i
HUBUNGAN KEKERABATAN BEBERAPA KULTIVAR
PISANG (
Musa sp.)
UNTUK SIFAT KETAHANAN TERHADAP
PENYAKIT BERDASARKAN
RESISTANCE GENE
ANALOG (RGA)
SKRIPSI
oleh :
SITI MAR’ATUSH SHOLIHAH
NIM. 10620066
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS ISLAM NEGERI
MAULANA MALIK IBRAHIM
MALANG
ii
HUBUNGAN KEKERABATAN BEBERAPA KULTIVAR
PISANG(
Musa sp.)
UNTUK SIFAT KETAHANAN
TERHADAP PENYAKIT BERDASARKAN
RESISTANCE GENE ANALOG (RGA)
SKRIPSI
Diajukan Kepada :
Fakultas Sains dan Teknologi
Universitas Islam Negeri (UIN)Maulana Malik Ibrahim Malang
Untuk Memenuhi Salah Satu Persyaratan dalam
Memperoleh Gelar Sarjana Sains (S. Si)
oleh :
SITI MAR’ATUSH SHOLIHAH
NIM. 10620066
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
UNIVERSITAS ISLAM NEGERI MAULANA MALIK
IBRAHIM MALANG
v
MOTTO
“Bertakwalah kamu kepada Allah dan ketahuilah bahwa Allah Maha
melihat apa yang kamu kerjakan” (Q.S Al- Baqarah 233).
سﺎﻧﻠﻠﻣﮭﻌﻔﻧﺄﺳﺎﻧﻟارﯾﺧو
“Dan sebaik-baik manusia adalah orang yang paling bermanfaat bagi
manusia.” (HR. Thabrani dan Daruquthni)”
Allah answer pray in 3 ways :
Allah says YES n gives u what u want
Allah says NO n gives u something better
Allah says WAIT n gives u the best in his own time
“Penelitian Molekuler Mengajarkan Bahwa Sesuatu Yang Kelihatan
Kecil Dapat Membawa Pengaruh Besar”
vi
Lembar Persembahan
ﻢﯿﺣ ﺮﻟا ﻦﻤﺣ ﺮﻟا ﷲ ﻢﺴﺑ
Ku persembahkan karya ini untuk kedua orang tuaku Ayah Nurul Huda dan Ibu Siti Almaidah yang selalu memotivasi, menasehati dan mendo’akan agar bersemangat dalam menuntut ilmu. Almarhum bapak H. Karnis, Bapak H. Tomo dan Almarhumah Mbah Ibu Hj. Siti Maimunah nasehat dan teladan yang engkau berikan semoga tetap terkenang Untuk Mbah H. Latifah terima kasih atas kasih sayang dan nasihat yang diberikan. Adikku Muhammad Miftahur Rizqi “si Hukting” yang selalu memotivasiku agar tetap terus bersemangat dan tidak mengeluh jika mendapat
kesulitan. Dosen pembimbing Dr. Evika Sandi Savitri,M.P dan Andik Wijayanto, M.Si yang selalu memberikan saran dan nasehat dalam menyusun skripsi. Dosen Wali Dwi Suheriyanto, M.P yang selalu memberikan nasehat dan berbagi ilmu selama menempuh kuliah. Sahabat–sahabat Biologi B yang tercinta Arif, Mbak Bonek, Sahla ,Susi , Erika, Ririn, Afif, Ika, Zaim dan Khotim dan yang lainnya yang tidak dapat disebutkan satu-persatu tetaplah berjuang menggapai mimpi-mimpi kalian.
