PROGRAM STUDI S3 ILMU PETERNAKAN FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS HASANUDDIN

(1)

PROGRAM STUDI S3 ILMU PETERNAKAN FAKULTAS PETERNAKAN

UNIVERSITAS HASANUDDIN

Kode Dokumen

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER

MATA KULIAH (MK) KODE Rumpun MK BOBOT (sks) SEMESTER Tgl Penyusunan

GENETIKA BIOMETRIKA 20I01310703 T=3 P=- 1 26 desember 2021

OTORISASI Pengembang RPS Koordinator RMK Ketua PRODI

Prof.Rr.Sri Rachma A.B., M.Sc., Ph.D.

Prof.Dr.Lellah Rahim, M.Sc.

Dr.Muh.Ihsan A.Dagong, M.Si.

Prof.Rr.Sri Rachma A.B., M.Sc., Ph.D. Prof.Rr.Sri Rachma A.B., M.Sc., Ph.D.

Capaian

Pembelajaran (CP)

CPL-PRODI yang dibebankan pada MK CPL-3

CPL-4 CPL-7 CPL-9 CPL-11

Menguasai filosofi dan konsep keilmuan bidang peternakan dan aplikasi ketrampilan tertentu secara terintegrasi (P-1) Menguasai dan mengembangkan konsep konsep teoritis masalah-masalah peternakan berlandaskan prinsip-prinsip ilmiah untuk mengoptimalkan produksi ternak

(P-2)

Mampu menganalisis dan mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi sesuai dengan keahliannya berdasarkan kaidah, tata cara dan etika ilmiah dalam rangka menghasilkan solusi, gagasan, desain atau karya seni (KU-2)

Mampu menyusun argumen dan solusi keilmuan dan teknologi bidang peternakan berdasarkan pandangan kritis atas fakta, konsep, prinsip, atau teori yang dapat dipertanggungjawabkan (KK-1)

Mampu mengevaluasi dan memecahkan permasalahan peternakan sehingga mampu mengambil keputusan secara tepat (KK-3)

Capaian Pembelajaran Mata Kuliah (CPMK)

CPMK-1 Memahami ruang lingkup dan urgensi mempelajari materi Genetika biometrika (CPL-3, CPL-4)

CPMK-2 Memahami dan menjelaskan tentang penjabaran hukum Mendel I dan II, genetika populasi, variasi DNA dalam populasi, pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPL-4, CPL-5, CPL-9)

CPMK-3 Memahami dan menjelaskan berbagai jenis dan fungsi komponen variansi dan korelasi (CPL-4, CPL-6, CPL-9) CPMK-4 Memahami cara perhitungan heritabilitas, repitabilitas, EPD dan EBV (CPL-3, CPL-4, CPL-6, CPL-9,CPL-11) CPL  Sub-CPMK

CPL-3 Sub-CPMK-1. Memahami ruang lingkup dan urgensi mempelajari materi Genetika biometrika (CPMK-1)

Sub-CPMK-2. Memahami konsep hukum Mendel, genetika populasi, variasi DNA dalam populasi, pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPMK-2)

(2)

2

CPL-4 Sub-CPMK-3. Memahami gene counting (frekuensi alel dan genotip), populasi random mating (kawin acak), Mutasi dan genetic drift dan

fungsi/efeknya pada ternak (CPMK-2)

Sub-CPMK-4.Memahami fungsi database gen (gen bank), analisis data genome serta peranan konstruksi data pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPMK-2)

Sub-CMPK-5. Mampu menghitung komponen variansi dan korelasi saat menyeleksi ternak (CPMK-3)

Sub-CMPK-6. Mampu mengevaluasi dan menganalisis hasil seleksi ternak berdasarkan estimasi heritabilitas, repitabilitas, EPD, dan EBV (CPMK-4)

CPL-7 Sub-CPMK-5. Mampu menghitung komponen variansi dan korelasi saat menyeleksi ternak (CPMK-3)

CPL-9 Sub-CPMK-5. Mampu menghitung komponen variansi dan korelasi saat menyeleksi ternak (CPMK-3)

CPL-11 Sub-CPMK-6. Mampu mengevaluasi dan menganalisis hasil seleksi ternak berdasarkan estimasi heritabilitas, repitabilitas, EPD, dan EBV (CPMK-4)

