Seminar Nasional Sains dan Teknologi (SAINSTEK) 2017

Seminar Nasional

Sains dan Teknologi

(SAINSTEK) 2017

Denpasar, 21 Oktober 2017

ȋ3HQJXDWDQRiset Perguruan Tinggi untuk Pengembangan

Sains dan Teknologi yang BerkelanjutanȌ

Buku Kumpulan Abstrak

FAKULTAS MIPA UNIVERSITAS UDAYANA

2017

SEMINAR NASIONAL SAINSTEK 2017 Denpasar ± 21 Oktober 2017

No Pemakalah Penulis Judul hlm

14 I N Artawan I N Artawan, NLP Trisnawati

Klasifikasi Keterbelitan Multipartit Menggunakan Nilai Tunggal Tensor Inti Matrik Unfolding dalam Sistem Teleportasi Kuantum

63 15 AAIAM Laksmiwati AAIAM Laksmiwati, I MAdi Parwata, I W. Suirta

Kapasitas Antioksidan, Toksisitas Akut dan Kadar Total Flavonoid Ekstrak Air Daun Gaharu (Gyrinops Versteegii) 64 16 I Made Sutha Negara I Made Sutha Negara, I Nengah Simpen

Karakteristik Hidroksiapatit Hasil Ekstraksi Termal Dari Tulang Limbah dan Aplikasinya Untuk Adsorpsi Ion Selektif Biru Metilen

66 17 M. Sumadiyasa

M. Sumadiyasa, P. Suardana, N. Wendri

Sintesis Bahan Superkonduktor Fase Nd1Ba2Cu3O7-Ɂ†‡‰ƒƒ͵†ƒ Ba(OH)2.8H2O sebagai Sumber Ba

67

18 Ida Ayu Raka Astiti Asih

Ida Ayu Raka Astiti Asih,

Wiwik Susanah Rita

Aktivitas Antibakteri Ekstrak Kulit Pisang (Musa sp.) Terhadap Escherichia coli dan

Staphylococcus aureus serta Identifikasi Senyawa Aktifnya 69 19 Ni Kadek Warditiani Ni Kadek Warditiani, I Gusti Ngurah Jemmy Anton Prasetia, I Made Agus Gelgel Wirasuta

Pengaruh Senyawa Andrografolid dari Herba

Sambiloto Pada Tikus Betina Bunting 70

20 Ni Nyoman Ratini

Ni Nyoman Ratini, I Made Yuliara

Efek Radioterapi Cobalt-60 Terhadap Profil Hematologi Pada Penderita Kanker Serviks di RSUP Sanglah

71 21 Made Ria

Defiani

Made Ria Defiani, I.A. Astarini, Made Pharmawati

Peningkatan Nutrisi Zn Pada Tanaman Padi

Melalui Pemupukan Zn(SO4) 73 22 Ida Bagus Alit

Paramarta

Ida Bagus Alit Paramarta, I Wayan Supardi

Analisa Struktur Mikroskopik Nanokristal

Superkonduktor Berbasis YLEBCO Terdoping Ag 74 23 Komang Ngurah Suarbawa Komang Ngurah Suarbawa, S. Poniman

Sintesis Nano-partikel Gd/Ca-Ferrite dari Bahan Baku Alam Lokal dalam Aplikasinya Sebagai Penyerap Gelombang Radar

77

24 Putu Suardana

Putu Suardana, I Gusti Agung Putra Adnyana, Ida Bagus Alit Paramarta

Sintesis Material Superkonduktor Sistem Yitrium Y-359 dengan Suhu Kritis Tinggi 80 25 Ngurah Intan

Wiratmini

Ngurah Intan Wiratmini, Iriani Setyawati

Uji Antifertilitas Ekstrak Biji Kapuk Randu (Ceiba pentandra Gaertn.) Terhadap Organ Reproduksi Tikus Jantan 83 26 Ni Made Suartini Ni Made Suartini dan Ni Wayan Sudatri

Famili Thiaridae Pada Habitat Kolam di Wilayah Kecamatan Selat, Kabupaten Karangasem, Bali 85 27 Ni Made Asih

Ni Made Asih, Ni Luh Putu Suciptawati, Widana I Nyoman

Keberhasilan Belajar Berdasarkan Gender Pada Mata Kuliah Geometri Analitik 86

28 Inna Narayani

Inna Narayani , Rasmaya Niruri, Putu Desy Yustinadewi

Identifikasi Gen ABCB1 Pada Pasien Anak dengan Limfoblastik Leukemia Akut untuk Diagnostik 87

