IDENTIFIKASI GENETIK KETURUNAN SOROH PANDE DI KECAMATAN SERIRIT, BULELENG BERDASARKAN DNA MIKROSATELIT KROMOSOM Y.

(1)

IDENTIFIKASI GENETIK KETURUNAN

SOROH

_{PANDE DI}

KECAMATAN SERIRIT, BULELENG BERDASARKAN DNA

MIKROSATELIT KROMOSOM Y

Sebagai Tugas Akhir untuk Memenuhi Syarat Mencapai Derajat Sarjana S-1

Program studi Biologi FMIPA Universitas Udayana

Oleh :

I Wayan Arya Mahardika 1208305006

PROGRAM STUDI BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS UDAYANA

(2)

(3)

iv Abstrak

Soroh Pande merupakan salah satu dari soroh/klan di dalam masyarakat Bali

yang tersebar di seluruh pulau Bali termasuk di Kecamatan Seririt, Kabupaten

Buleleng. Penelitian soroh Pande ini bertujuan untuk mengetahui variasi ragam alel

yang ada pada masyarakat Pande di Seririt dan luar Seririt menggunakan analisis DNA

mikrosatelit kromosom Y diantaranya DYS19, DYS390, DYS393, DYS 395.

Penelitian ini juga untuk menambah genetic data base DNA masyarakat Bali guna

kepentingan penelusuran forensik ke depannya. Dalam penelitian ini didapatkan 21

variasi ragam alel dan 25 haplotipe dengan nilai heterozigositas tertinggi pada lokus

DYS19 sebesar 0,75 ± 0,03 dengan rata-rata keempat lokus sebesar 0,72 ± 0,03.

Kekerabatan yang diperoleh antar masyarakar soroh Pande di Kecamatan Seririt tidak

mengelompok berdasarkan hubungan dadianya.

(4)

v Abstract

Clan Pande is one of the Balinese clans which spread in Bali, including in Seririt

District, Buleleng Regency. The research of Pande clan is purposed to find out the

varieties of allelic diversity which occurred on Pande community in Seririt and outside

Seririt using microsatellite DNA analysis of the Y chromosome, among others DYS19,

DYS390, DYS393, DYS395. This study is also to increase Balinese DNA genetic data

base for the future forensic search. In this study, there are found 21 varieties of allelic

diversity and 25 haplotypes with the highest value of heterozygosity is on DYS19 locus

in the amount of 0.75 ± 0.03 with the average of four loci that is 0.72 ± 0.03. The

kinship obtained among Pande clan communities in the District of Seririt is not

classified by relationship of the clan.

(5)

vi

1.1.Latar Belakang ... 1

1.2. Rumusan Masalah ... 3

1.3. Tujuan ... 3

1.4. Manfaat ... 4

II. TINJAUAN PUSTAKA ... 5

2.1.Deoxyribonuleic Acid (DNA) ... 5

2.2.DNA Mikrosatelit ... 6

2.3.Soroh Pande ... 7

2.4.Ekstraksi DNA ... 9

2.5.Polymerase Chain Reaction (PCR) ... 10

2.6.Elektroforesis ... 11

III. METODE PENELITIAN ... 13

3.1. Metode Pengumpulan Data ... 13

3.1.1. Tempat dan waktu penelitian ... 13

3.1.2. Variabel Penelitian ... 13

3.1.3. Teknik pengambilan sampel ... 13

3.1.4. Tahapan analisis DNA ... 14

(6)

vii

3.2.1. Jenis data ... 17

3.2.2. Analisis data ... 17

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ... 19

4.1. Hasil ... 19

4.2. Pembahasan ... 27

V. KESIMPULAN DAN SARAN ... 37

5.1. Kesimpulan ... 37

5.2. Saran ... 37

DAFTAR PUSTAKA ... 38

Lampiran I ... 45

Lampiran II ... 47

(7)

viii DAFTAR GAMBAR

Gambar 1. Struktur DNA Watson dan Crick (1953) ... 6

Gambar 2. Prapen ... 9

Gambar 3. Prapen Keseluruhan ... 9

Gambar 4. Prapen di Merajan Desa Kalisada ... 9

Gambar 5. Prapen Dusun Yehanakan ... 9

Gambar 6. Hasil elektroforesis pada Page 10% DYS390 dan DYS395 (1), DYS19 dan DYS393 (2) ... 22

Gambar 7. Hasil re-PCR elektroforesis page10% pada lokus DYS19, DYS390, DYS393 (Pd 2 dan Pd 11) ... 22

Gambar 8. Dendrogram 15 sampel hubungan kekerabatan masyarakat soroh Pande di Kecamatan Seririt dengan metode UPGMA ... 24

Gambar 9. Dendrogram 10 sampel hubungan kekerabatan masyarakat soroh Pande di luar Kecamatan seririt dengan metode UPGMA ... 24

(8)

ix DAFTAR TABEL

Tabel 1. Primer yang digunakan dalam analisis mikrosatelit ... 15

Tabel 2. Data probandus ... 19

Tabel 3. Identitas genetik semua sampel yang teramplifikasi dan tidak

teramplifikasipada lokus DYS19, DYS390, DYS393, dan DYS395 di Seririt

dan luar Seririt ... 20

Tabel 4. Data frekuensi dan sebaran alel kromosom Y pada soroh Pande di Seririt

dan luar Seririt ... 21

Tabel 5. Data gabungan frekuensi dan sebaran alel kromosom Y pada soroh Pande

Seririt dan luar Seririt. ... 23

Tabel 6. Nilai Keragaman Genetik pada masyarakat soroh Pande di Kecamatan

Seririt dan luar Seririt, Kabupaten Buleleng ... 26

Tabel 7. Haplotipe dari kombinasi alel dan frekuensi pada masing-masing lokus

(9)

x DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran I Dokumentasi penelitian ... 45

Lampiran II Form Biodata Probandus ... 47