VARIASI GENETIK PARVOVIRUS ANJING DI BALI
SKRIPSI
Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan
Oleh
Ayu Widya Nareswari NIM. 1109005006
FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN UNIVERSITAS UDAYANA
RIWAYAT HIDUP
Penulis dilahirkan di Denpasar, Bali pada tanggal 24 Maret 1993, merupakan anak pertama dari dua bersaudara pasangan suami-istri Dr. drh. Komang Gde Suaryana (alm.) dengan drh. Gusti Ayu Anni Budiwati. Penulis tamat dari TKK Swastiastu pada tahun 1998, pernah mengenyam pendidikan Sekolah Dasar di SDK Tegal Jaya pada tahun 1998 sampai dengan tahun 2002 namun menamatkan di SDN 4 Sading pada tahun 2005, menamatkan Sekolah Menengah Pertama di SMPN 1 Tabanan pada tahun 2008, dan lulus Sekolah Menengah Atas di SMAN 1 Tabanan pada tahun 2011. Pada tahun 2011, penulis diterima di Fakultas
Kedokteran Hewan Universitas Udayana pada tahun 2011 melalui jalur undangan. Selama menempuh kuliah di FKH Unud, penulis aktif di Badan Perwakilan
Mahasiswa (BPM) Senat Mahasiswa Fakultas Kedokteran Hewan, Universitas Udayana sejak tahun 2012 sampai tahun 2015. Sempat menjabat sebagai Ketua Umum BPM periode kepengurusan 2014-2015. Selanjutnya penulis melakukan penelitian di Laboratorium Biomedik Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana tentang “VariasiGenetik Parvovirus Anjing di Bali” sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Kedokteran Hewan di Fakultas
UCAPAN TERIMA KASIH
Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa/Ida Sang Hyang Widhi Wasa, karena atas Asung Kerta Wara Nugraha-Nya kepada penulis sehingga penulisan skripsi yang berjudul “Variasi Genetik Parvovirus Anjing di Bali” dapat terselesaikan tepat pada waktunya. Penulisan skripsi disusun berdasarkan data-data yang diperoleh melalui penelitian yang merupakan salah satu syarat untuk meraih gelar Sarjana Kedokteran Hewan pada Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana.
Keberhasilan penulis dalam menyelesaikan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak yang turut mendukung kelancaran penulisan skripsi ini. Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada:
1. Bapak Dr. drh. I Nyoman Adi Suratma, MP. selaku Dekan Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana.
2. Bapak Prof. Dr. drh. I Gst. Ngurah Kade Mahardika selaku Pembimbing I atas bimbingan, pengetahuan, saran, motivasi, serta dukungan baik moril maupun materil sejak awal masuk dunia perkuliahan hingga dalam penulisan skripsi ini.
3. Bapak Dr. drh. I Nyoman Suartha, M.Si selaku Pembimbing II yang telah membantu, membimbing, dan memberikan saran serta arahan selama penelitian dan penyusunan skripsi ini.
4. Prof. Dr. drh. Gusti Ayu Yuniati Kencana, MP., Dr. drh. Ida Bagus Kade Suardana, M.Si, dan Dr. drh. I Wayan Sudira, M.Si selaku dosen penguji yang telah memberikan bimbingan, saran, bahkan kritik membangun yang sangat berarti untuk penyempurnaan penyusunan skripsi ini.
6. Bapak/Ibu Dosen di lingkungan Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang telah membimbing dan memberikan ilmu pengetahuan yang sangat bermanfaat hingga di tahap penulisan skripsi ini.
7. Bapak/Ibu staff Tata Usaha di lingkungan Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang telah membantu pengurusan administrasi sebagai kelengkapan syarat penyusunan skripsi.
8. drh. Ni Made Ritha Krisna Dewi, M.Si dan drh. Ni Putu Sutrisna Dewi, S.Kh selaku staff Laboratorium Biomedik Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang telah dengan sabar meluangkan waktu disela-sela kesibukannya untuk membantu dan membimbing penulis dalam pelaksanaan penelitian hingga proses penulisan skripsi.
9. Kawan seperjuangan angkatan 2011 A dan B serta rekan-rekan Senat Mahasiswa FKH Unud yang turut membantu secara tidak langsung dan memberikan semangat dalam pelaksanaan penelitian sampai dengan penyusunan skripsi.
