در ﭘﺴﺘﺎﻧﺪارن ﺗﺤﻠﯿﻞ ﺑﯿﻮاﻧﻔﻮرﻣﺎﺗﯿﮏ ژن ﺷﻨﺎﺳﺎﯾﯽ وﺗﺠﺰﯾﻪ

(1)

ﻪﯾﺰﺠﺗو ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ نژ ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧاﻮﯿﺑ ﻞﯿﻠﺤﺗ

TLR4

نراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ رد

ﻖﯾﺮﻗ يﺮﻔﺻ دواد

يﻮﺠﺸﻧاد ﻊﻄﻘﻣ ﯽﺳﺎﻨﺷرﺎﮐ ﺪﺷرا ﮏﯿﺘﻧژ و حﻼﺻا داﮋﻧ

،ماد هوﺮﮔ مﻮﻠﻋ

،ﯽﻣاد هﺎﮕﺸﻧاد ﻖﻘﺤﻣ ﯽﻠﯿﺑدرا

[email protected] ﻖﯾرﻮﯾا ﺖﯾاﺪﻫ ﺖﻤﻌﻧ

،رﺎﯿﺸﻧاد هوﺮﮔ مﻮﻠﻋ

[email protected] ﯽﻔﯾﺮﺷ ﺪﯿﺳ ﺎﺿر

[email protected] شﻮﯾرادﺮﯿﻣ يرﻮﮑﺷ

يﺪﺣاو ﺪﯿﺣو

،رﺎﯾدﺎﺘﺳا هوﺮﮔ مﻮﻠﻋ

هدازﺎﻗآ ﻼﯿﻟ

ﯽﺳﺎﻨﺷرﺎﮐ ﻪﺘﺧﻮﻣآ ﺶﻧاد ﺪﺷرا

ﮏﯿﺘﻧژ و حﻼﺻا داﮋﻧ

،ماد هوﺮﮔ مﻮﻠﻋ

[email protected] ﺪﺳارﻮﭘ يﺮﺒﮐ

،ماد ﻪﯾﺬﻐﺗ يﺮﺘﮐد يﻮﺠﺸﻧاد ناﺮﻬﺗ هﺎﮕﺸﻧاد

هﺪﯿﮑﭼ هﺪﻧﺮﯿﮔ ﻖﯾﺮﻃ زا ﻢﺟﺎﻬﻣ يﺎﻫ نژﻮﺗﺎﭘ ﺺﯿﺨﺸﺗ لﻮﺌﺴﻣ ﯽﻨﻤﯾا ﻢﺘﺴﯿﺳ يﺎﻫ لﻮﻠﺳ ﺎﺑ هاﺮﻤﻫ لﺎﯿﻠﺘﯿﭘا يﺎﻫ لﻮﻠﺳ ،نﺎﺘﺴﭘ هﺪﻏ رد ) يﺎﻫ زا عﻮﻧ هد. ﺪﻨﺘﺴﻫ (TLRs

) ﻒﻠﺘﺨﻣTLR ﺎﺗTLR1

TLR10 ﺺﯿﺨﺸﺗ .ﺖﺳا هﺪﺷ ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ ﺎﻫوﺎﮔ رد ( ﻂﺳﻮﺗPAMP

ﮓﻨﯿﻟﺎﻨﮕﯿﺳ يﺎﻫﺮﯿﺴﻣ دﺎﺠﯾا و ﺎﻫTLR ﻞﯿﻓوﺮﺗﻮﻧ ﻪﻠﻤﺟ زا ،ﺎﻫ لﻮﻠﺳ زا ﯽﯾﺎﯿﻤﯿﺷ تﺮﺟﺎﻬﻣ ﺪﻧاﻮﺗ ﯽﻣ ﻦﯿﮐﻮﺘﯿﺳ ﺪﯿﻟﻮﺗ دﺎﺠﯾا ياﺮﺑ

نژ ﯽﺳرﺮﺑ ﻪﺑ ﻪﻌﻟﺎﻄﻣ ﻦﯾا رد ﺪﻫد ﺶﯾاﺰﻓا ار ﺖﻧﻮﻔﻋ ﻞﺤﻣ ﺎﺗ نآ فاﺮﻃا ﯽﻧﻮﺧ قوﺮﻋ زا ،ﺎﻫژﺎﻓوﺮﮐﺎﻣ و ﺎﻫ زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑTLR4

زا هﺪﻣآ ﺖﺳﺪﺑ يﺎﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ﺎﺑ نآ ﻪﺴﯾﺎﻘﻣ و ﯽﺑﺎﯾ ﯽﻟاﻮﺗ .ﺪﺷ ﻪﺘﺧادﺮﭘNCBI

ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ ﻪﺑ ﺮﺠﻨﻣ ﺎﻫ هداد ﺰﯿﻟﺎﻧآ 26

ﺎﺑ و ﭗﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ

ﯽﭙﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ عﻮﻨﺗ 951

/0 .ﺪﺷﺎﺑ ﯽﻣ ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﻦﯿﺑ ﻻﺎﺑ ﯽﮑﯿﺘﻧژ عﻮﻨﺗ ياراد ﻪﮐ .ﺪﺷ نژ ﻪﮑﻨﯾا ﻪﺑ ﻪﺟﻮﺗ ﺎﺑ