Sahabat-Sahabat TravellingUs Subada, bang Satriyo, A.Shonhaji,
Paqih, Mega dan Iva, semoga tetap selalu diberikan kesempatan untuk mengunjungi pesona alam yang indah dan terima kasih sudah membantu dalam pengambilan sampel daun pisang. Sahabat-Sahabat di Lab Biologi Molekuler Laboran Mas Ismail, Luluk, Asif, Mbak Nana, Fitrah,, Mbak Adel terima kasih sudah sering
vii
berbagipikiran, lembur bareng di Lab, terus bersemangat untuk mencapai cita-cita. Para Laboran Biologi Mbak Lil, Mas Basyar , Mas Zulfan,dan admin Mas Saleh terima kasih atas bantuannya selama ini. Teman-Teman HMJ Biologi mbak rike, dek Ifa, dkk terima kasih sudah sebagai tempat diskusi selain kuliah juga bertukar pikiran tentang organisasi dan kehidupan.Terus berjuang untuk HMJ Biologi. Teman-teman Asisten Praktikum Elik, Eva, Mbak Yanti, Bagus, Riftin dan mbak evi dan yang lain, terima kasih telah menjadi partner yang baik dan
memberikan banyak pengalaman. Sahabat-sahabat kos Wisma Asri Emil, Estu , mbak Firsty, mbak Hen,
Riris, terima kasih telah menjadi keluarga diperantauan. Masih banyak orang- orang yang sangat berarti dalam hidup semoga silaturahmi diantara kita tetap terjaga. Amin
ix
KATA PENGANTAR
Assalamualaikum Warrahmatullahi Wabarokatuh
Alhamdulillahirobbil ‘Alamin, segala puji bagi Allah Subhanahu wata’ala yang senantiasa memberikan Rahmat, sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “Hubungan Kekerabatan beberapa kultivar pisang (Musa sp)untuk sifat tahan penyakit berdasarkan Resistance Gene Analog
(RGA)”.Penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari bimbingan, bantuan dan
dukungan dari berbagai pihak Oleh karena itu penulis mengucapkan terima kasih kepada :
1. Prof.Dr.H. Mudjia Rahardjo, M.Siselaku Rektor Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Malang.
2. Dr.drh.Hj. Bayyinatul Muchtaromah, M.Si selaku Dekan Fakultas Sains dn Teknologi Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Malang.
3. Dr. Evika Sandi Savitri,M.Siselaku Ketua Jurusan Biologi sekaligus dosen pembimbing I yang telah banyak memberikan pelajaran dan saran pada penelitian ini.
4. Andik Wijayanto, M.Si selaku dosen pembimbing II yang telah sabar memberikan bimbingan, pengarahan, dan saran dalam pembuatan skripsi ini.
5. Kholifah Holil, M.Si dan Ruri Siti Resmisari, M.Si yang telah memberikan pengarahan dan saran dalam pembuatan skripsi ini.
x
6. Dwi Suheriyanto, M.P selaku dosen wali yang telah memberikan banyak nasehat.
7. Seluruh dosen, staf administrasi dan karyawan jurusan Biologi yang telah membantu dalam pembuatan skripsi ini.
8. Ayah H. Nurul Huda dan Ibunda Hj. Siti Almaidah yang telah memberikan dukungan dan do’a serta mendorong penullis untuk tetap semangat dalam menyelesaikan skripsi ini.
9. Adik Muhammad Miftahur Rizqi yang selalu memberikan semangat dalam menyelesaikan skripsi ini.
10.Ibu P.E.R Prahardini dan petugas BPP Kab. Lumajang yang telah memberikan dukungan dan bantuan untuk pembuatan skripsi ini.
11.Teman-teman seperjuangan di Laboratorium Biologi Molekuler dan Genetika : Luluk, Asif, Nana, dan Fitrah yang telah memberikan bantuan dan saran dalam penelitian.
12.Teman-Teman Biologi 2010 yang telah memberikan pengalaman berharga selama menempuh kuliah.
Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dalam menambah pengetahuan khususnya dalam bidang Biologi.. Harapan lain adalah skripsi ini dapat menjadi inspirasi untuk penelitian selanjutnya, khususnya dalam penerapan bidang biologi molekuler untuk pemuliaan tanaman.
Wassalamualaikum Warahmatullahi Wabarokatuh.
