DETEKSI IgM TERHADAP ANTIGEN
LIPOPOLISAKARIDA (LPS) O9 KUMAN
SALMONELLA TYPHI
PADA DEMAM TIFOID
TESIS
OLEH:
dr. YETTI FERULINA AKBAR
117041177/PK
PROGRAM MAGISTER KEDOKTERAN KLINIK–SPESIALIS
PATOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS
SUMATERA UTARA
RSUP HAJI ADAM MALIK MEDAN
DETEKSI IgM TERHADAP ANTIGEN LIPOPOLISAKARIDA
(LPS) O9 KUMAN
SALMONELLA TYPHI
PADA DEMAM
TIFOID
TESIS
Untuk Gemperoleh Gelar Magister Kedokteran Klinik di Bidang Ilmu
Patologi Klinik / M.Ked (Clin.Path) pada Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara
YETTI FERULINA AKBAR
117041177/PK
PROGRAM MAGISTER KEDOKTERAN KLINIK–SPESIALIS PATOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS
SUMATERA UTARA
RSUP H. ADAM MALIK MEDAN
Judul Tesis : Deteksi IgM Terhadap Antigen
Lipopolisakarida (lps) O9 Kuman
Salmonella Typhi Pada Demam Tifoid
Nama Mahasiswa : Yetti Ferulina Akbar
Nomor Induk Mahasiswa : 117041177
Program Magister : Magister Kedokteran Klinik
Konsentrasi : Patologi Klinik
Menyetujui
Komisi Pembimbing
Pembimbing I
dr. Ricke Loesnihari, MKed (Clin.Path), Sp.PK-K
Pembimbing II
dr. Tambar Kembaren Sp.PD, KPTI
Disahkan oleh :
Ketua Departemen Patologi Klinik Ketua Program Studi Departemen FK-USU/RSUP H. Adam Malik Patologi Klinik FK-USU/
Medan RSUP H. Adam Malik Medan
Prof. dr. Adi Koesoema Aman, Sp.PK-KH
NIP. 19491011 1979 01 1 001 NIP. 1948711 1979 03 2 001
Prof.DR.dr.Ratna Akbari Gani, Sp.PK-KH
Telah diuji pada
Tanggal : 5 Agustus 2015
PANITIA PENGUJI TESIS
Ketua : Prof. dr. Adi Koesoema Aman, Sp.PK-KH ...
Anggota : 1. Prof. DR. dr. Ratna Akbari Ganie, Sp.PK-KH ...
2. Prof. dr.Herman Hariman, Ph.D, Sp.PK-KH ...
3. Prof.dr.Burhanuddin Nasution, SpPK-KN,KGEH .……….
4. dr. Ricke Loesnihari, MKed (Clin.Path), Sp.PK-K ...
5. dr. Tambar Kembaren Sp.PD, KPTI .……….
KATA PENGANTAR
Assalamualaikum Wr. Wb.
Alhamdulillah segala puji dan syukur kehadirat Allah SWT yang
telah melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya serta atas ridha-Nya
sehingga penulis dapat mengikuti Program Pendidikan Dokter Spesialis
Patologi Klinik Fakultas Kedokteran Sumatera Utara dan menyelesaikan
penulisan tesis yang berjudul. Deteksi IgM Terhadap Antigen
Lipopolisakarida (lps) O9 Kuman Salmonella typhi Pada Demam
Tifoid. Tesis ini disusun untuk memenuhi persyaratan dan merupakan
tugas akhir pendidikan Magister Kedokteran Klinik di Bidang Ilmu Patologi
Klinik pada Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara.
Selama penulis mengikuti pendidikan dan proses penyelesaian
penelitian untuk karya tulis ini, penulis telah banyak mendapat bimbingan,
petunjuk, bantuan dan pengarahan serta dorongan baik moril dan materil
dari berbagai pihak sehingga penulis dapat menyelesaikan pendidikan
dan karya tulis ini
Penulis menyadari penelitian dan penulisan tesis ini masih jauh dari
kesempurnaan sebagaimana yang diharapkan. Oleh sebab itu dengan
segala kerendahan hati, penulis mengharapkan masukan yang berharga
dari semua pihak untuk perbaikan di masa yang akan datang.