TLR4 ﯽﻤﯿﻘﺘﺴﻣ طﺎﺒﺗرا

ﻂﯾاﺮﺷ ﺎﺑ يرﺎﮔزﺎﺳ ﯽﻠﯿﻟد ﻪﺑ توﺎﻔﺗ دﺎﺠﯾا ﺪﺳر ﯽﻣ ﺮﻈﻨﺑ دراد ﯽﻔﻠﺘﺨﻣ يﺎﻫرﺎﻤﯿﺑ و تﺎﺑﺎﻬﺘﻟا ﺎﺑ ﺖﻣوﺎﻘﻣ ﻆﻔﺣ ﺖﻬﺟ رد ﻒﻠﺘﺨﻣ

.ﺪﻫد ﺶﯾاﺰﻓا يرﺎﮔﺪﻧﺎﻣ ياﺮﺑ ار ماد ﯽﮕﺘﺴﯾﺎﺷ ﻖﯾﺮﻃ ﻦﯾازا ﺎﺗ ﺪﺷﺎﺑ ﯽﺑﺎﻬﺘﻟا و يرﺎﻤﯿﺑ يﺎﻫﺮﺘﺳا ﻒﻠﺘﺨﻣ عاﻮﻧا ﻪﺑ ماد نژ

TLR4

.ﺪﺷﺎﺑ ﻪﻧﻮﮔ ﻦﯿﺑ ﯽﻠﻣﺎﮑﺗ تﺎﻌﻟﺎﻄﻣ ياﺮﺑ بﻮﺧ ياﺪﯾﺪﻧﺎﮐ نژ ﮏﯾ ﺪﻧاﻮﺗ ﯽﻣ نژ :يﺪﯿﻠﮐ تﺎﻤﻠﮐ

،TLR4 ،ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧاﻮﯿﺑ ،ﯽﭙﯾﺎﺗﻮﻠﭘﺎﻫ ﻂﺑاور .ﯽﻠﻣﺎﮑﺗ تﺎﻌﻟﺎﻄﻣ

(2)

2

۱ ﻪﻣﺪﻘﻣ .

زوﺮﻣا ه ﯽﻠﮑﻟﻮﻣ ﯽﺳﺎﻨﺷ ﺖﺴﯾز ﻪﻨﯿﻣز رد ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧاﻮﯿﺑ ﮏﯿﻨﮑﺗ زا ﻪﮐ هﺪﺷ ﻞﯾﺪﺒﺗ ﯽﺳﺎﻨﺷ ﺖﺴﯾز زا ﯽﻤﻬﻣ ﺶﺨﺑ ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧاﻮﯿﺑ

هداد زا ﺪﯿﻔﻣ ﺞﯾﺎﺘﻧ جاﺮﺨﺘﺳا و ﺎﻫ لﺎﻨﮕﯿﺳ شزادﺮﭘ،يرادﺮﺑ ﺮﯾﻮﺼﺗ ياﺮﺑ ﺎﻫ

هدﺎﻔﺘﺳا مﺎﺧ ي ﯽﻣ

ﮏﯿﻣﻮﻧژ و ﮏﯿﺘﻧژ ﻪﻨﯿﻣز رد ﺎﻣا دﻮﺷ

ﯽﻟاﻮﺗ ﻦﯿﯿﻌﺗ ياﺮﺑ ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧا ﻮﯿﺑ ﮏﯿﻨﮑﺗ زا .دﻮﺷ ﯽﻣ هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﻫ نژ ﺮﯿﺴﻔﺗ و

ﯽﻣ ﺎﻣ ﮏﯿﻨﮑﺗ ﻦﯾازا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ ﯽﻠﭘ ﻢﯿﻧاﻮﺗ

ﺮﮕﯾد فﺮﻃ زا .ﺖﺳا توﺎﻔﺘﻣ ﺎﻫ ﻪﻧﻮﮔ نورد و ﻦﯿﺑ توﺎﻔﺗ و ﺖﻫﺎﺒﺷ .ﻢﯿﻨﮐ ﻪﻌﻟﺎﻄﻣ ار ﺎﻫ نژ نﺎﯿﺑو (نژ ﯽﻠﮑﺷﺪﻨﭼ) ﻢﺴﯿﻓرﻮﻣ هﺪﺷ نﺎﮔﺪﻨﻨﮐراﻮﺨﺸﻧ رد ﺎﻫ نژ ﯽﻠﮑﺷ ﺪﻨﭼ يﺎﻫ هﺎﮕﯾﺎﺟ ﻒﺸﮐ ﻪﺑ ﺮﺠﻨﻣ ﯽﮑﯿﺘﻧژ يرادﺮﺑ ﻪﺸﻘﻧ ﻪﮐ

ياﺮﺑ ناﻮﺗ ﯽﻣ ﺮﻣا ﻦﯾا زا

ﻪﻣﺎﻧﺮﺑ ﺑ يﺰﯾر ﺮﮐ دﺎﻔﺘﺳا ﺎﻫ ماد داﮋﻧ حﻼﺻا ياﺮ د

. [1]

