KERANGKA MODUL PEMBELAJARAN MATA KULIAH: STRUKTUR DAN FUNGSI BIOMOLEKUL

(1)

i

KERANGKA MODUL PEMBELAJARAN

MATA KULIAH: STRUKTUR DAN FUNGSI

BIOMOLEKUL

Nama

: Dr. Julius Pontoh, MSc

Lidya Momuat, SSi. Msi.

Vanda Kamu, SSi. MSi.

Institusi

: Universitas Sam Ratulangi Manado

Fakultas

: MIPA

(2)

ii

2015

LEMBAR PENGESAHAN

Judul Modul Ajar

: Struktur dan Fungsi Biomolekul

Nama Dosen Penyusun

: Dr. Julius Pontoh, MSc.

Lidya Momuat, SSi., MSi.

Vanda Kamu, SSi., MSi.

Mengetahui dan Menyetujui: Manado, 24 Juli 2015

Dekan Penyusun,

(Prof. Dr. Benny Pinontoan, M.Sc) (Dr. Julius Pontoh, M.Sc) NIP. 196606041995121001 NIP. 195102131976031001

Menyetujui, Mengesahkan,

Direktur Eksekutif PIU, Ketua LP3,

Prof. Dr. Ir. Dody M.J. Sumajouw, M.Eng, Ph.D, Prof. Dr. Ir. Odi R. Pinontoan, MS NIP. 195812171988031002 NIP. 19581007198621002

(3)

3

RANCANGAN PEMBELAJARAN

Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi Biomolekul

Semester : 4 (Empat); Kode : KIM-241; sks : 3 (2-1)

Program Studi : Kimia Dosen : Dr. Ir. Julius Pontoh, M.Sc; Lidya Momuat, SSi., M.Si; CAPAIAN PEMBELAJARAN:

a. Menguasai konsep teoretis struktur, sifat, dan perubahannya baik pada energi maupun kinetiknya, identifikasi, pemisahan, karakterisasi, transformasi, sintesis bahan kimia mikromolekul dan terapannya

b. Menguasai prinsip dasar piranti lunak untuk analisis dan sintesis pada bidang kimia yang umum atau yang lebih spesifik (organik, biokimia, analitik,kimia fisik, atau an-organik)

Matriks Pembelajaran : Ming Kemampuan akhir yang diharapkan Bahan Kajian/Materi Pembelajaran Bentuk Pembelajaran Waktu Belajar (Menit)

Deskripsi Tugas Luaran Kriteria Penilaian (Indikator) Bobot Nilai (%) Referensi 1 2 3 4 5 6 7 8 1 Penjelasan Umum Pelaksanaan Perkuliahan Diskusi 100 Kesepakatan Dosen dengan Mahasiswa 2 Menjelaskan konsep dasar biokimia sebagai lanjutan dari Kimia Organik dalam Sistim Kehidupan dalam Sel

Konsep Dasar Biokimia

Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mengikuti tes formatif Gambar empat jenis sel (Prokaryotik, Karyotik, Hewan dan Tumbuhan) Hasil tes formatif - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Hasil tes formatif perorangan 6,7 2, 3

(4)

4

(perorangan) 3 Memahami struktur

molekul air

Struktur molekul air dan fungsinya dalam biokimia sebagai pelarut dan buffer

Pembuatan larutan bufer Diskusi kelompok Praktikum dalam laboratorium T:100 P:160 - Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan hasil kajian struktur molekul air dan buffer

- Mahasiswa membuat larutan buffer sesuai dengan perhitungan masing masing pH

Ringkasan hasil kajian struktur molekul air dan fungsinya dalam sel Laporan praktikum - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kelengkapan laporan hasil praktikum 6,7 3 4 Mampu menggambarkan struktur karbohidrat sederhana dan klasifikasinya serta turunan turunannya

Monosakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa secara perorangan menggambarkan struktur karbohidrat Gambar struktur jenis jenis monosakarida dan turunannya - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kualitas gambar struktur monosakarida dan turunannya 6,7 1, 2, 3, 5 5 Mampu mengidentifikasi dan menggambarkan beberapa senyawa oligosakarida serta menyebutkan fungsi oligosakarida

Oligosakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa secara perorangan menggambarkan struktur beberapa senyawa oligosakarida Gambar beberapa senyawa oligosakarida - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kualitas gambar dan ringkasan fungsi oligosakarida 6,7 1, 2, 3, 5

(5)

5

6 Mampu menjelaskan struktur dan fungsi polisakarida

Polisakarida Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas

- Mahasiswa mempresentasikan suatu topik secara kelompok - Mahasiswa menyusun makalah Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 2, 3, 5 7 Mampu menggambarkan struktur dasar asam amino dan ke20 jenis asam amino

Asam Amino Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 1, 2, 3, 7 8 Memahami ikatan kimia peptida dan polimer polipeptida.

Struktur primer, sekunder, tertier dan kuartener

polipeptida/protein, motif, bentuk dan ukran protein Praktikum analisa [rotein menurut kelarutannya Diskusi kelompok Praktikum pemisasahan protein menurut kelarutannya T: 100 P: 160 - Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. - Mahasiswa melakukan Makalah kelompok Laporan praktikum - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok - Kelengkapan laporan praktikum 6,7 2, 3, 7

(6)

6 pemisahan protein sesuai kelarutannya 9 Memahami fungsi protein sebagai enzim Pengertian enzim, nomenklatur dan mekanisme kerja Praktikum aktivitas enzim Diskusi kelompok Praktikum Lab T: 100 P 160 - Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. - Mahasiswa membuat reaksi biokimia kerja enzim dalam menghidrolisa lipida dan karbohidrat Makalah kelompok Laporan praktikum - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok - Kelengkapan laporan praktikum 6,7 5, 6, 8 10 Memahami krontrol dan kinetika enzim

Pengertian kofaktor, alloenzim dan kinetika

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 2, 3 11 Memahami fungsi protein sebagai penggerak motorik dalam sel

Mekanisme kerja otot pada tingkat molekuler dan kerja flagela dalam sel bakteri

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam 6,7 3

(7)

7 - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. kelompok - Kualitas makalah kelompok 12 Memahami fungsi protein sebagai antibodi dan saluran signal

Struktur dasar antibodi dan mekanisme kerja; contoh protein sebagai saluran signal; dan peran protein dalam transpor melalui membran sel Praktikum analisa protein dengan elektroforesis Diskusi kelompok Praktikum Analisa Protein dengan Elektroforesis T: 100 P:160 - Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. - Mahasiswa melakukan kjegiatan praktikum elektroforeis sesuai penuntun Makalah kelompok Lapotan praktikum - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok - Kelengkapan laporan praktikum 6,7 2, 3 13 Memahami struktur dan sifat sifat molekul lipida

Pengertian lipida; pengelompokan dan struktur molekul lipida

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 3 14 Memahami struktur lipida kompleks dan membran

Diskusi kelompok 100 - Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok 6,7 3

(8)

8

sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 15 Memahami struktur nukleotida Struktur Nukluosida dan nukleotida; basa basa penyusun nukleotida

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 2, 3 16 Memahami fungsi nukleotida Fungsi nukleotida sebagai transfer energi, pembawa molekul dan penyimpan informasi genetika

permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Diskusi kelas - Mahasiswa mempresentasikan pengelompokan asam amino menurut polaritasnya masing masing. Makalah kelompok - Keaktifan dalam diskusi kelompok - Kemampuan presentasi dan diskusi dalam kelompok - Kualitas makalah kelompok 6,7 2, 3, 4 Daftar Referensi:

(9)

9

2. Campbell, M.K. dan S. O. 2006. Biochemistry. International Student Edition. Fifth Edition Thomson.

3. Voet, D., J.G. Voet dan C.W. Pratt. 1999. Fundamentals of Biochemistry. John Wiley & Sons, Inc. New York.

4. Alberts, B., D. Bray, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Robert dan P. Walter. 1998 Essential Cell Biology. Garland Publishing, Inc. 5. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Karbohidrat, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

6. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Lipida, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado 7. Pontoh, J. Struktur dan Fungsi Protein, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado 8. Pontoh, J. Biokimia Lanjut, Program Studi Kimia, FMIPA, Unsrat Manado

RANCANGAN TUGAS Nama Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Program Studi : Kimia Pertemuan ke : 2

