Silabus Biokimia dan Enzymologi

(1)

UNIVERSITAS NEGERI YOGYAKARTA F A K U L T A S M I P A

SILABI

SIL/KIC330/01 18 Februari 2011 Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)

Program Studi : Kimia

Mata Kuliah & Kode : Biokimia (KIC330) Jumlah sks : Teori 3 sks, Praktek-sks

Semester : Ganjil

Mata Kuliah Prasyarat : Kimia Organik I dan II

Dosen : Togu Gultom, M. Pd, M. Si

I. Deskripsi Mata Kuliah

Mata kuliah biokimia terdiri atas tiga bagian yang (1) membahas tentang struktur san fungsi biomolekul; (2) membahas metabolisme yanitu reaksi-reaksi yang terjadi dalam tubuh makhluk hidup, dan (3) bagian yang membahas tentang proses-proses kimia yang menyimpan serta menstransfer informasi biologi dari induk ke anak.

II. STANDAR KOMPETENSI MATA KULIAH

Mendeskripsikan struktur dan fungsi biomolekul, menjelaskan tentang konsep metabolisme karbohidrat, lemak, protein serta asam lemak; serta mendeskripsikan konsep-konsep biokimia tentang aliran informasi biologi meliputi replikasi, transkripsi, dan translasi; serta rekayasa genetika.

III. RENCANA KEGIATAN

Tatap muka ke :

Kompetensi Dasar Materi Pokok _PerkuliahanStrategi Referensi

1 Mendeskripsikan pola fikir

dala biokimia

Filosofi Bikimia 1. Diskusi dan

informasi. 1. C

2 Mendeskripsikan konsep

struktur dan fungsi karbohidrat

Karbohidrat:

- Monosakarida

- disakarida

Diskusi, Informasi, Tanya jawab dan

(2)

tugas

3 Mendeskripsikan hubungan

struktur dengan sifat-sifat karbohidrat

Karbohidrat dan polisakarida

struktur dan fungsi lipid

Lipid

- asam lemak

- lemak dan membran

Diskusi,

kimia tentang struktur dan fungsi protein

Protein

- asam amino - pembagian asam amino

6 Mendeskripsikan

identifikasi protein dan asam amino

- Polipeptida

- Pembagian protein

Diskusi,

7 Mendeskripsikan struktur

atom

- struktur protein - identifikasi protein/as. amino

UJIAN SISIPAN I

8 Mendeskripsikan

pengertaian enzim, serta hubungan antar factor yang memepengaruhi aktivitas enzim

Syruktur enzim, dan pengelompokan enzim serta kinetika enzim

Diskusi,

struktur dan fungsi asam nukleat

Asam nukleat,

penyususn as. Nukleat, san struktur as. nukleat

Diskusi,

metabolisme karbohidrat, hubungannya dengan kebutuhan energi

Metabolisme karbohidrat - glikolisis

- siklus pentosa fosfat

metabolisme lipid, dan hubungannya dengan kebutuhan energi

Metabolisme lipid - β oksidasi

- biosintesis as. lemak

Diskusi,

metabolisme protein, as. Amino, hubungannya

(3)

dengan kebutuhan energi dan biosintesis protein

- dekarboksilasi

- siklua area

jawab dan tugas

metabolisme nukleotida, hubungannya dengan metabolisme karbohidrat, lipid dan protein

Metabolisme nukletida dan hubungannya dengan metabolisme yang lain

transformasi inforamsi biologi

Transformasi informasi biologi

15 Menjelaskan hubugnan

antar struktur DNA, rekayasa genetika dan penurunan sifat-sifat gentika

Transformasi dan rekayasa genetika

16 UJIAN SISIPAN II

IV. REFERENSI/ SUMBER BAHAN

1. Acuan Wajib

a. Togu Gultom, 2001, Biokimia Bagian I ” Struktur dan Fungsi”, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia FMIPA UNY, JICA-IMSTEP.

b. Togu Gultom. 2002. Biokimia Bagian II ” Bagian Metabolisme:, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia UNY.

c. Lehninger, A, (Alih bahsa Maggy Thenawijaya). 1990. Dasar-dasar Biokimia Jilid I,, II, dan III. Jakarta : Penerbit Erlangga.