Deskripsi Singkat MK

Mata kuliah ini membahas tentang Genetika dasar, Hukum Hardy Weinberg, bioinformatik, komponen variansi dan berbagai jenis korelasi , berbagai metode menduga kualitas dan kuantitas genetik untuk seleksi ternak

Bahan Kajian / Materi

Pembelajaran

Materi pembelajaran matakuliah Biometrika Genetika adalah : 1 - Kontrak perkuliahan

- Urgensi mempelajari Genetika biometrika - Ruang lingkup matakuliah genetika biometrika 2 Genetika dasar :

- penjabaran hukum Mendel I dan II - definisi dasar teori probabilitas

- pemodelan teori probabilitas dalam genetika populasi 3 Hukum Hardy-weinberg :

- Variasi DNA dalam populasi - Lokus dan alel

- gene counting :frekuensi alel dan genotip - populasi random mating (kawin acak) - Mutasi dan genetic drift

4 Bioinformatika :

- database gen (gen bank) dan analisis data genome

(3)

3

- konstruksi data pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik

5 komponen variansi dan berbagai jenis korelasi

6 Metode pendugaan kualitas dan kuantitas genetik pada ternak menggunakan berbagai model dan rancangan:

- estimasi heritabilitas - estimasi repitabilitas

- estimasi expected progeny differences - estimasi breeding value

Pustaka Utama : 1. Genetics of livestock improvement. 1972. Lasley, J.F. Prentice Hall, USA.

2. Animal Genetic and Breeding. 2015. Tomar, A.K. and Singh, R. Astral.

3. Animal Breeding : Technology for the 21^st Century. 1998. Clark, A.E. Harwood Academic publisher.

4. Molecular and Quantitative Animal Genetics. 2015 . Khatib, H. John Wiley and Son Inc.

Pendukung : Jurnal, artikel, dan buku terkait Dosen Pengampu 1. Prof. Rr.Sri Rachma A.B., M.Sc., Ph.D

2. Prof. Dr.Lellah Rahim, M.Sc.

3. Dr. Muh.Ihsan A. Dagong, M.Si.

Matakuliah syarat 1. Genetika

2. Ilmu Pemuliaan Ternak

Mg Ke-

Sub-CPMK (Kemampuan

akhir tiap tahapan

belajar)

Penilaian Bantuk Pembelajaran, Metode

Pembelajaran,

Penugasan Mahasiswa, [ Estimasi Waktu] Materi Pembelajaran [ Pustaka ]

Bobot Penilaian Indikator Kriteria & Bentuk Luring (offline) Daring (online) (%)

(1) 2) (3) (4) (5) (6) (7) (8)

1 Sub-CPMK 1, 2 Mahasiswa mampu mengenali dan menyebutkan berbagai contoh kondisi tentang penjabaran hukum Mendel I dan II, definisi dasar teori probabilitas dan pemodelan teori probabilitas dalam genetika populasi di dunia peternakan

Mahasiswa menghadiri kuliah, melakukan

presentasi dan berinteraksi dalam diskusi, mengerjakan tugas mandiri

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : Kuliah dan

small group discussion

TM (1x 2x 50”)

PT: (1x30x60”) bahan dan panduan dari sumber rujukan BM: (1x30x60”)

Bahan dan panduan dari sumber rujukan dan referensi lain

a. penjabaran hukum Mendel I dan II, b. definisi dasar teori

probabilitas dan c. pemodelan teori probabilitas dalam genetika populasi

didunia peternakan

5%

(4)

4

2 ^{Sub-CPMK 3} Mahasiswa mampu mengenali

dan menyebutkan contoh kasus terkait variasi DNA dalam populasi, lokus dan alel, gene counting (frekuensi alel dan genotip), populasi random mating (kawin acak), Mutasi dan genetic drift dan fungsi/efeknya pada ternak

presentasi dan berinteraksi dalam diskusi, mengerjakan tugas mandiri

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : Kuliah dan

small group discussion TM (2 x 2x 50”)

PT: (2x30x60”) bahan dan panduan dari sumber rujukan BM: (2x30x60”) Bahan dan panduan dari sumber rujukan dan referensi lain

