• Tidak ada hasil yang ditemukan

Fingerprinting kelapa sawit (Elaeis guinensis Jacq.) Berdasarkan Marka Simple Sequence Repeats (SSR) dan Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD)

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2017

Membagikan "Fingerprinting kelapa sawit (Elaeis guinensis Jacq.) Berdasarkan Marka Simple Sequence Repeats (SSR) dan Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD)"

Copied!
10
0
0

Teks penuh

(1)

DAFTAR PUSTAKA

Abaii, S.D.A. 2014. Metode analisis dna finger printing metode RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism). Diakses dari

Pada Tanggal 25

Februari 2015.

Acquaah, G. 2007. Principles of plant genetics and breeding. Blackwell Publishing. 350 Main Street, Malden, MA 02148-5020, USA.

Ajambang, W., Sudarsono, Asmono, D. dan Toruan N. 2012. Microsatellite markers reveal Cameroon’s wild oil palm population as a possible solution to broaden the genetic base in the Indonesia-Malaysia oil palm breeding programs. Afr. J. of Biotechnol., 11(69): 13244-13249.

Allou, D., Adon, B., dan Sangare, A. 2008. Molecular variability from two selections of BRT10 population in an inbreeding program of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) in Cote d’Ivoire.Afr. J. Biotechnol., 7(20): 3550-3553.

Amrital, G. 2006. DNA fingerprinting the new sherlock holmes. Diakses dari:

Araya, E., Alvarado, A., dan Escobar, E. 2010. Use of DNA marker for fingerprinting comapct clones and determining genetic relationship

elaeis oleifera germplasm origins. ASD Costa Rica (Agricultural Services & Development), 2-21.

Ariani, S.H. 2014. Keragaman genetik aren sulawesi tenggara berdasarkan marka random amflified polymorphic DNA. [Tesis]. Program Magister Agroekoteknologi, Fakultas Pertanian. Universitas Sumatera Utara, Medan.

Asep, M. 2010. Keragaman genetik shorea laevis Ridl. di Kalimantan berdasarkan penanda mikrosatelit. [Skripsi]. Departemen Silvikultur. Fakultas Kehutanan. IPB. Bogor.

Asmono, D. 2007. Perlindungan varietas kelapa sawit. Disampaikan pada Seminar Nasional Hasil Penelitian yang Dibiiayai oleh Hibah Kompetitif dan Sosialisasi HKI/PVT dalam rangka Purnabakti Prof. Dr. Ir. Jajah Koswara. IPB Darmaga-Bogor. 16 (1) :11-12.

(2)

Bakar, E.S. 2003. Kayu sawit sebagai substitusi kayu dari hutan alam.forum komunikasi teknologi dan industri kayu Volume 2. Fakultas Kehutanan. Bogor.

Bakoume, C., Wickneswari , R., Raijanaidu, N., Kushairi, A., Amblard, P. and Billotte, N. 2009. Allelic diversity of natural oil palm (Elaeis guineensis

Jacq.) populations detected by microsatellite markers. Implication in conservation.Rev. Palmas 28(1), 149-158.

Batusha, S. 2013. The application of IRAP markers in the breeding of papaya. [Disertasi]. Institute of Biological Science. Faculty of Science.University of Malaya. Kuala Lumpur.

Billotte, N., Risterucci, A.M., Barcelos, E., Noyer, J.L., Amblard, P., dan Baurens, F.C., 2001. Develpoment characterisation and across-taxa utility of oil palm (Elais guineensis Jacq.) Microsatellite Markers.Genome, 44 (33), 413-425.

Botstein D, White R.L, Skolnick M, dan Davis R.W. 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am. J. Hum. Genet. 32:314–331.

[BPS]. 2014. Poduksi perkebunan besar menurut jenis tanaman, Indonesia (Ton). Diakses dari : http://www.bps.go.id/tab_ sub/view.php?kat=3&tabel= 1&daftar=1&id_subyek=54&notab=2. [13 Desember 2004].