Fakultas : MIPA

A. TUJUAN TUGAS:

Menjelaskan konsep dasar biokimia dan hubungannya dengan berbagai ilmu lain B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Biokimia 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Sel sebagai suatu sistim kehidupan

b. Jenis jenis sel dan perbedaan dalam strukturnya

c. Sistim kehidupan menyangkut perubahan molekul/senyawa secara kimia 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

- Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil - Permasalahan yang didiskusikan:

(10)

10

1) Jelaskan pengertian pengertian sel sebagai suatu kehidupan yang independen atau bagian dari jaringan dan organ 2) Gambarkan bagaian bagian dari sel

3) Mengapa sel diciptakan terdiri dari bagian bagian (organela) 4) Materi apa yang menyusun sel

- Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas - Mahasiswa mengikuti tes formatif

4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Hasil tes formatif (perorangan) yang dilaksanakan selama 10 menit terakhir pada tahap ini.

C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%):

- Keaktifan dalam diskusi kelompok - Hasil tes formatif perorangan

RUBRIK PENILAIAN KRITERIA 1:Keaktifan dalam diskusi (20%)

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Keaktifan mencari literatur

Sangat aktif Aktif Cukup aktif Kurang aktif Tidak aktif

Keaktifan berdiskusi

TOTAL

KRITERIA 2: Hasil tes formatif perorangan (80%)

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Skor

(11)

11

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul air dan fungsinya dalam biokimia B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Air 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur kimia molekul air

3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

- Mahasiswa mendiskusikan permasalahan yang sudah disusun dosen dalam kelompok kecil. Permasalahan yang dibahas meliputi:

1) Gambarkan struktur molekul air

2) Jelaskan sifat sifat molekul air dalam hubungan dengan distribusi elektron 3) Mengapa molekul molekul air dapat mengumpul dalam bentuk cairan 4) Jelaskan ikatan kimia yang menghubungan molekul molekul air 5) Jelaskan mengapa air dapat melarutkan berbagai senyawa kimia 6) Jelaskan pengertian buffer

7) Apa peran buffer dalam sistim sel

8) Bagaimana perhitungan bahan untuk pembuatan buffer - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran air dalam sel

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan perhitungan pembuatan buffer. - Praktikum Pembuatan Bufer

(12)

12 Lapoan praktikum pembuatan bufer

Hasil tes formatif (perorangan) yang dilaksanakan selama 10 menit terakhir pada tahap ini. C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%):

- Keaktifan dalam diskusi kelompok

- Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikum - Test formatif

TOTAL

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan 50%)

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan konsep secara optimal) Lengkap (melebihi konsep minimal pada modul) Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada modul) Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada modul) Tidak lengkap (konsep tidak sesuai)

(13)

13 Ketepatan gambar / diagram Sangat tepat (sesuai dengan logika ilmiah)

Tepat Cukup tepat Kurang tepat Tidak tepat

Ide baru dan

kreativitas

Sangat baik (memunculkan beberapa ide baru)

Baik (memunculkan ide

baru)

Cukup baik (ide seperti pada

modul) Kurang baik (ide di bawah tuntutan modul) Tidak baik (miskin ide) Total

(14)

14

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul karbohidrat sederhana dan turunannya B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Karbohidrat 2. Batasan yang harus dikerjakan:

b. Struktur kimia molekul karbohidrat

1) Gambarkan struktur molekul glukosa

2) Menunjukan gugus fungsi utama (kimia organik) dalam molekul glukosa 3) Jelaskan kemungkinan reaksi reaksi kimia dari gugus tersebut

4) Jelaskan bentuk bentuk struktur molekul glukosa 5) Jelaskan stereoisomer dari glukosa

6) Jelaskan berbagai jenis karbohidrat menurut jumlah aton C dan stereoisomer 7) Jelaskan senyawa senyawa turunan monosakarida

- Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan struktur beberapa monosakarida yang penting - Mahasiswa menggambarkan struktur monosakarida yang penting

4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan: Ringkasan hasil kajian struktur monosakarida

(15)

15

C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%): - Keaktifan dalam diskusi kelompok

- Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan - Test formatif

TOTAL

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan konsep secara optimal) Lengkap (melebihi konsep minimal pada modul) Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada modul) Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada modul) Tidak lengkap (konsep tidak sesuai)

(16)

16 Ketepatan gambar / diagram Sangat tepat (sesuai dengan logika ilmiah)

kreativitas

baru)

(17)

17

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul oligosakarida B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Oligosakarida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

c. Struktur kimia molekul oligosakarida

1) Jelaskan pengertian “oligo”

2) Jelaskan beberapa jenis oligosakarida yang penting 3) Jelaskan struktur molekul oligosakarida

4) Jelaskan mengapa sukrosa dinamakan gula nonpereduksi dan laktosa sebagai gula pereduksi 5) Jelaskan beberapa kompleks oligosakarida (glikoprotein dan glikolipid)

6) Jelaskan tentang struktur dan fungsi glykokonyugat 7) Jelaskan tentang lektin

8) Jelaskan tentang pebedaan golongan darah ABO dan antigennya

9) Jelaskan beberapa contoh mekanisme interaksi oligosakarida dalam pengenalan sel dan molekul - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

(18)

18 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian tentang oligosakarida dalam sel

TOTAL

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan konsep secara Lengkap (melebihi konsep minimal pada modul) Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada modul) Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada modul) Tidak lengkap (konsep tidak sesuai)

(19)

19 optimal) Ketepatan gambar / diagram Sangat tepat (sesuai dengan logika ilmiah)

kreativitas

baru)

(20)

20

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul polisakarida dan fungsinya dalam biokimia B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polisakarida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur kimia molekul beberapa polisakarida 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

1) Jelaskan monosakarida yang menyusun amilosa, amilopektin, selulosa, kitin dan glikosaminoglikan. 2) Jelaskan apa yang dinamakan homopolimer dan heteropolimer

3) Gambarkan struktur molekul amilosa, amilopektin, dan selulosa.

4) Sebutkan polisakarida sebagai penguat struktur sel dan sebagai simpanan makanan 5) Jelaskan tentang peptidoglikan

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran air dalam sel

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan polisakarida dalam sel. 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian tentang polisakarida dalam sel

(21)

21 C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%):

TOTAL

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan Lengkap (melebihi konsep minimal pada Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada Tidak lengkap (konsep tidak sesuai)

(22)

22 konsep secara

optimal)

modul) modul) modul)

Ketepatan gambar / diagram

Sangat tepat (sesuai dengan

logika ilmiah)

kreativitas

baru)

(23)

23

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul asam amino B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Asam Amino 2. Batasan yang harus dikerjakan:

b. Struktur kimia molekul beberapa asam amino 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

1) Jelaskan struktur umum dari asam amino dan tunjukan gugus fungsi utama (3) 2) Gambarkan setiap molekul asam amino yang biasanya menyusun protein (20) 3) Jelaskan pengelompokan asam asam asam amino

4) Sebutkan sifat sifat kelarutan kelompok kelompok asam amino tersebut.

5) Sebutkan dua asam amino selain diatas yang terdapat dalam sel dan fungsinya (Dopamin dan Histamin) 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian asam amino

(24)

TOTAL

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan konsep secara optimal) Lengkap (melebihi konsep minimal pada modul) Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada modul) Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada modul) Tidak lengkap (konsep tidak sesuai) Ketepatan gambar / diagram Sangat tepat (sesuai dengan logika ilmiah)

(25)

25

kreativitas (memunculkan

beberapa ide baru)

(memunculkan ide baru)

(ide seperti pada modul)

(ide di bawah tuntutan modul)

(miskin ide) Total

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Skor RANCANGAN TUGAS Nama Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul polipeptida dan fungsinya dalam biokimia B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polipeptida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur primer molekul polipeptida b. Struktur sekunder molekul polipeptida c. Struktur tertier molekul polipeptida

(26)

26 d. Struktur kuartener molekul polipeptida

1) Gambarkan ikatan peptida

2) Tunjukan satu contoh senyawa polipeptida dan urut urutan asam aminonya

3) Jelaskan beberapa cara penulisan urut urutan asam amino dalam suatu polipeptida. 4) Jelaskan apa yang dinamakan struktur primer, sekunder, tertier dan kuartener. 5) Jelaskan apa yang dinamakan struktur heliks, beta sheet dan beta turn.

