IDENTIFIKASI BAKTERI KTTINOLITIK DI DAERAH RAWA PANTAI PADANG BERDASARKAN ANALISIS SEKUENS GEN 16S-rRNA.

IDENTIFIKASI

BAKTERI

KITINOLITIK

DI DAERAH

RA.WA

PAmAI

PADAf\IC

BERDASARKAN ANALISIS

SEKUENS

GEN 16S-rRNA

CUT ANDESTI

SKRIPSI

Sebr€.i

Srl,l

S!t'n

Sydt

Ulttr&

M€oD€rc|.t

C.ltr

Strjtu

Pedrln!

JURUSAII

BI]DIDAYA PERTANIAN

FAKI'LTAS

PERTANIAN

I,INIVERSITAS

AI'DAIIS

IDE\TIFIKASI RAKTIRI KITINOLI'I'IK

DI DAERAH RAWA

P1\

fAI

PADAN(;

Bf,RD,,\S,4RKAN

A\ALISIS

SEKTJIi\S

(;llN

₁₆₅

rRNA

\BS

I

RAK

:':i.lrirtr

Ji!r

jknr

'

l(l.nririkrsi

ll.lr.n

Ki{nxniliL

{l

Dxernh

ttr$x

_

,

_i,rJrns

lr.dr\rr[in

_{triLiris Sc(Rns (;rn ]rS}

rR\1

. r. ih

dit

utu

di

-r

l,aLm Bi.i.krologl

d

I).nitrlirao

lxnlmrD.urrin

lludidrrx Pcnanirn

,.

.

P.drnid

I

ri\c6n.s

AndaL\ PaJxn| drri bulan

l).sc

nir.

t0t9

srnrnai

j

:1110

l.tr.lili!

ini

hurujuln unLlll mcndrNrt]n

t.te[\i

nnrts sotar

.::_

..ri

drrn,fu.\ri

rlh\rr,\

ll

r.lilik

varg

br

sll dari

a\x I'n.t.l

PrJ.o.!

r'

:r.nrulrn

denihs sp.sics

brklfi

lilinolilik rertiih nr.ilgrDxlm dd!

:-_ r1

biltrl

dilrl.lsi

dri

du

l.Lrir

1r n'

mui

Prnil

rl, nq

!

,ri n

ri\r

-

Pr!

.

Jxdib|l l,xdlng

DN.1

lrDomil dii\nx\r

dcrgrD

_n'oscdrr

i_::ari

orr(,dr

llll

Ne\nran

,\'ntlfikasi

r'

rnro mcnlruDrlln hfnibiJusi

l.rl

i5

AC^Cl

llL\lCNll(i(i(Ta,\G

r') d.n lililt

1j'

!rnlla,\'L((]\Rcc

l I

s.ltrr

jjoq dilxkuld

rcc.ft

,,r /il.rr,r

jri.rn

l,'i,r.r

l5l5lt

l!nrt

jr!

_{dlsetucDs xdxl:Llj .mrur iso]ll hrhr.ri}

\

r4rilih

du!

nr

al {Uanrrnntr

nicNrlili

nrdckl

L

n.lril

ritrg!i J:!r

:

trr

ntnlLjiL

i'rlcks

kiliFlirlI nnJlh

P.ocnnrn] nltarna\ hNLFn

-:

J.nlrn D.ngik{s

Llxrxlre

prblik

Nanl

Drcf!!u.ka.

rnllisil

.: P:o.ruf lrdi t.l.r$x[tri dild k

dengd

Dt

!!rn

rn

rn)!flnl

rrl

tr

\r-r,l k., /4\,f\

I

i., tt."trlrltrt,

"::L

nd.liliJn

hc.lusil nrcrnp.rol.h

l.Lorn

inrl!l

brlrer

tin!

b.idr

si

. _ :.

Jrn Jur loL6l

p.ngrnbiL

:!hl[l

l)rh

h.sil .n.lisis

BLAS

drn .l

' : _1ni

kilinflnlI

rc'nilh

orrnunrul[]n lconrpok:

/r

r/nhr.r.,

\t

:

-

..,t.t olr(

tu

aurs

t:

:ttin

_\\JAll

ttr1r6.,nn,rd!r,

ip

_{l K00r drn}

: - ,

..a1a

i i

(

Al5

llrlreri

_{)rnA bc[orcDsi} LiriJriliril

r.no!!i

_l)adr

::_::_::i \tlao

10

hrri

rdrrh rrrtl/ra..??L\

{rurn

a^lj

n.rd$l[ai

'-

.