Chandra , I.P. 2011. Keragaman Genetik Nilai (Pogostemon cablin Benth) yang dibudidayakan di bali berdasarkan marka random amplified polymorphic DNA (RAPD) [Abstrak]. Program Magister Program Studi Bioteknologi Pertanian. Program Pascasarjana. Universitas Udayana. Denpasar.

Chawla, H.S. 2003. Plant biotechnology a practical approach. science publishers, Inc. Plymouth.

Corvianindya, Y.R. dan Aerkari, E.I. 2001. Studi molekuler pada instabilitas genetik : mekanisme kerusakan DNA proses perbaikannya. Jurnal Kedokteran Gigi Universitas Indonesia (JKGUI). 8 (3) : 44-50.

[Deptan] Departemen Pertanian. 2008. Teknologi budidaya kelapa sawit. balai besar pengkajian teknologi pertanian. badan penelitian dan pengembangan pertanian. seri buku inovasi. 1. ISBN:978-979-1415- 32-3.

(3)

Sumatera Barat. Balai Benih Induk Tanaman Padi Palawija dan Hortikultura. Sumatera Barat.

Diana, A., Garmenza, M., Leonardo, R., dan Hernain, R. 2012. Genetic similiarity among commercial oil palm materials based on microsatellite markers.

Journal of Agronomia Colombiana. 30 (2) : 188-195. ISSN : 0120-9965.

Donata, S.P. 2010. Penanda DNA untuk pemuliaan tanaman kelapa (Cocos nucifera L.). Balai Penelitian Tanaman Kelapa dan Palma Lain.Prespsektif. Manado. 9: 21-35.

Dualembang, E. Yunus, M. dan Azrai. 2010. Krakterisasi genetik koleksi plasma nutfah surgom (Sorgum bicolor L. Moensch) Berbasis Marka SSR

(Simple Sekuen Repeats). Jurnal Penelitian. 1 : 1-14.

Elrod, S. dan Stansfield, W. 2007. Genetika. (Damaring Tyas W. Pentj). Penerbit Erlangga. Jakarta.

Emad, O.H.A., dan Soon, G.T. 2014. Using monomorphic microsatellite markes

in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Journal of Botanical Science. 3 (4) : 1-6.

Fatchiyah, 2011. Pelatihan analisis fingerprinting DNA tanaman dengan metode RAPD. Modul. Laboratorium Sentral Ilmu Hayati Universitas Brawijaya, Malang.

Guneeren, G., Akyuz, B., dan Ertugrul, O. 2010. Use of RAPD-PCR for genetic analyses on the native cattle breeds in Turkey. Journal of Ankara Univ Vet Fak Derg.57:167-172.

Hack, S.M., Huckket, B.I., dan Butterfield, M.K. 2002. Application of Microsatellite Analysis to The Screening Of Putative Parents Of Sugarcane Cross AA40. Proc S Afr Sug Technol Ass. 76 :232-234.

Hartati, Sumadi, Subandriyo dan Hartatik, T. 2010. Keragaman morfologi dan diferensiasi genetic sapi Peranakan Ongole di peternakan rakyat. JITV

15: 72-80.

Hetharine, H. 2010. Deteksi perubahan genetik pada kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Abnormal dengan Teknik RAPD. Jurnal Budidaya Pertanian. 6(2) : 45-50.

[ICAR] Indian Institure of Pulses Research Kanpur. 2007. DNA fingerprinting of major pulse crops of india. Tchnical Bulletin. 1: 1-85.

(4)

Irawan, B. 2008. Genetika molekuler. Aerlangga University Press. Surabaya.

Ismi, P.R., Endangm Y., dan Supriyadi. 2009. Analisis keragaman tanaman sukun (Durio zibetenus).Jurnal Bioteknologi. 6:89-98.

Istino, F., Jamsari, Suliansyah,I. dan Gustian. 2012. Studi hubungan karakter morfologi, anatomi, dan molekuler terkait potensi kadar katekin pada tanaman gambir (Uncaria gambir (Hunter) Roxb.). Artikel Disertasi Universitas Andalas. 5-25.

