Sekuensing suatu fragmen DNA menggunakan metode
BAB XIII. SEKUENSING DNA
... biasanya menggunakan fosfat radioaktif atau suatu nukleotida pada ujung 3’. Metode Maxam-Gilbert dapat diterapkan baik untuk DNA untai ganda maupun DNA untai tunggal dan melibatkan pemotongan ...
6
Penggunaan Lintasan Euler dalam Penyederhanaan Sekuensing DNA
... Sekuensing DNA adalah proses penentuan urutan nukleotida pada suatu fragmen ...DNA. Sekuensing DNA dapat kita analogikan sebagai puzzle acak ...potongan-potongan DNA dan ...
5
Penanda Genetik Tarsius (Tarsius Spp.) Dengan Menggunakan Gen Cytochrome Oxidase I (COI) DNA Mitokondria (MtDNA) Melalui Metode Sekuensing
... (COI) DNA mitokondria (mtDNA) pada Tarsius ...Penelitian menggunakan enam belas individu terdiri dari 10 Tarsius bancanus, 4 Tarsius ...daerah menggunakan gen ...dihitung menggunakan Kimura-2 ...
10
KLONING FRAGMEN DNA GENOM YANG TERLIBAT DALAM TOLERANSI ASAM
... mengikuti metode seperti yang diterangkan Wahyudi et al . (2001). DNA genom mutan sensitif asam-Al dipotong dengan Eco RV (enzim ini diketahui tidak memotong transposon mini-Tn 5 Km1), selanjutnya ...
9
Penggunaan DNA Mitokondria Sebagai Penanda Sumber Gelatin Sediaan Gummy Dengan Teknik Polymerase Chain Reaction dan Sekuensing DNA
... amplikon DNA dilakukan menggunakan gel agarosa 1,5 % dengan tegangan 70 volt selama 50 ...digunakan DNA ladder 1 kb yang memiliki rentang fragmen 250 bp hingga 10000 ...isolat DNA ...
7
Penerapan Teori Graf dalam Pembacaan Genom Meliputi Mapping, Assembling, dan Sekuensing DNA
... proses sekuensing mengasumsikan spektrum bersifat ideal, yaitu spektrum diasumsikan tidak memiliki tingkat ...rantai DNA utuh dan l adalah panjang ...sekuens fragmen oglinukleotida menggunakan ...
6
AMPLIFIKASI DNA DAN SEKUENSING DAERAH ITS-1 rdna TRICHODERMA Sp. LBKURCC22
... digunakan metode-metode molekuler untuk penentuan spesies fungi secara ...tepat. Metode molekuler untuk identifikasi spesies adalah berdasarkan penentuan sekuens DNA dan analisis ...
7
Karakteristik Primer pada Polymerase Chain Reaction (PCR) untuk Sekuensing DNA: Mini Review
... [1] menggunakan Bolton and McCarthy’s Formulauntuk menghitung suhu leleh, sementara penelitian lain lebih memilih menggunakan Wallace’s Formula [2], ...menyebutkan metode yang digunakan dalam ...
10
Karakterisasi Fragmen Dna Dari Bakteri Antagonis Yang Terlibat Dalam Aktivitas Antifungi Ganoderma Boninense
... teknologi DNA rekombinan dan bahkan ketika informasi secara bioinformatik suatu urutan protein target sangat tarbatas dan atau belum ...kloning DNA kromosom, ekstraksi dengan metode standar dan ...
44
Karakterisasi Fragmen DNA Burkholderia Gladioli Yang Terlibat Dalam Aktivitas Antifungi Ganoderma Boninense
... dengan menggunakan turunan transposon mini-Tn5Km R (de Lorenzo 1990) yang dikemas dalam plasmid ...antagonis menggunakan metode biparental mating pada kertas filter steril sesuai yang dideskripsikan ...
43
KLONING FRAGMEN DNA GENOM YANG TERLIBAT DALAM TOLERANSI ASAM-ALUMINIUM PADA BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM
... mengikuti metode seperti yang diterangkan Wahyudi et al. (2001). DNA genom mutan sensitif asam-Al dipotong dengan EcoRV (enzim ini diketahui tidak memotong transposon mini-Tn5Km1), selanjutnya diekstraksi ...
9
DETEKSI FRAGMEN DNA RENDAH PENGKODE GEN SITOKROM B (cyt b) BABI PADA SAMPEL MIE INSTAN MENGGUNAKAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
... dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) yang spesifik terhadap DNA suatu ...mengandung DNA cytb babi. Hal tersebut diketahui dari munculnya pita DNA pada daerah 149 ...
6
Deteksi Fragmen DNA Rendah Pengkode Gen Sitokrom B (cyt b) Babi pada Sampel Mie Instan Menggunakan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR)
... dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) yang spesifik terhadap DNA suatu ...mengandung DNA cytb babi. Hal tersebut diketahui dari munculnya pita DNA pada daerah 149 ...
6
Klasifikasi Fragmen Metagenome Menggunakan Metode Support Vector Machine (SVM)
... sequence DNA metagenome yang sudah dipilih lalu diuraikan fragmennya menggunakan perangkat lunak MetaSim (Richter et ...ribu fragmen, sedangkan untuk data uji berjumlah 100 ribu ...Panjang ...
59
ANALISIS FRAGMEN DNA GENOM YANG TERLIBAT DALAM TOLERANSI ASAM-ALUMINIUM PADA Bradyrhizobium japonicum DINI NURDIANI
... 34 putative inner membrane protein (protein membran dalam) yang disandikan oleh gen yhfK dari Salmonella typhimurium yang berfungsi sebagai efflux transporter. Pompa efflux merupakan protein transport yang terlibat dalam ...
57
KLASIFIKASI FRAGMEN METAGENOME MENGGUNAKAN METODE SUPPORT VECTOR MACHINE (SVM) ARINY
... sequence DNA metagenome yang sudah dipilih lalu diuraikan fragmennya menggunakan perangkat lunak MetaSim (Richter et ...ribu fragmen, sedangkan untuk data uji berjumlah 100 ribu ...Panjang ...
59
KLONING FRAGMEN DNA GENOM YANG TERLIBAT DALAM TOLERANSI ASAM-ALUMINIUM PADA Bradyrhizobium japonicum MELALUI MUTAGENESIS DENGAN TRANSPOSON.
... melalui metode mutagenesis dengan transposon untuk mengetahui gen yang terlibat dalam toleransi asam-aluminium pada .... Fragmen DNA sebesar ...(25) menggunakan teknik inverse polymerase chain ...
26
Analisis Fragmen DNA Ikan Kerapu Macan (Epinephelus fuscoguttatus) yang Tahan dan Rentan terhadap Bakteri Vibrio alginolyticus
... ekstraksi DNA genom. DNA genom diekstraksi menggunakan kit (Puregene, Minneapolis, USA) sesuai dengan prosedur yang ...Konsentrasi DNA diukur menggunakan mesin kuantifikasi ...
9
Keanekaragaman Dan Kekerabatan Lalat Buah (Diptera: Tephritidae) Di Kalimantan Selatan Berdasarkan Karakter Morfologi Dan Molekular (Rapd-pcr Dan Sekuensing Dna)
... Sekuen DNA yang mempunyai hubungan kekerabatan dapat diidentifikasi dengan menempati cabang atau outgroup yang berdekatan yang membentuk pohon ...Perbedaan DNA lebih banyak dipakai karena dianggap lebih ...
12