SKRIPSI
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI YANG
BERSIMBIOSIS DENGAN SPONS Haliclona Sp. DARI PERAIRAN PANTAI UTARA SITUBONDO, JAWA TIMUR
PROGRAM STUDI S-1 BUDIDAYA PERAIRAN
Oleh:
BAYU JALASENA BREBES – JAWA TENGAH
FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
Yang bertanda tangan di bawah ini :
N a m a : Bayu Jalasena
N I M : 141111129
Tempat, tanggal lahir : Brebes, 27 Oktober 1993
Alamat : Perumahan Tanggulangin Anggun Sejahtera II, Blok P2 / 50, Tanggulangin, Sidoarjo. / HP : 085648992744
Judul Skripsi : Isolasi dan Identifikasi Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. dari Perairan Pantai Utara Situbondo, Jawa Timur.
Pembimbing : 1. Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. 2. Sapto Andriyono, S.Pi., MT.
Menyatakan dengan sebenarnya bahwa hasil tulisan laporan Skripsi yang saya buat adalah murni hasil karya saya sendiri (bukan plagiat) yang berasal dari Dana Penelitian Dosen.
Di dalam skripsi / karya tulis ini tidak terdapat keseluruhan atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya ambil dengan cara menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau simbol yang saya aku seolah-olah sebagai tulisan saya sendiri tanpa memberikan pengakuan pada penulis aslinya, serta kami bersedia :
1. Dipublikasikan dalam Forum Ilmiah International Conference of Live Science and Biotechnology 2015;
2. Memberikan ijin untuk mengganti susunan penulis pada hasil tulisan skripsi / karya tulis saya ini sesuai dengan peranan pembimbing skripsi; 3. Diberikan sanksi akademik yang berlaku di Universitas Airlangga,
termasuk pencabutan gelar kesarjanaan yang telah saya peroleh (sebagaimana diatur di dalam Pedoman Pendidikan Unair 2010/2011 Bab. XI pasal 38 – 42), apabila dikemudian hari terbukti bahwa saya ternyata melakukan tindakan menyalin atau meniru tulisan orang lain yang seolah-olah hasil pemikiran saya sendiri
SKRIPSI
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI YANG
BERSIMBIOSIS DENGAN SPONS Haliclona Sp. DARI PERAIRAN PANTAI UTARA SITUBONDO, JAWA TIMUR
Skripsi sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan
Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga
Oleh:
BAYU JALASENA NIM: 141111129
Menyetujui, Komisi Pembimbing
SKRIPSI
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI YANG
BERSIMBIOSIS DENGAN SPONS Haliclona Sp. DARI PERAIRAN
PANTAI UTARA SITUBONDO, JAWA TIMUR
Oleh:
BAYU JALASENA NIM: 141111129
Telah diujikan pada
Tanggal :30 November 2015
KOMISI PENGUJI SKRIPSI
Ketua : Prof. Dr. Sri Subekti, DEA., drh. Anggota : Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir., M.Agr.
Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Si. Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si Sapto Andriyono, S.Pi, M.T.
RINGKASAN
BAYU JALASENA. Isolasi dan Identifikasi Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. dari Perairan Pantai Utara Situbondo, Jawa
Timur. Dosen Pembimbing Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. dan Sapto Andriyono, S.Pi., M.T.
Spons merupakan hewan avertebrata yang termasuk dalam filum Porifera. Kebiasaan makan spons sebagai filter feeder, menjadikan spons sebagai habitat atau inang bagi mikroorganisme, seperti alga, bakteri, fitoplankton dan jamur. Mikroorganisme mempunyai dua peran penting dalam sistem biologi spons, yaitu sebagai sumber makanan dan hidup bersimbiosis. Bakteri yang bersimbiosis dengan spons Haliclona Sp. cukup beragam. Empat filum bakteri ditemukan bersimbiosis dalam spons, diantaranya adalah filum Actinobacteria, Bacteriodetes, Firmicutes dan Proteobacteria.
Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat dan mengetahui jenis serta mengetahui karakteristik isolat bakteri yang bersimbiosis dengan spons Haliclona Sp. asal perairan pantai Utara Situbondo Jawa Timur khususnya dalam aktivitas penghasil enzim ekstraseluler (amilolitik, proteolitik dan selulolitik). Penelitian ini dilakukan secara kualitatif dengan menggunakan metode deskriptif,analisis data disajikan dalam bentuk uraian teks bersifat naratif, Tabel dan Gambar.
SUMMARY
BAYU JALASENA. Isolation and Identification of Bacteria that Symbiosis with Sponge Haliclona Sp. from Situbondo Coastal Waters Of The North,
East Java. Academic Advisors Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si. and Sapto Andriyono, S.Pi., M.T.