Jefri, N.R., Gusti, A.A.P., dan Nengah, W. 2013. Karakteristik lokus mikrosatelit dbs1100 pada populasi monyet ekor panjang di Bukit Gumang, Karangasem, Bali.Indonesia Medicus Veternus.1:115-125.

Kaidah, S. 1999. Analisis keragaman genetik tanaman salak (Salacca sp.) Indonesia dengan teknik Random Amplified Polymorphic DNA

(RAPD).[Tesis].IPB. Bogor.

Karsinah, Sudarsono, Lilik, Y., dan Hajrial, A. 2002. Keragaman genetik plasma nutfah jeruk berdasarkan analisis penanda RAPD. Jurnal Bioteknologi Pertanian. 7(1): 8-16.

Kirkpatrick, B.W. 1992. Identification of a conserved microsatellite site in the porcine and bovine insulin-like growth factor-I gene 5' flank. J. Animal Genetics. 23:543-548.

Kusumadewi, S.Y. 2011. Variasi dan kekerabatan genetik pada dua jenis belimbing baru (Averrhoa leucopetala Ruqyah et Sunartisp nov da A.

dolichorpa Ruqyah et Sunarti sp nov. Oxalidaceae) Berdasarkan Profil Random Amplified Polymorphic DNA. Jurnal Biologi Indonesia. 7(2) : 321-330.

Liu, B.H. 1998. Statistical genomics, linkage mapping, and QTL analysis.CRC Press. New York. p.45-83.

Liu, K., dan Muse, S.V. 2005. Power Marker : an integrated analysis environment for genetic marker analysis. Bioinformatics, 21 : 2128-2129.

Ma. X., X.Y. Gu, T.T. Chen, S.Y. Chen, L.K. Huang dan X.Q. Zhang. 2013. Genetic relationships between Lolium (Poaceae) species revealed by RAPD markers. Genet. Mol. Res. 12 (3): 3246-3255.

(5)

DNA. Pusat Pengembangan Bioteknologi Universitas Muhammadiyah Malang : 123-131.

Magdeldin, S. 2012. Principles of nucleic acid separation by agarose gel

electrophoresis, gel electrophoresis - principles and basics. Diakses dari :

gel electrophoresis. ISBN: 978-953-51- 0458-2.

Maizura I, Rajanaidu, N., Zakri A, dan Cheah, S.C. 2009. Assessment of genetic diversity in oil palm (Elaeis guineensis Jacq) using restriction fragment length polymorphism (RFLP). Genet.Resourc.Crop Evol.53(1): 187-195.

Makful, Purnomo, S., dan Sunyoto. 2010. Analisis keragaman genetik manggis menggunakan teknik amplified Fragmen Length Polymorphism (AFLP).

J.Hort. 4:313:320.

Mangoenwidjojo., W. 2003. Dasar-dasar pemuliaan tanaman. Penerbit Kanisius. Jakarta.

Mardziah, A. Rahimah, M., Ting, N.C. dan Rajinder, S. 2013. Development of a non-radioaktve screening protocol of various genetic backgraound of oil palm. Trans. Malaysia Soc. Plant Physiol. 1:135-138.

Mulsanti, I.W., Memen, S., Sri. Wahyuni dan Dwinita, W. U. 2013. Identifikasi galur tetua padi hibrida dengan marka SSR spesifik dan pemanfaatannya dalam uji kemurnian benih. Jurnal Balai Besar Penelitian Tanaman Padi. 1-8.

Mulyani Y, Purwanto A, dan Nurruhwati I, 2011. Perbandingan beberapa metode isolasi dna untuk deteksi dini Koi Herpes Virus (KHV) pada ikan mas (Cyprinus carpio L.).Jatinangor : Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Padjadjaran. Jurnal Akuatika. 8(11): 1-16.

Nicholl, D.S.T. 2002. An introduction to genetic engineering.second edition.The Edinburgh Building, CB2 8RU, UK. Cambridge University Press. New York.