6) Jelaskan apa yang dinamakan motif

7) Tujukan beberapa bentuk protein dan ukurannya.

8) Jelaskan tentang pelipatan protein (folding) dan ikatan kimia yang menstabilkannya - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur protein

- Mahasiswa secara perorangan mengumpulkan gambar tentang beberapa struktur protein - Praktikum kelarutan dan isolasi protein

Ringkasan hasil kajian struktur protein dan laporan praktikum kelarutan protein

(27)

27

TOTAL

kreativitas

baru)

(28)

28 KRITERIA 3: Hasil tes formatif perorangan (30%)

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami fingsi protein sebagai enzim B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Pengertian enzim dan mekanisme kerjanya 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Pengertian enzim b. Klasifikasi enzim c. Mekanisme kerja enzim

(29)

29

1) Jelaskan apa fungsi utama protein. Mengapa fungsi ini sangat penting dalam biokimia 2) Jelaskan mengapa enzim perlu dikelompokan dan bagaimana pengelompokan enzim 3) Jelaskan berbagai mekanisme kerja enzim

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang peran enzim dalam sel - Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan tentang enzim.

- Mahasiswa melakukan praktikum aktivitas enzim sesuai buku pedoman praktikum 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian peranan enzim dan mekanismenya dalam sel Laporan praktikum aktivittas enzim

C. KRITERIA PENILAIAN (6,7%): - Keaktifan dalam diskusi kelompok

(30)

30

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikumS 50%)

kreativitas

baru)

(31)

31

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami kontrol dan kinetika enzim B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Kinetika Enzim 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Kinetika enzim

b. Mekanisme pengontrolan aktifitas enzim 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

1) Apa yang dinamakan kinetika enzim dan apa tujuannya

2) Bagaimana menentukan mekanisme proses penghambatan (inhibisi) enzim 3) Jelaskan berbagai mekanisme pengontrol aktivitas enzim

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang kinetika enzim dan pengontrolan aktivitas enzim

- Mahasiswa secara perorangan menyusun ringkasan kinetika enzim dan pengontrolan aktivitas enzim. 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian kontrol dan kinetika enzim

(32)

32

TOTAL

kreativitas

baru)

(33)

33 KRITERIA 3: Hasil tes formatif perorangan (30%)

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami fungsi protein sebagai penggerak dalam sel B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Mekanisme kerja prorein dalam otot dan transport mioglobin dan hemoglobin 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur kimia molekul prtotein yang berada dalam otot dan flagela b. Mekanisme kerja gerak otot pada tingkat molekular

c. Struktur molekul miglobin dan hemoglobin d. Mekanisme transport oksigen dari protein

(34)

34 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

1) Jelaskan struktur protein (miosin dan aktin) dalam jaringan otot 2) Jelaskan mekanisme gerakan dalam otot secara molekuler

3) Gambarkan molekul mioglobin dengan gugus heme dan interaksinya dengan protein 4) Jelaskan fungsi mioglobulin

5) Gambarkan molekul dari hemoglobin 6) Jelaskan fngsi hemoglobin

- Mahasiswa membuat ringkasan protein sebagai penggerak dan pembawa oksigen 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian peran protein sebagai penggerak dan pembawa oksigen

(35)

35 berdiskusi

TOTAL

kreativitas

baru)

(36)

36

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami fungsi protein sebagai antibodi, saluran signal molekul dan transport senyawa melalui membran B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Fungsi protein sebagai antibodi, saluran signal dan transport senyawa melalui membran 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur kimia molekul antibodi b. Struktur kimia molekul saluran signal

c. Struktur kimia molekul transport melalui membran 3. Metode/Cara Pengerjaan (acuan cara pengerjaan):

1) Jelaskan struktur molekul antibodi dan mekanisme kerjanya.

