EKSTRAKSI
DAN
PEMURNIAN
PROTEASE
DARI
Bacillus pumiiius(Y1)
1 9 9 4
FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR
Julius. F 27. 0959. Ekstraksi dan Pemurnian Protease Dari Bacillus pumillus (Y1). Di bawah bimbingan D r . Ir. Maggy T. Suhartono dan I r . Sutrisno Koswara.
RINGKASAN
Bacillus adalah bakteri yang sangat potensial u n t u k d i j a d i kan sumber enzim protease. Bacillus yang digunakan dalam penelitian i n i a d a l a h j e n i s B. pumillus (Y1) y a n g diisolasi d a r i limbah c a i r t a h u ( L i kumahwa, 1993). Sedangkan penelitian ini b e r t u j u a n u n t u k mela-
k u k a n e k s t r a k s i dan p e m u r n i a n enzim protease d a r i B. purnillus (Y1 ) dengan menggunakan berbagai kolom kromatografi [DEAE ( d i e t i l a m i n o e t i l ) Sephadex A-50 dan A m b e r l i t e l u n t u k mendapatkan enzim protease yang r e l a t i f murni.
Dalam penelitian i n i dilakukan fermentasi bakteri u n t u k mengha- s i l k a n enzim protease dalam limbah cair tahu dengan penambahan 2%
skim, lalu d i i k u t i ekstraksi enzim dengan garam ammonium s u l f a t 55% ( w / v ) , besi (111) k l o r i d a , aluminium (111) k l o r i d a dan aseton dan d i l a r u t k a n kembali dalam b u f f e r sodium sitrat, sodium ditionat dan f o s f a t 0.01 M pH 8.0, kemudian d i d i a l i s i s dalam k a n t u n g selofan. Dialisat lalu di kromatografi dalam resin penukar anion (Amberlite I R A
400 dan DEAE Sephadex A
-
50) dan penukar kation (Amberlite DP-1). F r a k s i - f r a k s i yang diperoleh, dipekatkan dengan pengeringan b e k u dan selanjutnya dielektroforesis dalam gel SDS-poliakrilamid.Dari hasil e k s t r a k s i dengan berbagai macam garam pengendap (ammonium sulfat, besi (111) klorida, aluminium (111) klorida), maka
setelah d i l a r u t k a n kembaii hasil l a r u t a n enzim yang mempunyai a k t i f i - t a s t i n g g i dihasilkan pada pengendapan oleh besi (111) k l o r i d a yang kernudian d i l a r u t k a n dalam b u f f e r s i t r a t y a i t u sebesar 1.482 IU/ml, a k t i f i t a s spesifiknya 67.364 IU/mg dan konsentrasi p r o t e i n n y a 0.022 rng/ml dan d i i k u t i dengan ammonium s u l f a t (0.348 IU/ml; 0.742 IU/mg; 0.742 mg/ml). Sedangkan u n t u k pengendapan dengan p e i a r u t organik (aseton t e k n i s ) , a k t i f i t a s t e r t i n g g i d i d a p a t k a n pada p e r b a n d i n g a n aseton dengan ekstrak kasar enzim sebesar 1 : 3 yaitu 2.406 IU/ml dengan konsentrasi protein 2.367 mg/mi. Namun karena pertimbangan keamanan pangan oleh logam b e r a t (Fe) yang c u k u p r i s k a n dan dilihat d a r i segi ekonomis, maka l a r u t a n enzim yang berasal d a r i pengenda- p a n dengan ammonium s u l f a t l a h (0.393 I U / m l ) yang d i p a k a i u n t u k tahap pemurnian selanjutnya.
