ISOLASI DAN UJI ANTIFUNGI BAKTERI ENDOFIT
TANAMAN PADI (Oryza sativa
L.
) DAN JAGUNG (Zea mays
L.
)
TERHADAP
Rhizoctonia solani
SKRIPSI
NADILA YASMIN
090805035
DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
ISOLASI DAN UJI ANTIFUNGI BAKTERI ENDOFIT
TANAMAN PADI (Oryza sativa
L.
) DAN JAGUNG (Zea mays
L.
)
TERHADAP
Rhizoctonia solani
SKRIPSI
Diajukan untuk melengkapi tugas dan memenuhi syarat mencapai gelar Sarjana Sains Biologi pada Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas
Sumatera Utara
NADILA YASMIN
090805035
DEPARTEMEN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
PERSETUJUAN
Judul : Isolasi dan Uji Antifungi Bakteri Endofit Tanaman Padi (Oryza sativa L.) dan Jagung (Zea mays L.) terhadap Rhizoctonia solani
Kategori : Skripsi
Nama : Nadila Yasmin
Nomor Induk Mahasiswa : 090805035
Program Studi : Sarjana (S1) Biologi
Pembimbing II Pembimbing I
PERNYATAAN
ISOLASI DAN UJI ANTIFUNGI BAKTERI ENDOFIT TANAMAN
PADI (
Oryza sativa
L.) DAN JAGUNG (
Zea mays
L.)
TERHADAPRhizoctonia solani
SKRIPSI
Saya mengakui bahwa skripsi ini adalah hasil kerja saya sendiri, kecuali beberapa kutipan dan ringkasan yang masing-masing disebutkan sumbernya
Medan, Maret 2013
PENGHARGAAN
Puji dan syukur Alhamdulillah penulis panjatkan kehadirat ALLAH SWT yang telah melimpahkan rahmat dan karunia-NYA sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul Isolasi dan Uji Antifungi Bakteri Endofit Tanaman Padi (Oryza sativa L.) dan Jagung (Zea mays L.) Terhadap Rhizoctonia solani sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Sains (S.Si). Sholawat beriring salam tetap tercurah kepada Rosulullah Muhammad SAW, keluarga, sahabat serta ummatnya sampai akhir zaman.
Ucapan terima kasih penulis sampaikan kepada Bapak Prof. Dr. Dwi Suryanto, M. Sc. dan Bapak Prof. Dr. Erman Munir, M.Sc. selaku dosen pembimbing yang telah memberikan banyak arahan, bimbingan, masukan dan perhatian serta waktu pada saat penulis mengusulkan penelitian hingga penyusunan skripsi ini. Penulis juga mengucapkan terima kasih kepada Ibu Dr. It Jamilah, M.Sc dan Ibu Dr. Suci Rahayu, M.si selaku dosen penguji yang telah banyak memberikan masukan dan saran yang sangat membangun dalam penyempurnaan skripsi ini.
Ucapan terimakasih yang tidak terhingga penulis sampaikan kepada keluarga yang selalu melimpahkan kasih sayang, doa, dukungan, motivasi dan semangat. Kepada yang tercinta dan tersayang Ayahanda Mohammad Yasin Khan dan Ibunda Hazratunnisa. Kepada Bubu Aminah, Khala Aisyah, kakanda dan adinda terkasih Mohammad Tarique Khan, Mohammad Azhar Tamimi Khan, Hafizah, dan Azrina, dan seluruh keluarga besar yang senantiasa memberikan dukungan dan motivasi tiada henti. Semoga kita selalu dalam lindungan ALLAH SWT.
Ucapan terimakasih juga penulis sampaikan kepada para sahabat dan teman-teman seperjuangan yang telah mendampingi penulis dalam suka dan duka Eryna Elfasari, Arfah Nasution, Lisa Novita Arios, Sintha Dwi Wulandari, Siti Shofiya, Hema, Rulya, Rahmi, Willy, Anderson, Agustina, Febri, Imam, Nuri, Nisa, Bobby, Sepwin, Siska, Zulfan, Novi, Zubeir, dan teman-teman angkatan 2009 lainnya yang telah memberi semangat. Kepada rekan-rekan di Laboratorium Mikrobiologi kakak Nikmah, kakak Rahmiati, Kakak Umi, abang Asril, abang Mirza, kakak Ria, kakak Netti, kakak Widya, terima kasih atas segala bantuan dan dukungan yang telah diberikan selama ini.
Penulis juga mengucapkan terima kasih kepada semua pihak yang telah membantu secara langsung maupun tidak langsung atas tercapainya hasil penelitian ini. Semoga skripsi ini bermanfaat untuk semua pihak dan semoga ALLAH SWT memberikan balasan atas apa yang telah diberikan. Amin ya Rabbal ‘Alamin.