Sponges are invertebrates included in the phylum Porifera. Sponge feeding habits as a filter feeder, make sponge habitat or host for microorganisms, such as alga, bacteria, phytoplankton and fungi. Microorganisms have two important roles in biological systems sponges, namely as a source of food and living in symbiosis. Bacterial symbiosis with sponges Haliclona Sp. quite diverse. Four phyla of bacteria found in symbiosis with sponges, including the phylum Actinobacteria, Bacteriodetes, Firmicutes and Proteobacteria.
This study aims to gain isolate and determine the type and determine the characteristics of symbiotic bacteria with a sponge Haliclona Sp. the coastal waters of northern origin Situbondo, East Java, especially in the activity of producing extracellular enzymes (amylolytic, proteolytic and cellulolytic). This research was conducted qualitatively by using descriptive methods, data analysis is presented in narrative form text description, Tables and Images.
KATA PENGANTAR
Dengan menjunjung tinggi semangat Pancasila dan nilai luhur
Undang-Undang Dasar 1945 penulis telah berhasil menyelesaikan penulisan skripsi
dengan judul isolasi dan identifikasi bakteri yang bersimbiosis dengan spons
Haliclona Sp. dari perairan pantai Utara Situbondo, Jawa Timur. Skripsi ini
disusun berdasarkan penelitian yang telah dilaksanakan di Fakultas Perikanan dan
Kelautan, Universitas Airlangga dan Badan Karantina Ikan Kelas I Surabaya pada
bulan April sampai Mei 2015.
Penulis menyadari bahwa dalam pelaksanaan penelitian dan penulisan skripsi
ini banyak melibatkan orang – orang yang sangat berjasa bagi penulis. Oleh sebab
itu, pada kesempatan ini penulis menyampaikan rasa hormat serta ucapan terima
kasih yang sebesar-besarnya kepada:
1. Ibu Dr. Mirni Lamid, drh., M.P. selaku Dekan Fakultas Perikanan dan
Kelautan Universitas Airlangga
2. Ibu Dr. Kismiyati, Ir., M.Si selaku Dosen Wali yang selalu berkenan
memberikan waktu dan arahan kegiatan akademik kepada penulis.
3. Bapak Sapto Andriyono, S.Pi, M.T. serta Ibu Wahju Tjahjaningsih, Ir., M.Si.
selaku Dosen Pembimbing yang telah berkenan meluangkan waktu serta
membagi ilmunya kepada penulis dalam pelaksanaan penelitian dan penulisan
skripsi.
4. Ibu Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA, Bapak Prof. Dr. Hari Suprapto, Ir.,
M.Agr. serta Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes. selaku Komisi Penguji yang
5. Bapak Heru Pramono, S.Pi, M.Biotech. yang telah memberikan dukungan
berupa ilmu, moril maupun materi kepada penulis untuk menyukseskan
penelitian dan penulisan skripsi.
6. Bapak Agustono, Ir., M.Kes. selaku Koordinator Skripsi yang telah
memberikan banyak dukungan dan bantuan kepada penulis agar dapat
menyelesaikan studi tepat waktu.
7. Seluruh staff pengajar, staff kependidikan dan staff kemahasiswaan Fakultas
Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga atas segala ilmu dan bantuan
yang diberikan.
8. Kedua orang tua Bapak Akh. Junaedi M. serta Ibu Kumiati yang kiranya tak
pernah berhenti mencurahkan doa, motivasi, semangat dan dukungan baik
secara moril dan materi kepada penulis.
9. Rekan-rekan Dewan Legislatif Mahasiswa Universitas Airlangga, Majelis
Perwakilan Mahasiswa Universitas Airlangga serta Badan Legislatif
Mahasiswa Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga masa
bakti 2014 yang telah banyak memberikan motivasi maupun inspirasi selama
sebelum maupun sesudah kegiatan penelitian dan penulisan skripsi.
10. Chairul Anam, S.T., Ira Ayu Andreeliya, S.Pd., Iensi Annisak, S.Pd., Ulin
Nuha, S.Pd., Rudy Widiyantoro, Yosep Adi dan Satria Permana yang selalu
memberikan motivasi dan dorongan agar penulis dapat dengan segera
11. Pipin Suciati, Tiara Hapsari, Mutia Adinda dan Shabrina Putri selaku tim
penelitian mikrobiologi, serta Fitrotin Chasanah yang telah memberikan
bantuan serta dukungan selama penelitian berlangsung.
12. Andre Mahardhika H., S.Ked. dan Vito Daryfauzi, S.Psi. yang selalu
memberikan dukungan moril dan motivasi selama pelaksanaan penelitian dan
penulisan skripsi.
