ANALISIS PROFIL PROTEIN EKSTRAK BIJI MIMBA
(
Azadirachta indica A. Juzz)
DENGAN PEMANASAN BASAH
SEBELUM EKSTRAKSI MELALUI
METODE SDS-PAGE
SKRIPSI
Oleh :
Akbar Cendia Sugiharsono NIM. 061610101023
BAGIAN BIOMEDIK
FAKULTAS KEDOKTERAN GIGI
UNIVERSTAS JEMBER
ANALISIS PROFIL PROTEIN EKSTRAK BIJI MIMBA
(
Azadirachta indica A. Juzz)
DENGAN PEMANASAN BASAH
SEBELUM EKSTRAKSI MELALUI
METODE SDS-PAGE
SKRIPSI
Diajukan Guna Melengkapi Tugas Akhir dan Memenuhi Salah Satu Syarat Untuk Menyelesaikan Program Studi Pendidikan Dokter Gigi (S1) dan
Meraih Gelar Sarjana Kedokteran Gigi
Oleh :
Akbar Cendia Sugiharsono NIM. 061610101023
BAGIAN BIOMEDIK
FAKULTAS KEDOKTERAN GIGI
UNIVERSTAS JEMBER
PERSEMBAHAN
Skripsi ini hanya kupersembahkan untuk :
1. ALLAH SWT yang telah melimpahkan rahmat dan ridhoNya, 2. Agamaku tercinta,
3. Kedua orang tuaku (Ayah Sigit Sugiharsono dan Mama Siti Nuriya Zamzam) yang selalu melimpahkan kasih sayang, doa dan dukungan yang terbaik bagiku,
4. Guru dan dosenku sejak SD sampai PT, yang telah memberikan ilmu dan membimbingku,
MOTTO
Boleh jadi kamu membenci sesuatu, padahal ia amat baik bagimu, dan boleh jadi (pula) kamu menyukai sesuatu, padahal ia amat buruk bagimu;
Allah mengetahui, sedang kamu tidak mengetahui. (QS. Al-Baqarah 216)
Sesungguhnya apabila Dia (Allah) menghendaki sesuatu hanyalah berkata: “jadi !” maka jadilah.
(QS. Yaasiin 82)
Kesempatan tidak datang dua kali, manfaatkan semua kesempatan untuk meraih apa yang menjadi keyakinanmu.
PERNYATAAN
Saya yang bertanda tangan dibawah ini :
Nama : Akbar Cendia Sugiharsono
NIM : 061610101023
Menyatakan dengan sesungguhnya, bahwa karya ilmiah yang berjudul :
Analisis Profil Protein Ekstrak Biji Mimba (Azadirachta indica A. Juzz) dengan Pemanasan Basah Sebelum Ekstraksi Melalui Metode SDS-PAGE adalah benar-benar hasil karya sendiri, kecuali jika dalam pengutipan substansi disebutkan sumbernya, dan belum pernah diajukan pada institusi manapun, serta bukan karya jiplakan. Saya bertanggung jawab atas keabsahan dan kebenaran isinya sesuai dengan sikap ilmiah yang harus dijunjung tinggi.
Demikian peryataan ini saya buat dengan sebenarnya, tanpa adanya tekanan dan paksaan dari pihak manapun serta bersedia mendapat sanksi akademik jika ternyata dikemudian hari pernyataan ini terbukti tidak benar.
Jember, Januari 2014 Yang menyatakan,
Akbar Cendia Sugiharsono NIM. 061610101023
SKRIPSI
ANALISIS PROFIL PROTEIN EKSTRAK BIJI MIMBA
(
Azadirachta indica A. Juzz)
DENGAN PEMANASAN BASAH
SEBELUM EKSTRAKSI MELALUI
METODE SDS-PAGE
Oleh:
Akbar Cendia Sugiharsono 061610101023
Pembimbing:
Dosen Pembimbing Utama : Dr., drg., I Dewa Ayu Ratna Dewanti, M.Si Dosen Pembimbing Anggota : drg. Erna Sulistyani, M.Kes
PENGESAHAN
Skripsi berjudul Analisis Profil Protein Ekstrak Biji Mimba (Azadirachta indica A. Juzz) dengan Pemanasan Basah Sebelum Ekstraksi Melalui Metode SDS-PAGE telah diuji dan disahkan oleh Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember pada :
Hari :
Tanggal :
Tempat : Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember Tim Penguji,
Ketua
(Dosen Pembimbing Utama)
Dr.,drg., I.D.A Ratna Dewanti M.Si NIP 196805021997012001 Anggota I
(Sekretaris Penguji)
Anggota II
(Dosen Pembimbing Anggota)
drg. Erna Sulistyani, M.Kes NIP
Mengesahkan
Dekan Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember
drg. Hj. Herniyati, M.Kes NIP 195909061985032001
RINGKASAN
Analisis Profil Protein Ekstrak Biji Mimba (Azadirachta indica A. Juzz) dengan Pemanasan Basah Sebelum Ekstraksi Melalui Metode SDS-PAGE; Akbar Cendia Sugiharsono 061610101023; 2014; 41 halaman; Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember.