Extended Abstract SEMINAR NASIONAL SAINSTEK 2017 Denpasar, Bali Ȃ 21 Oktober 2017

87

IDENTIFIKASI GEN ABCB1 PADA PASIEN ANAK DENGAN

LIMFOBLASTIK LEUKEMIA AKUT UNTUK DIAGNOSTIK

Inna Narayani1§, Rasmaya Niruri 2, Putu Desy Yustinadewi3

1

Program Studi Biologi FMIPA Universitas Udayana Email: narayani@unud.ac.id

2

Program Studi Farmasi FMIPA Universitas Udayana Email: rasmaya@yahoo.com

3

Program Studi Farmasi FMIPA Universitas Udayana Email: desy.yustinadewi@yahoo.com

§

Penulis Korespondensi

EXTENDED ABSTRACT

Leukemia limfoblastik akut adalah kasus kanker anak yang sering terjadi di Indonesia, termasuk di Bali. Kemoterapi hingga saat ini masih menjadi pengobatan kuratif utama pada penderita LLA. Salah satu mekanisme resistensi obat yang menyebabkan kegagalan kemoterapi adalah terjadinya penurunan akumulasi obat di dalam sel kanker akibat dari pompa efluks yang difasilitasi oleh transporter adenosine triphospate binding cassette subfamily 1 (ABCB1) [1] . Salah satu Single

Nucleotide Polymorphism (SNP) yang diketahui memiliki pengaruh terhadap respon obat kemoterapi

adalah SNP G1199A, dimana pada penelitian ditemukan adanya efluks dari vincristine dapat menyebabkan resiko kekambuhan pada pasien dengan varian 1199GA lebih tinggi dibandingkan pasien dengan variant 1199GG [2]. Tujuan penelitian ini adalah untuk identifikasi varian yang terdapat pada titik 1199 gen ABCB1 pasien anak dengan leukemia limfoblastik akut dan digunakan sebagai diagnostik dalam menentukan regimen terapi untuk meningkatkan luaran terapi yang diberikan. Penelitian ini diawali dengan melakukan identifikasi terhadap varian 1199 gen ABCB1 dengan mengamplifikasi varian 1199 dengan metode PCR menggunakan sepasang primer: F- ¶*$* 7***&$&$$$&&$*$7$¶GDQ5- ¶GTC ATC TCA CCA TCC CCT CT¶ [3]. Hasil PCR

menunjukkan adanya produk berukuran sekitar 226 pb, kemudian disekuensing. Hasil analisis produk PCR dan uji homologi ke dalam database yang terdapat dalam NCBI (National Center for Biotechnology Information) menunjukkan hasil sampel memiliki varian 1199GG. Dari 18 sampel anak penderita LLA di Bali sementara ini belum ditemukan varian heterozigot.

Kata Kunci: Diagnostik, G1199A, Leukemia Limfoblastik Akut, SNP

DAFTAR PUSTAKA

[1] U Brinkman, and M. Eichelbaum. Polymorphisms in The ABC Drug Transporter Gene MDR-1.

The Pharmacogenomics Journal. Vol. 1. P. 59-64, 2001

[2] G. Dessilly, L. Elens, N. Panin, A. Capron, A. Decottignies, J.B. Demoulin, V. Haufroid. MDR-1 1199G.A Genetic Polymorphism (Rs2229109) Influences the Intracellular Accumulation of Tacrolimus in HEK293 and K562 Recombinant Cell Lines. Plos One. Vol. 9. Issue 3. 2014.

[3] H. Green, P. Söderkvist, P. Rosenberg, G. Horvath and C. Peterson. MDR-1 G1199A

Polymorphism and Ovarian Cancer Response to Paclitaxel. Sweden: Department of Medicine

HIBAH UNGGULAN PROGRAM STUDI

TIM :

Dra. Inna Narayani, M.Sc

NIDN:0023035905

Rasmaya Niruri, S.Si.M.Farm.Klin.Apt. NIDN: 0028057806

Putu Desy Yustinadewi

NIM: 1208505088

IDENTIFIKASI GEN ABCB1 PADA PASIEN ANAK

DENGAN LIMFOBLASTIK LEUKEMIA AKUT

LATAR BELAKANG

• Leukemia Limfoblastik Akut (LLA) merupakan jenis

kanker yang paling sering terjadi pada anak, di RSUP

Sanglah sebesar 58%

(Ariawati, 2017)

• Gen Multidrug resistance -1 (MDR-1), dikenal dengan

nama ABCB1, mempunyai peranan ketahanan terhadap

berbagai zat asing

(Brambila, 2013)