2. Acuan Anjuran.

a. Horton Robert H. Et all, 1996. Principle of Biochemical. Second Edition London : The Prentice Hall International

b. Wood William B. Et all. 1981. Biochemistry A Problem Approach. London : The Benjamin/Cumings Publishing Company

c. Akhmaloka. 1990. Asam Nukleat Struktur dan Fungsi. Bandung : Penerbit ITB Bandung

V. EVALUASI

No Komponen Evaluasi Bobot (%)

1 Partisipasi Kuliah 10%

2 Tugas-tugas 15 %

3 Ujian Tengah Semester 20 %

4 Ujian Akhir Semester 35 %

JUMLAH 100 %

V. KETERANGAN Strategi Perkuliahan

Tatap Muka Non Tatap Muka

1. Perkuliahan tatap muka 5. Kerja lab

(4)

3. Presentasi 7. Lainnya

4. Ujian tengah semester

Yogyakarta, Februari 2012

Mengetahui

Ketua Jurusan Pendidikan Kimia

Dr. Hari Sutrisno

NIP. 19670407 199203 1 002

Dosen

(5)

SILABI

SIL/KIM330/01 18 Februari 2011 Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)

Program Studi : Kimia

Mata Kuliah & Kode : Biokimia (KIM330) Jumlah sks : Teori 3 sks, Praktek-sks

Semester : Ganjil

Mata Kuliah Prasyarat : Kimia Organik I dan II

Mata kuliah biokimia terdiri atas tiga bagian yang (1) membahas tentang struktur san fungsi biomolekul; (2) membahas metabolisme yanitu reaksi-reaksi yang terjadi dalam tubuh makhluk hisup, dan (3) bagian yang membahas tentang proses-proses kimia yang menyimpan serta menstransfer informasi biologi dari induk ke anak.

Mendeskripsikan struktur dan fungsi biomolekul, menjelaskan tentang konsep metabolisme karbohidrat, lemak, protein serta asam lemak; serta mendeskripsikan konsep-konsep biokimia tentang aliran informasi biologi meliputi replikasi, transkripsi, dan translasi; serta rekayasa genetika.

Tatap muka ke :

Kompetensi Dasar Materi Pokok Strategi

Perkuliahan Referensi

1 Mendeskripsikan pola fikir

dala biokimia

Filosofi Bikimia 1. Diskusi dan

informasi. 1. C

struktur dan fungsi karbohidrat

Karbohidrat:

- Monosakarida

- disakarida

Diskusi, Informasi, Tanya jawab dan tugas

1.A.1.C

3 Mendeskripsikan hubungan

struktur dengan sifat-sifat karbohidrat

Karbohidrat dan polisakarida

(6)

4 Mendeskripsikan konsep struktur dan fungsi lipid

Lipid

- asam lemak

- lemak dan membran

Diskusi,

kimia tentang struktur dan fungsi protein

Protein

- asam amino - pembagian asam amino

6 Mendeskripsikan

identifikasi protein dan asam amino

- Polipeptida

- Pembagian protein

Diskusi,

7 Mendeskripsikan struktur

atom

- struktur protein - identifikasi protein/as. amino

UJIAN SISIPAN I

8 Mendeskripsikan

pengertaian enzim, serta hubungan antar factor yang memepengaruhi aktivitas enzim

Syruktur enzim, dan pengelompokan enzim serta kinetika enzim

Diskusi,

struktur dan fungsi asam nukleat

Asam nukleat,

penyususn as. Nukleat, san struktur as. nukleat

Diskusi,

metabolisme karbohidrat, hubungannya dengan kebutuhan energi

Metabolisme karbohidrat - glikolisis

- siklus pentosa fosfat

metabolisme lipid, dan hubungannya dengan kebutuhan energi

Metabolisme lipid - β oksidasi

- biosintesis as. lemak

Diskusi,

metabolisme protein, as. Amino, hubungannya dengan kebutuhan energi dan biosintesis protein

Metabolisme protein

- transsminasi

- deaminasi

- dekarboksilasi

- siklua area

Diskusi,

metabolisme nukleotida, hubungannya dengan metabolisme karbohidrat, lipid dan protein

(7)