10.Keluarga besar yang tidak dapat saya sebutkan satu-persatu, yang selalu menjadi penyemangat, nasihat, motivasi dan selalu memberikan doa serta dukungannya baik fisik maupun materi yang sangat bermanfaat hingga terselesaikannya skripsi ini.
11.Sahabat-sahabat terdekat saya, Putu Bulan Sasmita Dewi, Ni Made Dwi Indahyani, Kadek Wijaya Kusuma, Ida Bagus Gde Rama Wisesa, Made Dwicky Widya Iswara, Anak Agung Raka Pramasudha, Ni Luh Sri Sundari Rahayu, I Dewa Ayu Gede Tara Damayanthi, Anak Agung Istri Trisna Jiwani Lestari, Raden Roro Chandra Gita, A.A Ratih Pramiswari, dan Dwi Kusuma Komala Ratih yang selama ini sudah menjadi keluarga bagi penulis dengan saling berbagi suka, duka, dukungan, kritik serta saran bagi kemajuan studi penulis. Terima kasih untuk selalu membantu, menghibur, memberikan semangat maupun motivasi, serta saran dan kritik yang sangat membangun demi terselesaikannya skripsi ini.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan, maka dalam kesempatan ini penulis mengharapkan kritik dan saran yang bersifat membangun agar skripsi ini dapat memberikan manfaat bagi para pembacanya bahkan kemajuan ilmu Kedokteran Hewan kedepannya. Selamat membaca.
Denpasar, Juni 2015
DAFTAR ISI
RIWAYAT HIDUP ... i
ABSTRAK-ABSTRACT ... ii
UCAPAN TERIMA KASIH ... iii
DAFTAR ISI ... v
DAFTAR GAMBAR ... vi
DAFTAR TABEL ... vii
DAFTAR LAMPIRAN ... viii
BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang ... 1
1.2 Rumusan Masalah ... 3
1.3 Tujuan Penelitian ... 3
1.4 Manfaat Penelitian ... 3
BAB II TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Penyakit Parvo ... 4
2.2 Virus Parvo ... 6
2.3 Genetika Virus Parvo ... 7
2.4 Teknik Kajian Virus Parvo ... 8
` 2.5 Polymerase Chain Reaction dan Sekuensing ... 9
2.6 Bioinformatika ... 10
2.7 Kerangka Konsep ... 11
BAB III MATERI DAN METODE 3.1 Materi Penelitian ... 13
3.1.1. Objek penelitian ... 13
3.1.2. Bahan yang digunakan ... 13
3.1.3. Peralatan yang digunakan ... 13
3.2 Rancangan Penelitian ... 14
3.3 Variabel Penelitian ... 14
3.4 Cara Pengumpulan Data ... 14
3.5 Prosedur Penelitian ... 15
3.5.1. Isolasi DNA ... 15
3.5.2. Polymerase Chain Reaction ... 16
3.5.3. Elektroforesis ... 16
3.5.4. Sekuensing dan analisis sekuen ... 17
3.6 Analisis Data ... 18
3.7 Lokasi dan Waktu Penelitian ... 18
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Hasil Penelitian ... 19
4.2 Pembahasan ... 24
BAB V SIMPULAN DAN SARAN 5.1 Simpulan ... 26
5.2 Saran ... 26
DAFTAR GAMBAR
Judul Halaman
2.1. Bagan kerangka konsep... 12 3.1. Kerangka alur pelaksanaan penelitian ... ……. 14 4.1. Hasil elektroforesis produk PCR VP2 dari CPV-2
DAFTAR TABEL
Judul Halaman
4.1. Kode isolat, tahun isolasi dan data klinis spesimen ... 19 4.2. Asam amino polimorfik CPV asal Bali dibandingkan
dengan berbagai strain CPV yang dikenal didunia ... ……. 21 4.3. Rangkuman asam amino polimorfik protein VP2 dari
berbagai isolat yang sekuennya tersedia di GenBank
dan strainnya diketahui ... ……. 22 4.4. Perbedaan variasi CPV asal Bali dibandingkan dengan
DAFTAR LAMPIRAN
Judul Halaman
1. Asam amino polimorfik protein VP2 dari berbagai isolat
yang sekuennya tersedia di GenBank dan strainnya diketahui ... 32 2. Sekuen fragmen VP2 dari CPV-2 Bali