• Pada ras Asia, varian yang banyak ditemukan adalah

polimorfisme pada gen ABCB1 pada C1236T dan mulai

ditemukan juga G1199A

(Gregers, 2015)

LATAR BELAKANG

• Analisa haplotype ini dapat berperan dalam

mengidentifikasi variasi genetik

• Teknologi genetika ini bermanfaat dalam

penentuan adanya polimorfisme gen ABCB1

sebagai dasar untuk mendesain perangkat

diagnostik terapi pasien LLA

TUJUAN dan URGENSI

Tujuan:

Mengidentifikasi varian yang terdapat pada titik

1199 gen ABCB1 pada pasien anak dengan

leukemia limfoblastik akut

Urgensi Hasil dan Potensi :

Hasil analisa varian 1199 digunakan sebagai

indikator penting dalam pemeriksaan klinis

untuk menentukan respon obat.

MANFAAT

• Menghasilkan data dan masukan berupa varian

gen ABCB1 pada titik 1199 pada pasien anak

dengan LLA di Bali,sehingga dapat digunakan

sebagai indikator prognosis dan respon

terapetik obat.

•

Dapat digunakan sebagai diagnostik dalam

menentukan regimen terapi untuk

meningkatkan luaran.

METODE PENELITIAN

• Rancangan Penelitian

• Tempat dan Waktu Penelitian

• Subyek Penelitian

Rancangan penelitian

• Penelitian ini merupakan penelitian eksplorasi

laboratoris untuk mengidentifikasi:

Varian 1199 gen ABCB1 dan respon terapeti pada

pasien Leukemia Limfoblastik Akut di Bali.

• Penelitian ini dilakukan setelah mendapatkan

persetujuan /pernyataan Laik Etik dari Komite Etik

Penelitian Kesehatan Rumah Sakit Umum Pusat (RSUP)

Sanglah atas metode yang akan digunakan.

Tempat dan waktu penelitian

Penelitian dilakukan selama bulan

Februari – Juli

2017

di:

• Laboratorium Biomolekuler Fakultas Kedokteran

Universitas Udayana

Subyek penelitian

Subyek penelitian

ini adalah pasien anak dengan Leukema Limfositik Akut di

RSUP Sanglah, yang selanjutnya disebut kelompok LLA. Kriteria subyek yang

masuk dalam kelompok kasus adalah:

• Pasien anak penderita Leukemia Limfositik Akut di RSUP Sanglah Kota

Denpasar .

• Pasien berusia 0 hingga 18 tahun.

• Pasien secara sukarela berpartisipasi dalam penelitian ini dengan

menyatakan kesediannya melalui information for consent.

• Sampel dalam penelitian ini adalah seluruh pasien anak dengan Leukemia

Limfositik Akut di RSUP Sanglah yang memenuhi kriteria subyek tersebut

diatas.

Sebagai

kontrol

digunakan kelompok kontrol. Subyek dalam kelompok kontrol

dengan kriteria sebagai berikut:

• Anak yang tidak menderita penyakit kanker .

• Berusia 0 hingga 18 tahun.

• Pasien secara sukarela berpartisipasi dalam penelitian ini dengan

menyatakan kesediannya melalui information for consen

SKEMA ALUR PENELITIAN

Amplifikasi Varian 1199 Gen MDR-1 dengan metode PCR

Deteksi produk PCR dengan elektroforesis

Penarikan Kesimpulan

Analisis Data

Penentuan nukleotida dengan sekuensing

Sampel buffy coat

RANCANGAN PENELITIAN

NO

URAIAN

TAHUN - I

1

Masalah

a. Identifikasi varian 1199 gen ABCB1

b. Identifikasi Respon Terapetik Pada Pasien LLA

c. Identifikasi Hubungan Varian 1199 Gen ABCB1 dan

Respon Terapetik

d. Identifikasi Toksisitas Pada Pasien LLA dengan

varian 1199 gen ABCB1

e. Identifikasi Hubungan Varian 119 9 dengan angka

kejadian Toksisitas

RANCANGAN PENELITIAN

lanjt.