Nida, W.N.M.S. 2014. Genetic Diversity of DxP Population yield componenr in oil palm’s paternal half-sib family based on microsatellite markers.

Energy Procedia. 47: 196-203.

(6)

Noorhariza, M.Z., Ismanizan, I., Rozana, R., Ting, N.C., dan Rajinder, S. 2010. Development and characterization of elaeis oleifera microsatellite markers. Journal of Sains Malaysiana. 39 (6): 909-912.

Noorhariza, M.Z., Rajinder, S., Rozana, S. and Ismanizan, I. 2012. Elaies olifeiera genomic-SSR : exploitation in oil palm germplasm diversity and cross-amplification in Arecaceae. International Journal of /Moleculer Science. 13:4069-4088.

Novita, L. 2013. Analisis genetik Karakter Morfo-Agronomi Jarak Pagar Hasil Pemuliaan Berbasis Pendekatan Kuantitatif dan Molekuler. [Tesis] Sekolah Pasca Sarjana. Institut Pertanian Bogor.

Nurita, T.M., Bangun, S.I.I., dan Maria, B. 2001. Analisis abnormalitas tanaman kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) hasil kultur jaringan dengan Teknik Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Jurnal Menara Perkebunan. 69(2): 58-70.

Nyoman, I.M., Mulyani, Y. dan Arifuddin, R. 2008. Penanda molekul DNA mikrosatelit untuk karakterisasi bibit jamur kuping (Auricularia polytricha [Mont.] Sacc.). Jurnal FMIPA ITB. Bandung. 3:8-15.

Odenore, V.D., Eke, C.R., Asemoto, O., dan Shittu, H.O. 2015. Determination of phylogenetic relationship among oil palm (Elaeis guineensis) varieties with Random Amplified Polymorphic DNA. European International Journal of Science and Technology.Vol. 4.No.2.155-160.

Pahan, I. 2008. Panduan lengkap kelapa sawit manajemen agribisnis dari hulu hingga hilir. Penerbit Penebar Swadaya. Jakarta.

Pamin, K. 1998. A hundred and fifty years of oil palm development in Indonesia: from the Bogor Botanical Garden to the industry. International Proceeding Oil Palm Conference. IOPRI. Bali.

Peakall dan Smouse. 2012. Introduction to population genetic analysis. GenAlex Genetic Analysis in Excel. Based on material provided at the national graduate workshop An Introduction to Genetic Analysis for Populations Studies offered by Rod Peakall and Peter Smouse at the Australian National University, Canberra, Australia, July 2009.

(7)

Pramudi, M.I., Retno, D.P., dan Bambang, T. R. 2013. Keragaman dan kekerabatan lalat buah (Diptera : Tephritidae) di Kalimantan Selatan berdasarkan karakter morfologi dan molekuler (RAPD-PCR dan Sekuensing DNA). Jurnal HPT Tropika. 2: 191-202.

Pratiwi, R. 2001. Mengenal metode elektroforesis. Oseana. Balitbang Biologi Laut, Puslitbang Osenologi LIPI, Jakarta. 1 (16).

Priyono, Michel, R. dan Dominique, C. 2010. Transferability of simple sequence repeats and single nucleotide polymorphisms marker for genetic map development in Coffea canephora Pierre. Jurnal Pelita Perkebunan, 26(3) : 126-141.

Priyono. 2010. Kemampuan transfer marka simple sekuen repeats dan single nucleotide polymorphisms pada pengembangan peta genetik Coffea canephora Pierre. Abstract. 26: 126-141.

Putri, L.A.P. 2010. Pendugaan Parameter Genetik dan Karakterisasi Molekuler Keragaman Genetik dengan Menggunakan Marka Mikrosatelit (SSR) pada Kelapa Sawit. [Disertasi]. Sekolah Pascasarjana. Institut Pertanian Bogor. Bogor.