2) Sebutkan dan gambarkan dua protein yang berfungsi sebagai penuerus signal (signal transduction) 3) Sebutkan dan gambarkan dua protein yang berfungsi sebagai pengantar molekul melewati membran - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang fungsi fungsi protein sebagai antibodi

- Praktikum analisa protein dengan gel elektroforesis sesuai dengan pedoman praktikum 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian antibodi Laporan praktikum

(37)

TOTAL

KRITERIA 2: Kualitas ringkasan hasil kajian perorangan dan laporan praktikum 50%)

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR Kelengkapan gambar/diagram Sangat lengkap (mampu mengembangkan konsep secara optimal) Lengkap (melebihi konsep minimal pada modul) Cukup lengkap (sesuai konsep minimal pada modul) Kurang lengkap (dibawah konsep minimal pada modul) Tidak lengkap (konsep tidak sesuai) Ketepatan gambar / diagram Sangat tepat (sesuai dengan

(38)

38 logika ilmiah)

kreativitas

baru)

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul lipida dan fungsinya dalam biokimia B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Lipida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Klasifikasi lipida

(39)

1) Jelaskan pengelompokan senyawa senyawa lipida 2) Gambarkan struktur molekul asam lemak

3) Jelaskan pengelompokan asam lemak 4) Gambarkan struktur molekul triasil gliserol

5) Gambarkan struktur molekul umum gliserofosfolipida 6) Jelaskan sifat sifat dan fungsi gliserofosfolipida 7) Jelaskan struktur molekul dan fungsi spingolipida 8) Jelaskan struktur umum steroid

9) Sebutkan beberapa jenis steroid yang penting - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang senyawa lipida 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian senyawa lipida

DIMENSI Sangat Memuaskan (≥80) Memuaskan (65-79) Batas (55-64) Kurang Memuaskan (40-54) Di bawah standard (<40) SKOR

(40)

40 Keaktifan mencari

literatur

TOTAL

kreativitas

baru)

(41)

41

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur membran dalam sel B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul Polisakarida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur membran dalam sel b. Fungsi membran dalam biokimia

1) Jelaskan proses pembentukan membran dalam sel dan pergeseran molekul fosfolipida dalam membran 2) Jelaskan manfaat kompartemen dalam sel

3) Jelaskan struktur membran dan hubungannya dengan berbagai senyawa protein kompleks 4) Jelaskan mekanisme gerak molekul protein dalam membran

5) Jelaskan trnsport glukosa melalui membran - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang membran dan mekanisme fungsi fungsi membran dalam sel 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian struktu membran, fungsi membran dan mekanisme transport melalui membran Hasil tes formatif (perorangan) yang dilaksanakan selama 10 menit terakhir pada tahap ini.

(42)

TOTAL

(43)

43 logika ilmiah)

kreativitas

baru)

(44)

44

FORMAT RANCANGAN TUGAS Nama Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul nukleotida dan fungsinya dalam sel B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul nukleotida 2. Batasan yang harus dikerjakan:

a. Struktur kimia molekul nukleotida

1) Jelaskan struktur umum nukleotida, gugus fungsi apa yang terlibat dalam penyusunannya 2) Jelaskan pengelompokan basa dan gambarkan basa basa yang biasanya menyusun nukleotida 3) Gambarkan struktur molekul nukleosida

4) Sebutkan sifat sifat molekul nukleotida 5) Sebutkan empat fungsi utama nukleotida - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur nukleotida 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian struktur dan fungsi molekul nukleotida dalam sel

(45)

TOTAL

(46)

46 logika ilmiah)

kreativitas

baru)

FORMAT RANCANGAN TUGAS Nama Mata Kuliah : Struktur dan Fungsi

Biomolekul

Sks : 3 (2-1)

Memahami struktur molekul DNA dan RNA B. URAIAN TUGAS:

1. Obyek Garapan: Molekul DNA dan RNA 2. Batasan yang harus dikerjakan:

(47)

1) Jelaskan perbedaan struktur DNA dan RNA

2) Jelaskan ikatan kimia antara basa basa dalam DNA dan RNA 3) Jelaskan struktur molekul DNA, doobel heliks, kromosom dan gen 4) Jelaskan fungsi DNA

5) Sebutkan jenis jenis dan fungsi RNA

6) Jelaskan proses penentuan urut-urutan basa dalam molekul DNA - Hasil diskusi kelompok didiskusikan di kelas