NO

URAIAN

TAHUN - I

2

Tahapan

a. Identifikasi Varian : Sekuensing

Yang

dilakukan

b. Identifikasi Respon Terapetik : Melihat capaian

Remisi, setelah kemoterapi fase induksi, melalui data

rekam medis

3

Analisa Data - Data hasil sekuensing, dilakukan analisis homologi

dengan data base pada www. ncbi. nlm.gov lalu

ROAD MAP

2014

2016

2017

2018

2019



Identif

ikasi

varian

C3435

T Gen

ABC

B1



Identif

ikasi

varian

1236

Gen

ABCB

1



Identifikasi

varian

1199

Gen ABCB1



Identifikasi

respon

terapetiknya



Identifikasi

angka kejadian

toksisitasnya



Evaluasi

Farmakokin

etika

Parameter

dari

Vincristine

Pada Pasien

LLA

dengan

Varian Gen

MDR-1



Penggunaan

P-gp

Inhibitor

Pada

Ekspresi

dan Fungsi

P-gp dari

Limfosit

Pasien LLA

Anak

dengan

Varian Gen

MDR-1

LUARAN

2014

2016

2017

2018

2019

Luaran :



Jurnal

Internasio

nal



SENAST

EK

Luaran :



Jurnal

Interna

sional



SENA

STEK

Luaran :



Jurnal

Nasional

Terakreditasi

/Internasional



Seminar

Nasional/

Internasional

Luaran :



Jurnal

Nasional

Terakredit

asi

/Internasi

onal



Seminar

Nasional/

Internasio

nal

Luaran :



Jurnal

Nasional

Terakredita

si

/Internasion

al



Seminar

Nasional/

Internasion

al

INDIKATOR CAPAIAN

2014

2016

2017

2018

2019

Indikator

Capaian



Diiden

tifikasi

Varian

3435

Gen

ABCB

1 pada

LLA

Anak

Indikator

Capaian



Diidentifik

asi Varian

1236 Gen

ABCB1

pada LLA

Anak

Indikator

Capaian



Diidentif

ikasi

Varian

1199

Gen

ABCB1

pada

LLA

Anak

Indikator

Capaian



Diketahui

parameter

Farmakokin

etika

Vincristin

Pada Pasien

LLA dengan

Varian

MDR-1 dan

Prognosisny

a

Indikator

Capaian



Diketahui

aktivitas P-gp

inhibitor pada

Fungsi

Limfosit Pada

Varian Gen

MDR-1 dan

Faktor -faktor

yg mempenga

ruhinya

HASIL

No.

Sumber

Panjang

Produk

Primer

Jumlah

nukleot

ida

(20-30)

% GC

(40%-60%)

Tm

(42

0

C-65

0

_C)

Ta

(3

0

C-5

0

_{C di}

bawah

Tm

1.

http://biotools.umassm

ed.edu/

bioapps/primer

3_www_results.cgi

225 bp

F : 5’- GAG TGG GCA CAA ACC AGA TAA-3’

R : 5’- ggc aat tca cag aca cag ga-3’

K : 3’- tc ctg tgt ctg tga att gcc -5’

F: 21

R: 20

F: 47%

R: 50%

60

0

_C

-66

0

_C

55

0

_C

-61

0

_C

2.

ABCB1 G1199A

Polymorphism and

Ovarian Cancer

Response to Paclitaxel

(Green, et. al., 2008)

329 bp

F : 5’- GAG TGG GCA CAA ACC AGA TA -3’

R : 5’- GTC ATC TCA CCA TCC CCT CT -3’

K : 3’- C AGT AGA GTG GTA GGG GAG A -5’

F: 20

R: 20

F: 50%

R: 55%

60

0

_C

-62

0

_C

55

0

_C

-57

0

_C

Hasil Pembuatan Primer

Keterangan:

Primer 1 dan 2 dipilih dengan Software Primer3. Analisa homologi primer dengan DNA genome

dilakukan melalui BLAST-NCBI untuk meghindari terjadinya cross homologi. Berdasarkan

hasil analisis primer ini cukup baik dapat digunakan dalam proses PCR.

HASIL

(lanj.)

Keterangan :

M: 100 bp Ladder

(15-b 1) berasal dari Primer 1

menghasilkan pita 225 bp. dan

(15-b 2) berasal dari Primer 2

menghasilkan pita 329 bp pada

sampel pasien dengan LLA anak

untuk menganalisis varian 1199

ABCB1

Hasil Pengujian Primer dengan PCR

329 bp

225 bp

300 bp

200 bp

100 bp

HASIL

(lanj.)

Keterangan:

-

Baris atas adalah data nukleotida dan baris bawah adalah grafik yang mewakili

nukleotida varian 1199 ABCB1 pada pasien LLA anak yang dianalisis menggunakan

program MEGA.

-

Panah menunjukkan posisi nukleotida C posisi 120 pada semua sampel

KESIMPULAN

• Hasil analisis produk PCR dan uji homologi ke dalam

database yang terdapat dalam NCBI (National Center

for Biotechnology Information) menunjukkan hasil

sampel memiliki varian 1199GG. Dari 16 sampel anak

penderita LLA di Bali sementara ini belum ditemukan

varian heterozigot.