B1J009058 13.

(1)

Lampiran 1. Hasil amplifikasi RAPD menggunakan 10 primer

Gambar 1. Amplifikasi menggunakan OPA 9

Gambar 2. Amplifikasi menggunakan OPA 10 500 bp

1000 bp 1600 bp

500 bp 1000 bp 1600 bp

(2)

Gambar 4. Amplifikasi menggunakan OPA 18

Gambar 5. Amplifikasi menggunakan OPB 2 500 bp

1000 bp 1600 bp

500 bp 1000 bp 1600 bp

(3)

Gambar 7. Amplifikasi menggunakan OPB 6

1000 bp 1600 bp

1600 bp

500 bp 1000 bp

1600 bp 1000 bp 500 bp

(4)

1000 bp

(5)

Lampiran 5. Cara Pengoperasian GenAlex 6.1

a. Jarak genetik

Double klik pada program GenAlex 6.1 lalu muncul kotak dialog Ms. Office Excel

Security Notice. Klikenable macros. Kemudian pilihadd-inspadatoolbar Ms. Excel,

muncul GenAlex 6.1. kemudian kursor diarahkan pada genetic, klik distance. Lalu

muncul tabel genetic distance option. Kolom genetic calculation diisikan binary

(haploid),distance output optiondiisikanoutput total distance onlydan pada kolom

output dipilih ceklist to work, as tri matrix, label matrix dan sampel. Klik ok,

kemudian muncul hasil analisisgenetic distance.

b. PCA

Worksheet hasil genetic distance dibuka kemudian klik GenAlex 6.1. Pilih PCA,

muncul tabelPCA parameters. Pada kolom data dipilihtype tri distance matrix, pilih

covariance-standarized pada kolom PCA method. Kemudian isi kolom jumlah

sampel dan pada kolom graph option dipilih data labels dan color code pops.

Kemudian klik ok.

c. Frekuensi alel dan estimasi variasi genetik; analisis Nei s biased and unbiased dan

nilai heterozigositas.

Pilih GenAlex 6.1 padaadd-ins, pilihfrequency. Kemudian muncul tabel pertanyaan,

pada kolom data format one coloumn/locus dipilih binary (haploid) lalu klik ok.

Muncul tabel pertanyaan, pada kolom allele frequency and heterozigosity dipilih

frequency and heterozigosity by pop. Pada kolomallele paterns optiondipilihallelic

paternsdangraph paternsdan pada kolommultiple pop option, dipilihNei distance

(6)

Lampiran 2. Hasil skoring pita RAPD

61 15 3 5 5 5

kontrol prlk 20 Gy prlk 25 Gy

OPA9-350 OPA9-500 OPA9-600 OPA9-1000 OPA9-1300 OPA10-300 OPA10-350 OPA10-400 OPA10-600 OPA13-500 OPA13-800 OPA13-1200

P0.1 kontrol 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0

P0.2 kontrol 1 0 1 0 0 1 0 0 1 1 1 0

P0.3 kontrol 1 0 1 1 0 1 0 0 0 1 1 0

P0.4 kontrol 1 0 1 1 0 1 0 0 1 1 1 1

P0.5 kontrol 0 1 0 0 0 1 0 0 1 1 1 1

P20.1 prlk 20 Gy 1 0 1 1 0 1 0 0 1 1 1 0

P20.2 prlk 20 Gy 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 1 0

P20.3 prlk 20 Gy 1 0 1 1 0 0 0 0 1 1 1 0

P20.4 prlk 20 Gy 1 0 1 1 1 0 0 1 0 1 1 0

P20.5 prlk 20 Gy 1 0 1 1 0 0 1 0 0 1 1 0

P25.1 prlk 25 Gy 0 0 1 0 0 0 0 1 1 1 1 1

P25.2 prlk 25 Gy 1 0 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0

P25.3 prlk 25 Gy 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0

P25.4 prlk 25 Gy 1 0 1 1 0 0 0 1 0 1 1 0

(7)

Lanjutan

OPB2-200 OPB2-250 OPB2-350 OPB2-500 OPB2-600 OPB2-700

(8)

(9)

(10)

Lampiran 3. Jarak genetik pada sampel kecipir

1 15

Sheet1 Binary Distance

P0.1 P0.2 P0.3 P0.4 P0.5 P20.1 P20.2 P20.3 P20.4 P20.5 P25.1 P25.2 P25.3 P25.4 P25.5

0 P0.1

8 0 P0.2

14 14 0 P0.3

19 13 11 0 P0.4

18 20 16 15 0 P0.5

17 15 11 8 13 0 P20.1

14 16 12 15 18 11 0 P20.2

22 20 14 17 24 15 16 0 P20.3

22 20 22 23 32 21 20 22 0 P20.4

25 23 21 22 23 18 19 21 17 0 P20.5

19 17 21 22 21 18 17 19 21 20 0 P25.1

20 18 12 19 22 17 16 8 18 21 17 0 P25.2

15 15 17 22 23 20 17 21 19 16 14 17 0 P25.3

16 14 18 21 26 21 18 16 16 19 15 14 15 0 P25.4

(11)

