1
Infected, Recovered (SEIR) (Studi Kasus : Kota Salatiga)
LAPORAN PENELITIAN
Diajukan kepada Fakultas Teknologi Informasi
Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Komputer
Peneliti :
Yohana Siti Winarni 672005061 Sri Yulianto Joko Prasetyo, S.Si., M.Kom.
Program Studi Teknik Informatika Fakultas Teknologi Informasi Universitas Kristen Satya Wacana
Salatiga Desember, 2012
Pernyataan
Yang bertandatangan di bawah ini,Nama : Yohana Siti Winarni
NIM : 672005061
Program Studi : Teknik Informatika
Fakultas : Teknologi Informasi, Universitas Kristen Satya Wacana
Menyatakan dengan sesungguhnya bahwa tugas akhir dengan judul : Deteksi Daerah Endemis Tuberculosis (TB) dengan Menggunakan Pemodelan Matematis Susceptible, Exposed,
Infected, Recovered (SEIR) (Studi Kasus : Kota Salatiga) Yang dibimbing oleh :
1. Sri Yulianto Joko Prasetyo, S.Si., M.Kom.
Adalah benar hasil karya saya.
Di dalam tugas akhir ini tidak terdapat keseluruhan atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya ambil dengan menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau gambar serta simbul yang saya akui seolah-olah sebagai karya saya tanpa memberikan pengakuan penulisan atau sumber aslinya.
Salatiga, 1 Februari 2013 Yang memberi pernyataan,
Kata Pengantar
Puji syukur kepada Tuhan Yesus Kristus, atas kasih dan berkat-berkat-Nya yang tak berkesudahan sehingga tugas akhir ini dapat diselesaikan dengan baik. Kesulitan demi kesulitan dapat dilalui selama proses penyelesaian tugas akhir ini. Meskipun banyak tantangan dan kesulitan, bukan berarti membuat kita mundur, terpuruk, dan menyerah, akan tetapi semuanya itu dapat menjadi batu lompatan agar kita bisa naik ke tingkat selanjutnya, menjadi lebih baik dan matang. Banyak pula pelajaran berharga yang didapatkan selama mengerjakan tugas akhir.
Ucapan terima kasihpun tidak dapat tidak terucap atas dukungan dari berbagai pihak yang secara langsung maupun tidak langsung yang ikut ambil bagian dalam membantu merampungkan tugas akhir ini. Terima kasih diucapkan kepada:
1. Dr. Andeka Rocky Tanaamah, S.E.,M.Cs. selaku Dekan Fakultas Teknologi Informasi Universitas Kristen Satya Wacana Salatiga.
2. Dian W. Chandra, S.Kom., M.Cs., selaku Ketua Program Studi Teknik Informatika Fakultas Teknologi Informasi Universitas Kristen Satya Wacana Salatiga.
3. Sri Yulianto Joko Prasetyo, S.Si., M.Kom., selaku dosen pembimbing, terima kasih atas kesabaran dalam memberi bimbingan, masukan, motivasi dan pengarahan dalam penyusunan laporan penelitian ini.
4. Mila C. Paseleng, S.Si., M.Pd. selaku Koordinator KP/TA. 5. Dinas Kesehatan, BPS Salatiga, Bapeda Salatiga, dan seluruh
6. Kedua orang tuaku, papi dan mami serta kakak-kakakku Embon, Marlin, dan Wiwin yang terkasih. Terima kasih untuk seluruh kasih, doa, tenaga, pikiran, bimbingan, dukungan baik moral maupun material, serta kesabaran dan untuk segalanya yang tak pernah bisa dibalas dengan apapun.
7. Kekasihku Victor Daely yang selalu menyemangati dalam segala keadaan dan tidak pernah lelah memberikan dukungan dan bantuan dalam menghadapi kesulitan-kesulitan pada proses penyusunan tugas akhir.
8. Teman-temanku Rere, Sendy, Kiko, Dita, Indri, Riezqi, Dewi, Nita, Indras, Bobo, Dobby, Gilang, Andree, Andre Ngapak, Novi, Kakek, Gepeng, dan Ricardo. Terimakasih atas kebersamaan dan dukungan kalian.
9. Efata Youth 4 Christ, API Efata dan GSM Serayu. Terimakasih atas dukungan dan doa kalian.
10. Semua pihak dan teman terkait yang telah membantu dalam penyusunan laporan ini, yang tidak dapat disebutkan satu persatu.
Disadari sepenuhnya bahwa dalam penulisan laporan penelitian ini masih terdapat kekurangan. Oleh karena itu, sangat diharapkan saran yang membangun dari pembaca demi penyempurnaan laporan ini. Akhir kata, penulis berharap semoga laporan penelitian ini dapat bermanfaat bagi pembaca sekalian.
