Lampiran 1. Mystus gulio
(Sumber: http://acsi.acnatsci.org/base/image_list.html?mode=genus&genus=Mystus)
Lampiran 2. Hasil Skrining DNA
Sampel
Marka
OPA-9 OPAC-14 OPAC-14 OPAC-14
900 935 1250 1380
M.gulio 1 0 0 0 0
M.gulio 2 0 0 0 0
M.gulio 3 0 0 0 0
M.gulio 4 0 0 0 0
M.gulio 5 0 0 0 0
M.gulio 6 0 0 0 0
M.gulio 7 0 0 0 0
M.gulio 8 0 0 0 0
M.gulio 9 0 0 0 0
M.gulio 10 1 0 0 0
M.gulio 11 0 1 0 1
M.gulio 12 0 0 1 0
Lampiran 3. Hasil Analisis (Molecular Diversity Indices)
===============================
== Standard diversity indices : (Mystus gulio) ===============================
Reference: Nei, M., 1987. No. of gene copies : 12 No. haplotypes : 4 No. of loci : 4
No. of usable loci : 4 loci with less than 5.00 % missing data
No. of polymorphic sites : 4 Haplotype-level computations ---
Sum of square freqs. : 0.5833
Gene diversity : 0.4545 +/- 0.1701 ================================
== Molecular diversity indices : (Mystus gulio) ================================
Reference: Tajima, F., 1983. Tajima, F. 1993.
Lampiran 4. Spesifikasi Bahan dan Peralatan
No Nama Bahan Kegunaan
1 Alkohol 96% Pengawet spesimen
2 chelex Memurnikan senyawa lain melalui pertukaran
ion
3 Dithiotritol Menstabilkan enzim dan protein
4 Proteonase-K Pemecah Protein dan menghilangkan kontaminasi
5 TAE
Buffer solution agarosa dalam proses elektroforesis berfungsi untuk memisahkan DNA dan RNA
6 Agarosa Gel elektroforesis untuk
7 etidium bromide
pewarna dan pengikat kuat pada DNA dan untuk memvisualisasi potongan DNA yang telah dipisahkan pada gel elektroforesis
8 loading dye Pemberat agar tidak keluar dari sumuran
9 DNA marker
Penanda posisi pasangan basa dari molekul DNA yang bermigrasi dan acuan untuk mengetahui ukuran DNA hasil ampifikasi.
10 Buffer PCR Mempertahankan pH
11 dNTPs Mengkatalisasi reaksi pembentukan DNA 12 Taq DNA Polimerase Enzim DNA polimerase
13 ddH₂O Pelarut DNA
14 Primer komponen PCR yang nantinya akan menempel pada ssDNA saat proses annealing
15 kertas parafilm tempat menghomogenkan sampel DNA dan
loading dye
No Nama Alat Kegunaan
1
eppendorf
mengixolasi DNA dan membuat larutan master mix
2
micropipets dan tips
memindahkan cairan yang bervolume cukup kecil
3 thermomixer inkubasi pada proses isolasi
4 microcentrifuge Memisahkan molekul menurut berat jenis 5 electric stove Pemanas dan mempercepat homogenisasi 6 erlenmeyer Menampung dan menghomogenkan larutan 7 timbangan analitik Alat ukur untuk menimbang agaros
8 electrophoresis
chamber wadah gel agarosa
9
power supply
merubah arus AC menjadi arus DC untuk pemberi daya
10 UV transiluminator Melihat hasil elektroforesis
11 thermocycler mesin PCR untuk menggandakan DNA 12 nanophotometer mengukur kuantitatif DNA
13 gloves melindungi terkena DNA-se yang dapat merusak
DNA
14 kamera digital dokumentasi