Mimba (Azadirachta indica A. Juss) merupakan tanaman multifungsi, karenanya tanaman ini juga dikenal sebagai Wonderfull Tree. Di Indonesia, pemanfaatan mimba sebagai obat tradisional sudah banyak digunakan, namun kandungan dan kegunaan sebagai obat yang terstandarisasi belum banyak diteliti. Meskipun sudah banyak literatur yang menyebutkan tentang senyawa aktif biji mimba, tetapi masih jarang yang menjelaskan secara spesifik khususnya kandungan protein yang ada dalam biji mimba. Penelitian ini dilakukan pada biji mimba dengan perlakuan pemanasan basah sebelum ekstraksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil protein ekstrak cair biji mimba (Azadirachta indica A. Juzz)
dengan pemanasan basah sebelum ekstraksi. Biji mimba diekstrak dengan menggunakan pelarut aquadest. Analisis profil protein menggunakan SDS-PAGE. Pada ekstrak biji mimba dengan pemanasan basah dapat diidentifikasi 7 profil protein dengan berat molekul 76 kDa, 36 kDa, 24 kDa, 23 kDa, 21 kDa, 15 kDa dan 13 kDa; dan pada ekstrak biji mimba tanpa pemanasan basah didapatkan 6 profil protein dengan berat molekul 83 kDa, 58 kDa, 29 kDa, 25 kDa, 20 kDa dan 13 kDa. Selanjutnya didapatkan juga intensitas terbesar pada biji mimba dengan pemanasan basah adalah sebesar 4149 pixel pada BM 21 kDa; dan pada biji mimba tanpa pemanasan basah adalah sebesar 12195 pixel pada BM 13 kDa. Intensitas dari pita protein menunjukkan kandungan atau banyaknya protein yang mempunyai berat molekul sama yang berada pada posisi pita yang sama. Profil protein pada ekstrak biji mimba dengan pemanasan basah lebih banyak teridentifikasi bila dibandingkan ekstrak biji mimba tanpa pemanasan basah.
PRAKATA
Puji syukur ke Hadirat Allah SWT atas segala rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul Analisis Profil Protein Ekstrak Biji Mimba (Azadirachta indica A. Juzz) dengan Pemanasan Basah Sebelum Ekstraksi Melalui Metode SDS-PAGE. Skripsi ini disusun untuk memenuhi salah satu syarat untuk menyelesaikan pendidikan strata satu (S1) pada Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember.
Penyusunan skripsi ini tidak lepas dari bantuan berbagai pihak, oleh karena itu penulis ingin menyampaikan ucapan terima kasih kepada:
1. drg. Hj. Herniyati, M.Kes, selaku Dekan Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Jember;
2. drg. Leliana Sandra Devi, Sp. Ort Dosen Pembimbing Akademik yang telah memberikan arahan dan bimbingan dalam perjalanan studi saya;
3. Dr.,drg.,I.D.A Ratna Dewanti, M,Si selaku Dosen Pembimbing Utama yang telah memberikan bimbingan dan arahan serta semangat sampai terselesaikan skripsi ini;
4. drg. Erna Sulistyani, M.Kes selaku Dosen Pembimbing Anggota yang telah memberikan bimbingan dan arahan serta semangat sampai terselesaikan skripsi ini;
5. Tri Handoyo, S.P., Ph.D selaku Dosen Pembimbing Lapangan yang telah membimbing dan membantu berjalannya penelitian ini di Laboratorium Genetika jurusan Agronomi Fakultas Pertanian Universitas Jember;
6. Kedua orang tua, Ayah Sigit Sugiharsono dan Mama Siti Nuriya Zamzam yang telah memberikan kasih sayang, dukungan dan doa yang terbaik demi terselesaikannya skripsi ini;
7. Teman-teman seperjuangan yang merupakan rekan penelitian saya yaitu Heva, terimakasih atas kerjasamanya;
8. Para lelaki angkatan 2006 Heva, Pramuditho, Nugroho, Firman, Januar, Ipin, Irfan, dan Ari yang telah memberikan masukan dan semangat;
9. Sahabat terbaik Rina Puspita, yang telah memberikan bantuan, masukan dan kerjasamanya hingga selesainya kuliah terakhir dan penelitian ini;
10.Tante Sani dan Budhe Yuyuk yang telah banyak membantu hingga tahap terakhir;
11.Semua pihak yang telah memberikan bantuan dalam penyusunan skripsi ini yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu.
