Diskriminasi Daun Gandarusa (Justicia gendarrusa Burm.f.) Asal Surabaya, Jember dan Mojokerto Menggunakan Metode Elektroforesis

PR.

5E

I

5E

INAR

NASIONAI

DAN

KONGRES

t

0NEsrAr{

PR0TETN

so(lETY

(rPs)

Jember,

6-7 Juli 2012

Tema:

s

Eoras!

a$? lraovasi

Sumher

Protein

ffie?tuk

Penguatan

Sains

dan

Ed

itor:

Dr. Ir.

Miswar,

M.Si.

Netty

Ermawaty,

5P",

M.Sc, Ph.D.

Tri Flandoyo,

SP,,

Ph.D

PM. SIDING

s[MINAR

NASIONAT DAN

KONGRES

INDONESIAN PROTEIN

SOCIETY

(IPS)

Tema:

[ksplorasi dan

Inovasi

Sumber Protein untuk Penguatan

Sains

dan

Teknologi

Jember,

6-7 )u\i2012

Editor

Dr, lr. Miswar, M.Si.

Netty Ermawaty,5P., M.Sc., Ph.D.

Tri Handoyo, SP., Ph.D.

tsBN

978-979-803684-2

Fenerbit

XHfil,ffiiilfl:1,T,?10.,.6013s

Tel. (03 1) 37 1 5941, Fax. (031 ₎ 3770687

email:

kartikamulya69mail.com

UNIVERSITAS JEMBER

' . ; ti,,ta

'.;;ait'

lndonesian

Protein Society

Hak

cipta dilindungi

undang'undang.

Dilarang mengutip

atau

memperbanyak

sebagianiseluruh

isi buku

ini

DAFTAR

ISI

Halaman

iii

Kata Pengantar

iv

Daltar Isi

Sanrbutan Ketua

Parritia

viii

Saurbutan I(etLra

IPS

ix

Sanrbutan Rektor Universitas

Jentber

x

Molecular Machineties for Photosyrrthetic Bio-Assimilation iu

Ferredoxin-Depeudent

1

Redox Metabolisnrs

Toshiharu Hase

Molecular Properties of Redox-Chaperones and Theil Physiological Roles

Agairrst

3

Exterrral Stresses

in

ELrkaryotic Cells Kyun Oh Lee and Sang Yeol Lee

N-Clycan Modificatiorr aud Plarrt

Developlnent

4

K1,un Oh Lee, Rikno Harnrol<o, Wahyu lndra Duwi Fanata, and Sang Yeol Lee

Structural Study Of Actin Cytoskeleton

Regulation

5

Nico Tjandra

Proteirr and Peptide

Bioactive

6

Maggy Thenawidjaja Suhartono

Having Future Srveet with Suclose-Phosphate Synthase and Sucrose-Trauspofter

Proteiu

8

Bnmbang Sugiharto

Application of Plotein Engineering to

Biosensors

l0

Tonrohiho Yanrazalti

Upaya Penirtgkatan Ploduksi dan Kualitas Tanarran JagLrng Lokal Madura

Melalui

l3

Seleksi Daur Ulang Ferrotipe

Sri Hartatil< dan Zahratus Sakdijah

Petnbttatart Antibodi Poliklonal Menggunakau Arrtigen Protein Rekombinan

Sucrose

I9 Trunsprtrter (strtl)

Popy Hartatie Hardjo, Nurul Holifah, Triliani Farlisa,

Tri

Handoyo, dan Bambang

Sugiharto

Analisis lokasi gen carbonic anhydrase (MVFACS, MAFACS dan LVFACS)

pada

24

F'luvariq bitlcnlis Didik Pudji Restanto

Peranan Synecltoc'occ,/.\ sp. sebagai biofertilizer urrtuk nreningkatkan kadar protein

biji

28 tanarrran kedelai (G11,6'irro ntctx L. Merill)

lrornrtrlasi F'illet'dan LJji Kiner'la E,nzirn Bronrelin urrtuk Pengenrpuk

Daging(Meot

ll3

'l-cntlc _{r i: ct'\}

lkn Ralrrnatul Layly, Deden Rosid Waltanr, Ayi Mufti dan Ruby Setiarvan

Penguiian Nilai Kualitas Protein Hidrolisat Kacang Hijau dengan Metode NPU

(,ryel

121

Protcin Litilizcttion) Secara In Vivo

Galilr Kusuma Aji, Noer Laily, Alit Pangestu, Sri Peni Wijayanti, dan Fajarwati Utami