Malang, 29 Agustus 2014
xi
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ... i
HALAMAN PERSETUJUAN ... ii
HALAMAN PENGESAHAN ... iii
MOTTO ... iv
PERSEMBAHAN ... v
PERNYATAAN ORISINALITAS PENELITIAN ... vii
KATA PENGANTAR ... viii
DAFTAR ISI ... x
DAFTAR TABEL ... xiii
DAFTAR GAMBAR ... xiv
DAFTAR LAMPIRAN ... xv ABSTRAK ... xvi ABSTRACT ... xvii ﺚﺤﺒﻟا ﺺﺨﻠﻣ ... xviii BAB I. PENDAHULUAN ... 1 1.1 Latar Belakang ... 1 1.2 Rumusan Masalah ... 5 1.3 Tujuan Penelitian ... 6 1.4 Manfaat Penelitian ... 6 1.5 Batasan Masalah ... 6
BAB II. TINJAUAN PUSTAKA ... 7
2.1 Deskripsi Tanaman Pisang (Musa sp.) ... 7
2.1.1 Tanaman Pisang Dalam Al-Qur’an ... 7
xii
2.1.3 Morfologi Tanaman Pisang (Musa sp.) ... 8
2.1.4 Keanekaragaman Genetik tanaman Pisang (Musa sp.) ... 11
2.1.5 Penyakit Pada Tanaman Pisang ... 13
2.2 Bentuk-bentuk Ketahanan Tumbuhan ... 17
2.2.1 Ketahanan Mekanis ... 17
2.2.2 Ketahanan Kimiawi ... 17
2.2.3 Ketahanan Fungsional ... 18
2.3 Genetika Sifat Ketahanan ... 18
2.3.1 Ketahanan Gen Tunggal ... 18
2.3.2 Ketahanan Gen Ganda ... 19
2.3.3 Pewarisan Ketahanan ... 20
2.4 Penggunaan Marka Genetik ... 21
2.4.1 Pengertian dan Penggunaan Marka Genetik ... 21
2.4.2 Penggunaan Resistance Gene Analog (RGA) Untuk Mengelompokkan Tanaman ... 25
2.5 Analisis Keakeragaman Genetik Dari Marka Molekuler ... 31
BAB III. METODE PENELITIAN ... 32
3.1 Rancangan Penelitian... 32
3.2 Waktu dan Tempat ... 33
3.3 Alat dan Bahan ... 33
3.3.1 Alat ... 33
3.3.2 Bahan ... 34
3.4 Cara Kerja ... 34
3.4.1 Pengambilan Sampel Daun ... 34
3.4.2 Ekstraksi DNA ... 35
3.4.3 Pengukuran Kuantitas dan Kemurnian DNA ... 36
3.4.4 Pengukuran Kualitas DNA (Visualisasi DNA) ... 36
3.4.5 Pembuatan Primer (Primer Design) ... 36
xiii
3.4.7 Analisis Data ... 38
3.5 Kerangka Konsep Penelitian... 40
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ... 41
4.1 Ekstraksi DNA ... 41
4.2 Amplifikasi DNA... 46
4.2.1 Amplifikasi DNA Menggunakan Primer NBS-LRR ... 46
4.2.2 Amplifikasi DNA menggunakan Primer NLRR ... 48
4.3 Dendogram Pengelompokan Kultivar Pisang Untuk Sifat Ketahanan Terhadap Penyakit ... 55
BAB V. PENUTUP ... 60
5.1Kesimpulan ... 60
5.2 Saran ... 60
DAFTAR PUSTAKA ... 61
xiv
DAFTAR TABEL
Tabel 3.1 Kelompok sampel beberapa kultivar pisang ... 32
Tabel 3.2 Hasil urutan sekuens basa primer RGA Pisang ... 37
Tabel 3.3 Komposisi PCR Mix untuk 12 tabung PCR ... 37
Tabel 3.4 Pengkondisian suhu dan waktu PCR untuk primer NBS-LRR ... 38
Tabel 3.5 Pengkondisian suhu dan waktu PCR untuk primer NLRR ... 38
xv
DAFTAR GAMBAR
Gambar 2.1 Habitus tanaman, batang semu dan pelepah daun pisang ... 9
Gambar 2.2 Bentuk daun tua dan daun muda pisang ... 9
Gambar 2.3 Tandan buah dengan braktea membuka, warna braktea bagian dalam, kepala putik, tepal, tepal bebas ... 10
Gambar 2.4 Buah pisang Cavendish dan buah pisang Agung ... 11
Gambar 2.5 Isolat dan konidia F. oxisforum ... 14
Gambar 2.6 Daun yang terserang penyakit F.oxisforum ... 14
Gambar 2.7 Gejala awal dan lanjut penyakit speackle daun ... 16
Gambar 2.8 Contoh motif yang terkonservasi sebagai contoh target primer RGA ... 28
Gambar 3.9 Letak geografis Kecamatan Senduro dan Pasrujambeh Kabupaten Lumajang ... 33
Gambar 3.10 Kerangka konsep penelitian ... 40
Gambar 3.11 Hasil ekstraksi DNA genom pisang dan keterangan sampel .... 43