14 Mendeskripsikan konsep transformasi inforamsi biologi

Transformasi informasi biologi

- Replikasi - Transkripsi - Translasi

1.C.2.C

15 Menjelaskan hubugnan

antar struktur DNA, rekayasa genetika dan penurunan sifat-sifat gentika

Transformasi dan rekayasa genetika

1.C.2.C

16 UJIAN SISIPAN II

1. Acuan Wajib

a. Togu Gultom, 2001, Biokimia Bagian I ” Struktur dan Fungsi”, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia FMIPA UNY, JICA-IMSTEP.

b. Togu Gultom. 2002. Biokimia Bagian II ” Bagian Metabolisme:, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia UNY.

c. Lehninger, A, (Alih bahsa Maggy Thenawijaya). 1990. Dasar-dasar Biokimia Jilid I,, II, dan III. Jakarta : Penerbit Erlangga.

2. Acuan Anjuran.

a. Horton Robert H. Et all, 1996. Principle of Biochemical. Second Edition London : The Prentice Hall International

b. Wood William B. Et all. 1981. Biochemistry A Problem Approach. London : The Benjamin/Cumings Publishing Company

c. Akhmaloka. 1990. Asam Nukleat Struktur dan Fungsi. Bandung : Penerbit ITB Bandung

V. EVALUASI

Nomor Komponen Evaluasi Bobot (%)

2 Tugas-tugas 15 %

JUMLAH 100 %

2. Diskusi 6. Tugas individu/kelompok

Yogyakarta, 17 September 2011

Mengetahui

(8)

Dr. Suyanta

NIP. 19660508 199203 1 002

Togu Gultom, M. Pd, M. Si dkk NIP. 19500508 197803 1 001

SILABI

SIL/SIK224/02 18 Februari 2011 Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)

(9)

Mata Kuliah & Kode : Enzymologi(SIK224) Jumlah sks : Teori 2 sks, Praktek-sks

Semester : Genap

Mata Kuliah Prasyarat : Biokimia Umum

Enzimologi berisi uraian bahasan tentang struktur dan fungsi enzim; pengertian tentang enzim; klasifikasi enzim dan tatanama, enzim monomer dan oligomer, faktor yang mempengaruhi kerja enzim. Kinetika reaksi enzim mekanisme molekuler enzimatik, mekanisme reaksi tanpa kofaktor, keterlibatan koenzim dalam reaksi enzimatik, kinetika reaksi enzimatik dengan satu substrat, hubungan laju reaksi awal dengan konsentrasi, inhibisi, reaksi enzim allosterik. Aplikasi enzim dalam industri, isolasi dan purifikasi enzim, dan amobilisi enzim.

Mendeskripsikan konsep-konsep dasdr tentang struktur dan fungsi enzim, mejleaskan kinetika enzim, mendemonstrasikan mekanisme reaksi enzimatik, megisolasi enzim dari bakteri, mengamobilkan enzim dan mengaplikasikannya dalam industri

Tatap muka ke :

Kompetensi Dasar Materi Pokok _PerkuliahanStrategi Referensi

1, 2 Mendeskripsikan struktur san

fungsi

Pengertian dan klasifikasi

1. Diskusi dan

informasi. 1A. 2C

3, 4 Menjelaskan pengelompokan

enzim didasarkan kerjanya Mekanisme kerja enzim, enzim monomer oligomer

Diskusi, Informasi, tugas membuat makalah

1.A.2.C

5, 6 Menjelaskan fungsi

Koenzim, dan Factor yang mempengaruhi kerja enzim

Koenzim, faktor yang mempengaruhi enzim

1.A.2.C

7 _{UJIAN SISIPAN}

8, 9, 10, 11

Menjelaskan pengertian kinetika reaksi enzim dan reaksi pengendalian enzim (Inhibition)

Kinetika reaksi enzim dan inhibisis enzim

(10)

12, 13

Mendeskripsikan amobilisasi enzim dihubungkan dengan cara amobilisasi

- Amobilisasi enzim dalam matriks

1.A.2.B

14,

15 Mendeskripsikan Isolasi dengan pemurnian enzim dari bakteri

Isolasi dan pemurnian enzim

2. A

UJIAN AKHIR

1. Acuan Wajib

a. Togu Gultom, 2003, Pengantar Enzimologi. Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia FMIPA UNY,. 2. Acuan Anjuran.

