ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (
Strobilanthes crispus
) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA
PATOGEN
SKRIPSI
AGUSTINA JATI PANGLIPUR 090805039
DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (
Strobilanthes crispus
) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA
PATOGEN
SKRIPSI
Diajukan untuk melengkapi tugas dan memenuhi syarat mencapai gelar Sarjana Sains
AGUSTINA JATI PANGLIPUR 090805039
DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
PERSETUJUAN
Judul : Isolasi dan Uji Ekstrak Metanol Bakteri Endofit
Keji Beling (Strobilanthes crispus) dalam
Menghambat Pertumbuhan Beberapa Mikroba Patogen
Kategori : Skripsi
Nama : Agustina Jati Panglipur
Nomor Induk Mahasiswa : 090805039
Program Studi : Sarjana (S1) Biologi
Departemen : Biologi
Fakultas : Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Universitas Sumatera Utara
Disetujui di
Medan, April 2014
Komisi Pembimbing :
Pembimbing 2,
Dr. It Jamilah, M. Sc NIP: 196310121991032003
Pembimbing 1,
Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc NIP: 196404091994031003
Disetujui oleh
Departemen Biologi FMIPA USU Ketua,
PERNYATAAN
ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI ENDOFIT KEJI BELING (Strobilanthes crispus) DALAM MENGHAMBAT
PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA PATOGEN
SKRIPSI
Saya mengakui bahwa skripsi ini adalah hasil karya sendiri. Kecuali beberapa kutipan dan ringkasan yang masing-masing disebutkan sumbernya.
Medan, April 2014
PENGHARGAAN
Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Tuhan Yang Maha Kuasa yang telah memberikan kasihNya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan judul Isolasi dan Uji Ekstrak Metanol Bakteri Endofit Keji Beling (Strobilanthes crispus) dalam Menghambat Pertumbuhan Beberapa Mikroba Patogen.
Pada kesempatan ini penulis mengucapkan terimakasih kepada Bapak Prof. Dr. Dwi Suryanto, M. Sc selaku Dosen Pembimbing I dan Ibu Dr. It Jamilah, M.Sc selaku Dosen Pembimbing II yang telah memberikan nasehat dan bimbingan kepada penulis dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Ibu Dr. Nunuk Priyani, M. Sc selaku Dosen Penguji I dan Bapak Riyanto Sinaga, S. Si, M. Si selaku Dosen Penguji II yang telah memberikan kritik dan saran yang membangun dalam penyusunan skripsi ini. Terimakasih kepada Ibu Dr. Nursahara Pasaribu, M. Sc selaku Ketua Departemen Biologi FMIPA USU, Bapak Dr. Sutarman, M. Sc selaku Dekan FMIPA USU, Ibu Dr. Marpongahtun, M. Sc selaku Pembantu Dekan I, Bapak Drs. Nursal, M.Sc selaku Pembantu Dekan II dan Bapak Drs. Kerista Sebayang, M. Si selaku Pembantu Dekan III, Bapak dan Ibu Dosen Biologi FMIPA USU, kepada Bang Erwin dan Ibu Roslina Ginting serta seluruh staf pegawai FMIPA USU, terimakasih saya ucapkan atas semua bantuannya.
Terimakasih tak terhingga kepada orangtuaku tercinta, Bapak Christophorus Bangun Topo (alm) dan Ibu Yuliana Sumariyam yang senantiasa berkorban, mencintai dan berdoa untukku, juga kepada adik-adikku tersayang, Yohana Retno Puspo Giwang dan Cicilia Dewi Melati Sari yang memberikan dukungan penuh. Terimakasih juga kepada masku Andreas Urip Waluyo yang telah memberikan dukungan dan doanya kepadaku. Tak lupa juga kepada Tante Tetty dan Opung serta rekan-rekan di opung camp yang selalu menghibur dan berbagi cerita.
Kepada seluruh sahabatku Febrin, Jesica, Silvia, Grace, Ledi, Febri, Yenni, Bertua, Uba, Itok Raymond, Edag Fivin dan seluruh stambuk 2009. Kepada adikku Doris dan seluruh stambuk 2010, 2011 dan 2012. Kepada Kak Yanti, Kak Netty, Kak Nikmah, Kak Widya, dan Kak Rahmi yang telah membantu selama penelitian. Terimakasih juga kepada rekan-rekan Persekutuan Keluarga Besar Kristen Biologi (PKBKB), Biologi Pecinta Alam dan Studi Lingkungan Hidup (BIOPALAS) dan Keluarga Mahasiswa Katolik (KMK) St. Aloysius Gonzaga serta semua pihak yang telah memberikan ilmu, pengalaman dan membantu penulis yang tidak dapat disebutkan satu persatu.