ISOLASI DAN UJI ANTIFUNGI BAKTERI ENDOFIT TANAMAN PADI (Oryza sativa L.) DAN JAGUNG (Zea mays L.) TERHADAP
Rhizoctonia solani
ABSTRAK
Penelitian isolasi dan uji antifungi bakteri endofit tanaman padi dan jagung telah telah selesai dilaksanakan. Terdapat delapan dan lima isolat bakteri endofit masing-masing dari tanaman jagung dan padi. Seluruh isolat dari jagung dan tiga isolat dari padi menunjukkan penghambatan terhadap pertumbuhan R. solani
secara in vitro. Isolat AJ02 yang berasal dari jagung memiliki hambatan terbesar yaitu 21 mm, sedangkan BJ01 menunjukkan zana hambat terkecil dengan penghambatan sebesar 14,5 mm. Isolat DP01 yang berasal dari padi menunjukkan zona hambat terbesar yaitu 18 mm. isolat BP01 menunjukkan zona hambat terkecil yaitu 13,5 mm. AJ02, DJ01 dari jagung dan AP01, DP01 dari padi digunakan untuk pengujian in vivo karena keempat isolat menunjukkan pengahambatan pertumbuhan fungi yang paling besar. Isolat dari jagung, AJ02 dan DJ01 mampu mengurangi serangan fungi R. solani sebesar 25% dan 22% sedangkan isolat dari padi AP01 dan DP01 dapat mengurangi serangan R. solani
sebesar 22% dan 27%.
ISOLATION AND ANTIFUNGAL ESSAY OF ENDOPHYTIC BACTERIA FROM PADDY (Oryza sativa L.) AND CORN (Zea mays L.) PLANT
AGAINST Rhizoctonia solani
ABSTRACT
Isolation and antifungal essay of endophytic bacteria from paddy and corn has been conducted. There were eight and five endophitic bacterial isolates from corn and paddy, respectively. All corn isolates and three paddy isolates showed to inhibit R. solani growth in vitro. AJ02 of corn has showed maximum inhibition to fungal growth with the inhibition zone of 21 mm. Meanwhile, the BJ01 showed minimum inhibition zone, with inhibition by 14,5 mm. The DP01 of paddy showed the maximum inhibition zone 18 mm. BP01 showed the minimum inhibition zone, 13,5 mm. AJ02, DJ01 of corn and AP01, DP01 of paddy were used for the study since all four showed maximum inhibition to fungal growth. Corn isolates AJ02 and DJ01 were able to decrease R. solani attack by 25% and 22% respectively, while paddy isolates AP01 and DP01 were able to decrease R. solani
attack of 22% and 27% respectively.
DAFTAR ISI 2.4 Penyakit yang Disebabkan Rhizoctonia solani 8
BAB 3 METODE PENELITIAN 10
3.1 Waktu dan Tempat 10
Jumlah Daun Kecambah Jagung
BAB 4 HASIL DAN PEMBAHASAN 16
4.1 Isolasi Rhizoctonia solani 16
4.2 Isolasi Bakteri Endofit dari Tanaman Padi dan Jagung 17 4.3 Kemampuan Bakteri Endofit Menghamat Pertumbuhan
Rhizoctonia solani Secara In Vitro 20
4.4 Pengamatan Hifa Abnormal 22
4.5 Patogenitas Rhizoctonia solani Terhadap Benih Jagung 23 4.6 Penghambatan Serangan Rhizoctonia solani Terhadap
Pertumbuhan Benih Jagung
25 4.7 Pengaruh Bakteri Endofit Terhadap Pertumbuhan Benih
Jagung
27 4.8 Reisolasi Patogen Rhizoctonia solani dari Benih Jagung 30
BAB 5 KESIMPULAN DAN SARAN 32
5.1 Kesimpulan 32
5.2 Saran 32
DAFTAR PUSTAKA 33
DAFTAR TABEL
Nomor Tabel
Judul Halaman
4.2.1 Karakteristik Morfologi, Sifat Pewarnaan Gram, dan Biokimia Bakteri Endofit Tanaman Padi dan Jagung
18 4.3.1 Kemampuan Bakteri Endofit Tanaman Padi dan Jagung
Dalam Menghamat Pertumbuhan Rhizoctonia solani
DAFTAR GAMBAR
Nomor Gambar
Judul Halaman
3.6.1 Metode Pengukuran Zona Hambat Bakteri Terhadap Koloni Fungi
13
4.1.1 Rhizoctonia solani 16
4.3.1 Hasil Uji Antagonis In Vitro Rhizoctonia solani
Terhadap Bakteri
21 4.4.1 Morfologi Hifa Abnormal Hasil Uji In Vitro
Rhizoctonia solani dengan Bakteri Endofit
23 4.5.1 Serangan R. solani pada Benih Benih Jagung 24 4.6.1 Patogenitas dan Penghambatan R. solani Terhadap
Benih Jagung
25 4.6.2 Persentase Rebah Kecambah Benih Jagung setelah
diinokulasikan Bakteri Endofit Padi dan Jagung
26 4.7.1 Perbandingan Tinggi Tanaman Tiap Perlakuan 28
4.7.2 Perbandingan Jumlah Daun Tiap Perlakuan 29
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Lampiran
Judul Halaman
1 Isolasi Bakteri Endofit Dari Bagian Akar, Batang dan Daun
39 2 Isolasi Fungi Patogen Dari Bagian Akar, Batang dan
Daun
40 3 Uji Antagonisme Isolat Bakteri Endofit Terhadap
R.solani denganMetode Difusi Cakram
41
