ABSTRAK
Indra Syahputra, Validasi Keturunan Kelapa Sawit Material Genetik PT. Socfindo Berdasarkan Marka SSR (Simple Sequence Repeats). Dibimbing oleh Dr. Ir. Lollie Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Tanaman kelapa sawit merupakan tanaman penghasil devisa terbesar bagi Indonesia, oleh sebab itu perakitan varietas unggul terus dilakukan. Validasi dengan teknik molekuler dapat membantu proses identifikasi keurunan kelapa sawit dengan hasil yang lebih cepat dan akurat dibandingkan dengan cara konvensional. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis kandidat primer yang dapat memvalidasi turunan kelapa sawit, kemurnian genetik dan tingkat keragaman molekuler tanaman kelapa sawit material genetik PT. Socfindo berdasarkan marka SSR. Bahan yang digunakan pada penelitian adalah 5 turunan kelapa sawit material generik PT. Socfindo. Primer yang digunakan pada penelitian ini antara lain mCnCIR0038, mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663. Analisis data dilakukan dengan menggunakan Softwere Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 dan DARwin 6.0. Kesimpulan penelitian ini menunjukkan bahwa primer mCnCIR0038, primer mEgCIR3785, primer mEgCIR3663 dan primer mEgCIR0257 telah berhasil memvalidasi turunan kelapa sawit material genetik PT. Socfindo, kemurnian genetik berdasarkan empat marka SSR mencapai 95 % sampai dengan 100% dan tingkat keragaman molekuler berdasarkan empat marka SSR sebesar 41.68%.
Kata kunci : Kelapa sawit, SSR, validasi, kemurnian genetik, keragaman molekuler
ABSTRACT
Indra Syahputra, Validation of Oil Palm Progeny from Genetic Material of PT. Socfindo Based on SSR Marker (Simple Sequence Repeats) supervised by Dr. Ir. Lollie Agustina P.Putri, M.Si. dan Mohammad Basyuni, S.Hut., M.Si., Ph.D.
Oil palm is the plant's largest foreign exchange earner for Indonesia, therefore the assembly of high-yielding progeny has been continuously done. Validation results with molecular techniques to assist in the identification of oil palm progeny more quickly and accurately than the conventional way. The purpose of this study was to analyze the primer candidate to validate oil palm progeny, genetic purity and genetic diversity at the molecular level from the genetic material of PT. Socfindo based on SSR marker. There were 5 palm genetic materials and 4 primers (mCnCIR0038, mEgCIR0894, mEgCIR3292 dan mEgCIR3663) were used in this research. Gen Alex 3.0, Power Marker 3.25 and DARwin 6.0 were used to analyze data in this research has successfully validated the genetic material of oil palm progeny from the fgenetic material of PT. Socfindo,where genetic purity of SSR markers was achieved 95% to 100% and molecular variance based on four SSR markers of was 41.68%.
Keywords : Oil palm, SSR, validation, genetic purity, molecular variance