Putri, L.A.P., Dame, H.Y.L.T., Basyuni, M. dan Setyo, E.I. 2014. Pendugaan keragaman genetik 16 aksesi manggis Sumatera Utara berdasarkan 10 marka RAPD. Prosiding Seminar Nasional Perhimpunan Hortikultura Indonesia “Peningkatan Daya Saing Produk Hortikultura Nusantara dalam Menghadapi Era Pasar Global”. Malang. 5-7 November 2014. hlm 55-58.

Putri, L.A.P., Mahyuni, K.H., Basyuni, M., dan Setyo, I.E. 2013. Analisis awal : Pemakaian marka molekuler RAPD untuk pendugaan keragaman genetik plasma nutfah aren Sumatera Utara. Prosiding Seminar Nasional Agroforestri “Agroforestri untuk Pangan dan Lingkungan yang Lebih Baik”; Universitas Brawijaya. 21 Mei. 2013. hlm 706-709.

Putri, L.A.P., Samosir, R.U.A., dan Tarigan, M.,J. 2016. Diversitas plasma nutfah tebu Sumatera Utara berdasarkan marka molekuler. Prosiding Seminar Nasional “Kontribusi Akademisi dalam Pencapaian Pembangunan Berkelanjutan”; Universitas Brawijaya, 12 Februari 2016. Malang. hlm KP32-KP37.

(8)

_%20Rajanaidu.pdf .pada tanggal 08 Maret 2015. Pkl. 09.30 WIB. reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol. 4: 406–425.

Rodica, C., Monica, M. and Roxana, I. 2013. The RAPD techniques used to acces the genetic diversity in Draba dorneri , a Critically Endangered Plant Species. Journal of Biosceince and Biotcehnology. 4:164-169.

Saitou, N dan Nei, M . 1987. The neighbor-joining method: a new method for

Satish, D.K. dan Mohankumar, C. 2007. RAPD marker for identifying oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). parental varieties (Dura and Pisifera) and the hybrid tenera. Indian Journal of Biotechnology. 3 : 354-358.

Semagn, K., Bjornstad, A., dan Ndjiondjop., M.N. 2006. An overview of moleculer methods for plants. African Journal of Biotechnology. 5 (25):2540-2568.

Setiyo, I.E. 2001. Pemetaan dan Keragaman Genetik RAPD pada Kelapa Sawit Sungai Pancur (RISPA). [Tesis]. Program Pascasarjana. IPB. Bogor.

Sharma, A., Namdeo, A.G. dan Mahadik, K.R. 2008. Molecular markers: new prospects in plant genome analysis. Pharmacognosy Reviews 2 (3): 23- 31.

Soehardjo. 1999. Vademecum Kelapa Sawit. PT. Perkebunan Nusantara IV. Bah Jambi. Pematang Siantar, Sumatera Utara.

Sugiono, M. 2010. Marka mikrosatelit sebagai alternatif uji buss dalam perlindungan variaetas tanaman padi.buletin plasma nutfah. Balai Besar Peneltiian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian. Bogor. 16 : 1-7.

Surahman, M., Muhamad, S. dan Toding, T. 2007. Perakitan Varietas Semangka (Citrullus lanatus (Thunberg) Matsum & Nakai) Banpa biji Tahan Terhadap Penyakit Layu Fusarium dengan Memanfaatkan Marka RAPD [laporan penelitian hibah bersaing]. Bogor : Institut Pertanian Bogor.

Suryanto, D. 2003. Melihat keanekaragamanorganisme melalui beberapa teknikgenetika molekuler. USU Digital Library [terhubung berkala].http://www.library.usu.ac.id/modules.php [23 November 2013].

(9)

Tasma, M. dan Arumsari, S. 2013. Analisis diversitas aksesi kelapa sawit kamerun berdasarkan marka SSR. Jurnal Litri 19 (4) : 194-202. ISSN. 0853-8212.

Thawaro, S. 2009. Screening and Detection of Hybrid Oil Palms by DNA Markers and Their Propogation.[Dissertation]. A Thesis Submitted in Partial Fufilment of Requirenment for the Degree of Doctor of Philosophy in Plant Science. Prince of Songkla University. Thailand.