ISOLASI DAN UJI EKSTRAK METANOL BAKTERI
ENDOFIT KEJI BELING (
Strobilanthes crispus
) DALAM
MENGHAMBAT PERTUMBUHAN BEBERAPA MIKROBA
PATOGEN
ABSTRAK
Penelitian mengenai isolasi dan uji ekstrak metanol bakteri endofit keji beling (Strobilanthes crispus) dalam menghambat pertumbuhan mikroba Salmonella typhii, Streptococcus mutans, Escherichia coli dan Aspergillus flavus telah dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat bakteri endofit penghasil senyawa antimikroba. Terdapat 12 isolat bakteri endofit yang diisolasi dari keji beling. Dua isolat yaitu AJ5 dan AJ7 dipilih untuk diekstrak dengan metanol berdasarkan kemampuannya dalam menghambat pertumbuhan mikroba patogen. Kemampuan ekstrak dalam menghambat pertumbuhan mikroba patogen dibuat dalam konsentrasi 40%, 60%, 80% dan 100%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa zona hambat tertinggi terhadap Salmonella typhii ditunjukkan oleh ekstrak AJ7 pada konsentrasi 60% dengan besar 14 mm, terhadap Streptococcus mutans
ditunjukkan oleh ekstrak AJ7 pada konsentrasi 40% dengan zona hambat 8,4 mm, sedangkan ekstrak AJ5 pada konsentrasi 40% dan 60% menghambat Escherichia coli sebesar 10 mm. Penghambatan terhadap jamur Aspergillus flavus ditunjukkan oleh ekstrak AJ7 pada konsentrasi 100% sebesar 6,6 mm.
ISOLATION AND EXAMINATION METHANOL EXTRACT
OF ENDOPHYTIC BACTERIA FROM KEJI BELING
(
Strobilanthes crispus
) IN INHIBIT SEVERAL PATHOGENIC
MICROBE GROWTH
ABSTRACT
A study on isolation and examination methanol extract of endophytic bacteria from keji beling (Strobilanthes crispus) in inhibiting Salmonella typhii, Streptococcus mutans, Escherichia coli and Aspergillus flavus microbe growth was conducted. The objective of the study was to isolate endophytic bacteria producing antimicrobial compounds. There were 12 isolates of endophytic bacteria isolated
from “keji beling”. Two isolates, AJ5 and AJ7 were chosen to be extracted with methanol based on their ability to inhibit the pathogen growth. The ability of the extract to inhibit the gowth of the pathogens were conducted at concentration of 40%, 60%, 80%, and 100%. The results showed that higher inhibition zone against
Salmonella typhii was shown by the extract of AJ7 at concentration of 60% by 14 mm, Streptococcus mutans was shown by extract of AJ7 at concentration of 40% with inhibition zone of 8.4 mm, respectively, while extract of AJ5 with concentration of 40% and 60% inhibited Escherichia coli by 10 mm. Inhibition of fungi Aspergillus flavus was shown by the extract of AJ7 at concentration of 100% by 6.6 mm.
Keywords: antimicrobial activity, endophytic bacteria, methanol extract,
DAFTAR ISI
1.2. Permasalahan 2
1.3. Tujuan Penelitian 3
1.4. Hipotesis 3
1.5. Manfaat 3
BAB 2. Tinjauan Pustaka
2.1. Keji Beling (Strobilanthes crispus) 4
2.2. Bakteri Endofit 5
BAB 3. Bahan Dan Metoda
3.1. Waktu dan Tempat 11
3.2. Alat dan Bahan
3.3. Isolasi Bakteri Endofit dari Akar dan Batang Keji Beling 3.4. Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit
3.5. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Jamur Patogen 11 12 12 12 3.6. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Bakteri Patogen 3.7. Ekstraksi Bakteri Endofit
3.8. Pengamatan hifa abnormal jamur patogen
3.9. Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
BAB 4. Hasil Dan Pembahasan
4.1. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Endofit dari Tanaman Keji Beling
16
4.2. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Pertumbuhan Mikroba Patogen
4.3. Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
4.4. Pengamatan Hifa Abnormal
18
20
24
BAB 5. Kesimpulan Dan Saran
5.1. Kesimpulan 25
5.2. Saran 25
Daftar Pustaka Lampiran
DAFTAR TABEL
Nomor Tabel Judul Halaman
4.1. Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit 17 4.2. Hasil Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit
terhadap Pertumbuhan Mikroba Patogen
18
4.3. Hasil Uji Aktivitas Ekstrak Metanol Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
DAFTAR GAMBAR
Nomor Gambar
Judul Halaman
2.1. Keji Beling (Strobilanthes crispus) 4
2.2. Koloni jamur A. flavus & Konidia A. flavus
pada pembesaran
100x10
9
3.1. Metode pengukuran zona hambat bakteri
endofit terhadap koloni jamur patogen
13
4.1. Uji daya hambat isolat bakteri endofit terhadap bakteri pathogen
20
4.2. Uji daya hambat isolat bakteri endofit terhadap jamur patogen
20
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Lampiran
Judul Halaman
1. Isolasi Bakteri Endofit dari Akar dan Batang Keji Beling
30
2. Karakterisasi Isolat Bakteri Endofit 31
3. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Jamur Patogen
32
4. Uji Daya Hambat Isolat Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
33
5. Ekstraksi Bakteri Endofit 33
6. Pengamatan hifa abnormal jamur patogen 34
7. Uji Aktivitas Antimikroba Ekstrak Metanol
Bakteri Endofit terhadap Mikroba Patogen
34