Akhirnya Penulis berharap semoga Karya Tulis Ilmiah ini dapat memberikan manfaat bagi semua dan merupakan sumbangsih berharga bagi khasanah ilmu pengetahuan, terutama dibidang Kedokteran Gigi.
Jember, Januari 2014
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL ... i
HALAMAN PERSEMBAHAN ... ii
HALAMAN MOTTO ... iii
HALAMAN PERNYATAAN ... iv HALAMAN PEMBIMBINGAN ... v HALAMAN PENGESAHAN ... vi RINGKASAN ... vii PRAKATA ... viii DAFTAR ISI ... x
DAFTAR TABEL ... xiii
DAFTAR GAMBAR ... xiv
BAB 1. PENDAHULUAN 1.1Latar Belakang ... 1
1.2Rumusan Masalah ... 3
1.3Tujuan Penelitian ... 3
1.4Manfaat Penelitian ... 4
BAB 2. TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Tanaman Mimba ... 5
2.2 Klasifikasi Tanaman ... 5
2.3 Morfologi Tanaman ... 6
2.4 Kandungan Biji Mimba ... 7
2.5 Protein dalam Mimba ... 8
2.6 Kandungan Senyawa Aktif Mimba ... 10
2.7 Manfaat Tanaman Mimba ... 12
2.9 Ekstraksi ... 18
2.10 Elektroforesis Protein ... 19
2.11 Kerangka Konseptual ... 23
2.12 Hipotesa ... 24
BAB 3. METODE PENELITIAN 3.1 Jenis, Tempat dan Waktu Penelitian ... 25
3.1.1 Jenis Penelitian . ... 25
3.1.2 Tempat Penelitian ... 25
3.1.3 Waktu Penelitian ... 25
3.2 Populasi dan Sampel Penelitian ... 25
3.2.1 Populasi penelitian ... 25 3.2.2 Sampel Penelitian ... 25 3.3 Variabel Penelitian ... 25 3.3.1 Variabel Bebas ... 25 3.3.2 Variabel Terikat ... 25 3.3.3 Variabel Terkendali ... 25 3.4 Definisi Operasional ... 26
3.4.1 Ekstrak Biji Mimba ... 26
3.4.2 Profil Protein Biji Mimba ... 26
3.4.3 Intensitas Protein Biji Mimba ... 26
3.5 Bahan dan Alat Penelitian ... 26
3.5.1 Bahan Dasar ... 26
3.5.2 Bahan Kimia ... 26
3.5.3 Alat Penelitian ... 27
3.6 Prosedur Penelitian ... 28
3.6.1 Pembuatan ekstrak cair biji Mimba ... 28
3.6.2 Proses elektroforesis dengan teknik SDS-PAGE ... 29
3.8 Skema Penelitian ... 30
BAB 4. HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1Hasil Penelitian ... 31
4.2Pembahasan ... 35
BAB 5. KESIMPULAN DAN SARAN 5.1 Kesimpulan ... 39
5.2 Saran ... 39
DAFTAR BACAAN ... 40
DAFTAR TABEL
Halaman
2.1 Analisis Proksimal Biji Mimba ………... 8 4.1 Berat molekul fraksi protein biji mimba dengan pemanasan
dan tanpa pemanasan ... 32 4.2 Berat molekul dan Intensitas biji mimba dengan pemanasan basah ... 33 4.3 Berat molekul dan Intensitas biji mimba tanpa pemanasan basah ... 34
DAFTAR GAMBAR
Halaman
2.1 Tanaman Mimba ... 6
2.2 Daun,bunga,dan buah mimba ... 7
2.3 Biji-biji mimba ... 7
2.4 Struktur Kimia Azadirachtin ... 10
2.5 Struktur Kimia Salanin ... 11
2.6 Struktur Kimia Meliantriol ... 11
2.7 Struktur Kimia Nimbin dan Nimbidin ... 11
2.8 Struktur Asam Amino ... 13
2.9 Dua puluh jenis asam amino ... 14
2.10 Struktur Primer ... 16
2.11 Struktur Sekunder ... 16
2.12 Struktur Tersier ... 17
2.13 Alur Elektroforesis ... 19
2.14 Contoh pita protein pada hasil elektroforesis ... 22
2.15 Kerangka Konseptual Penelitian ... 23
4.1 Hasil Elektroforesis Biji Mimba dengan Pemanasan dan Tanpa Pemanasan ... 31
4.2 Hasil Scan Elektroforesis Biji Mimba dengan Software Gel Analysis 2010 ... 32
4.3 Hasil analisis intensitas biji mimba dengan pemanasan basah ... 33