Metode Sterilisasi Pernrukaan Yang Murah Untuk Eksplan Daun Majegat

(D7,,eoil,11il11

127

cttulo,ttttcltyrrnr Miq.) Pada Kultur

ht

Vi/t'o

Novi Harun AIt

C'lorring Arrd,/ri

I/itto

Antinly'cobacterial Activit_v Of Lectin Protein in Cornbinatiorr

rvith

135

Streptonrvc i rr To I ncrease Sensi tiv ity Agai nst A[.t,cr.tlt ocl er i u nt t ub erc u los i s

Ahlar Ahnrad and Mulr. Nasrum Massi

lsolasi dan l(alaliterisasi Protein Bioalitif clari Beberapa Jenis Spous sebagai

Agerrt

145

A nt irn ikroba

Andi llham Latunra dan Ahyar Ahntad

Spesilisitas Antibodi

/r/'-l

l6kDa Ilasil Induksi Protein Nort Kinase

Menrbrart

1 50

Spelnratozoa Manusia Pacla Jalirrgau Sonratik dan Reproduksi Martusia

Urnie Lestari

lclerrtifikasi Protein Spesifik Ittsulirt-Likc

(irovth

Fuclot's (lGF,s) pada Ayanr

Broiler

155

sebagai l3aharr Bioaktif

Ilosa Tri Hertanran'ati

Kaiian Potensi Alergenisitas Nila Tebu Ploduk Rehayasa Cenetika (PRG)

NXI

4T

dan

162

NXI 6T Melalui U.ii Praklinik Pada Hervarr Coba Tikus PLrtih

Nunnalasari, Nltalia Tri Astuti, Agus Heri Setlo Wahyudi, Herra Studiarvan, Tutik

Sri Walrluni

POS-l EIt: Strrrcture' of 3-Ketosteroici Ar-Dehydrogerrase Frorn Rfuttlococcus

er'.t,lh'o;loli,s

168

SQI: Whele []ad Meets'[),rosittes

Ali ltohnran, Niels van Oosterrvijk and llauke W. Dijlstra

ltesporr Antibodi Manusia terhadap Proteirr Salivaly Gland (SC) Aede.s tteg,pti

Berpotensi sebagai Indikator Resistensi terlradap Derran.r Berdarah (DBD)

Ilikc Ohtarianti, Sy'ubbanul Wathon, Drvi Esti F dan Kartilm Senjarini

Ef'eli Penghanrbatarr EkstLak Kelen jar Saliva Nyanruk Anopheles terhadap Derajat

Parasitelnia pada Mencit Model UntLrk Malaria

Yunita Arnril,anti, lna Soral'a, Vinny dan Kartil<a Senjarini

Ka.iiarr I)rotein Alergi dan Fisiologi

Biji

Kaliao Selaura Proses Pra-Perkecantbahart

Tri Handolo, Mega Kartil<a Sari,, lnvan Sadintnn, l)enna 0riani

Analisis Biointbrrnatika Motif Resiclu Lestari Dortiaitt (B/u)s-Barrel GFI5I

A-l--

188

Arabinoluranosidase Yan-u Berperan Pada Spesifitas SLrsbtrat Melalui lnteraksi Sidik

Jari Gugus Arabinolirlanosil

Much Zaenal Fannni, One Asurarani, Hery Survito, Ni N1'onran Tri Puspaningsih

lsolasi Cen Pengkode Protein Antioksidan (AOP) pada

Biji

Melinio (Gnelunt

gnenton)

l9,r

Ar.r-a Bagus Boedi lsu'nnto dan

Tri

Agus Sisrvoyo

\l

r69

116

lclcntifiliasi Proteirr Spelnratozoa darr Cairan Lurnerr pacla trpiclidimis Sapi,