Lampiran 4. Hasil perhitungan frekuensi alel dan estimasi variasi genetik

Band Frequencies, Allele Frequencies and Estimated Diversity by Pop for Binary (Haploid) Data

Data Sheet Sheet1

Data Title

No. Loci 61

No. Samples 15

No. Pops. 3

Band Frequency, Allele Frequency (p & q), Samples Size, No. Alleles, No. Effective Alleles, Information Index, Diversity and Unbiased Diversity

Pop Locus Band Freq. p q N Na Ne I h uh

Control OPA9-350 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA9-500 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA9-600 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

(12)

Control OPA13-1200 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA18-300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-350 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-450 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-500 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-600 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA18-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-1000 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-1200 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA18-1600 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB2-200 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-250 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB2-350 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB2-500 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB2-600 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB2-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB3-300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB3-350 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

(13)

Control OPB6-600 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB6-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB6-1400 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB7-250 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB7-350 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-400 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-500 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-600 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB7-700 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-800 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-1000 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-1100 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-1400 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-1800 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB10-350 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB10-600 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

(14)

Prlk 20 Gy OPA9-350 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA9-500 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA9-600 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA9-1000 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA9-1300 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA10-300 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA10-350 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA10-400 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA10-600 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA13-500 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA13-800 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA13-1200 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA18-350 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA18-450 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-500 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-600 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA18-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

(15)

Prlk 20 GY OPB2-600 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB3-300 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-350 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-450 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-600 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB3-650 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-700 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-1000 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB6-300 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB6-500 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB6-600 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB6-700 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB6-1400 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-250 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-350 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

(16)

Prlk 20 GY OPB10-350 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB10-600 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-700 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-800 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-1200 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-1300 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB11-300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB11-400 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB11-600 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB11-700 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB11-800 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

Prlk 25 Gy OPA9-350 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA9-500 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA9-600 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA9-1000 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPA9-1300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA10-300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPA10-350 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

(17)

Prlk 25 Gy OPA18-450 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-500 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-600 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-700 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-1000 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-1200 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPA18-1600 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-200 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB2-250 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-350 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB2-500 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-600 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB2-700 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB3-300 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB3-350 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB3-450 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

(18)

Prlk 25 Gy OPB7-250 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-350 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-400 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-500 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-600 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB7-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-800 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB7-1000 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-1100 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-1400 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB7-1800 0.600 0.600 0.400 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB10-350 1.000 1.000 0.000 5.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB10-600 0.400 0.400 0.600 5.000 2.000 1.923 0.673 0.480 0.600

OPB10-700 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB10-800 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-1200 0.800 0.800 0.200 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

OPB10-1300 0.000 0.000 1.000 5.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000

OPB11-300 0.200 0.200 0.800 5.000 2.000 1.471 0.500 0.320 0.400

(19)

Mean and SE over Loci for each Pop

Pop N Na Ne I h uh

Pop1 Mean 5.000 1.115 1.342 0.283 0.194 0.243

SE 0.000 0.117 0.051 0.039 0.027 0.034

Pop2 Mean 5.000 1.443 1.397 0.351 0.236 0.295

SE 0.000 0.101 0.046 0.036 0.025 0.031

Pop3 Mean 5.000 1.262 1.336 0.302 0.202 0.252

SE 0.000 0.112 0.045 0.037 0.025 0.031

Grand Mean and SE over Loci and Pops

N Na Ne I h uh

Total Mean 5.000 1.273 1.359 0.312 0.211 0.263

SE 0.000 0.064 0.027 0.022 0.015 0.019

Percentage of Polymorphic Loci Population %P

Pop1 47,54%

Na = No. of Different Alleles

(20)

6. Spesifikasi alat dan bahan

No. Nama Alat Merek/Tipe Kegunaan Tempat

1. dan Vintage Menghaluskan bahan Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 2. Spatula Oxone Mencampur bahan Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 3. Gelas ukur Pyrex Mengukur volume

larutan

Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 4. Erlenmeyer Pyrex Wadah larutan Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 5. Timbangan

analitik

Scout Pro Ohaus

Menimbang bahan Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 6. Lemari

pendingin

Panasonic Menyimpan larutan Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 7. Microwave LG Melarutkan agarosa Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 8. Rak tabung

eppendorf

Eppendorf Menyimpan tabung Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 9. Amplop Kiky Tempat sampel Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 10. Sarung tangan Sensi gloves Melindungi tangan Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM

11. Kertas tisu Tessa Membersihkan Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 12. Masker Sensi mask Melindungi mulut dan

hidung

Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 13. Merck Menjaga kelembapan

sampel

Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 14. Mikropipet dan

tip

Eppendorf Mengambil larutan dengan volume kecil

Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 15. Tabung

eppendorf 1,5 ml

Axygen Tempat larutan Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM

16. R tube Axygen PCR Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 17. Vortex Barnstead

Thermolyne maxi mix II

Menghomogenkan bahan

Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM

18. Waterbath Advantec

TBS221AA

(21)

. Merek/Tipe Kegunaan Tempat

22. UV

transilluminator

UVP Visualisasi DNA Lab. Genetika dan Pemuliaan Tanaman UGM 23 !"# $% Eppendorf Sentrifugasi Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 24. Kamera digital Sony Dokumentasi Lab. Genetika dan

Pemuliaan Tanaman UGM 25. PC Lenovo Analisis data Lab. Genetika dan

26. Flashdisk Toshiba Menyimpan data Lab. Genetika dan

No Nama Bahan Spesifikasi Kegunaan

1. Daun muda kecipir - Sebagai sampel

2. Buffer CTAB - Melisis membran sel

3. TBE 1 X Sebagai buffer

4. Kloroform : Isoamil alkohol (24:1) Mendegradasi protein

5. Sodium asetat 3 M Mengendapkan DNA

6. Alkohol 70% Sterilisasi

7. Etanol 70% Memurnikan DNA

8. Isopropanol 2/3 Volume

(dingin)

Presipitasi DNA

10. Akubides - Pelarut

11. DNA PCRmaster mix - PCR

12. Gel agarosa 1% Membuat gel agarosa

13. DNA Stain - Mengikat DNA untuk menangkap

sinar UV

14. DNAladder 10000 bp Sebagai marker

15. OPA-1 (5 - CAGGCCCTTC -3 ) 10 pb Sebagai primer

16. OPA-2 (5 - TGCCGAGCTG -3 ) 10 pb Sebagai primer

17. OPA-3 (5 - AGTCAGCCAC -3 ) 10 pb Sebagai primer

18. OPA-4 (5 - AATCGGGCTG -3 ) 10 pb Sebagai primer

(22)

& ' & ()(Bahan Spesifikasi Kegunaan 25. OPA-11 (5 - CAATCGCCGT -3 ) 10 pb Sebagai primer

26. OPA-12 (5 - TCGGCGATAG -3 ) 10 pb Sebagai primer

27. OPA-13 (5 - CAGCACCCAC -3 ) 10 pb Sebagai primer

28. OPA-14(5 - TCTGTGCTGG -3 ) 10 pb Sebagai primer

29. OPA-15 (5 - TTCCGAACCC -3 ) 10 pb Sebagai primer

30. OPA-16 (5 - AGCCAGCGAA -3 ) 10 pb Sebagai primer

31. OPA-17 (5 - GACCGCTTGT -3 ) 10 pb Sebagai primer

32. OPA-18 (5 - AGGTGACCGT -3 ) 10 pb Sebagai primer

33. OPA-19 (5'- CAAACGTCGG -3') 10 pb Sebagai primer

34. OPA-20 (5 - GTTGCGATCC -3 ) 10 pb Sebagai primer

35. OPB-1 (5 - GTTTCGCTCC -3 ) 10 pb Sebagai primer

36. OPB-2 (5 - TGATCCCTGG -3 ) 10 pb Sebagai primer

37. OPB-3 (5 - CATCCCCCTG -3 ) 10 pb Sebagai primer

38. OPB-6 (5 - TGCTCTGCCC -3 ) 10 pb Sebagai primer

39. OPB-7 (5 - GGTGACGCAG -3 ) 10 pb Sebagai primer

40. OPB-8 (5 - GTGACGTAGG -3 ) 10 pb Sebagai primer

41. OPB-9 (5 - TGGGGGACTC -3 ) 10 pb Sebagai primer

42. OPB-10 (5 - CTGCTGGGAC -3 ) 10 pb Sebagai primer

43. OPB-11 (5 - GTAGACCCGT -3 ) 10 pb Sebagai primer

44. OPB-12(5 - CCTTGACGCA -3 ) 10 pb Sebagai primer

45. OPS-2 (5 - CCTCTGACTG -3 ) 10 pb Sebagai primer

46. OPS-4 (5 - CACCCCCTTG -3 ) 10 pb Sebagai primer

47. OPS-9 (5 - TCCTGGTCCC -3 ) 10 pb Sebagai primer

48. OPS-12 (5 - CTGGGTGAGT -3 ) 10 pb Sebagai primer

49. OPH-10 (5 - CCTACGTCAG -3 ) 10 pb Sebagai primer

50. OPH-18 (5 - GAATCGGCCA -3 ) 10 pb Sebagai primer

51. OPJ-13 (5 - CCACACTACC -3 ) 10 pb Sebagai primer