• Tidak ada hasil yang ditemukan

• Berbagai macam reaksi biokimia yang

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Membagikan "• Berbagai macam reaksi biokimia yang "

Copied!
27
0
0

Teks penuh

(1)

ENZIM

ENZIM

(2)

• Berbagai macam reaksi biokimia yang

terjadi dalam organisme hampir semuanya diperantarai oleh serangkaian katalis

biologi yang dikenal dengan ENZIM

• Enzim juga dapat diartikan sebagai

molekul biopolimer yang tersusun dari serangkaian asam amino dalam kondisi dan susunan rantai yang teratur dan tetap

ENZIM

(3)

Enzim berbeda dengan katalis kimia biasa Enzim berbeda dengan katalis kimia biasa

dalam beberapa hal dalam beberapa hal : :

1. Laju reaksi yang lebih tinggi

2. Kondisi reaksi yang ’mild’

3. Spesifikasi reaksi lebih besar

4. Kapasitas untuk pengaturan

(4)

An enzyme controlled An enzyme controlled

pathway pathway

• Enzyme controlled reactions proceed 10

8

to 10

11

times faster than corresponding non-enzymic reactions.

© 2007 Paul Billiet ODWS

(5)

FAKTOR-FAKTOR YANG MEMPENGARUHI FAKTOR-FAKTOR YANG MEMPENGARUHI

AKTIVITAS ENZIM AKTIVITAS ENZIM

• Konsentrasi Substrat

• Kadar Enzim

• pH

• Suhu

• Zat Penghambat (inhibitor)

• AKTIVATOR

(6)

Pengaruh pH terhadap Kecepatan Reaksi

Pengaruh Konsentrasi Substrat terhadap Kecepatan Reaksi

(7)

Tata nama enzim Tata nama enzim

• Enzim diberi nama sesuai dengan nama substrat dan reaksi yang dikatalisis

• Biasanya ditambah akhiran ase

• Enzim dibagi ke dalam 6 golongan besar

(8)

Penamaan Enzim Penamaan Enzim

• Oksidoreduktase (EC 1)

 Enzim yang termasuk dalam golongan ini adalah dehidrogenase dan oksidase

• Transferase (EC 2)

 Bekerja sebagai katalis pada reaksi pemindahan suatu gugus dari suatu senyawa ke senyawa lain. sebagai contoh ialah

metiltransferase, karboksitransferase, asil transferase dan amino transferase/transaminase

• Hidrolase (EC 3)

 Bekerja sebagai katalis pada reaksi hidrolisis. Ada tiga jenis

hidrolase yakni yang memecah ikatan ester, ikatan glikosida dan yang memecah ikatan peptida

Enzyme commission (EC)

(9)

• Liase (EC 4)

 Mempunyai peranan penting dalam reaksi pemisahan suatu gugus dari suatu substrat (bukan cara hidrolisis)

atau sebaliknya. Contoh enzim dalam golongan ini adalah dekarboksilase, aldolase dan hidratase

• Isomerase (EC 5)

 Enzim yang termasuk golongan ini bekerja pada reaksi perubahan intramolekuler, misalnya reaksi perubahan

glukosa menjadi fruktosa, senyawa L menjadi senyawa D, senyawa sis menjadi trans.

• Ligase (sintesa) (EC 6)

 Bekerja pada reaksi-reaksi penggabungan dua molekul.

Ikatan yang terbentuk adalah adalah ikatan C-O, C-S, C-N

atau C-C. Contohnya adalah enzim glutamin sintease dan

piruvat karboksilase

(10)

APA ITU ENZIM ? APA ITU ENZIM ?

• 1800 Pencernaan daging oleh sekresi lambung.Perubahan pati mjd gula oleh air liur

• 1850 LOUIS PASTEUR.Fermentasi gula mjd alkohol oleh ragi dikatalis fermen dsb enzim (tdk dpt dipisahkan dr sel ragi hidup)

• 1897 EDUARD BUCKNER. Berhasil mengekstrak bentuk aktif sel ragi yi enzim ferment gula mjd alkohol

• 1926 Kristal urease ekstrak kacang tdr dari protein shg semua ensim adalah protein. Richard Willstatter (jerman) menentang kristal urease.

Enzim adalah senyawa BM rendah.Kristal urease adalah cemaran

• 1930 Isolasi proteolitik yaitu mengkristalkan pepsin dan tripsin (keduanya protein).

