i
HUBUNGAN POLA PITA RNA TOTAL DENGAN VIRULENSI FUSARIUM
ASAL SOLANACEAE
SKRIPSI
untuk memenuhi sebagian persyaratan guna memperoleh derajat Sarjana Pertanian
di Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret
Oleh : Siti Ifadatul Ulya
H0712169
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
FAKULTAS PERTANIAN
ii
SKRIPSI
HUBUNGAN POLA PITA RNA TOTAL DENGAN VIRULENSI FUSARIUM
ASAL SOLANACEAE
iii
SKRIPSI
HUBUNGAN POLA PITA RNA TOTAL DENGAN VIRULENSI
FUSARIUM ASAL SOLANACEAE
yang dipersiapkan dan disusun oleh:
Siti Ifadatul Ulya H0712169
Telah dipertahankan di depan Tim Penguji pada tanggal 1 Februari 2017
dan dinyatakan telah memenuhi syarat untuk memperoleh gelar (derajat) Sarjana Pertanian
iv
PERNYATAAN
Dengan ini saya Nama: Siti Ifadatul Ulya, NIM: H0712169 Program Studi: Agroteknologi menyatakan bahwa dalam skripsi saya yang berjudul
“HUBUNGAN POLA PITA RNA TOTAL DENGAN VIRULENSI FUSARIUM ASAL SOLANACEAE” ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar akademik dan sepanjang pengetahuan penulis juga tidak ada unsur plagiarisme, falsifikasi, fabrikasi karya, data, atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan oleh penulis lain, kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Surakarta, 1 Februari 2017 Yang menyatakan
v
KATA PENGANTAR
Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat dan
karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul
“Hubungan Pola Pita RNA Total dengan Virulensi Fusarium Asal Solanaceae”. Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Pertanian di Fakultas Pertanian UNS.
Dalam penulisan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak, sehingga penulis mengucapkan terimakasih kepada:
1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pujiasmanto, M.S selaku Dekan Fakultas Pertanian UNS atas bimbingannya selama perkuliahan.
2. Prof. Dr. Ir. Hadiwiyono, M.Si selaku Kepala Program Studi Agroteknologi Fakultas Pertanian UNS dan Dosen pembahas atas bimbingannya selama
perkuliahan dan penyusunan skripsi.
3. Dr. Ir. Supyani, M.P selaku Pembimbing Utama atas bimbingannya dalam
penyusunan skripsi.
4. Ir. Sri Widadi, M.P selaku Pembimbing Pendamping atas bimbingan dalam penyususan skripsi.
5. Prof. Dr. Ir. Sholahuddin M.S selaku Pembimbing Akademik atas bimbingan dan arahan selama perkuliahan.
6. Keluarga dan teman-teman yang telah memberikan dukungan baik materi, semangat dan doa.
7. Kepada Bidik misi selaku sponsor utama kuliah saya.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih banyak kekurangan dan kesalahan.
Oleh karena itu, penulis mengharapkan kritik dan saran demi kesempurnaan penulisan skripsi ini. Penulis berharap, semoga skripsi ini dapat memberikan
manfaat kepada kita semua.
Surakarta, 1 Februari 2017
vi
B. Analisis deskriptif pola pita total RNA total ... 16
vii
DAFTAR TABEL
Nomor Judul Halaman
1. Virulensi Fusarium Berdasarkan Diameter Lesio pada Buah Apel... 16 2. Hubungan keberadaan pita RNA untai ganda pada profil RNA
total dari 7 isolat Fusarium dengan dengan diameter lesio
viii
DAFTAR GAMBAR
Nomor Judul Halaman
1. Elektroforesis RNA Total yang Diektraksi dari Miselium Fusarium Asal Tanaman Cabai pada 0,7% Gel Agarose
dengan Buffer TAE dan Menggunakan Marker HindIII... 17 2. Elektroforesis RNA Total yang Diektraksi dari Miselium
Fusarium Asal Tanaman Tomat dan Terong pada 0,7% Gel Agarose dengan Buffer TAE dan Menggunakan Marker
ix
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Judul Halaman
1. Dokumentasi penelitian. ... 27 2. Lesio pada apel dalam uji virulensi setelah inkubasi selama 14
x
RINGKASAN
HUBUNGAN POLA PITA RNA TOTAL DENGAN VIRULENSI FUSARIUM ASAL SOLANACEAE. Skripsi: Siti Ifadatul Ulya (H0712169). Pembimbing: Supyani, Sri Widadi. Program Studi: Agroteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta.
Fusarium merupakan jamur penyebab salah satu penyakit utama pada tanaman Solanaceae. Fusarium memiliki keragaman genetika yang luas yang berpengaruh pada virulensi Fusarium. Keberadaan RNA untai ganda yang merupakan genom dari mikovirus pada beberapa jamur patogen dilaporkan mampu menyebabkan hipovirulensi pada jamur yang terinfeksi dan potensial digunakan sebagai agen pengendali hayati. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman Fusarium asal Solanaceae berdasarkan pola pita RNA total serta hubunganya dengan virulensi dan Fusarium.
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan september 2015 sampai Oktober 2016 bertempat di Laboratorium Hama dan Penyakit Tanaman dan Laboratorium Biologi Tanah, Fakultas Pertanian, Universitas Sebelas Maret Surakarta. Sebanyak 32 isolat Fusarium telah diisolasi dari pertanaman Solanaceae (cabai, tomat dan terong). Masing-masing isolat telah diidentifikasi secara morfologi dan diuji virulensi pada penelitian sebelumnya. Pada penelitian ini masing-masing isolat disubkultur pada 20ml media Potato Dextrose Broth (PDB) dan dipanen
setelah ±14 hari dengan cara disaring. Miselium Fusarium yang telah dipanen diekstraksi RNA totalnya hingga membentuk pelet RNA total, selanjunya pelet RNA total dielektroforesis pada 0,7% gel agarose dan divisualisasikan menggunakan UV transiluminator. Pola pita RNA total yang dihasilkan selanjutnya dianalisis secara deskriptif untuk mengetahui hubungan antrara pola pita RNA total dengan virulensi Fusarium.
xi
SUMMARY
TOTAL RNA BAND PATTERN RELATED THE VIRULENCE OF FUSARIUM ISOLATES FROM SOLANACEAE. Thesis: Siti Ifadatul Ulya (H0712169). Supervisor: Supyani, Sri Widadi. Study Program: Agrotechnology, Faculty of Agriculture, Sebelas Maret University (UNS) Surakarta.
Fusarium is a pathogenic fungus causing Fusarium wilt on Solanaceae. Fusarium has a wide genetic diversity that affected to the virulence of Fusarium. The existence of double-stranded RNA of mycovirus inducing hypovirulence of fungus has been reported on some pathogenic fungi and potential to develope as a biological control agent. The purpose of this study was to determine the diversity of Fusarium from solanaceae based on the total RNA band pattern and its relationship with the virulence of Fusarium.
Research was held on September 2015 until October 2016, in the Laboratory of Pest and Plant Disease and Soil Biology Laboratory, Faculty of Agriculture, Sebelas Maret University. Total of 32 isolates of Fusarium had been isolated from solanaceae field (chili pepper, tomato and eggplant). Each isolates was identified morphologically and virulence tested on previous study. Each isolats was subcultured on 20ml Potato Dextrose Broth (PDB) and filtered after ± 14 days. Total RNA was extracted from Fusarium mycelium to total RNA pellets, electrophoresed on 0,7% agarose gel and visualized using UV transiluminator. Total RNA profile was analyzed descriptively to determine the relationship of Total RNA profile with the virulence of Fusarium.