I(aitarrnya

196 clerrgarr Matulasi Sperrnalozoa

Mahrianidan Della Ratna Kartini

Dislrrirrirtasi Daun Candarusa (.ltt,tticicr gendurt'usu Buln-r.f.) Asal SLrrabal,a. Jeutber

clalr

205

M oj o lie rto Merr-{gunahan M etode E I ektrolb res i s

Moclr. Arnrun Hidayat,

Tri

Handoyo rlan Bantbang Prajogo E.W.

Pertingkatart Keutarnpuan Antioksidarr Pada

Biii

Melinio (Gnctunr Gnernon)

dengan

210

Metocle Enzirnatik

Tri Agus Sisrvoyo

Skrinirrg E,nzinr Fibrinolitik dari Bakteri

Tarrah

216 Nladaniyah, Sattl'a Arirnurti dan Evi Umay,ah Ulfa

Transfbrrnasi Gerr Sy86 dalarn Vektor Ekspresi pET TOPO 200 untuk

Mcndapatkan

222

Protein Rekourbinan sY86

Evi Hanizar

Alitivitas Tlonrbolitik dan Antikoagulan El<strak.larnur'T-ilanr Pulilt

(l'>lectturu.;

226 ( ).\' t t'Ltt'tts) Sccara

In

Vi/ r'r.t

Khilrvilah Eka Putri, Evi Unray'ah Ulfa tlan Sattya Arimurti

lsolasi Ilakteri Penghasil dau Kalakterisasi Enziur

Dekstrause

233

M isu ar

Proc1ttlisi dan Aplikasi Kitinase Dari

B.

licheni/in'rni.r HSA3-la dalanr

Menghi-drolisis

239

Kitin dari Linrbah [Jdang dan Dinding Sel Jaurrrr Gurtoclerrnu sp.

Hasnah Natsir _, Abd. Rauf Patong, Mnggt, T.Suhartono

dan

Ahyar Alrmad

Pctnbttatan Keju Kedelai (So.r'c/lec,se) Rendah Caranr deugan Mengguuakan

Rltizoprr,s

244

rtligo.spot'tt.s

Ncny Novita Yuliany, Eka Rurianidan Nurhayati

ldcntillkasi Tattattratt Potensial Perrgltasil Bahart AktiITanin Prolein Konrplek

uutuk

251

Penghambatan Ahtivitas Alpha Arnylase

Asriyah Firdausi dan Tri Agus Sisn'oyo

Kloning Gerr B-E,ndoxilanase Asal Mikroolgarrisnre clalaur Abdolninal

Rayap

255

A.A. lstri Ratnaderri, Ni Ny'ornan

Tri

Puspaningsih, Wuriyanti Hantlayani dan Previta

Anali-sis Sctrttrting Llcclt'r.ttt A,lic'rct.sco1'tc 'l-erhaclalr Peltrbalran Stnrklur

Pernrukaan

263

Bonggol Ir,elapa Sarvit Aliibat Aktivitas Xilarrase Dan Selr-rlase

Anita Kurniati dan Ni Nyornarr Tri Pusllaningsih

I'rof-il Aktivitas Xilanase dalanr lonic

Liquid

267

lkn Ohtavianarvati

Skrining Bakteri Xilanolitik Asal Kulit fJuah

Kakao

271

Esti [Jtarti, Audiananti Mcganandi Kartini dln Satty'a Arirnurti

Optinrasi Ekslraksi Euziur Bronrelin Belbahau Dasar l-inrbah Nanas Lol<al

Subang

279

Ikir Rahmatul Lavly, Deden llosid Waltanr,

Ari

Nlufti dan Ruby Setiarvan

Seminar Nasional dan Kongres lndonesian Protein Societ', Jernber, 6-7 )uli 201 2

Diskriminasi

Daun Gandarusa

(lusticio gendurusa Burm.f.)