Gambar 4.12 Hasil elektroforesis primer NBS-LRR dan keterangan sampel 47 Gambar 4.13 Hasil elektroforesis primer NLRR dan keterangan sampel ... 49
Gambar 4.14 Zimogram pita hasil amplifikasi dan keterangan sampel ... 50 Gambar 4.15 Dendogram pengelompokan berdasarkan primer RGA-NLRR 55
xvi
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Skema Kerja ... 69
Lampiran 2. Pembuatan primer RGA berdasarkan NBS-LRR ... 71
Lampiran 3. Pembuatan dendogram pengelompokan ... 77
Lampiran 4. Dokumentasi Penelitian ... 78
Lampiran 5. Karakterisasi morfologi pisang Agung Semeru, Mas Kirana (kontrol tahan) dan Pisang Embug (kontrol rentan) ... 80
xvii
ABSTRAK
Sholihah, Siti Mar’atush. 2014. Hubungan Kekerabatan Beberapa Kultivar Pisang (Musa sp.) Untuk Sifat Ketahanan Terhadap Penyakit Berdasarkan Resistance Gene Analog (RGA). Skripsi. Jurusan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Maulana Malik Ibrahim Malang. Pembimbing Biologi : Evika Sandi Savitri. Pembimbing Agama : Andik Wijayanto.
Kata Kunci : Kultivar Pisang (Musa sp), Ketahanan Terhadap Penyakit, RGA. Pisang (Musa sp.) merupakan salah satu tanaman yang mempunyai keanekaragaman genetik tinggi, sehingga sifat-sifat dari tanaman ini juga beragam. Salah satu sifat unggul dari tanaman ini adalah tahan terhadap penyakit(contoh kultivar kultivar Mas Kirana dan Agung Semeru) dan rentan (kultivar Embug).Ketahanan dan kerentanan terhadap penyakit dikendalikan oleh RGA.Sekuens daerah terkonservasi pada RGA dapat digunakan sebagai dasar pembuatan primer, sehingga terdapat perbedaan pita amplifikasi antara kultivar tahan dan rentan. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan beberapa kultivar pisang (Musa sp.) untuk sifat ketahanan terhadap penyakit berdasarkan RGA.
Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah daun 12 kultivar pisang. Pisang Agung Semeru dan Mas Kirana digunakan sebagai kontrol tahan. Sedangkan kontrol rentan adalah kultivar Embug, untuk dibandingkan pita DNA dengan 9 kultivar lain. Primer yang digunakan adalah primer daerah terkonservasi NBS-LRR dan NLRR. Tahap Penelitian meliputi ekstraksi DNA, Amplifikasi DNA dan pembuatan dendogram dengan softwere NTSys 2.01.Parameter data dalam penelitian ini adalah konsentrasi DNA, elektroforesis DNA genom, hasil amplifikasi DNA dan dendogram hubungan kekerabatan.
Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi DNA yang didapat berkisar antara 159,2 sampai 1131 ng/µl. Elektroforesis DNA menunjukkan beberapa sampel mepunyai pita yang tebal dan beberapa masih terdapat smear. Amplifikasi DNA menghasilkan pita berukuran 100 sampai 700 bp dan bersifat polimorfik. Hasil analisis hubungan kekerabatan menghasilkan Kultivar Mas Kirana sebagai kultivar tahan I berkerabat jauh dengan kelompok rentan dan tahan II dengan indeks kemiripan 0,54. Kultivar Embug sebagai kultivar rentan berkerabat dengan kultivar Barley dan Raja Nangka dengan indeks kemiripan 1, sedangkan dengan kultivar Kepok mempunyai indeks kemiripan 0,81. Kultivar Agung Semeru sebagai kontrol tahan II berkerabat dengan kultivar Susu dengan indeks similaritas kedua varietas ini adalah 1, sedangkan dengan kultivar Agung Jawa, Ambon Hijau dan Raja Mala indeks kemiripannya 0,91. Kultivar Cavendih berkerabat dengan kultivar tahan II dengan indeks kemiripan 0,73 dan kultivar Kidang dengan indeks kemiripan 0,68.