.

i..L3tuhxr1n

t.r.r(

hr[rr]

kiriiltiliL

dcntxn

m$!-rundd

ptu!.xni

I.

Pf,NDAHIJI,IJAN

l.l

Latar Betakang

S&t

ini

lahan pertanian

di

lndoncsia mtuk budidaya tanmrer semakin

t

!rytt

Hal lesebul

dika€nak

oleh b€benpa fattor

didlllfula

bmyak yang

rtuEjmrtd

_{Mtuk Fnndu{nan}

db

bsgune

jsa.

Disisi lain.

lan

nwa ymg

&

di lndonesia dipcrkimrrd ncncapai 3l-4 juta ha. Sekitar 60 % (20 jula ha)

.ld@ya

nerupal

lanan rawa pdrai atau

r.sa

p4ang sunrt dan 40 %

selc-tfu?(ll,4

jut

ha) adalab lalEn nwa non

pabs

surur.Il6il suryey talun 1994

Ei{6r&

b:nva, ku6ne dan 50 % yaitu seluN 9 juta ha ddi lahb rdwa panlai

rEkniikai

porensial unruk penscnbonsan pcnanid (suriadikana

db

_Suriadi,

!7).

Denem

denikid

hnd

F.nmi&

untuk budiday!

lanmm

b€rpotcnsi

di-Ela

te dacnn m"a pdrai tcscbut.

Lana Ewa pant.i densan kondhi li.Bkungb

lds

mlrjinal, densm

tins-tr

elini'.s

yang linasi. sulir

din

fm&dr untuk budidala lanaman. Tanaman

-E

dea!

b.radaplnsi Grhadap

laha

slin.

Pcnsemm ielnik rekdyAa _Bene

iE

mugkinkd

untuk me.gh6ilkln

tanmm-hmd

ydg

toienn te.hadap

trb

elh

slnneea lanan& daFt bendapksi ierhadap lanan bcrealsi salini1,1\.

tdt

i@

dengan hal rescbut naka

dibutu*m

sudber sumbfl gen adaptif

y

g

-:

raindapat dipemleh dei mikJoorc isnca.hptildi land salin.

Vir@.guisme

mikroorsanisne lerscbur

biMya

diaeroleh

dui

lol6i

=rl--

kondni linekunaan yans besifat salin.

spcrti land tamai

Mikro

Eis

tcscbut biasanyr bouilir

kninolilil

karem ssara umun potcnsi

kc-'.i&!

shyawa kitin bmyal ditemdld ddn limbah laut seperti hewm

inlel€-Er

berliulil keEs (C

ntz.ea?).

\{adal

lai! dari nikroba _,yatrc bcBilar kirinohik €aebut ldalah sebasai

4Erhli

bayni j@ur p€nyebab penyakit pada

t

md.

Dmpal

dri

selanglD

,-

Et

dap

ldanan

ssal

bdyat

salah satunya adalan produlci dari lanb

F--

alm

ncnuu

shingga ne.yebrbkd nilai ekonomi

d

i suaru poduk

ta- EuM.

Olch scbab itu dilalukdlah pensendalian lefiadap

jmur

penye-E

po)n.kit pada tanamd secara

almi

dcngd

nelakurd

per,rild

lananan

-.lri

t tin.lni[.

l]aktr

kninolilik u.mDrDrri

k.drnpmn

drl$r

nrsnJe!.a

i-.

jr.drn!

_se

irmur

).ra

_pen\tr{Ln

urmrr\r

_{xlalah k}

rin

_{r)cnlan dcmikiar}

:-.:Jri

Lrrin.lilil

brrtolcnsi

icb4ri ttog.rdrli

rlrnrijanu

pableD b.rditrd Dg

-

.rjn

r\ddF

rltilirxs

rc.s.bu.

ih

dihxrxtlxn

d!|rd

nrenlhrnrhd _ner

--rr!hm drri.rmrr nxbsc

p.drturmix.ltu'

pxU

rkhi.nlr

i!

urtrr)!.ndr

,\lhi!.khii

ini.

tnr,/v,

[cnhrli nrc'rt

i

_nerhd

rn

karcl .d.nF

kc-' l kc-'.kc-'..

r il,i".'

' - 'J.iltl

:-.r

inio

\ete

iianlur

Pe.S.ndxhrn

hlrrrii!nLr

JenSan ordnlgunrlrn rn,knl

',-iLinc lili.blnik

!Lid$dltu]

p.!r

lcnturpuxd

drild]ryrri:m!

nr.nlhrsilLrn

. :..

tlan/, /

j !/i{d,,r.