ﺎﻫ لﻮﻠﺳ ،نﺎﺘﺴﭘ هﺪﻏ رد ي

ﭘا ﯿ ﻠﺘ ﯿ لﺎ ﺎﻫ لﻮﻠﺳ ﺎﺑ هاﺮﻤﻫ ي

ﺳ ﯿ ﻢﺘﺴ اﯾ ﻨﻤ ﯽ ﺨﺸﺗ لﻮﺌﺴﻣ ﯿ

ﺺ نژﻮﺗﺎﭘ ﺎﻫ ي ﺮﻃ زا ﻢﺟﺎﻬﻣ ﯾ

ﻖ

ﮔﯿ هﺪﻧﺮ ﺎﻫ ي ) ﺪﻨﺘﺴﻫ (TLRs ﺎﻬﻧآ ﻦﯾﺮﺘﻤﻬﻣ ﻪﻠﻤﺟ زا ﻪﮐ

ﯽﻣ TLR4 ﺪﻨﺷﺎﺑ ] 2 [.

اﯾ ﻦ ﮔ ﯿ هﺪﻧﺮ ﺎﻫرﺎﺘﺧﺎﺳ ﺎﻫ ي

ﻤﺋاد ﯽ

ﻣﯿ ﻧﺎﮔراوﺮﮑ ﯿ ﻢﺴ ﺎﻫﻮﮕﻟا مﺎﻧ ﻪﺑ ار ﺎﻫ ي

ﮔﺪﻨﮐاﺮﭘ ﯽ ) نژﻮﺗﺎﭘ ﺎﺑ ﻂﺒﺗﺮﻣ ﺨﺸﺗ (PAMP

ﯿ ﺺ ا ﻞﻣﺎﮐ ﺶﻨﮐاو و هداد ﯾ

ژﻮﻟﻮﻧﻮﻤ ﯾ ﮏ ﻣ زﺎﻏآ ار ﯽ

ﺨﺸﺗ .ﺪﻨﻨﮐ ﯿ

ﺺ ﻂﺳﻮﺗ PAMP

ا و ﺎﻫ TLR ﯾ دﺎﺠ ﺴﻣ ﯿ ﺎﻫﺮ ي ﺳ ﯿ ﻟﺎﻨﮕ ﯿ ﮓﻨ اﺮﺑ ي اﯾ دﺎﺠ ﻟﻮﺗ ﯿ ﺪ ﺳ ﯿ ﮐﻮﺘ ﯿ ﻦ ﻣ ﯽ تﺮﺟﺎﻬﻣ ﺪﻧاﻮﺗ

ﺷ ﯿ ﻤ ﯿﺎ ﯽﯾ لﻮﻠﺳ زا

،ﺎﻫ ﻓوﺮﺗﻮﻧ ﻪﻠﻤﺟ زا ﯿ

ﻞ ﻧﻮﺧ قوﺮﻋ زا ،ﺎﻫژﺎﻓوﺮﮐﺎﻣ و ﺎﻫ ﯽ

اﺰﻓا ار ﺖﻧﻮﻔﻋ ﻞﺤﻣ ﺎﺗ نآ فاﺮﻃا ﯾ

ﺶ ﺪﻫد . [3]

هد ) ﻒﻠﺘﺨﻣTLR

ﺎﺗTLR1 TLR10 ﺎﺳﺎﻨﺷ ﺎﻫوﺎﮔ رد ( ﯽﯾ

.ﺖﺳا هﺪﺷ رد

ﻣ ﯿ نﺎ ﺎﻬﻧژ ،ﺎﻬﻧآ ي ،TLR2 ،TLR4 وTLR6

TLR9

ﺘﺳﺎﻣ ﺮﺑاﺮﺑ رد ﺖﻣوﺎﻘﻣ ﺎﺑ طﺎﺒﺗرا رد ﯿ

ﺖ ا رد و ﺎﻫ وﺎﮔ رد ﯾ

ﻨﻤ ﯽ ﺗاذ ﯽ .ﺪﻧراد ﺶﻘﻧ و TLR2

ﺎﻫ لﻮﮑﻟﻮﻣ TLR4 ي

ﺮﺘﮐﺎﺑ ﯾﺎ ﯽﯾ ار

ﺨﺸﺗ ﯿ ﺺ ﻣ ﯽ ا ﺦﺳﺎﭘ رد و ﺪﻨﻫد ﯾ

ﻨﻤ ﯽ ﺮﺘﮐﺎﺑ ﻪﺑ ﺖﺒﺴﻧ ي

ﺎﻫ ي ﻔﻨﻣ مﺮﮔ و ﺖﺒﺜﻣ مﺮﮔ ﯽ

.ﺪﻨﺘﺴﻫ سﺎﺴﺣ ﻦﯾﺎﺘﺸﻠﻫ وﺎﮔTLR2

ﻪﺑ

ﺘﺳرد ﯽ ﻣ ﯽ ﺳ ﺪﻧاﻮﺗ ﯿ لﺎﻨﮕ ﺎﻫ ي Staphylococcus aurous و

Escherichia coli ﺪﻫد لﺎﻘﺘﻧا ار

[4] TLR6 .

