumatra) 3 5 .2 9 0 .1 75
Jawa (Java) 4 4 .1 2 0 .1 71
Kaliman tan 5 0 .0 0 0 .2 06
Populasi
Populations
Sum at era
Sumatr a
Jawa
Java Kali m ant an
Su matera (Sumatra) *****
Jawa (Java) 0.0 00 0* *****
Kaliman tan 0.0 00 0* 0 .0 0 00* *****
Ke terang an (Descri pt ion): * = Berbed a nyata (P> 0,05)
Si gnificant l y di ffer ent (P< 0 .0 5)
Tabel 8. Jarak genet ik ikan t engadak asal Sumat era, Jawa, dan Kalimant an
Table 8. The genet ic dist ance of t infoil barb from Sumatra, Java, and Kalimantan
Popul asi
Populations
Sum at era
Sum atra
Jawa
Java Kali m ant an
Su mater a (Sumat ra) *****
Jawa (Java) 0 .47 5 5 *****
Kaliman tan 0 .47 5 8 0 .4 9 2 9 *****
Gambar 7. Dendrogram hubungan kekerabatan ikan tengadak berdasarkan keragaman 1
2
3
Co p yright @ 2 016 , Jurnal Rise t Akuakultu r, p -ISSN 190 7-67 54, e-ISSN 25 02-6534 215 memiliki jarak genet ik t erjauh (0,4929). Menurut Tave (1 9 9 3 ), p e r b e d a a n k e r a g a m a n g e n e t ik d a p a t meningkat kan jarak genet ik ant ar po pulasi. Po pulasi Kalimantan dan Jawa berpo t ensi unt uk dikembangkan secara bu didaya be rkelan ju t an. Pe rkawin an secara out breeding antara po pulasi Jawa dan Kalimant an dapat m e nin gkat kan ragam ge n e t ik. Pe n ingkat an ragam ge net ik berdam pak pada p eningkat an kemampu an adapt asi dan perfo rma pro duksi (Wedemeyer, 2001).
KESIM PULAN
Hasil analisis PCR-RAPD dan t russ-mo rfo met rik ikan t engadak dari ket iga po pulasi (Jawa, Sumat era, dan Ka lim a n t a n ) t id a k m e m ilik i k e s a m a a n k a r a k t e r (P< 0,05) dan secara kekerabat an menunjukkan ikan t engadak po pulasi Kalimant an lebih jauh dengan ikan t engadak po pulasi Jawa dan Sumat era. Ikan t engadak populasi Kalimantan pot ensial sebagai sumber genetik do no r unt uk pengembangan budidaya ikan t engadak yang berkelanjut an. (2008). Penent uan variasi genet ik ikan bat ak (Tor soro) dari Sumat era Ut ara dan Jawa Barat dengan me t o d e an alisis Random Amplified Polymor phism ceeding 15 (p. 439-444). Depart ment o f Fisheries, Thailand. Bangko k.
Dunham, R.A. (2004). Aquacult ure and fisheries bio -t echno lo gy: gene-t ic app ro ach . CABI Pub lishing, Cambridge. USA, 372 pp.
Falco ner, F.S., & Mackay, T.F.C. (1996). Int ro duct io n t o quant it at ive genet ics. Lo ngman. England. Gjedrem, T. (2005). Select io n and breeding pro gram genet ik t iga po pulasi sepat siam asal Kalimant an m e n ggu n aka n an alis is RAPD d an p e n g u ku r an mo rfo met rik t russ. Berit a Biologi, 14(1), 57-68. Ko t t e lat , M., & Wh it t e n , A.J. (1 9 9 6 ). Fre s h wat e r
bio diversit y in Asia wit h special reference t o fish. Wo rld Bank. Washingt o n D.C.
Kusmini, I.I., Mulyasari., Widiyat i, A., & Nugro ho , E. (2009). Karakt er Genet ik Ikan t engadak (Barbodes sp.), ikan tawes albino (Barbodes sp.) dan ikan tawes (Barbodes gonionot us). Prosiding Seminar Nasional Tahunan VI Hasil Penelit ian Perikanan dan Kelaut an Tahun 2009, Budidaya Perikanan. Jilid I. Universi-t as Gadjah Mada. Jo gjakarUniversi-t a.
Lo renzen, K., Beveridge, M.C.M., & Mangel, M. (2012). Cultured fish: integrative biolo gy and management o f do mest icat io n and int eract io ns wit h wild fish. Biology Review, 87, 639-660.
Miller, M.P. (1997). To o ls fo r po pulat io n genet ic analy-sis (TFPGA) versio n 1.3. Depart ment o f Bio lo gi-cal Science. No rt hern Arizo na Universit y, Arizo na. USA.
Mulyasari. (2009). Karakt erist ik fenotipe morfometrik dan keragaman genot ipe RAPD (Random Amplified Poly-morphic DNA) ikan nilem (Ost eochilus hasselt i) di Jawa Barat. Tesis. Inst it ut Pert anian Bo go r. Bo go r. geno tipe ikan t engadak (Barbonymus schwanenfeldii) p e r s ila n g a n p o p u la s i Ja w a d a n Ka lim a n t a n perairan umum. Seminar Indoaqua. Yogyakart a, 17-20 Desember 17-2008.
g ou r a m y La c . ) b e r d a s a r k a n m e t o d e t r u ss mo rfo me t rik. Jur nal Ikt iologi Indonesia, 7(1), 2 3-30.
So ewardi, K. (2007). Pengelo laan keragaman genet ik sumberdaya perikanan dan kelaut an. Depart emen Ma n a je m e n Su m b e r d a ya Pe r a ir a n , In s t it u t Pert anian Bo go r. Bo go r, 153 hlm.
Sukadi, M.F., Krist ant o , A.H., Nugro ho , E., Ko marudin, O., Widiyat i, A., Gust iano , R., Djajasewaka, H., &
Kusmini, I.I. (2009). Kandidat komo dit as ikan lo kal a ir t a w a r p o t e n s ia l u n t u k p e n g e m b a n g a n budidayanya di Kalimant an Selat an. Prosiding Fo-rum Inovasi Teknologi Akuakult ur, hlm. 365-373. Tave, D. (1993). Genet ic fo r fish hat cher y managers.
Kluwer Academic Publishers. Net herland.