Dari hasil penelitian pemurnian protease dari Bacillus pumillus ( Y l ) , setelah pernisahan d e n g a n A m b e r l i t e I R A 400 d i d a p a t k a n d u a kelompok gabungan f r a k s i - f r a k s i d e n g a n a k t i f i t a s p r o t e a s e c u k u p t i n g g i y a i t u A ( f r a k s i nomor 2
-
5 ) dan B ( f r a k s i nomor 11-
18) dengan a k t i f i t a s masing-masing 0.186 I U / m l dan 0.159 I U / m l s e r t a a k t i f i t a s spesifiknya 0.451 IU/mg dan 0.846 IU/mg. Konsentrasi pro- t e i n u n t u k A dan B b e r t u r u t - t u r u t adalah 0.412 mg/ml dan 0.188 rng/ml. Pada pemisahan dengan Amberlite DP-1 hanya didapat satu kelompok f r a k s i dengan a k t i f i t a s t e r t i n g g i yaitu C ( f r a k s i nomor 2-
6 dengan a k t i f i t a s protease 0.194, a k t i f i t a s spesifik 0.357 IU/mg, konsen- t r a s i protein 0.442 mg/ml). Sedangkan u n t u k DEAE Sephadex A-
50 didapatkan dua kelompok gabungan f r a k s i - f r a k s i y a i t u E (nomor 6 -15) dan G (nomor 22
-
24) d e n g a n a k t i f i t a s protease 0.186 IU/ml; a k t i f i t a s spesifik 0.576 IU/mg; konsentrasi protein 0.323 mg/ml dan0.131 IU/ml; 0.985 IU/mg; 0.133 rng/ml.
U n t u k kelipatan pemurnian, niiai terbesar didapat pada pemur-
n i a n dengan r e s i n D E A E Sephadex A - 50 (sebesar 2.5
-
4.3 k a l i ) kernudian Arnberiite penukar anion (IRA 400) (sebesar 2-
3.6 kali) dan Arnberlite penukar kation (DP-1) (1.9 kali).Dari perhitungan hasil elektroforesis, u n t u k f r a k s i A didapat-
kan p e r k i r a a n berat rnolekul enzim adalah 19550.34 Dalton; f r a k s i 6
didapat dua p i t a dengan perkiraan berat rnolekul enzimnya 25202.17
Dalton dan 19550.34 Dalton. Untuk f r a k s i C t i d a k dapat d i t e n t u k a n
b e r a t rnolekul aproksimatnya karena p i t a yang dihasilkan d a r i elektro-
foresis t i d a k c u k u p jelas terlihat. Sedangkan u n t u k f r a k s i E dan G
didapat dua p i t a dengan berat moiekul dugaannya 22197.10 Dalton dan
I N S T I T U T PERTANIAN BOGOR
FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN
EKSTRAKSI DAN PEMURNIAN PROTEASE
DARI Bacillus purnillus (Y1 )
S K R I P S I
sebagai s a l a h s a t u s y a r a t u n t u k mernperoleh g e l a r
SARJANA TEKNOLOGI PERTANIAN
p a d a J u r u s a n T e k n o l o g i Pangan d a n Gizi F a k u l t a s T e k n o l o g i P e r t a n i a n Institut P e r t a n i a n B o g o r Oleh J U L I U S F 27. 0959 1994
JURUSAN TEKNOLOGI PANGAN DAN G I Z I
FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN
I N S T I T U T PERTANIAN BOGOR FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN
EKSTRAKSI DAN PEMURNIAN PROTEASE DARI Bacillus pumillus (Y1 )
SKRIPSI
sebagai s a l a h satu s y a r a t u n t u k memperoleh gelar SARJANA TEKNOLOGI PERTANIAN
p a d a J u r u s a n T e k n o l o g i Pangan d a n Gizi F a k u l t a s T e k n o l o g i P e r t a n i a n Institut P e r t a n i a n Bogor Oleh J U L I U S F 27. 0959 D i s e t u j u i , Bogor, S e p t e m b e r 1994 .
-?/,p-.-r
i
A/'.&
Dr. Ir. M&y T. S u h a r t o n oKATA PENGANTAR
P u j i s y u k u r kepada T u h a n Yang Maha Kasih, k a r e n a b e r k a t k a r u n i a - N y a l a h p e n u l i s d a p a t rnenyelesaikan penulisan s k r i p s i i n i dengan baik dan tepat pada waktunya.
Dengan t e r s u s u n n y a laporan ini, rnaka penulis hendak rnengha- t u r k a n terirna kasih kepada :
1. I b u Dr. Ir. Maggy Thenawijaya Suhartono, selaku dosen
pernbirnbing I dan Bapak Ir. Sutrisno Koswara selaku
dosen pernbirnbing 11, yang telah rnernberi kan bantuan dan
pengarahan selarna berlangsungn y a penelitian dan proses
penyusunan s k r i p s i , s e r t a atas kesediaannya rnenjadi dosen p e n g u j i I dan 11.