ﺎﺑ طﺎﺒﺗرا رد

ﻃTLR2 ﯿ ﻒ ا هدﺮﺘﺴﮔ ي اﺰﺟا زا ي د ﯾ هراﻮ ﻟﻮﻠﺳ ﯽ ﺮﺘﮐﺎﺑ ﯾﺎ ﯽﯾ ﻟ ﻪﻠﻤﺟ زا ﯿ ﻠﭘﻮﭙ ﯽ رﺎﮐﺎﺳ ﯾﺪ ﻟ ،ﺎﻫ ﯿ ﺌﺗوﺮﭘﻮﭙ ﯿ ﻦ ﺳا و ﺎﻫ ﯿ ﺪ ﺗ ﯿ ﺋﻮﮑ ﯿ ﮏ ار

ﺨﺸﺗ ﯿ ﺺ ﻣ ﯽ ﺪﻫد . [5]

دTLR9 ﯾ ﺗﻮﺌﻠﮐﻮﻨ ﯿ ﺪ ﻏCpG ﯿ ﺮﺘﻣﺮ ﯾﻠ ﯽ ﺎﻫ DNA ي ﺮﺘﮐﺎﺑ ﯾﺎ ﯽﯾ ﺎﺳﺎﻨﺷ ار ﯽﯾ ﻣ ﯽ ﺪﻨﮐ ﻦﯾا ﻦﯾاﺮﺑﺎﻨﺑ .[6]

يﺎﻬﻧژ ﺮﺑاﺮﺑ رد ﺖﻣوﺎﻘﻣ ياﺮﺑ ﯽﺒﺳﺎﻨﻣ دﺰﻣﺎﻧTLR

نﺎﺘﺴﭘ مرو يﺎﻫوﺎﮔ رد

يﺮﯿﺷ .ﺪﻨﺘﺴﻫ ﺎﺑ ﻪﻌﻟﺎﻄﻣ ﻦﯾا اﺬﻟ رﺎﺘﺧﺎﺳ ﯽﺳرﺮﺑ فﺪﻫ

ژ ن .ﺪﺷ مﺎﺠﻧا نژ ﻦﯾا يا ﻪﻌﺳﻮﺗ و ﯽﻠﻣﺎﮑﺗ ظﺎﺤﻟ زا ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﺮﯾﺎﺳ ﺎﺑ نآ ﻪﺴﯾﺎﻘﻣ و يﺮﯿﺷ يﺎﻫوﺎﮔ ردTLR4

2 . ﺎﻫ شور و داﻮﻣ

نﻮﺧ ﻪﻧﻮﻤﻧ ﻖﯿﻘﺤﺗ ﻦﯾا ياﺮﺟا ياﺮﺑ 100

ﻊﻤﺟ نﺎﻐﻣ ﺖﻌﻨﺻ و ﺖﺸﮐ يﺮﯿﺷ يﺎﻫوﺎﮔ زا سار .ﺪﻧﺪﺷ يروآ

ﻪﯿﻠﮐ ﻪﻧﻮﻤﻧ يﺎﻫ زا نﻮﺧ

ﯽﻧدﺮﮔ گﺮﻫﺎﯿﺳ ﻪﯿﻬﺗ

يﺎﻣد رد جاﺮﺨﺘﺳا نﺎﻣز ﺎﺗ و هﺪﺷ 20

- ﯽﺘﻧﺎﺳ ﻪﺟرد .ﺪﺷ يراﺪﻬﮕﻧ داﺮﮔ

ياﻮﺘﺤﻣ ﻞﮐ زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑDNA

جاﺮﺨﺘﺳا ﺖﯿﮐ شور ﺖﮐﺮﺷ ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ نﻮﺧ زاDNA

GenAll ﺖﯿﻔﯿﮐ و ﺖﯿﻤﮐ .ﺪﺷ جاﺮﺨﺘﺳا

جاﺮﺨﺘﺳا DNA شور ﻪﺑ هﺪﺷ

زرﺎﮔا لژ 8/

0 .ﺪﺷ هﺪﯿﺠﻨﺳ زﻮﻓ وﺮﺘﮑﻟا هﺎﮕﺘﺳد زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ ﺪﺻرد و

ﻪﺑ رﻮﻈﻨﻣ نژ زا ﺮﻈﻧ درﻮﻣ ﻪﯿﺣﺎﻧ ﺮﯿﺜﮑﺗ يﺎﻫﺮﮔزﺎﻏآ زاTLR4

لﻮﺼﺤﻣ ﺲﭙﺳ . ﺪﺷ هدﺎﻔﺘﺳا ﯽﺻﺎﺼﺘﺧا PCR

.ﺪﯾدﺮﮔ ﯽﺑﺎﯾ ﯽﻟاﻮﺗ ﺮﮕﻧﺎﺳ شور هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ هﺪﻣآ ﺖﺳﺪﺑ

يﺎﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ﺎﺑ ﻪﺑﺎﺸﻣ يﺎﻫ هداد ندروآ ﺖﺳد ﻪﺑ ﺖﻬﺟ رد ﺖﺳﻼﺑ شور زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑTLR4

ﯽﻟاﻮﺗ ﻪﺑ طﻮﺑﺮﻣ يﺎﻫ هدادNCBI

ﻞﮐ رد ﺪﯾدﺮﮔ لﺎﺼﺤﺘﺳا ﻒﻠﺘﺨﻣ نﺎﮔﺪﻨﻨﮔراﻮﺨﺸﻧ رد هﺪﺷ جاﺮﺨﺘﺳا يﺎﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ﺎﺑ ﻒﯾدﺮﻤﻫ يﺎﻫ 44

يﺎﻫداﮋﻧ ﻪﺑ طﻮﺑﺮﻣ ﯽﻟاﻮﺗ عﻮﻧ

ﻪﺒﺷ نژ ياﺮﺑ نﺎﮔﺪﻨﮔراﻮﺨﺸﻧ ﻒﻠﺘﺨﻣ لوﺪﺟ)TLR4

1 .ﺪﻣآ ﺖﺳد ﻪﺑ (

(3)

3

لوﺪﺟ 1 نژ ياﺮﺑ هﺪﻣآ ﺖﺳﺪﺑ يﺎﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ﯽﺳﺮﺘﺳد ﺪﮐ . زا

TLR4

NCBI هرﺎﻤﺷ

نژ ﯽﺳﺮﺘﺳد CDS ﯽﻟاﻮﺗ داﺪﻌﺗ ﻪﻧﻮﮔ

XM_012111214.- DQ922636.1- XM_012111214.2- GU461888.1-

GU461887.1- AM231300.- DQ922636. 500 7 Ovisaries

HQ263215- DQ922635.- HM627213.- HM627213.- LC463029-

LC463028- LC463027 500 7 caprahircus

HQ343416.- LC437955.- KM058708.- LC437954.- LC437953.-

LC437952 - LC437951 500 7 Bubalusbubalis

AH013178.- AB056444.- AF310952.- AY634630. - M_174198.6 -

XM_005210586.- XM_005210586. 500 7 Bostaurus

KX138607- JX276459.- HM219870.- EU386357.- JX276462 -

JX276461.- JX276460. 500 7 Bosindicus

34_T19-TLR4-F- 33_T85-TLR4-F- 32_T96-TLR4-F- 31_T26- TLR4-F30_T30-TLR4-F- 29_T91-TLR4-F- 28_T22-TLR4-F-

27_T84-TLR4-F- 26_T37-TLR4-F - 25_T76-TLR4-F 500 9 Holstein

هدﺎﻣا و ﯽﺑﺎﯾ ﯽﻟاﻮﺗ زا ﺲﭘ هداد يزﺎﺳ

ياﺮﺑ ،ﺎﻫ ﻢﻫ مﺮﻧ زا ﻮﻠﯿﻓ ﺖﺧرد ﻢﺳر و هﺪﺷ ﯽﺑﺎﯾ ﯽﻟاﻮﺗ تﺎﻌﻄﻗ ندﺮﮐ زاﺮﺗ راﺰﻓا

) Tamura et

al. 2011 (

MEGA 5 ﯽﻟاﻮﺗ ﻦﯾا رد دﻮﺟﻮﻣ تﺎﻋﻮﻨﺗ ندﺮﮐ ﺺﺨﺸﻣ ياﺮﺑ و ،

مﺮﻧ زا ﺎﻫ راﺰﻓا DnaSp ﻢﯿﺳﺮﺗ ﺖﻬﺟ ﺪﺷ هدﺎﻔﺘﺳا

راﺰﻓا مﺮﻧ زا ﺎﻫ ﭗﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ ﻪﮑﺒﺷ Network

ﺪﯾدﺮﮔ هدﺎﻔﺘﺳا

.

3 . ﺚﺤﺑ و ﺞﯾﺎﺘﻧ

ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ ﻪﺑ ﺮﺠﻨﻣ ﺎﻫ هداد ﮏﯿﺗﺎﻣرﻮﻔﻧا ﺰﯿﻟﺎﻧآ 26

ﯽﭙﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ عﻮﻨﺗ ﺎﺑ ﭗﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ 951

/0 .ﺪﯾدﺮﮔ ﺮﻈﻧ درﻮﻣ يﺎﻬﻣاد رد ﻒﻠﺘﺨﻣ نﻮﻣزآ

ﺎﻤﯿﺟﺎﺗ ﺶﻬﺟ سﺎﺳا ﺮﺑD

ﯽﻟاﻮﺗ رد ﯽﺜﻨﺧ يﺎﻫ ﯽﻣ ﺮﻈﻧ درﻮﻣ يﺎﻫ

ﺎﻤﯿﺟﺎﺗ ﻪﮐ ﯽﻧﺎﻣز رد .ﺪﺷﺎﺑ ﺮﻔﺻ ﺎﺑ ﺮﺑاﺮﺑ و ﺖﺴﯿﻧ راد ﯽﻨﻌﻣD

نﺎﺸﻧ ﺖﺳا ﻌﻤﺟ ﺖﺑﺎﺛ هزاﺪﻧا هﺪﻨﻫد

درﻮﻣ ﻪﮐ يﺎﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ﻦﯾا ياﺮﺑ ﺎﻤﯿﺟﺎﺗ ﺖﺴﺗ ﺪﺷﺎﺑ ﯽﻣ هﺎﮕﯾﺎﺟ نآ ياﺮﺑ بﺎﺨﺘﻧا ﭻﯿﻫ دﻮﺒﻧ و ﺖﯿ