Berbagai pemahaman tentang :

a. Variasi DNA dalam populasi

b. Lokus dan alel

c. gene counting (frekuensi alel dan genotip) d. populasi random mating

(kawin acak)

e. Mutasi dan genetic drift pada ternak

5%

3 ^{Sub-CPMK 4} Mahasiswa mampu mengenali dan menyebutkan fungsi database gen (gen bank) dan analisis data genome serta peranan konstruksi data pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : Kuliah dan small group discussion TM (2 x 2x 50”)

PT: (2x30x60”) bahan dan panduan dari sumber rujukan

BM: (2x30x60”) Bahan dan panduan dari sumber rujukan dan referensi lain

a. database gen (gen bank) dan analisis data genome b. konstruksi data pohon

phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak

10%

4 Evaluasi Tengah Semester / Ujian Tengah Semester

15%

5 Sub-CPMK 5 Mahasiswa mampu mengenali berbagai jenis komponen variansi dan korelasi pada saat menyeleksi ternak

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : small group

discussion, collaborative learning TM (1x 2x 50”)

PT: (1x30x60”) bahan dan panduan dari sumber rujukan BM: (1x30x60”) Bahan dan panduan dari sumber rujukan dan referensi lain

Fungsi dari

a. Komponen variansi b. Berbagai jenis korelasi c. Sebagai alat analisis saat

penyeleksian ternak

10%

6 ^{Sub-CPMK 6} a.Mahasiswa dapat

menghitung nilai dugaan heritabilitas ternak saat menyeleksi ternak

presentasi dan berinteraksi dalam

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : small group

discussion,

PT: (1x30x60”) bahan dan panduan dari sumber rujukan BM: (1x30x60”)

Heritabilitas 5%

(5)

5

b. Mahasiswa dapat

menganalisis suatu kondisi berdasarkan nilai heritabilitas

diskusi, mengerjakan tugas mandiri

collaborative learning TM (1x 2x 50”)

Bahan dan panduan dari sumber rujukan dan referensi lain 7 Sub-CPMK 6 a.Mahasiswa dapat

menghitung nilai dugaan repitabilitas ternak saat menyeleksi ternak b. Mahasiswa dapat

menganalisis suatu kondisi berdasarkan nilai

repitabilitas

Bentuk

pembelajaran:

Kuliah, responsi MP : small group discussion, collaborative learning TM (2 x 2x 50”)

Repitabilitas 10%

8 ^{Sub-CPMK 6} a. Mahasiswa dapat

memahami fungsi dan cara kerja perhitungan

berdasarkan EPD b. Mahasiswa dapat

menganalisis suatu kondisi berdasarkan nilai EPD saat menyeleksi ternak

Bentuk

pembelajaran:

Expected Progeny Differences

12,5%

9 ^{Sub-CPMK 6} a. Mahasiswa dapat

memahami fungsi dan cara kerja perhitungan

berdasarkan berbagai model EBV

c. Mahasiswa dapat

menganalisis suatu kondisi berdasarkan nilai EBV saat menyeleksi ternak

Bentuk

pembelajaran:

Estimated Breeding Value 12,5%

10 Evaluasi Akhir Semester / Ujian Akhir Semester 15%

(6)

6 Catatan :

1. Capaian Pembelajaran Lulusan PRODI (CPL-PRODI) adalah kemampuan yang dimiliki oleh setiap lulusan PRODI yang merupakan internalisasi dari sikap, penguasaan pengetahuan dan ketrampilan sesuai dengan jenjang prodinya yang diperoleh melalui proses pembelajaran.

2. CPL yang dibebankan pada mata kuliah adalah beberapa capaian pembelajaran lulusan program studi (CPL-PRODI) yang digunakan untuk pembentukan/pengembangan sebuah mata kuliah yang terdiri dari aspek sikap, ketrampulan umum, ketrampilan khusus dan pengetahuan.

3. CP Mata kuliah (CPMK) adalah kemampuan yang dijabarkan secara spesifik dari CPL yang dibebankan pada mata kuliah, dan bersifat spesifik terhadap bahan kajian atau materi pembelajaran mata kuliah tersebut.

