x
RINGKASAN
Jabon (Neolamarckia sp.) terdiri atas dua spesies, yaitu Jabon Putih (Neolamarckia cadamba (Roxb.) Bosser dan Jabon Merah (Neolamarckia
macrophylla (Roxb.) Bosser. Jabon merupakan komoditi yang baru berkembang.
Penelitian aspek molekuler Jabon masih sangat terbatas sehingga data molekuler Jabon pun belum tersedia. Data yang tersedia mengenai Jabon sejauh ini hanya terbatas pada data morfologi (akar, batang, daun, buah, dan bunga). Dengan demikian upaya awal yang harus dilakukan adalah identifikasi Jabon secara molekuler.
Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui primer yang dapat digunakan dalam analisis keragaman genetik Jabon menggunakan penanda RAPD (Random
Amplified polymorphic DNA), menemukan alel spesifik Jabon, mengetahui
keragaman genetik dalam dan antar serta jarak genetik populasi Jabon Putih dan Jabon Merah.
Sampel daun berasal dari populasi Jabon Merah (Sulawesi Utara) dan populasi Jabon Putih (Sumatera Selatan). Analisis keragaman genetik menggunakan 8 primer terpilih yaitu OPA 1, OPA 4, OPA 12, OPA 14, OPA 16, OPQ 14, OPQ 15, dan OPQ 16. Variabel yang diamati adalah pola dan jumlah fragmen DNA hasil amplifikasi PCR. Pemilihan primer dilakukan berdasarkan ada tidaknya pita polimorfik. Data dianalisis menggunakan program POPGENE 1.32 untuk mengetahui keragaman genetik dan menghitung jarak genetik berdasarkanNe’I Gene
Diversity (1978) danNe’i Original Measures of Genetics Distance(1978).
Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 8 primer yang digunakan diperoleh tiga alel spesifik pada Jabon Putih dan tujuh alel spesifik pada Jabon Merah. Nilai keragaman genetik populasi Jabon Putih sebesar 0,21, sedangkan Jabon Merah sebesar 0,15. Nilai jarak genetik antar populasi Jabon Putih dan Jabon Merah adalah 0,49.
Kata kunci : Neolamarckia, alel spesifik, keragaman genetik, penanda RAPD, polimorfik.
xi
SUMMARY
Jabon (Neolamarckia sp.) consists of two species, namely White Jabon (Neolamarckia cadamba (Roxb.) Bosser and Red Jabon (Neolamarckia macrophylla (Roxb.). Bosser. Jabon is an important emerging comodity. Research on molecular aspect of jabon is still limited. The data available on jabon is limited to morphological characteristics (root, stem, leaf, fruit, and flower). Therefore molecular identification of jabon is needed.
The purpose of this study was to determine primers that could be used in the analysis of jabon genetic diversity using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), find jabon specific allele, determine the genetic diversity within and between Red and White Jabon populations
Leaf samples were taken from population of Red Jabon (North Sulawesi) and population of White Jabon (South Sumatra). Analysis of genetic diversity used 8 primers OPA 1, OPA 4, OPA 12, OPA 14, OPA 16, OPQ 14, OPQ 15 , and OPQ 16. Observed variables were the pattern and number of specific DNA fragments resulted from PCR amplification. Determination of selected primers was conducted descriptively based on the presence or absence of DNA bands in the agarose gel. The POPGENE 1.32 program was used to determine the genetic diversity and calculating the genetic distance based on Ne'I Gene Diversity (1978) and Ne'i Genetics Original Measures of Distance (1978).
The results showed that of the 8 primers used to generate the RAPD profiles, there were three specific alleles in White Jabon and seven in Red Jabon. Population genetic diversity value of White Jabon was 0,21 and that of Red Jabon was 0,15. Genetic distance between White and Red Jabon was 0,49.
Keywords: Neolamarckia sp., specific allel, genetic diversity, RAPD markers, polymorphic.