Treuren, R. V. 2000. Genetic Marker

ur.nl/about/Biodiversity/cgn/ research/molgen.

Toruan-Mathius, N., Hutabarat, T. 1997. Pemanfaatan teknik penanda molekuler dalam usaha meningkatkan produktivitas tanaman perkebunan. Warta Biotek Perkebunan II (1):2-9.

Ulfah, J.S. dan Rany, D.W. 2010. Keragaman Genetik Populasi Sengon (Paraseranthes falcataria (L) Nielsen) pada Hutan Rakyat Berdasarkan Penanda RAPD. Departemen Silvikultur Fakultas Kehutanan IPB. Bogor.

Weber, J. L. 1990, informativeness of human (dCdA)n.(dG-dT)n polymorphisms,

Genomics, 7, 524-530.

Weising, K., Hilde, N., Kristen, W., dan Gunter, K. 2005. Dna Fingerprinting in Plants, Principles, Methods, and Application. Second Edition.CRC Press.Taylor & Francis Group.

Widhiono, I. 2015. Strategi Konservasi Serangga Pollinator. Universitas Jeneral Soedirman. Purwokerto.

Widiastuti, A., Sobir., M.R. dan Suhartanto. 2013. Analisis keragaman genetik manggis (Garcinia mangostana) diiradiasi dengan sinar gamma berdasarkan penanda ISSR. Jurnal Bioteknologi. 10(1) : 15-22.

Yu, Q., Luo, J. Han, X., Zhu, Y.Z., Chen, C., Liu, J.X. dan Sheng, H. 2009. Genetic diversity and relationships of 10 chinese goat breeds in the middle and western china. Small Ruminant Research.

Yunita, T.R., Taryono dan Suyadi, M.W. 2015. Pengujian sifat kemampuan menyerbuk silang lima klon kakao (Theobroma cacao). Prosiding Seminar Nasional Masy Biodiv Indon pada Bulan Agustus. 1 (5) : 1182-1185.

Yurna, Y., Lalu, F.B., Jayusman, dan Dwi, A. 2002. Diversitas genetik plasma nutfah kelapa sawit tenera oringin binga. Jurnal Penelitian Kelapa Sawit.

(10)

Zulfahmi, 2013. Penanda DNA untuk analisis genetik tanaman. Jurnal Agroektekonologi. 3:41-52.

Referensi

Dokumen terkait

Apakah ibu mengucapkan kata-kata kasar yang menyakitkan hati saat marah dan menghukum (mencubit, memukul, menampar) kamu saat melakukan kesalahan. Apakah ibu membiarkan

Metode ini melakukan pembuatan VoIP Cloud Server dengan menggunakan Eucalyptus Iaas sistem dan uji coba dilakukan dalam satu jaringan

Disisi lain persepsi mahasiswa atas harga pada hakikatnya adalah merupakan proses penilaian mahasiswa terhadap harga (biaya pendidikan) yang ditawarkan perguruan

Hasil uji statistik antara infeksi Askariasis dengan pendapatan orangtua pada murid SDN 29 Purus Padang diperoleh hasil p value 0,370 ( p > 0,05), dengan

Hubungan Motivasi dengan Efikasi Diri Pasien DM Tipe 2.. dalam Konteks Asuhan Keperawatan di RSUP H.Adam

Sistem tertentu adalah suatu sistem yang operasinya dapat diprediksi secara tepat sedangkan sistem tak tertentu adalah sistem dengan perilaku ke depan yang tidak

Pada penelitian ini, kejadian ISPA atas lebih sering terjadi pada anak laki- laki yaitu sebesar 54,7% dengan perbandingan antara balita penderita ISPA atas laki-laki dan

Pada tahun 2000 Taufik Ashal melakukan penelitian mengenai prevalensi anti-HCV positif di UTDC PMI Padang dan didapatkan hasil prevalensinya adalah sebesar 0,95%