xviii
ABSTRACT
Sholihah, Siti Mar'atush. 2014. Phylogenetic Relationship Some cultivars Banana (Musa sp.) For Resistanceof the Disease Based on
Resistance Gene Analog (RGA). Thesis. Department of Biology, Faculty of Science and Technology of the State Islamic University of Maulana Malik Ibrahim Malang. Biology Supervisor: Dr.Evika Sandi Savitri, M.P.Religion Supervisor: Andik Wijayanto, M.Si.
Keywords: Banana Cultivars (Musa sp), Resistance of the Disease, RGA.
Banana(Musa sp.) is one of theplants that have high genetic diversity, so that the propertiesof this plant are also diverse. One of thesuperior properties of this plantis resistant todisease (eg.cultivar Mas Kirana and Agung Semeru) and susceptible (cultivar Embug). Resistance and susceptible to diseaseis controlled by the RGA. Sequences of conserve dregionsin the RGA can be used as the basis for the primer design, so that there is a difference between resistant cultivars band amplificationand suspectible. Therefore,this studyaims to determine the phylogenetic relationship several cultivars of banana (Musa sp.) resistance the of disease based on RGA.
The sample used in this study were 12 cultivars of banana leaves. Agung Semeru and Mas Kirana cultivar used asresistant controls. While cultivar Embug used as susceptible, tocompare DNA band with 9 other cultivars. Primer- primer used was NBS-LRR conserved regions and NLRR. The research phase includes DNA extraction, DNA amplification and manufacturedendogramwithNTSYS softwere 2.01. Data Parameter in this study is the concentration of DNA, genomic DNA electrophoresis, DNA amplification and dendogram results phylogenetic relathionship.
The results showed that the DNA concentration sobtained ranged from159.2 to1131 ng/ µl. DNA electrophoresis showed some samples had thick ribbon and some still are smears. DNA amplification product measuring tape of 100 to700 bp and are polymorphic. The results ofthe analysis of phylogenetic relationship produce cultivars Mas Kirana as idistantly related cultivars resistantt osusceptible and resistant group II with similarity index of 0.54. Embug cultivars susceptible cultivarsas related to the Barley cultivars and Raja Nangka withsimilarityindex of 1,00 whereas the cultivars Kepok have similarity index of 0.81. Agung Semeru as control cultivars resistant II is related Susu Cultivar index similarity of both is 1,00, whilethe Agung Jawa Cultivar, Ambon Hijau and Raja Mala has similarity index of 0.91. Cavendish cultivars related with resistant cultivars II has a similarity index of 0.73 and Kidang cultivars the similarity index is 0.68.
xix
ﺚﺤﺒﻟا ﺺﻠﺨﺘﺴﻣ
ﺔﺤﻟﺎﺼﻟا
.
ةأﺮﻣ ﻲﺘﺳ
2014
.
ﺔﻋﻮﻨﺘﻤﻟ ﺔﯾﺮﺳﻷا ﺔﻗﻼﻋ
ﺔﯿﻋﺎﻓﺪﻟا ﺔﻔﺼﻟا ﻦﻋ زﻮﻤﻟا ﻲﻓ سﺎﻨﺠﻟا
و
ﻦﻋ ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا
ﺐﺴﺣ ﻰﻠﻋ ضاﺮﻣﻷا
ﺔﯾﺮظﺎﻨﺘﻟا ﺔﯿﻠﯿﻠﺤﺘﻟا
.
ﺎﯿﺟﻮﻟﻮﻨﻜﺘﻟاو مﻮﻠﻌﻟا ﺔﯿﻠﻛ ﻲﻓ ﺎﯿﺟﻮﻟﻮﯿﺒﻟا ﻢﺴﻗ ﻲﻓ ﻲﻤﻠﻋ ﺚﺤﺑ
ﻖﻧﻻﺎﻣ ﺔﯿﻣﻮﻜﺤﻟا ﺔﯿﻣﻼﺳﻹا ﻢﯿھاﺮﺑإ ﻚﻟﺎﻣﺎﻧﻻﻮﻣ ﺔﻌﻣﺎﺠﺑ
.