(11)

DEFINISI ENZIM

1. Protein yang mempunyai daya katalitik spesifik

2. Protein pembeda non enzimatik katalis 3. Enzim adalah protein spesifik katalis

reaksi biologis (disebut biokatalis)

Spesifik: hanya cocok untuk satu macam substrat saja atau sekelompok kecil substrat yang

susunannya sama dan fungsinya sama

(12)

BEDA KATALIS DAN BEDA KATALIS DAN

BIOKATALIS BIOKATALIS

Klasifikasi Katalis Biokatalis 1.Senyawa Logam Protein

(Pt,Ni,Cu)

2.Pusat Aktif Negatif Positif

3.Kerja Tdk spesifik Spesifik

4.Sifat Dena Negatif Positif

turasi

(13)

Susunan enzim Susunan enzim

• Komponen utama enzim adalah protein

• Protein yang sifatnya fungsional, bukan protein struktural

• Tidak semua protein bertindak sebagai

enzim

(14)

SISI AKTIF SISI AKTIF

• Pada sisi aktif ada 2 gugus

• 1. Gugus katalitik

• 2. Gugus pengikat

ENZIM

Protein <100 %+ Non protein (kofaktor)

AKTIF PROTEIN 100 %

(15)
(16)

RUMUS DASAR REAKSI RUMUS DASAR REAKSI

ENZIMATIS ENZIMATIS

• E + S ES E + P

• Sebelum melakukan katalitik Enzim

bergabung Substrat menjadi ES. Tidak semua enzim dapat bergabung substrat tapi hanya pada satu sisi yi sisi aktif

(tempat dimana E bergabung S)

(17)

Contoh koenzim Contoh koenzim

1. NAD (koenzim 1) 2. NADP (koenzim 2) 3. FMN dan FAD

4. Cytokrom: cytokrom a, a3, b, b6, c, dan f 5. Plastoquinon, plastosianin, feredoksin

6. ATP: senyawa organik berenergi tinggi, mengandung 3 gugus P dan adenin

ribose

(18)

Sifat enzim Sifat enzim

• Enzim dibentuk dalam protoplasma sel

• Enzim beraktifitas di dalam sel tempat

sintesisnya (disebut endoenzim) maupun di tempat yang lain diluar tempat

sintesisnya (disebut eksoenzim)

• Sebagian besar enzim bersifat endoenzim

(19)

1.

Enzim bersifat koloid, luas permukaan besar, bersifat hidrofil

2.

Dapat bereaksi dengan senyawa asam maupun basa, kation maupun anion

3.

Enzim sangat peka terhadap faktor-faktor yang menyebabkan denaturasi protein misalnya suhu, pH dll

4.

Enzim dapat dipacu maupun dihambat aktifitasnya

5.

Enzim merupakan biokatalisator yang dalam

jumlah sedikit memacu laju reaksi tanpa merubah keseimbangan reaksi

6.

Enzim tidak ikut terlibat dalam reaksi, struktur enzim tetap baik sebelum maupun setelah reaksi berlangsung

7.

Enzim bermolekul besar

8.

Enzim bersifat khas/spesifik

(20)

 Suhu: optimum 30

0

C, minimum 0

0

C, maksimum 40

 Logam, memacu aktifitas enzim: Mg, Mn, Co, Fe

 Logam berat, menghambat aktivitas enzim: Pb, Cu, Zn, Cd, Ag

 pH, tergantung pada jenis enzimnya (pepsin aktif kondisi asam, amilase kondisi netral, tripsin kondisi basa)

 Konsentrasi substrat, substrat yang banyak mula-mula memacu aktifitas enzim, tetapi

kemudian menghambat karena: penumpukan produk (feed back effect)

 Konsentrasi enzim, peningkatan konsentrasi enzim memacu aktifitasnya

 Air, memacu aktifitas enzim

 Vitamin, memacu aktifitas enzim

(21)

CARA KERJA ENZIM

1. Hipotesis Emil Fisher 1894. Substrat dan

enzim hrs cocok supaya enzim dpt mengubah substrat. Dikenal LOCK and KEY

2. KOAHLAND. Substrat masuk celah enzim mk bagian itu mengatur sendiri shg substrat cocok (terjadi perubahan geometrik pd protein

enzim). Dikenal teori INDUCED FIT

(22)