4. Sub-CP Mata kuliah (Sub-CPMK) adalah kemampuan yang dijabarkan secara spesifik dari CPMK yang dapat diukur atau diamati dan merupakan kemampuan akhir yang direncanakan pada tiap tahap pembelajaran, dan bersifat spesifik terhadap materi pembelajaran mata kuliah tersebut.

5. Indikator penilaian kemampuan dalam proses maupun hasil belajar mahasiswa adalah pernyataan spesifik dan terukur yang mengidentifikasi kemampuan atau kinerja hasil belajar mahasiswa yang disertai bukti-bukti.

6. Kreteria Penilaian adalah patokan yang digunakan sebagai ukuran atau tolok ukur ketercapaian pembelajaran dalam penilaian berdasarkan

indikator-indikator yang telah ditetapkan. Kreteria penilaian merupakan pedoman bagi penilai agar penilaian konsisten dan tidak bias. Kreteria dapat berupa kuantitatif ataupun kualitatif.

7. Bentuk penilaian: tes dan non-tes.

8. Bentuk pembelajaran: Kuliah, Responsi, Tutorial, Seminar atau yang setara, Praktikum, Praktik Studio, Praktik Bengkel, Praktik Lapangan, Penelitian, Pengabdian Kepada Masyarakat dan/atau bentuk pembelajaran lain yang setara.

9. Metode Pembelajaran: Small Group Discussion, Role-Play & Simulation, Discovery Learning, Self-Directed Learning, Cooperative Learning, Collaborative Learning, Contextual Learning, Project Based Learning, dan metode lainnya yg setara.

10. Materi Pembelajaran adalah rincian atau uraian dari bahan kajian yg dapat disajikan dalam bentuk beberapa pokok dan sub-pokok bahasan.

11. Bobot penilaian adalah prosentasi penilaian terhadap setiap pencapaian sub-CPMK yang besarnya proposional dengan tingkat kesulitan pencapaian sub-CPMK tsb., dan totalnya 100%.

12. TM=Tatap Muka, PT=Penugasan terstruktur, BM=Belajar mandiri.

(7)

7 PROGRAM STUDI S3 ILMU PETERNAKAN FAKULTAS PETERNAKAN

UNIVERSITAS HASANUDDIN

SILABUS SINGKAT

MATA KULIAH

Nama GENETIKA BIOMETRIKA Kode 20I01310703

Kredit 3 Semester 1

DESKRIPSI MATA KULIAH

Mata kuliah ini membahas tentang Genetika dasar, Hukum Hardy Weinberg, bioinformatik, komponen variansi dan berbagai jenis korelasi , berbagai metode menduga kualitas dan kuantitas genetik untuk seleksi ternak

CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH (CPMK)

1 Memahami ruang lingkup dan urgensi mempelajari materi Genetika biometrika (CPL-3, CPL-4) 2 Memahami dan menjelaskan tentang penjabaran hukum Mendel I dan II, genetika populasi,

variasi DNA dalam populasi, pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPL-4, CPL-5, CPL-9)

3 Memahami dan menjelaskan berbagai jenis dan fungsi komponen variansi dan korelasi (CPL-4, CPL-6, CPL-9)

4 Memahami cara perhitungan heritabilitas, repitabilitas, EPD dan EBV (CPL-3, CPL-4, CPL-6, CPL- 9,CPL-11)

SUB CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH (Sub-CPMK)

1 Memahami ruang lingkup dan urgensi mempelajari materi Genetika biometrika (CPMK-1) 2 Memahami konsep hukum Mendel, genetika populasi, variasi DNA dalam populasi, pohon

phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPMK-2)

3 Memahami gene counting (frekuensi alel dan genotip), populasi random mating (kawin acak), Mutasi dan genetic drift dan fungsi/efeknya pada ternak (CPMK-2)

4 Memahami fungsi database gen (gen bank), analisis data genome serta peranan konstruksi data pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik ternak (CPMK-2)

5 Mampu menghitung komponen variansi dan korelasi saat menyeleksi ternak (CPMK-3)

(8)

8

6 Mampu mengevaluasi dan menganalisis hasil seleksi ternak berdasarkan estimasi heritabilitas,

repitabilitas, EPD, dan EBV (CPMK-4)