لوﻷا فﺮﺸﻤﻟا
:
يﺮﻄﻓﺎﺳ يﺪﻧﺎﺳ ﺎﻜﯿﻓأرﻮﺘﻛد
.
فﺮﺸﻤﻟا
ﻲﻨﯾﺪﻟا
:
ﺮﯿﺘﺴﺟﺎﻤﻟاﻮﻄﻧﺎﯾﺎﺠﯾو ﻚﯾﺪﻧأ
.
ﺔﯿﺳﺎﺳﻷا تﺎﻤﻠﻜﻟا
:
زﻮﻤﻟا فﺎﻨﺻأ
،،ضاﺮﻣﻷا ﻦﻋ ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا
ﺘﻟا ﺔﯿﻠﯿﻠﺤﺘﻟا
ﺔﯾﺮظﺎﻨ
ﺔﻋﻮﻨﺘﻤﻟا تﺎﺒﻨﻟا تﺎﻔﺻو ﺔﯿﻟﺎﻌﻟا ﺲﻨﺠﻟا ﺔﻋﻮﻨﺘﻣ ﺎﮭﻟ ﻲﺘﻟا تﺎﺒﻨﻟا ىﺪﺣإ ﻦﻣ زﻮﻤﻟا
ﺎﻀﯾأ
.
ضاﺮﻣﻷا ﻦﻣ ﮫﺗﻮﻗو ﮫﻋﺎﻓد ﻲھ ﺔﻗﻮﻔﺘﻤﻟا ﮫﺗﺎﻔﺻ ﻦﻣ
)
ﻖﻧﻮﻏأو ﺎﻧاﺮﯿﻛ سﺎﻣ فﺎﻨﺻأ
وﺮﯿﻤﺳ
(
ﺔﺿﺮﻋ و
)
كﻮﺒﻣأ فﺎﻨﺻأ
.(
ﺔﯿﻠﯿﻠﺤﺘﻟا ﮫﻀﺒﻘﯾ ضاﺮﻣﻷا ﻦﻋ ﺔﻋﺎﻓﺪﻟاو ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟاو
ﺔﯾﺮظﺎﻨﺘﻟا
.
ﻨﻤﻟا ﻞﺴﻠﺴﺗو
ﻲﻓ ﺔظﻮﻔﺤﻤﻟا ﺔﻘﻄ
،
ﺔﯾﺮظﺎﻨﺘﻟا ﺔﯿﻠﯿﻠﺤﺘﻟا
ﺔﯿﺳﺎﺳﻷا داﻮﻤﻟﺎﻛ مﺪﺨﺘﺴﯾ
ﺔﺿﺮﻌﻟاو ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا فﺎﻨﺻأو ﻢﯿﺨﻀﺘﻟا ﺔﻗﺮﻔﻟا ﻦﯿﺑ فﻼﺘﺧا نﻮﻜﺗ ﻰﺘﺣ ﺔﯿﺳﺎﺳﻷا ﺔﻋﺎﻨﺻ ﻲﻓ
.
ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا ﺔﻔﺻ ﻲﻓ زﻮﻤﻟا ﻲﻓ ﺔﯾﺮﺳﻷا فﺎﻨﺻأ ﻦﯿﺑ ﺔﻗﻼﻌﻟا ﺔﻓﺮﻌﻤﻟ ﺚﺤﺒﻟا اﺬھ فﺪﮭﯾ ﻚﻟﺬﻟ
ﻦﻋ
ﺐﺴﺣ ﻰﻠﻋ ضاﺮﻣﻷا
ﺔﯿﻠﯿﻠﺤﺘﻟا
ﺔﯾﺮظﺎﻨﺘﻟا
.
ﻲھ ﺚﺤﺒﻟا اﺬھ ﻲﻓ ﺔﻣﺪﺨﺘﺴﻤﻟا ﺔﻨﯿﻌﻟاو
12
زﻮﻤﻟا ﻒﻨﺻ
.