Salatiga, 21 Desember 2012
Daftar Isi
Halaman Judul ... i
Lembar Pengesahan ... ii
Lembar Pernyataan Tidak Plagiat ... iii
Pernyataan ... iv
Kata Pengantar ... v
Daftar Isi ... vii
Daftar Tabel ... viii
Daftar Gambar ... ix
Daftar Kode Program ... x
Daftar Lampiran ... xi
Abstract ... xii
Bab 1 Pendahuluan ... 1
1.1 Latar Belakang ... 1
1.2 Rumusan Masalah ... 5
1.3 Tujuan dan Manfaat ... 5
1.4 Batasan Masalah ... 6
1.5 Sistematika Penulisan ... 6
Bab 2 Tinjauan Pustaka ... 8
2.1 Penelitian Terdahulu ... 8
2.2 Surveilans... 11
2.3 Konsep SEIR ... 11
2.4 Pemodelan ... 12
Bab 3 Metode dan Perancangan Sistem ... 15
3.1 Metode Pengembangan Sistem ... 15
3.1.1 Rumusan Masalah ... 17
3.1.2 Pengumpulan Data dan Analisis ... 17
3.1.3 Pengembangan Model... 18
3.1.4 Verifikasi Model dan Validasi ... 18
3.1.5 Model Eksperimen dan Optimasi ... 19
3.1.6 Implementasi Dari Hasil Simulasi ... 19
3.2 Analisa Sistem ... 20
3.2.1 Analisa Kebutuhan Sistem ... 20
3.2.2 Analisis Alur Kerja Sistem ... 21
3.2.4 Analisis Kebutuhan Hardware & Software 22 3.3 Perancangan Sistem ... 23
3.3.1 Data Flow Diagram (DFD) ... 23
3.1.2 Entity Relationship Diagram (ERD) ... 27
3.1.3 Perancangan Tabel ... 28
3.1.5 Perancangan Antarmuka Sistem ... 31
Bab 4 Hasil Dan Pembahasan ... 32
4.1 Implementasi Sistem ... 32
4.2 Hasil Pemodelan ... 38
4.3 Pengujian Sistem... 49
Bab 5 Kesimpulan Dan Saran Pengembangan ... 54
5.1 Kesimpulan ... 54
5.2 Saran ... 54
Daftar Pustaka ... xiii
Daftar Tabel
Hal Tabel 3.1 Struktur Tabel Populasi ... 28 Tabel 3.2 Struktur Tabel Kelurahan ... 29 Tabel 4.1 Tabel Data Hasil Perhitungan Laju Persebaran TB 39 Tabel 4.2 Tabel Data Kasus TB Dinas Kesehatan ... 50 Tabel 4.3 Tabel Pemodelan SEIR ... 51 Tabel 4.4 Tabel Perbandingan ... 52
Daftar Gambar Hal
Gambar 2.1 Diagram alir SEIR Tracy Atkins ... 9
Gambar 3.2 Diagram Transfer SEIR Aminah Ekawati ... 10
Gambar 3.1 Model Analisis Simulasi ... 16
Gambar 3.2 Pendekatan Untuk Validasi Model ... 19
Gambar 3.3 DFD Level 0 ... 23
Gambar 3.4 DFD Level 1 ... 25
Gambar 3.5 DFD Level 2 ... 26
Gambar 3.6 Relasi Antar Tabel ... 27
Gambar 3.7 Program Pemodelan Endemis SEIR ... 30
Gambar 3.8 Perancangan Sistem ... 31
Gambar 4.1 Anatarmuka Pemodelan SEIR ... 32
Gambar 4.2 Laju Penyebaran SEIR di Kelurahan Mangunsari .... 40
Gambar 4.3 Titik Kesetimbangan Kelurahan Randuacir ... 41
Gambar 4.4 Titik Kesetimbangan Kelurahan Mangunsari ... 42
Gambar 4.5 Peta Daerah Endemis TB Kota Salatiga ... 43
Gambar 4.6 Peta Persebaran Penduduk Rentan TB ... 44
Gambar 4.7 Peta Persebaran Penduduk Terjangkit TB ... 42
Gambar 4.8 Peta Persebran Daerah Terinfeksi TB ... 47
Gambar 4.9 Peta Persebaran Penduduk Sembuh TB ... 48
Daftar Kode Program Hal Kode program 4.1 Perintah memanggil Library ... 33
Kode program 4.2 Perintah Untuk Menghitung Laju Persebaran Penyakit TB ... 34
Kode program 4.3 Perintah Untuk Menampilkan Titik Kesetimbangan TB ... 36
Kode program 4.4 Perintah Untuk Menampilkan Daerah Endemis TB ... 37
Daftar Lampiran
Hal Lampiran1 Data TB Kota Salatiga... xi
Abstract
Tuberculosis (TB) is primarily a disease of the respiratory system with variable degrees of infectiousness. It can follow infection with the airborne bacteria germ Mycrobactorium tuberculosis. An indivdual with infectious TB expels bacteria into the air, airborne droplets containing
tubercle bacilli can then be inhaled by others and cause latent infection.
SEIR Model used to know the spread of infectious disease. In this model, population be divided in 4 subclass are susceptible, exposed, infectious,and recovery. Then model was investigated to find the point of equilibrium.
An SEIR epidemic model with an arbitrarily distributed exposed stage is revisited to study the impact of heterogeneity on the spread of infectious diseases. The heterogeneity may come from age or behavior and disease stages, resulting in multi-group and multi-stage models, respectively. For each model, Lyapunov functionals are used to show that the basic reproduction number R0 gives a sharp threshold. Depending on the values of the reproduction ratio Ro, this state can be either endemic (Ro>1) or infection-free (Ro ≤1 ).
Keywords : Tuberculosis, SEIR, Tuberculosis Model,