MATERI PEMBELAJARAN

1

- Kontrak perkuliahan

- Urgensi mempelajari Genetika biometrika - Ruang lingkup matakuliah genetika biometrika

2

Genetika dasar :

- penjabaran hukum Mendel I dan II - definisi dasar teori probabilitas

- pemodelan teori probabilitas dalam genetika populasi

3

Hukum Hardy-weinberg : - Variasi DNA dalam populasi - Lokus dan alel

- gene counting :frekuensi alel dan genotip - populasi random mating (kawin acak) - Mutasi dan genetic drift

4

Bioinformatika :

- database gen (gen bank) dan analisis data genome

- konstruksi data pohon phylogeni untuk deteksi hubungan kekerabatan genetik 5 komponen variansi dan berbagai jenis korelasi

6

Metode pendugaan kualitas dan kuantitas genetik pada ternak menggunakan berbagai model dan rancangan:

- estimasi heritabilitas - estimasi repitabilitas

- estimasi expected progeny differences - estimasi breeding value

PUSTAKA

PUSTAKA UTAMA

PUSTAKA PENDUKUNG Jurnal- jurnal yang relevan

PRASYARAT (Jika ada)

Genetika ternak dan Ilmu Pemuliaan Ternak

(9)

9 PROGRAM STUDI S3 ILMU PETERNAKAN FAKULTAS PETERNAKAN

UNIVERSITAS HASANUDDIN

RENCANA TUGAS MAHASISWA

MATA KULIAH GENETIKA BIOMETRIKA

KODE 20I01310703 sks 3 SEMESTER 1

DOSEN PENGAMPU

1. Prof. Rr.Sri Rachma A.B., M.Sc., Ph.D 2. Prof. Dr.Lellah Rahim, M.Sc.

3. Dr. Muh.Ihsan A. Dagong, M.Si.

BENTUK TUGAS WAKTU PENGERJAAN TUGAS

Paper makalah 12 minggu

JUDUL TUGAS

1. Genetika populasi dan variasi DNA pada ternak

2. Keragaman genetik ternak berdasarkan hubungan kekerabatan 3. Seleksi ternak menggunakan nilai estimasi heritabilitas

4. Seleksi ternak menggunakan nilai estimasi repitabilitas

5. Seleksi ternak menggunakan nilai estimasi expected progeny differences 6. Seleksi ternak menggunakan nilai estimasi breeding value

SUB CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH

1. Mahasiswa mengetahui pengaruh genetika populasi dan variasi DNA hubungannya dengan kesetimbangan Hardy-Weinberg

2. Mahasiswa mengetahui dan dapat menggunakan berbagai metode untuk menduga kualitas dan kuantitas genetik pada ternak

DISKRIPSI TUGAS

Tugas makalah paper ini adalah mahasiswa mengkaji berbagai efek yang dapat berpengaruh pada kesetimbangan Hardy Weinberg dan mengkaji berbagai metode menduga kualitas genetik ternak

(10)

10

sebagai dasar seleksi ternak unggul yang dapat didiskusikan dan menghasilkan suatu paper riview

sebagai simpulan dari hasil bacaan dan belajar mandirinya serta dapat menjadi rujukan penelitian Tugas ini juga bentuk kemampuan bagi mahasiswa untuk berpikir secara logis kritis dan sistematis dan inovatif dalam mengkaji keragaman genetik ternak lokal dan seleksi bibit unggul ternak.

METODE PENGERJAAN TUGAS 1. Diskusi

2. Makalah

3. Tugas kelompok

BENTUK DAN FORMAT LUARAN a. Obyek Garapan:

- Hubungan kekerabatan ternak - Seleksi ternak

b. Bentuk Luaran:

Makalah review

INDIKATOR, KRITERIA DAN BOBOT PENILAIAN

Mahasiswa menghadiri perkuliahan, mampu memahami dan menjelaskan kembali materi kuliah dengan baik serta mampu menghitung data sampel sederhana untuk materi seleksi ternak.

JADWAL PELAKSANAAN 1.

LAIN-LAIN

DAFTAR RUJUKAN

-Buku “animal Breeding/pemuliaan ternak -Jurnal Bereputasi Internasional dan nasional -prosiding Internasional dan Nasional