ﺎﻤﯿﺟﺎﺗ .دﻮﺑ ﯽﻨﻌﻣ ﯽﺑ ﻦﺘﻓﺮﮔ راﺮﻗ ﻪﻌﻟﺎﻄﻣ قﻮﻓ نژ ﯽﻟاﻮﺗ ياﺮﺑ ﺖﺴﺗ D

-1.21152

ﯽﻤﻧ راد ﯽﻨﻌﻣ ﻪﮐ ﺪﯾدﺮﮔ شراﺰﮔ

)ﺪﺷﺎﺑ p<0.1 (.

ﯽﻟاﻮﺗ ياﺮﺑ ، راد نﺎﻫﻮﮐ يﺎﻫوﺎﮔ ﺖﯿﻌﻤﺟ

344 ﯿﻓرﻮﻣ ﯽﻠﭘ هﺎﮕﯾﺎﺟ دﺪﻋ ﮏ

347 توﺎﻔﺗ ﻦﯿﮕﻧﺎﯿﻣ ﺎﺑ ﺶﻬﺟ دﺪﻋ

يﺪﯿﺗﻮﺌﻠﮐﻮﻧ 99.429

) (K ﯽﮑﯿﺘﻧژ عﻮﻨﺗ و 0.22046

و ﺪﯾدﺮﮔ هﺪﻫﺎﺸﻣ ﺖﯿﻌﻤﺟ ﯽﻟاﻮﺗ ياﺮﺑ

، ﯽﯾﺎﭘورا يﺎﻫوﺎﮔ 318

هﺎﮕﯾﺎﺟ دﺪﻋ

ﮏﯿﻓرﻮﻣ ﯽﻠﭘ 318

يﺪﯿﺗﻮﺌﻠﮐﻮﻧ توﺎﻔﺗ ﻦﯿﮕﻧﺎﯿﻣ ﺎﺑ ﺶﻬﺟ دﺪﻋ 92.198

) ﯽﮑﯿﺘﻧژ عﻮﻨﺗو (K 0.20441

.ﺪﺷ هﺪﻫﺎﺸﻣ

رﺎﺗ ﯾ ﺦ شور زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ ﻞﻣﺎﮑﺗ UPGMA 1)

( ﻌﺗ ﯿﯿ ﻦ .ﺪﺷ ﺖﺧرد ﻬﺑ ﯿ ﻪﻨ = لﻮﻃ ﻪﺧﺎﺷ عﻮﻤﺠﻣ ﺎﺑ 0.05522437

هداد نﺎﺸﻧ

.ﺖﺳا هﺪﺷ ﺎﻫ ﻪﻠﺻﺎﻓ

ي ﻠﻣﺎﮑﺗ ﯽ ﻟﺎﻤﺘﺣا شور زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ ﯽ

ﺮﺜﮐاﺪﺣ ﯽﯾﺎﻤﻨﺘﺳرد ﺎﭘ داﺪﻌﺗ ﺪﺣاو رد و هﺪﺷ ﻪﺒﺳﺎﺤﻣ

ﯾﻪ ﺎﻫ ي

ﺎﺟ ﯾ ﺰﮕ ﯾ ﻦ ﺎﺳ ﺮﻫ رد ﯾ ﺖ ﻣ راﺮﻗ ﯽ ﮔ ﯿ ﺪﻧﺮ . ا ﯾ ﻦ ﺰﺠﺗ ﯾﻪ ﻠﺤﺗ و ﯿ ﻞ 44 ﻟاﻮﺗ ﯽ ﺗﻮﺌﻠﮐﻮﻧ ﯿ ﺪ ي ﻣ ﻞﻣﺎﺷ ار ﯽ

.دﻮﺷ ﻌﻗﻮﻣ مﺎﻤﺗ ﯿ

ﺖ ﺎﻫ ي ﻢﻬﺒﻣ

اﺮﺑ ي ﺮﻫ ﯽﻟاﻮﺗ ) optionwise deletion pair .ﺪﻧﺪﺷ فﺬﺣ (

ﺎﻋﻮﻤﺠﻣ 428 ﻌﻗﻮﻣ ﯿ ﺖ ﺎﻬﻧ هداد ﻪﻋﻮﻤﺠﻣ رد ﯽﯾ

ﺖﺷاد دﻮﺟو .