Asal

Surabaya, Jember dan

Mojokerto

Menggunakan

Metode

Elektroforesis

Moch.

Amrun Hidayatl,

Tri

Hantloyo2, Bambang

Prajogo E.W.3

I

)

Bagian Biologi Fannasi, Fakultas Farmasi Universitas Jember

2)

Jurusan Agroteknologi, Fakultas Peftanian Universitas Jember

3)

Bagian Farmakognosi dan Fitokirnia, Fakultas Farmasi Universitas Airlangga

Abstract

Gandarusa

leaf

(Justicia

gendarcusa

Burm.f.)

has

been used

traditionally

by

the

Papuan indigenous people

for

the male contraception remedy.

This

plant has been

further

explorated

to determine the mechanism

of

its reported

activity.

It

was known that the

activity

through its

inhibition

on sperm hyaluronidase enzyme

which

was competitive and reversible.

This

plant

has been undergoing phase

Il-clinical trial in

Surabaya, Indonesia

for

the non hormonal male contraceptive remedy since 2009.

The gandarusa samples was harvested from East Javaarea: Surabaya, Jember and Mojokerto.

As

a part

of

the

standardization

of

raw

material, the protein

profiling

has been done

to

seek

any proteins

which

can be used as a marker

for

the gandarusa leaf. The proteomic study was

performed

by

one and

two

dimentional SDS PAGE

Q

e,

2-D). The area

of

protein spots was

measured and compared using ImageJ program.

The results showed that

all

three samples

of

gandarusa had

relatively similar

1-D profiles.

In

this

regard,

the 2-D

profiles were made

to

see

the

difference

of

their

proteomics.

Discrimination

of

gandarusa samples

were

made based

on the availability

of

individual

protein

spot, and

the color

intensity

of

the

same

protein

spot

in all

samples.

It

can be

suggested

that2-DE

profiles can be used to differentiate the gandarusa samples.

Key

worcls :

Gandarusa

leaf,

protein profiling,

I

&

2-D

PE,I{DAHULUAN

Penilaian

keseragaman (unifttrnlity)

tanaman

umurrnya

bergantung

kepada metode

morfologi

yang subyektif dan dapat

dipengarLrhi

oleh

kondisi

lingkungan

(Goodrich et crl., 1985). Sayangnya,

ciri-ciri

morfblogi

tidak

cukup

kuat

untuk

rnengekspos keragaman

genetika

diantara

tanaman-tanaman

yang

memiliki

ciri

morfologi

yang

sAlna atau trlmpang

tindih

(Gardiner &.

Forde, l98B).

Oleh karenanya

clibutuhkan

suatu metode

yang

mampu

mengakomodir hal tersebut.

Saat

ini,

metode

elektroforesis telah

berkernbang

menjadi

piranti

analisis

yang

clapat digunakan sehagai

pelacak

gen

(genonte

probing)

secara

tidak

langsung

dengan

cara

mengekspos

variasi

struktur

enzim atau protein

gerl

lainnya.

Hasil

elektroforesis (eleclrophoretic

ntolrers)

muncul

karena

gen-gen

yang netral

yang

tidak

terkait

oleh

lokus

manaplul

yang

berpengaruh

terhadap

suatll

tanaman

(Gilliland, 1989). Selain

itu,

hasil

elektroforesis

tidak

terpengaruh

oleh

morfologi

dan

fisiologi

tanam&tr, sehingga

lebih

menguntungkan

jika

dibandingkarr

dengan

metode morfologi.

Pada

metode

elektroforesis, digunakan protein

konservatif sebagai

protein

penanda

Qtrotein

morkers)

(misal:

protein

penyimparl

pada

btji)

yang

bermanfaat

untuk identifikasi

spesies

dan

atau varitas

tanaman secara cepat,

relatif

murah. tanpa

menungglt

tanaman meqiadi

matang

Qnature)

dan tidak

terpengaruh

oleh

lingkungan (Sammour, 1 991).