Pada kesempatan ini, perkenankanlah penulis menyampaikan
penghargaan dan ucapan terima kasih yang sebesar – besarnya kepada :
1. Yth, Prof. dr. Adi Koesoema Aman, SpPK-KH sebagai Ketua
Departemen Patologi Klinik yang telah memberikan kesempatan
kepada saya menjadi peserta Program Pendidikan Magister dan
Pendidikan Dokter Spesialis Patologi Klinik. Beliau telah banyak
memberikan bimbingan, petunjuk, dan pengarahan kepada saya
ii
ini sampai selesai, hanya doa yang dapat saya sampaikan semoga
Allah SWT memberikan kesehatan dan membalas segaka kebaikan
beliau dengan pahala yang berlipat ganda, Amiin.
2. Yth, Prof. DR. dr. Ratna Akbari Ganie, SpPK-KH sebagai Ketua
Program Studi Departemen Patologi Klinik Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara yang telah memberikan kesempatan
kepada saya sebagai peserta Program Pendidikan Magister dan
Pendidikan Dokter Spesialis Patologi Klinik serta beliau juga telah
banyak membimbing, mengarahkan dan memotivasi saya sejak awal
sampai selesai pendidikan .
3. Yth, Prof. dr. Herman Hariman, PhD, SpPK-KH selaku Sekretaris
Departemen Patologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera
Utara yang telah banyak memberikan bimbingan, pengarahan dan
masukan kepada saya selama pendidikan sampai penyelesaian
penulisan tesis ini.
4. Yth, dr. Ricke Loesnihari, Mked (Clin-Path), SpPK-K, selaku
Sekretaris Program Studi Departemen Patologi Klinik Fakultas
Kedokteran Universitas Sumatera Utara dan sebagai pembimbing I
saya yang telah bersusah payah dengan setiap saat bersedia
meluangkan waktu dan pikirannya dalam memberikan bimbingan,
petunjuk, pengarahan, dan motivasi kepada saya selama menempuh
pendidikan terutama selama penelitian. selama proses penyusunan
sampai selesainya tesis ini, semoga Allah SWT menerima segala
kebaikan beliau. .
5. Yth, dr. Tambar Kembaren Sp.PD, KPTI sebagai pembimbing II
saya dari Departemen Ilmu Penyakit Dalam FK-USU/RSUP H. Adam
Malik Medan, yang sudah banyak memberikan bimbingan, petunjuk,
pengarahan dan bantuan mulai dari penyusunan proposal, selama
dilaksanakan penelitian sampai selesainya tesis ini.
6. Yth, Prof. dr. Burhanuddin Nasution, SpPK-KN, KGEH,, yang telah
berbagi pengalaman selama pendidikan dan penyelesaian penulisan
tesis ini.
7. Yth, dr. Zulfikar Lubis, SpPK-K, dr. Muzahar, DMM, SpPK-K, dr. Tapisari Tambunan, SpPK-KH, dr. Ozar Sanuddin SpPK-K, dan dr
Nelly Elfrida S, SpPK, dr. Ida Adhayanti, SpPK, semuanya
guru-guru saya yang telah banyak memberikan petunjuk, pengarahan
selama saya mengikuti pendidikan Spesialis Patologi Klinik.
8. Yth, Drs. Abdul Jalil Amri A M.Kes ,yang telah banyak memberikan
bimbingan, arahan terutama di bidang statistik selama penelitian
sampai selesainya tesis ini..
9. Seluruh teman-teman sejawat saya, terutama peserta Program Pendidikan Dokter Spesialis Patologi Klinik Fakultas Kedokteran
Universitas Sumatera Utara. Khususnya kepada para sahabat dr. Enny marziah, dr. Tissy Liskawini Putri, dr. Lentini Win Maretti Sihaloho, dr. Rini Rahmayani, dr. Fitri Handa Yani, dr. Hilda Sungkar, dr. Desi Arisanti, dr. Wingsar Simarmata, dr. Betty Maria
Limbong, terima kasih atas dukungan kalian semua untuk
kebersamaan, pengertian, kisah serta masa-masa indah yang pernah
kita jalani bersama sebagai teman seangkatan.
10. Para analis di Instalasi Patologi Klinik RSUP H.Adam Malik, terutama
Kak Indart, Kak Siti, Kak Ellis, Kak Masri, Mbak Asih, Mbak Ustati,
Junita dan Nancy atas bantuan dan kerjasamanya selama
pendidikan dan juga kepada Yoyok dan Evi yang banyak membantu dalam urusan administrasi dibagian Patologi Klinik.
11. Para pegawai, serta semua pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu
persatu, atas bantuan dan kerja sama yang diberikan kepada saya,
selama pendidikan dan sampai selesainya tesis ini.