(4)

4

ﯽﯾاﺮﮔاو ﺺﺧﺎﺷDXY ﻦﯾﺮﺘﮐﺰﺑ ياراد نژ ﻪﮐ ﺖﺳا ﯽﻟاﻮﺗ نﺎﯿﻣ رد ﺎﯾ ﻦﯿﺑDNA

ﺮﺑو دراد ار ﯽﮑﯿﺘﻧژ ﻪﻠﺻﺎﻓ ﻦﯾﺮﺘﮑﭼﻮﮐDXY

سﺎﺳا ﻪﺑ طﻮﺑﺮﻣ ﯽﮑﯿﻧژﻮﻠﯿﻓ ﺖﺧرد ﮏﯾDXY

44 زا ﯽﻟاﻮﺗ 6 ﻞﮑﺷ رد ﻪﻧﻮﮔ 1

ﻪﺒﺷ نژ ﺖﺳا هﺪﺷ ﻢﯿﺳﺮﺗ رد ﻦﯾﺎﺘﺸﻠﻫTLR4

.دﻮﺑ هوﺮﮔ نآ رد سﻮﮔﺪﻨﯾا سﻮﺑ و سورﺎﺗ سﻮﺑ ﻪﮐ دراد راﺮﻗ ﯽﻫوﺮﮔ ﻧا ﻪﻋﻮﻤﺠﻣ رد

زا هﺪﺷ مﺎﺠﻧا ﺰﯿﻟﺎ 6

نﺎﮔﺪﻨﻨﮔراﻮﺨﺸﻧ ﺖﯿﻌﻤﺟ

زا يﺪﻨﯾﺎﻤﻧ هوﺮﮔﺮﻫ رد ﻪﮐ.ﺪﺷ ﻢﯿﺴﻘﺗ هوﺮﮔ ﻪﺳ ﻪﺑ 6

ﻪﺒﺷ نژ ﯽﮑﯿﺘﻧژ يﻻﺎﺑ عﻮﻨﺗ هﺪﻨﻫد نﺎﺸﻧ ﻦﯾا ﻪﮐ ﺖﺷاد رﻮﻀﺣ ﺖﯿﻌﻤﺟ

.ﺖﺳا ﯽﺳﺮﺑ درﻮﻣ يﺎﻫ ﻪﻧﻮﮔ ﻦﯿﺑ ردTLR4

ﻞﮑﺷ 1 .

نژ زا هﺪﺷ ﻢﯿﺳﺮﺗ ﯽﮑﯿﺘﻧژﻮﻠﯿﻓ ﺖﺧرد .ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﻦﯿﺑ ردTLR4

(5)

5

ﻪﻧﻮﮔ رد ﯽﭙﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ ﻂﺑاور ﻪﮑﺒﺷ راﺰﻓا مﺮﻧ زا هدﺎﻔﺘﺳا ﺎﺑ ﯽﺳرﺮﺑ درﻮﻣ يﺎﻫ

Network

ﻻﺎﺑ ﯽﻧاواﺮﻓ ﺎﺑ ﭗﯾﺎﺗﻮﻠﭘﺎﻫ .ﺖﺳا هﺪﺷ ﻢﺳر

ﺖﻣﻼﻋ .ﺪﻧداد نﺎﺸﻧ ار يﺮﺘﮑﭼﻮﮐ هﺮﯾاد ﻦﯿﯾﺎﭘ ﯽﻧاواﺮﻓ ﺎﺑ يﺎﻫ ﭗﯾﺎﺗﻮﻠﭘﺎﻫ و ﺮﺘﮔرﺰﺑ هﺮﯾاد دﻮﺟو هﺪﻨﻫد نﺎﺸﻧ ﻪﮑﺒﺷ رد ﺎﻫmv

ﭗﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ ﻪﻧﻮﻤﻧ رد ﻪﮐ ﺖﺳا هﻮﻘﻟﺎﺑ

ﻞﮑﺷ زا ﻪﮐ رﻮﻄﻧﺎﻤﻫ .ﺖﺳا هﺪﺸﻧ هﺪﻫﺎﺸﻣ ﺎﻣ يﺎﻫ 1

و 2 و ﺪﻨﻔﺳﻮﮔ ﺪﻧﻮﺷ ﯽﻣ طﺎﺒﻨﺘﺳا

رد ﺰﺑ

ﻢﻫ ﻪﺑ ﮏﯾدﺰﻧ ﺶﯿﻣوﺎﮔ هاﺮﻤﻫ ﻪﺑ نﺎﻫﻮﮐ نوﺪﺑ يﺎﻫوﺎﮔ و راد نﺎﻫﻮﮐ يﺎﻫوﺎﮔ ﯽﻟﺎﺣ رد ﺪﻧﺪﺷ يﺪﻨﺑ ﻪﺘﺳد ﻒﻠﺘﺨﻣ ﺮﺘﺳﻼﮐ ود .دﻮﺷ ﯽﻣ هﺪﻫﺎﺸﻣ

ﻞﮑﺷ 2 ﺎﻫ ﮓﯿﺗﻮﻠﭘﺎﻫ يا ﻪﮑﺒﺷ ﺰﯿﻟﺎﻧآ . نژ رد هﺪﺷ ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ ي