2. Bapak Ir. Feri K. yang telah bersedia u n t u k menjadi dosen p e n g u j i I11 pada u j i a n skripsi.
3. Yang kukasihi d i Jakarta, Ibu, Ayah, Saudara-saudaraku
dan Rok k i d a yang telah rnernberi kan kasi h sayang, dorongan, sernangat dan bantuan baik rnoril dan rnateriil.
4. Sernua ternan-ternan se-lab dan para laboran (Pak Putu "you're t h e most", Junaidi, Marcella, Mardi, Agus, Lili, Ricki, Kang Yaya, I b u Eni, I b u Ika, Pak Angga, Pak Ujang dan lain-lain) yang telah rnernberi kan banyak bantuan dan suasana k e r j a yang rnenyenangkan.
5. Sernua ternan-ternanku d i Bogor, Narto Sunarno, Evi Wirat- ma, Ong Hui Yung, Elingsari, Fiametta, Grace, St. Agung
8 I
N., Suciono, Durrnan, Herijanto dan lain-lain yang telah
memberi kan a r t i sebuah persahabatan.
6. Semua pihak yang t u r u t p u l a rnernbantu penulis daiarn rnenye- iesai kan penyusunan laporan ini.
P e n u l i s menyadari bahwa dalam pelaksanaan rnaupun daiarn penyusunan s k r i p s i i n i masih jauh dari sernpurna dan tidak lepas dari kesalahan, sehingga k r i t i k dan saran u n t u k kesempurnaan iaporan i n i sangat diharapkan. Akhirnya, semoga tuiisan i n i dapat rnemberi kan manfaat bagi yang rnembutuhkannya.
DAFTAR I S 1 KATA PENGANTAR
. . .
i DAFTAR I S 1. . .
iii DAFTAR GAMBAR. . .
v i DAFTAR T A B E L. . .
v i i DAFTAR L A M P I R A N. . .
v i i i. . .
I.
PENDAHULUAN 1 A.
LATAR BELAKANG. . .
1 B.
TUJUAN. . .
3 I 1.
T I N J A U A N PUSTAKA. . .
4 A.
PROTEASE MIKROBA. . .
4. . .
B.
PROTEASEBaci77us pumi77us
6C
.
E K S T R A K S I DAN PEMURNIAN. . .
7 D.
ELEKTROFORESIS. . .
1 5 I11.
METODA P E N E L I T I A N. . .
1 8 A.
BAHAN DAN A L A T. . .
18 1.
BAHAN. . .
1 8 2.
A L A T. . .
1 8 8.
METODA P E N E L I T I A N. . .
1 9 1.
PRODUKSI E N Z I M. . .
1 9.
. . .
a P r o d u k s i I n o k u l u m 1 9 b.
P r o d u k s i E n z i r n. . .
1 9 2.
PEMURNIAN E N Z I M. . .
2 0 a.
P e n g e n d a p a n d e n g a n b e r b a g a i p e r e a k s i. .
21.
. . .
b D i a l i s i s 2 2c . K r o m a t o g r a f i
. . .
P e r s i a p a n k o l o m DEAE Seahadex A-50. .
P e r s i a p a n k o l o m A m b e r l i t e. . .
oenukar a n i o n dan k a t i o n d . E l e k t r o f o r e s i s. . .
P e r s i a p a n Sampel (Hames, 1987). . .
P e r s i a p a n b u f f e r r e s e r v o i r. . .
(Sigma,1988) Pembuatan Gel e l e k t r o f o r e s i s SDS ( 1 0 % ). . .
(Hames, 1987) Pewarnaan ( S t a i n i n q ) dan p e n g h i l a n g a n warna ( d e s t a i n i n g l (Sigma, 1988). . .
Mo 7ecu7ar m a r k e r (Sigma, 1988). . .
3 . ANALISIS. . .
. . .
a . Pengukuran j u m l a h p r o t e i n b . P e n g u j i a n a k t i f i t a s p r o t e a s e. . .
I V . HASIL DAN PEMBAHASAN. . .
A . Pemurnian Enzim P r o t e a s e Dengan Kolom
A m b e r l i t e Penukar A n i o n
. . .
B . Pemurnian Enzim P r o t e a s e Dengan KolomA m b e r l i t e Penukar K a t i o n
. . .
C . Pemurnian Enzim P r o t e a s e Dengan Kolom