12. Dekan Fakultas Kedokteran Universitas Sumatera Utara, Rektor
Universitas Sumatera Utara dan Direktur Rumah Sakit Umum
Pusat H. Adam Malik yang telah memberikan kesempatan dan
iv
Patologi Klinik dan memberikan kemudahan dalam menggunakan
fasilitas dan sarana Rumah Sakit dalam menunjang pendidikan
keahlian.
13. Ayahanda Drs.H. Ali Akbar, MM dan ibunda Hj. Roslina
Perangin-angin yang telah membesarkan, mendidik serta memberikan dorongan
moril dan materil serta cintanya kepada ananda selama ini. Tanpa
beliau berdua mungkin ananda tidak dapat menjadi seperti ini. Tidak
ada satu kata pun yang dapat mewakili perasaan ananda atas cinta
dan kasih sayang kalian berdua. Semoga kalian berdua selalu dalam
lindungan Allah SWT. Selain itu terima kasih juga saya ucapkan untuk
mertua saya Drs.H. Zainal Abidin Desky dan Hj. Murniati Hasibuan
terima kasih atas dukungan, doa, bantuan moril dan materil selama
saya menjalani pendidikan.
14. Suami saya tercinta Muhammad Zepri Desky SP, M.Agr yang telah mendampingi saya dengan penuh pengertian, perhatian, kesetiaan,
kesabaran, memberikan motivasi dan pengorbanan selama mengikuti
pendidikan hingga saya dapat menyelesaikan pendidikan ini, demikian
juga buat buah hati dan anak anakku tercinta Muhammad Kanz
Alfarizky Desky yang memberi semangat dan motivasi kepada mami
untuk menyelesaikan pendidikan.
15. Kakanda saya, dr. Novita Linda Akbar, dan adik saya Akita
Rukmana Akbar S.ked dan Kakak-kakak ipar saya Ramadhan
Selian SE, MM, Zeni safitri Desky, Rustam Effendi SP, M.Pd, M.Si
Murida wati Desky dan Adi Saptono adik ipar saya Zaina purwanti
desky SP, Rahmadin Syahputra Desky SP, M.Si dan Putri Desrianti
Desky Amd yang telah memberikan dorongan dan doa kepada saya
selama masa pendidikan.
Sebagai manusia, saya menyadari akan keterbatasan dan
kekurangan serta tidak terlepas dari tutur kata dan tingkah laku yang
kurang berkenan di hati, maka pada kesempatan ini saya mohon maaf
Akhir kata semoga kiranya tesis ini dapat bermanfaat bagi kita
semua. Dan semoga Allah SWT memberkati kita semua. Amin Ya Rabbal
Allamin.
Medan, Agustus 2015
Penulis,
vi
DAFTAR ISI
Lembar pengesahan tesis
Lembar penetapan panitia penguji
Ucapan terimakasih………. i
Daftar isi... vi
BAB I. PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang………... 1
1.2. Rumusan Masalah………. 4
1.3. Hipotesa Penelitian……… 4
1.4. Tujuan Penelitian………... 4
1.4.1. Tujuan Umum………. 4
1.4.2. Tujuan Khusus………... 5
1.5. Manfaat Penelitian………... 5
BAB II.TINJAUAN PUSTAKA 2.1. Definisi………. 6
2.2 Etiologi………. 6
2.3.Epidemiologi……… 7
2.4. Patofisiologi……….. 7
2.4.1. Aspek Imunologi……… 9
2.6. Pemeriksaan Laboratotium……… 14
2.6.1. Pemeriksaan Darah Tepi……….. 14
2.6.2. Identifikasi Kuman Melalui Isolasi/biakan………….. 15
2.6.3. Identifikasi Kuman Melalui Uji Serologi……….. 18
2.6.3.1. Uji Widal………18
2.6.3.2. Tes Tubex TF………. 20
2.6.3.3. Metode Enzyme Immunoassay (EAI) Dot…22 2.6.3.4. Metode Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA)... 23
2.6.3.5. Pemeriksaan Dipstik... 25
3.6.4. Identifikasi Kuman Secara Molekuler... 26
2.7. Komplikasi………. 27
2.7.1.Komplikasi Intestinal……….. 27
2.7.1.1. Perdarahan Usus……… 27