و
ﺎﻧاﺮﯿﻛ سﺎﻣ فﺎﻨﺻأ
ﺰﻛر ﻲﻓ اﺰﻛر نﻮﻜﺗوﺮﯿﻤﺳ ﻖﻧﻮﻏأو
و ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا
نرﺎﻘﯿﻟ ﺔﺿﺮﻌﻟا ﺰﻛﺮﻛ كﻮﺒﻣأ فﺎﻨﺻأ
ﺑ
ﺔﻗﺮﻔﻟﺎ
DNA
ـﺑ
9
ىﺮﺧأ قﺮﻓ
.
سﺎﺳأ ﻮھ مﺪﺨﺘﺴﯾ ﺎﻣ لوأو
ﺔظﻮﻔﺤﻤﻟا ﺔﻘﻄﻨﻤﻟا
NBS-LRRو
NLRR .ﻒﻄﺘﻘﻣ ﻰﻠﻋ ﺚﺤﺒﻟا ىﻮﺘﺣاو
DNA
ﻢﯿﺨﻀﺗ ،
DNA
ﺔﻋﺎﻨﺻو
dendogramـﺑ
softwere NTSys 2،01.
ﻂﺳﻮﺘﻤﻟا ﺮﺘﻣارﺎﺒﻟاو
ﺰﻛر ﺚﺤﺒﻟا اﺬھ ﻲﻓ ﺔﻣﺪﺨﺘﺴﻤﻟا
DNA
،
elektroforesis DNA genom ،
ﺔﺠﯿﺘﻧو
amplifikasi DNAو
dendogramﺔﯾﺮﺳﻷا ﺔﻗﻼﻋ
.
ﻰﻠﻋ لﺪﺗ ﺚﺤﺒﻟا اﺬھ ﺔﺠﯿﺘﻧو
ﺰﻛر
DNA
ﻦﯿﺑ ﺎﻣ ﻢﻗر ﻲﻓ ﺐﺴﺘﻜﻤﻟا
159،2
–
1131
ng/µl .و
ﻢﯿﺨﻀﺗ
DNA
ﺎﮭﯿﻓو ﻢﯿﺨﻀﺘﻟا ﻂﯾﺮﺸﻟا تﺎﻨﯿﻋ ﻰﻠﻋ لﺪﯾ
smear .و
ﻢﯿﺨﻀﺗ
DNA
ـﺑ ﻂﯾﺮﺸﻟا ﺞﺘﻨﯾ
100
-700
bpﻮھو
polimorfik .ﺔﺠﯿﺘﻧو
ﺔﯾﺮﺳﻷا ﺔﻗﻼﻋ
ﺎﻧاﺮﯿﻛ سﺎﻣ فﺎﻨﺻأ
ﺔﻣوﺎﻘﻣ ﻒﻨﺼﻛ
1
ﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا ﺔﺿﺮﻌﻟا ﻒﻨﺼﺑ ةﺪﯿﻌﺒﻟا ﺔﯾﺮﺳﻷﺎﺑ
2
ﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
0،54
.
فﺎﻨﺻأ و
ﻲﻟﺮﺑ ﻒﻨﺻ ﻊﻣ ﺔﯾﺮﺳﻷﺎﺑ ﺔﺿﺮﻌﻟا ﻒﻨﺼﻛ كﻮﺒﻣأ
ﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ ﺎﻜﻧﺎﻧ ﺎﺠﺗرو
1
كﻮﻔﻛ ﻒﻨﺻ و ،
ﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
0،81
.
ﺔﻣوﺎﻘﻣ ﺰﻛﺮﻛ وﺮﯿﻤﺳ ﻖﻧﻮﻏأو ﻒﻨﺻو
2
ﻮﺳﻮﺳ ﻒﻨﺻ ﻊﻣ ﺔﯾﺮﺳﻷﺎﺑ
ﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
1
ﻒﻨﺻ ﻲﻓ و ،
Agung Jawa, Ambon Hijau dan Raja Malaﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
0،91
.
ﻒﻨﺻو
Cavendishﺔﻣوﺎﻘﻤﻟا ﻒﻨﺼﺑ ﺔﯾﺮﺳﻷﺎﺑ
2
ﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
0،73
ﻒﻨﺻو
Kidangﮫﺑﺎﺸﺘﻟﺎﺑ
0،68
.