The Lock and Key Hypothesis The Lock and Key Hypothesis

Enzyme may be used again Enzyme-

substrate complex E

S

P E

E

P

Reaction coordinate

© 2007 Paul Billiet ODWS

(23)

Induced Fit Theory

Induced Fit Theory

(24)

Penghambatan aktifitas enzim ada dua tipe:

1. Kompetitif: zat penghambat mempunyai struktur yang mirip dengan substrat

sehingga dapat bergabung dengan sisi aktif enzim. Terjadi kompetisi antara

substrat dengan inhibitor untuk

bergabung dengan sisi aktif enzim (misal feed back effect)

2. Non kompetitif: zat penghambat

menyebabkan struktur enzim rusak

sehingga sisi aktifnya tidak cocok lagi

dengan substrat

(25)
(26)

1. Protein memegang peran penting dalam hampir semua proses biologi.

Peran dan aktivitas protein terlihat dalam katalisis enzimatik, transport dan penyimpanan, koordinasi gerak, penunjang mekanis, proteksi imun, membangkitkan dan menghantar impuls saraf, pengaturan pertumbuhan dan diferensiasi, dan sebagainya

2. Asam amino merupakan unit dasar penyusun struktur protein, yaitu

rangkaian monomer-monomer asam amino yang menyusun polipeptida protein

3. Berbagai macam reaksi biokimia yang terjadi dalam organisme hampir semuanya diperantarai oleh serangkaian katalis biologi yang dikenal dengan enzim. Enzim merupakan molekul polimer yang beragam yang dihasilkan sel hidup. Keragaman ini bukan hanya nyata di dalam bentuk dan ukurannya, tetapi juga di dalam peranannya. Di dalam sel sumber enzim terlibat dalam setiap reaksi biokimia, mulai dari konversi energy, metabolism makanan, mekanisme pertahanan sel, komunikasi antar sel, sampai ke konversi sifat keturunan. Enzim juga dapa diartikan sebagai molekul biopolymer yang tersusun dari seragkaian asam amino dalam kondisi dan susunan rantai yang teratur dan tetap

(27)

Klas Tipe reaksi Oksidoreduktase

(nitrat reduktase)

Memisahkan dan menambahkan elektron atau hidrogen

Transferase (Kinase)

Memindahkan gugus senyawa kimia

Hidrolase

(protease, lipase,

amilase) Memutuskan ikatan kimia dengan penambahan air

Liase

(fumarase) Membentuk ikatan rangkap dengan melepaskan satu gugus kimia

Isomerase

(epimerase) Mengkatalisir perubahan isomer Ligase/sintetase

(tiokinase)

Menggabungkan dua molekul yang disertai dengan hidrolisis ATP

Polimerase

(tiokinase) Menggabungkan monomer-monomer sehingga

terbentuk polimer

Referensi

Dokumen terkait

Dalam melaksanakan kegiatan PIPPK, Lembaga Kemasyarakatan (RW, PKK, LPM dan Karang Taruna) Kelurahan harus berpedoman kepada jenis kegiatan yang pada dasarnya meliputi

Stressor yang mencetus perilaku kekerasan bagi setiap indi/idu bersifat unik. Stressor tersebut dapat disebabkan dari luar maupun dari dalam. @ontoh stressor yang bersal

Ada beberapa konsep dalam pendekatan analisis jejaring sosial, selain menggambarkan pola yang terbentuk dari hubungan antara simpul, node atau aktor, analisis jejaring sosial juga

Kemitraan adalah hubungan kerjasama yang terjadi antara civil society, pemerintah dan swasta dalam rangka mencapai suatu tujuan yang didasarkan pada prinsip

Dalam NLP, pengenalan token dilakukan pada tahap analisis leksikal yang bertujuan untuk mendapatkan daftar token (kata/leksikon) yang diperoleh melalui kalimat tanya

V,xax Komite &amp;kreditasi hlasional LANJ UTAN LAM PIRAN SERTIFIKAT AKREDITASI LABORATORI U M NO.. LANJUTAN LAMPIRAN SERTIFIKAT AKREDITASI LABORATORIUM

Saifullah, S.H., M.Hum, selaku dosen wali selama penulis menuntut ilmu di Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Pembimbing yang telah memberikan

Penelitian ini telah dilakukan pada bulan Juli – Agustus 2015 pengambilan sampel vegetasi dasar dilakukan pada lokasi bekas pertambangan emas pada kenagarian