J_rn!

&prl

ni.lisis s.l

ilhr

K.

ia

nuatr hrrrc.

.

.:Lrik

dai

bakrdi

,.r,,",rr

rrr,rk

ieLrh

diluri(rn

ritlk

nrcn-lcnda lkan

li1.r.r

jrinu

_{prolen lnnrnxn}

Cllur.\!?,?arUrld\..n\

_{lchh dimJnli.lkan}

:

r1.r-rcf.la _{ilQn irDrtr' nrr,gdn}

rFn,

,'/.rttr,,

r,r\i;

(M!nir.1006) \unrb.r p.nrebarrn drii

hrIl.ri

r.]ri ilil

iDil.rd.prl prd.

b.b.r:N

1.m

:i ::fl lril

_lrldr Lxnrh dro

lrrdr

dftrah

n\r

trrlrL. nrJrrrr

lxur. pl(lr _nerr

.-_::

hrnrn

drn rornxt

.lnri,r

srrudi

l!\'ah

_lunung

d

suDbur riL p.nrs

r-- \rhr!!i

corprl

L! r!r!

diarlrsro

b.rlrrl$\i

untuL lumhuhnrr hrLlrri ki

_.

rr.h$i

_{k t}

rolirik

il

_1cLtrh

h.ira[

_ditcjni

!

_tddod.sia.

]!i{u ,lrlx

_{r pc}

'-irnli

scb.!.ipenlcnar

ihrlaliscmn!.n

anntr

lcrln

rp {x.anxd

3r.h!ri

hlsil

Fnellirn

lelrh

hxnFl

dikdrahu,

berhrlr

kcorl.r.grn.n

: jf,\i

\ncsi.5 rfc\ics

brktn

Jcngan

rlr

v

r!\

[ilirnnir k

nr.si|!

D.sin! nr]i

-r-_..-

_hrhitrt

lllrtun

l

rt|r Mlrt,$lxr

bxlto.

_{ilu \.ndiri}

drfihil

_Nanrun

--:;: n,{

,i

trr,r}d _tads d trjLikxtr

ritut

nr.nnr-!kx&.0 k.J..DrOL.d akrlllhs

.

: ii b.lLm

bii] lihkr[

r. AprLili upr]a rclnrasa sccda

-!...rik

sam

.r J:,nib.lLn

6.frrk

diftrb iLrsikrn ()leh sch.b

t'

prdr tuhrr

rNr

dri

kc-:.:

r-.nrnskrrrn knramttrxn

!lliliris

kihnolltil.

plrlu dlLkukn

id.nriliktrsi

. , -.rt Lrl.liil!n! ditld.li

:.idL

u trLl

drdla

.lnn

id.'il.

kc,.gr.rd

!.

.rik

l!d.

\trlu

jr.prlxs,

-r: :.!.

b.iL

lunrbtrhrr. hc$in.

nrililbx

dxn

r.balrirrr

(.1.h

b.rl..rbdg

r-_:i ri.r

,'\u.lnta dinruhi Inelrlu l*sesi

lcrl]irt

rx,irsl

mvlnlo!.

lisiol.

BAB Y.

KESIMPIII,AN

Dlri

semqkai& pcnchlian _)aDg

rcl$

I

Ditedeh

8

kolat brrrcri

kilrolilil

_tans bcrasal ddn dlerrh ra*,x panrai Bungus PadaD! dar Panrai PNrlaDrbat PrtanS. B$daerkao 8 isotar bakteri

kilitroliril. dipilih

J

isolar _{rans mesakili} jndek\ kitinotirik

rif!ri

dx. ind€ks

2

Dlta

l.sil

analisis

BI^Sl

dri

4

isolar

batrn

rninotit:k

rrpilih

Fis

nr*akih

I

isolar dcneln i0deks kninolnik

lnrrrj

dijdcntifik.sita. sebrexi

/tzird.cr.A

strain

C

l5 dan

Zrrel.1,,./.r

sp.t U l t:t90 Jan

I

hotar yang

to.wikili nrdeks kirnrolnik rcndah diid.nlilikNikan

scbagr,.l.r,rord./r/

sp

TK006

165dmt

r.roaa0

/rro!,",.LsrahWAB

1906

llerdaselan hasil

v

_{s dldapatkd da.i dnallsjs BLASt. tul. z.ienis brkrcri} )ans berh.slldiidc lilikasika0 sa.tar ke ievcl spc\icsny. _rairu

ri,r?/,rd./..