TLR4 .ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﻦﯿﺑ

نژ ﺪﺳر ﯽﻣ ﺮﻈﻨﺑ ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﻦﯿﺑ ﻒﻠﺘﺨﻣ يﺎﻫ ﺶﻬﺟ ﯽﯾﺎﺳﺎﻨﺷ و ﻪﺘﻓﺮﮔ مﺎﺠﻧا ﺰﯿﻟﺎﻧآ سﺎﺳاﺮﺑ عﻮﻨﺗ زا ناراﺪﻧﺎﺘﺴﭘ ﻦﯿﺑ ردTLR4

دﺎﺠﯾا ﺪﺳر ﯽﻣ ﺮﻈﻨﺑ دراد ﯽﻔﻠﺘﺨﻣ يﺎﻫرﺎﻤﯿﺑ و تﺎﺑﺎﻬﺘﻟا ﺎﺑ ﯽﻤﯿﻘﺘﺴﻣ طﺎﺒﺗرا ﻪﮑﻨﯾا ﻪﺑ ﻪﺟﻮﺗ ﺎﺑ و ﺖﺳا رادرﻮﺧﺮﺑ ﯽﯾﻻﺎﺑ ﯽﮑﯿﺘﻧژ ﻦﯾازا ﺎﺗ ﺪﺷﺎﺑ ﯽﺑﺎﻬﺘﻟا و يرﺎﻤﯿﺑ يﺎﻫﺮﺘﺳا ﻒﻠﺘﺨﻣ عاﻮﻧا ﻪﺑ ماد ﺖﻣوﺎﻘﻣ ﻆﻔﺣ ﺖﻬﺟ رد ﻒﻠﺘﺨﻣ ﻂﯾاﺮﺷ ﺎﺑ يرﺎﮔزﺎﺳ ﯽﻠﯿﻟد ﻪﺑ توﺎﻔﺗ ﻃ .ﺪﻫد ﺶﯾاﺰﻓا يرﺎﮔﺪﻧﺎﻣ ياﺮﺑ ار ماد ﯽﮕﺘﺴﯾﺎﺷ ﻖﯾﺮ

ﻊﺟاﺮﻣ [1]Jing-FenK; Yang, F; Luo, JY; Wang, XR; Liu, LH and Li, HS (2008). Influences of season, parity, lactation, udder area, milk yield, and clinical symptoms on intramammary infection in dairy cows. J.

Dairy Sci., 99: 1- 10.

[۲]Alva-Murillo, N; Ochoa-Zarzosa, A and López-Meza, JE (2017). Sodium octanoate modulates the innate immune response of bovine mammary epithelial cells through the TLR2/P38/JNK/ERK1/2

(6)

6

pathway: implications during Staphylococcus aureus internalization front. Cell. Inf. Microbiol., 7: 78 [۳]Cates, EA; Connor, EE; Mosser, DM and Bannerman, DD (2009). Functional characterization of bovine TIRAP and MyD88 in mediating bacterial lipopolysaccharide-induced endothelial NF-kappa B activation and apoptosis. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis., 32: 477-490.

[٤]Yang, W; Zerbe, H; Petzl, W; Brunner, RM; Günther, J; Draing, C; von Aulock, S; Schuberth, HJ and Seyfert, HM (2008). Bovine TLR2 and TLR4 properly transduce signals from Staphylococcus aureus and E. coli, but S. aureus fails to both activate NF-kappa B in mammary epithelial cells and to quickly induce TNF alpha and interleukin-8 (CXCL8) expression in the udder. Mol. Immunol., 45:

1385-1397.

[٥]Buwitt-Beckmann, U; Heine, H; Wiesmuller, KH; Jung, G; Brock, R; Akira, S and Ulmer, AJ (2006). TLR1- and TLR6-independent recognition of bacterial lipopeptides. J. Biol. Chem., 281:

9049-9057.

[6]Kant, R; de Vos, WM; Palva, A and Satokari, R (2014). Immunostimulatory CpG motifs in the genomes of gut bacteria and their role in human health and disease. J. Med. Microbiol., 63: 293-308.

(7)

7

Identification and bioinformatics analysis of TLR4 gene in Mammalian

D. safari^*, N. Hedayat, R. Seyedsharif, M.D. Shakouri, V. Vahedi, K. Pourasad Department of Animal Science, Faculty of Agriculture and natural resources, University of

Mohaghegh Ardabili.

*[email protected]

Abstract

In the mammary gland epithelial cells and immune system cells responsible for detecting invading pathogens via receptors (TLRs). ten types of TLRs (TLR1 to TLR10) have been identified in cows.

PAMP recognition by TLR signaling pathways for cytokine production can create and chemical migration of cells, including neutrophils and macrophages, blood vessels surrounding the site of infection increase. In this study, we sequenced PCR products of TLR4 gene and evolution analysis was done with other mammalians. The results showed 26 haplotype with 0.951 haplotype diversity.

Genetic diversity observed among species and within species indicates that TLR4 gene is very variable. Regard to association between this gene and diseases, it seems that the deference observation between species is due to adaptation to variety local to increase sustainability of animal.TLR4 gene could be suitable candidate gene for species evolution study.

Keywords: TLR4 Gene, Haplotype Relationship, Bioinformatics analysis, Evolution study.