2.7.1.2. Perforasi Usus………. 27
2.7.2. Komplikasi Ekstraintestinal……….. 28
2.7.2.1. HepatitisTifosa……… 28
2.7.2.2. Miokarditis……… 28
2.7.2.3. Neuropsikiatri……….. 28
2.8. Sumber Penularan (Reservoir)……….. 29
viii
2.9.1.Pencegahan Primer……… 30
2.9.2. Pencegahan Sekunder………. 30
2.9.3. Pencegahan Tersier……….. 30
2.10 Kerangka Konsep……… 32
BAB III METODE PENELITIAN 3.1. Rancangan Penelitian……….. 33
3.2. Lokasi Dan Waktu Penelitian……….. 33
3.3. Populasi Dan Sampel Penelitian……… 33
3.3.1. Populasi……….. 33
3.3.2. Sampel Penelitian………. 34
3.4. Perkiraan Besar Sampel………. 34
3.5. Variabel Penelitian……… 35
3.5.1. Definisi Operasional Variable……… 35
3.6. Bahan dan Cara Kerja………. 36
3.6.1. Bahan………. 36
3.6.2. Pengambilan dan Pengolahan Sampel………. 36
2.6.2.1. Prosedur Pemeriksaan Ig M anti Salmonella metodeTubex TF……….. 36
2.6.2.2.Kultur Darah……….. 39
2.6.2.3.Pewarnaan Gram………. 41
2.6.2.4. Tehnik Identifikasi Bakteri………. 42
3.7. Pemantapan Kualitas………... 44
3.7.2. Pemantapan Kualitas Media Kultur………. 45
3.7.3. Pemantapan Kualitas Untuk Identifikasi Kuman… 46 3.7.4. Pemantapkan Kualitas Bactec………... 46
3.8. Ethical Clearance dan Informed Consent……… 46
3.9. Batasan dan Defenisi Operasional……….. 46
3.10. Rencana Pengolahan dan Analisis Data………. 47
3.11. Kerangka Kerja……… 47
BAB IV. HASIL……….. 48
BAB V. PEMBAHASAN……….. 53
Biakan Salmonella typhi……….. 55
Uji Tubex TF……….. 56
BAB VI. KESIMPULAN DAN SARAN……… 58
x
DAFTAR SINGKATAN
ADH : Arginine dihydrolase
API : Analytical profile index
CIT : Citrate (Simmons)
EKG : Elektokardiografi
GEl : Gela in liquefaction
H2S : Hidrogen Sulfur
LDH : Lysine decarboxylase
NPP : Nilai Prediksi Positif
NPN : Nilai Prediksi Negatif
ODC : Ornithine decarboxylase
PCR : Polymerase chain reaction
URE : Urease
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1. Sensitifitas Tubex TF vs Profil Respon Antibody Salmonella
typhi Periode Fase Demam……….. 11
Gambar 2. Mekanisme Reaksi Negatif dan Mekanisme Reaksi Positif
pada Pemeriksaan Tubex TF... 21
Gambar 3. Prinsip Pemeriksaan Tubex TF……… 37
xii
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Skala Penilaian Klinis Demam Tifoid Menurut Nelwan RHH…. 13
Table 2. Interpretasi Hasil Tubex TF……… 38
Tabel 3. Bahan Pembuatan Media Salmonella Shigella Agar…………. 40
Tabel 4.1. Karakteristik Subjek Penelitian Berdasarkan Jenis Kelamin dan
Umur………. 48
Table 4.2. Gambaran Klinis Pasien Dengan Kecurigaan Demam Tifoid.. 49
Tabel 4.3. Hubungan Antara Lamanya Demam Dengan Kultur Darah
Salmonella typhi Pada Pasien Dengan Kecurigaan Demam Tifoi……… 50
Tabel 4.4. Hubungan Antara Lamanya Demam Dengan Tubex TF Pada
Pasien Dengan Demam Tifoid……… 51
Table 4.5. Hubungan Antara Tubex TF Dengan Kultur sarah Salmonella
typhi Pada Pasien Dengan Demam Tifoid……….. 51
Tabel 4.6. Nilai Sensitivitas, Spesifisitas, Nilai Prediksis Positif dan Nilai
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1………. xvi
Lampiran 2 Lembaran Penjelasan Kepada Calon Subjek Penelitian….. xvii
Lampiran 3 Formulir Persetujuan Setelah Penjelasan…………... xix
Lampiran 4 Status Pasien……….. xxii
Lampiran 5 Persetujuan Komite Etik ………. xxv
Lampiran 6……….. xxvi