- Mahasiswa membuat ringkasan tentang struktur nukleotida 4. Deskripsi Luaran tugas yang dihasilkan:

Ringkasan hasil kajian struktur dan fungsi molekul DNA dan RNA

(48)

48 berdiskusi

TOTAL

kreativitas

baru)

(49)

49

GARIS BESAR MATERI PEMBELAJARAN

No. Pertemuan Materi Pembelajaran Garis Besar Materi Pembelajaran

1. 1 Penjelasan Umum

Pelaksanaan Perkuliahan

Pertemuan membahas capaian pembelajaran, metode dan strategi dalam pembelajaran, evaluasi, serta tugas-tugas yang akan dicapai selama pembelajaran

2. 2 Konsep Dasar Biokimia Pertemuan ini akan membahas konsep dasar Biologi Konservasi yang terdiri dari: - Jenis jenis sel

- Struktur sel

- Bahan biomolekul dalam sel 3. 3 Struktur molekul air dan

fungsinya dalam sel

Pertemuan ini akan membahas: - Struktur molekul air

- Peran air sebagai pelarut dalam sel - Peran bufer dalam reaksi biokimia 4. 4 Struktur molekul

monosakarida

Pertemuan ini akan membahas: - Sruktur molekul glukosa

- Gugus fungsi utama dalam glukosa - Klasifikasifikasi monosakarida

- Struktur senyawa senyawa turunan monosakarida - Fungsi monosakarida dalam sel

5. 5 Struktur molekul oligosakarida

Pertemuan ini akan membahas: - Jenis jenis oligosakarida

- Kompleks oligosakarida dang fungsi biologinya 6. 6 Struktur molekul

polisakarida

Pertemuan ini akan membahas: - Struktur beberapa polisakarida - Fungsi polisakarida dalam sel - Polisakarida kompleks

7. 7 Struktur molekul asam amino

Pertemuan ini akan membahas: - Struktur molekul asam amino

(50)

50

- Pengelompokan dan sifat sifat asam amino - Fungsi asam asam asam mino dalam sel 8. 8 Struktur molekul protein Pertemuan ini akan membahas:

- Ikatan peptida dan struktur molekul protein - Struktur primer protein

- Struktur sekunder protein - Struktur tertier protein

- Proses pelipatan molekul protein

9 9 Enzim Pertemuan ini akan membahas:

- Fungsi protein sebagai enzim - Klasifikasi enzim

- Mekanisme kerja enzim 10 10 Kontrol kerja enzim Pertemuan ini akan membahas:

- Kinetika enzim

- Proses penentuan kontrol enzim - Mekanisme kontrol enzim 11 11 Fungsi protein sebagai

penggerak

Pertemuan ini akan membahas: - Fungsi protein sebagai penggerak - Mekanisme kerja gerak otot

- Struktur molekul mioglobin dan hemoglobin - Mekanisme transport oksigen oleh protein 12 12 Fungsi protein sebagai

antibodi, saluran signal dan transport melalui membran sel

Pertemuan ini akan membahas:

- Struktur molekul antibodi dan mekanisme kerjanya - Protein sebagai media penerus signal

- Fungsi protein sebagai pengantar molekul dalam membran 13 13 Struktur dan fungsi lipida Pertemuan ini akan membahas:

- Pengelompokan senyawa senyawa lipida - Struktur molekul asam lemak

- Struktur molekul triasil gliserol

- Struktur molekul gliserofosfolipida dan fungsinya - Struktur molekul steroid dan fungsinya

(51)

51 14 14 Struktur dan fungsi

membran

Pertemuan ini akan membahas: - Struktur membran dalam sel

- Hubungan membran dan protein dalam sel - Mekanisme transport glokosa melewati membran 15 15 Struktur dan fungsi

nukleotida

Pertemuan ini akan membahas:

- Struktur molekul nukleotida dan beberapa jenis nukleotida - Sifat sifat nukleotida

- Fungsi beberapa senyawa nukleotida 16 16 Struktur dan fungsi DNA

dan RNA

Pertemuan ini akan membahas: - Struktur molekul DNA dan RNA - Pembentukan double helix pada DNA - Struktur kromosom dan gen

- Klasifikasi RNA