13. Mbak Dyah Sunaring, S.Pi., Gusti N.S., Hari S., Mizar D., Fahmi H.A.,
Lailatul M., Tasyarrafa N.S., Tatak D.C., Kurnia A.K.W., Surono D.S., A.
Romadhoni, Novi S., Julius H., Khairanita K. serta rekan-rekan S1 Budidaya
Perairan angkatan 2011 - OCTOPUS yang selalu memberikan semangat yang
tiada henti.
14. Semua pihak yang telah membantu dalam penelitian dan penulisan skripsi
yang kiranya tidak dapat saya sebutkan satu persatu, saya sampaikan banyak
terima kasih atas kesediaannya membantu. Semoga dharma yang telah
saudara berikan dapat terberkati serta mendapatkan balasan kebaikan oleh
Tuhan Yang Maha Esa.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh dari sempurna, sehingga
kritik dan saran dari semua pihak yang bersifat membangun sangat diharapkan.
Akhirnya penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dan memberikan
informasi bagi semua pihak.
Surabaya, 30 November 2015
DAFTAR ISI
2.2 Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons ... 11
2.2.1 Interaksi Spons dengan Bakteri ... 12
III KERANGKA KONSEPTUAL ... 15
3.1 Kerangka Konseptual Penelitian ... 15
IV METODOLOGI PENELITIAN ... 18
4.1 Tempat dan Waktu ... 18
4.4.7 Uji Aktivitas Penghasil Enzim Ekstraseluler (Amilolitik, Proteolitik dan Selulolitik) pada Isolat Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. ... 23
A. Uji Aktivitas Amilolitik ... 23
B. Uji Aktivitas Proteolitik ... 23
4.4.8 Pengamatan Aktivitas Isolat Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. dalam menghasilkan Enzim
Ekstraseluler ... 24
5.1.1 Isolasi Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. ... 32
5.1.2 Isolasi Bakteri dari Lingkungan Perairan Spons Haliclona Sp. ... 33
5.1.3 Uji Aktivitas Penghasil Enzim Ekstraseluler (Amilolitik, Proteolitik dan Selulolitik) pada Isolat Bakteri yang Bersimbiosis dengan Spons Haliclona Sp. ... 34
A. Uji Aktivitas Amilolitik ... 34
B. Uji Aktivitas Proteolitik ... 34
C. Uji Aktivitas Selulolitik ... 34
5.1.5 Identifikasi Isolat Bakteri dari Lingkungan Perairan Spons
Haliclona Sp. ... 37
5.2 Pembahasan ... 39
VI SIMPULAN DAN SARAN ... 47
5.1 Simpulan ... 47
5.2 Saran ... 47
DAFTAR PUSTAKA ... 48
DAFTAR GAMBAR
Gambar Halaman
1. Spons Haliclona Sp. ...5
2. Kerangka Konsep Penelitian ...15
3. Diagram Alir Penelitian ...29
4. Isolat dan Isolat Murni Bakteri Simbion Spons Haliclona Sp. ...31
DAFTAR TABEL
Gambar Halaman
1. Hasil Uji Identifikasi Bakteri yang Bersimbiosis dengan
Spons Haliclona Sp. ... 35
2. Hasil Uji Identifikasi Bakteri dari Lingkungan Perairan
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran Halaman
1. Komposisi Media Isolasi dan Uji Aktivitas Penghasil
Enzim Ekstraseluler ... 52 2. Tabel Hasil Isolasi Pertama Isolat Bakteri yang Bersimbiosis dengan
Spons Haliclona Sp. ... 54 3. Tabel Hasil Uji Aktivitas Amilolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis
Dengan Spons Haliclona Sp. ... 56 4.Gambar Hasil Uji Aktivitas Amilolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis Dengan Spons Haliclona Sp. ... 57 5. Tabel Hasil Uji Aktivitas Proteolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis
Dengan Spons Haliclona Sp. ... 58 6. Gambar Hasil Uji Aktivitas Proteolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis Dengan Spons Haliclona Sp. ... 59 7. Tabel Hasil Uji Aktivitas Selulolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis
Dengan Spons Haliclona Sp. ... 60 8. Gambar Hasil Uji Aktivitas Proteolitik Isolat Bakteri yang Bersimbiosis Dengan Spons Haliclona Sp. ... 61 9. Tabel Hasil Pengamatan Parameter Kualitas Air di Lingkungan Perairan yang Menjadi Habitat Spons Haliclona Sp. ... 62 10.Tabel Hasil Pewarnaan Gram Bakteri yang bersimbiosis dengan Spons
Haliclona Sp. (Perbesaran 1.000X) . ... 62 11. Tabel Hasil Pewarnaan Gram Bakteri Lingkungan Perairan yang Menjadi