,?/racr.J

stnin

W]\a

1906 daD

&i.tl6

(.,?,r {nnr

_CAt5,

dd I

jcDG

b.llcn

laAiberhasldiidcndlilrsl(0silansa.U! _{kclc!.1 Cjcfusntasxrx!!ilu}

,.ircr,6d.?.rf

l KOir6 l6S dan

Fnlr.hadet

{;lUt:Ltgt)

5,2sann

lJnluk mendapdlkm iotumusi _{idcnrilxs dan}

tct.abara.

_{gcncrik surru}

orgmhn.

llng

lebih.kurar.

frrk!

dalur

xnrtisis

ltLr\ST

dan anxtisis

kek.rabab

gcnehk disiranlan ,hcnssunalitu

cnrq

data sekucns yang Lchih

paojafe. schirger

d.Fr

diperoteh

:nloml\i

_lang tchjh lkumt dan Gpat. llat

irj

dxrd

dilakukan dengan

mcnleuul,n

dua

pdncr

sekaliers datanr pmscs

T}AFT,TR

PTISTAKA

Agrnvib!$L

Nl

1004 D€leksi dan

A.alsis

Sckuens Cen

l

ribiror Prorci.asc

pdr

Bebenpa Klon

Klkro

lla.apan lahan leng8erck

llual

Kalao dari

suli\r.si

ScLrlan. Fakulras Per'1.nl0n

ddr K.hurturd

Bolor

Mrnara

Perkebu

ai.7l(l).

l- 10

r\Li.

I

2008 P.numbuhan

Biklei

daD

n

ru. hnp:/A$*!.iqtiaLaLi..on _lliJ

l,linr

2010

Alh:tr

M

2000. Didco!-S.n!er. Snrtu M.toda l,cmmutui ljruhn \ukleotidr

D\^

J

laksath ?

ll)

63-81)

lliirl.

1

100.1. M.rloLo-{i

llallcLi

pada

lrlcksi

Srlurxn Kcnrib

dln

K.lanrin

h!!:l**w

lib.tur.dsr.ac.id

ll

ltlci 20101

B.xro

H.rvh

l.

LB..

S.A. DanichcD.

drd

SA

NicrsickiBlucr.

199:.

Delelonme.r

.l

x

rrtid

olcrhod Jnr derecting

br4e.i!l

celG nr

rr,

uslng

Ii-_\\

JjiJt

. P l '.1'_ ir:84ii

(

_lLISTALW

I

31 2009 hro:/1r\rvry(i.ocbcc

nr!,.lrchNrlr.lvanc.d.hhl

₁₂₀

IDKPI

Depdlenrdr Kelnurrn

dan

reri[rnrn

Rcpublik

lftoNsia

]00:l Pcrlcmbarg.n ckspor komoditi

h.sil

p*ikadan

lndrn.\ir

19981001.

hno

NrN

r.sNccs

ur!&.c.1!

lTluni

20091

laui.

S.

100!.

|.kl.rfaklor

!rr!

McmDc

laruhi

Prflumhuhln Uakrcri.

hro//rv$a.c[

nrlsaurus.bLo$oor

.oiii

l0 Mrftr. ]0101

lirLiatd

ll

I dln

Str.taii

tr

200.1. hol.si

dx

ldulilikxsi

R*l€n

P(biotik d0i

lku

Kcnru

Mr[n

(Fphin.d.]u\

Jn{osatus) dalam Llpara litisicnsi

P.kan

lliu

JunrlNrrurl.do.esia6lz)

75 80.

|enrah-

RS

lan

PuNa.rnlri.

s

2008

KrrakrerisNi

Silitl

Biollnri.

llasil

l,cn.Fisan holal BaLrcri Kitlnolirik

hlrpl

$r1.sv.ir79.i1cs."tdprcs conl

llidxlar. l.2005 lrcn-laillr

pIIlerh

.p Akriyil.s l:h.I. I

I

h

(;!tu.

tsl RdLrlh^ sp .4R 1)09 6(.1)i1.1,1-1,16.

Hid.Jat.

P.

Dc{i

S.. Sri

ll.100.1.

K.iid

Ciri

NtrbLogi

dm

N1l)lclulcr

Kurukebul

(H.nrottcm

:

L.yrodida.)

S€b4di

Drsar

PcngcndaLian Penlxkll Cenrinivnus

nxJr

ra.rman Sar-urrn Jumal Lenrbasa lenelirlan

du

Pcrgibdi.n

Kcpdn

Mdyarlkat.

lirslitu

Pcfxniar

Boeor