a. Azis Darwis dan E. Sukara. (1990). Isolasi, Purikasi dan Karakterisasi Enzim. Bogor : Pusat Antar Universitas Bioteknologi.

b. Chibata, I, (1978), Immobilized Enzyme, Research and Development. Tokyo : Kodhansa, Ltd c. Palmer, T. (1994). Understanding Enzyme. 3th_{. Edition. Londodn : ellisherword.}

V. EVALUASI

Nomor Komponen Evaluasi Bobot (%)

2 Tugas-tugas 15 %

JUMLAH 100 %

2. Diskusi 6. Tugas individu/kelompok

Mengetahui

Dr. Hari Sutrisno

NIP. 19670407 199203 1 002

Dosen

(11)

SILABI

SIL/SIK224/02 18 Februari 2011

Fakultas : FMIPA

Program Studi : Pendidikan Kimia

Mata Kuliah/Kode : Enzimologi

Jumlah SKS : Teori : 2 SKS; Praktek : - SKS

Semester : VII

Mata Kuliah Prasyarat/Kode : Biokimia ; Kode :

Dosen : Togu Gultom, M.Pd; M.Si dan Eddy S, Apt, M.Si

(12)

Mata kuliah ini berisi al : Pengertian enzim, Tata nama enzim, Kinetika enzim, Inhibisi enzim meliputi Michaelis Mnten, Linewaver - Burk, Eddy Hotsfee, Hanes, dan Dixon, kemudian diikuti amobilisasi ennzim dan isolasi enzim II. Standar Kompetensi Mata Kuliah

Mampu mendiskripsikan struktur, tata nama, kinetika baik Michaelis Mnten, Linewaver - Burk, Eddy Hotsfee, Hanes, Dixon dan amobilisasi enzim, serta isolasi enzim.

III. Rencana Kegiatan

Tatap muka ke

Kompetensi Dasar Materi Pokok Strategi

Perkuliaha

Menjelaskan pengertian enzim

Mendeskripsikan tatanama enzim

Menjelaskan mekanisme kerja enzim dengan kofaktor

Menjelaskan mekanisme reaksi tanpa kofaktor Menyebutkan koenzim turuna vitamin

Mendeskripsikan koenzim zat anorganik

Menjelaskan kinetika

reaksi enzim

reaksi dengan inhibisi irreversibel

reaksi reversible

Menurunkan persamaan Reaksi Eddy-Hotsfee Mendeskripsikan Kinetika Hanes

Mendeskripsikan kinetika Dixon

Menjelaskan proses

amobilisasi enzim

Mendeskripsikan proses isolasi ennzim

Pengantar pengertian enzim

Klasifikasi dan tatanama

Mekanisme kerja ennzim

Mekanisme reaksi tanpa Kovaktor

Koenzim turunan vitamin

Koenzim zat anorganik

Kinetika Reaksi enzim

Kinetika Inhibisi

Irreversibel

Kinetika reaksi reversible

Kinetika Eddy - Hotsfee

Kinetika Hanes 2011, Pengantar

Enzimologi:

Yogyakarta, UNY-FMIPA

A.Tambahan 2. Azis Darwis dan

Sukara, E. 1990.

Isolasi,

Purifikasi dan Karakterisasi

Fundamental of

Enzymology,

Oxford : Oxford Science

Publication

IV. Referensi/Sumber Bacaan Wajib

A. Wajib

1. Togu Gultom,(2011), Pengantar Enzimologi: Yogyakarta, UNY-FMIPA

B. Lampiran

1. Azis Darwis dan Sukara, E. 1990. Isolasi, Purifikasi dan Karakterisasi Enzim,

(13)

2. Palmer, T, 1984, Understanding Enzime, New Yorka : The Farmaceutical Press 3. Price C, !984, Fundamental of Enzymology, Oxford : Oxford Science

V. Evaluasi

No Komponen Bobot %

1 Partisipasi kuliah 10

2 Tugas-tugas 15

3 Ujian tengah semester 25

4 Ujian akhir semester 50

JUmlah 100 %

Mengetahui

Dr. Hari Sutrisno

NIP. 19670407 199203 1 002

Dosen